$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Принимайте микротитровые планшеты, содержащие серийно разведенный аминогликозидный антибиотик. Одна из пластин содержит NTBC, синтетический наркотик.
Введите Pseudomonas aeruginosa, грамотрицательную бактерию, и инкубируйте.
Бактерии вырабатывают пиомеланин — защитный внеклеточный пигмент — в необработанных лунках NTBC, в то время как препарат препятствует выработке пиомеланина.
Катионный антибиотик связывается с анионными липополисахаридами, или ЛПС, на бактериальной внешней мембране, смещая катионные мостики и дестабилизируя мембрану.
Попадая в бактерию, антибиотик связывается с аминоацильным сайтом, или сайтом А, в 30S рибосомальной субъединице.
Связанный антибиотик предотвращает связывание аминоацил-тРНК и движение рибосомы по мРНК, препятствуя синтезу белка и подавляя рост бактерий.
После инкубации измерьте оптическую плотность культуры, чтобы оценить рост бактерий.
Самая низкая концентрация антибиотика, препятствующая росту бактерий, — это минимальная ингибиторная концентрация или MIC.
Одинаковые значения МПК для скважин, обработанных и необработанных НТБК, указывают на отсутствие влияния НТБК на чувствительность бактерий к антибиотикам.
За день до анализа МПК подготовьте культуры штаммов для исследования в ЛБ с 2-[2-нитро-4-трифторметил)бензоил]-1-3 циклогександионом или НТБК и без него. В данной демонстрации используется репрезентативный уровень 300 микромоляров NTBC. Метод титрования для определения подходящей концентрации NTBC описан в тексте протокола. Инкубируйте культуры в течение ночи при температуре 37 градусов Цельсия с аэрацией. На следующий день сделайте мастер-растворы LB plus NTBC и LB plus DMSO для анализа MIC.
Чтобы проверить один антибиотик на один штамм, добавьте 600 микромоляров NTBC к 2 миллилитрам LB и перемешайте, чтобы получить главный раствор NTBC. NTBC добавляется в концентрации 600 микромоляров, потому что при добавлении инокулюма он разбавляется в два раза, в результате чего конечная концентрация составляет 300 микромоляров. Добавьте эквивалентный объем ДМСО транспортного средства к 2 миллилитрам LB и перемешайте, чтобы получить главный раствор без NTBC. Эти два основных решения будут использоваться для создания исходных растворов антибиотиков, а также для настройки серии разведения в 96-луночных планшетах.
Затем приготовьте растворы антибиотиков в главных растворах LB плюс NTBC или LB плюс DMSO. Приготовьте гентамицин плюс-минус НТБК в массовом растворе из расчета 64 мкг на миллилитр. Сделайте канамицин плюс-минус в исходном растворе NTBC в дозе 256 мкг на миллилитр. Приготовьте тобрамицин плюс-минус в исходном растворе NTBC в концентрации 8 мкг на миллилитр.
После того, как растворы антибиотиков 2X были приготовлены, добавьте по 100 микролитров каждого раствора антибиотика в четыре лунки в 96-луночном планшете в ряду А. Например, гентамицин следует размещать в группах от А1 до А4. Канамицин следует помещать в ячейки от А5 до А8, а тобрамицин — в ячейки А9 до А12.
Добавьте 50 микролитров LB плюс NTBC или LB плюс главный раствор ДМСО в ряды от B до H 96-луночного планшета. Убедитесь, что одна пластина имеет LB плюс NTBC, а другая пластина — LB плюс DMSO. С помощью головки микропипетки выполните двукратное последовательное разведение антибиотиков, перенеся 50 микролитров раствора из ряда А в ряд В. Перемешайте раствор, поменяйте наконечники пипеток и перенесите 50 микролитров раствора из ряда В в ряд С. Повторите для остальных рядов.
После разбавления ряда G удалите 50 микролитров раствора из этого ряда и выбросьте. Используйте ряд H в качестве средства контроля роста бактерий без антибиотиков. Соберите ночные культуры. После промывки всех культур для устранения имеющегося в среде биомеланина измерьте наружный диаметр600 культур. Развести ночные культуры в LB.
С помощью многоканальной микропипетки добавьте 50 микролитров разведенной бактериальной культуры в соответствующие лунки. Добавьте бактерии в три лунки для каждого штамма и концентрации антибиотика. Добавьте 50 микролитров LB в четвертую лунку, чтобы он действовал как контроль бактериального загрязнения. Накройте 96-луночные планшеты парапленкой и инкубируйте в течение примерно 24 часов при температуре 37 градусов Цельсия.
На следующий день осмотрите планшеты визуально на предмет роста бактерий в лунках. MIC является самой низкой концентрацией антибиотика, при которой не наблюдается роста бактерий для всех трех реплик каждого штамма.