-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

RU

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

ru_RU

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Immunology and Infection
Выделение и анализ генома Единого Вирионы использованием "Единое геномики Вирус"
Выделение и анализ генома Единого Вирионы использованием "Единое геномики Вирус"
JoVE Journal
Immunology and Infection
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Immunology and Infection
Isolation and Genome Analysis of Single Virions using ‘Single Virus Genomics’

Выделение и анализ генома Единого Вирионы использованием "Единое геномики Вирус"

Full Text
11,555 Views
08:31 min
May 26, 2013

DOI: 10.3791/3899-v

Lisa Zeigler Allen1, Thomas Ishoey1, Mark A. Novotny1, Jeffrey S. McLean1, Roger S. Lasken1, Shannon J. Williamson1

1Department of Microbial and Environmental Genomics,The J. Craig Venter Institute

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Одноместный геномики Вирус (SVG) является методом, чтобы изолировать и усилить геномы одного вирионов. Вирусные суспензий смешанной сборкой сортируются с использованием проточной цитометрии на предметное стекло микроскопа с дискретными лунки, содержащие агарозы, тем самым захватив вириона и сокращение генома сдвига во время последующей обработки. Амплификация полного генома достигается использованием нескольких усиления смещения (MDA), в результате геномный материал, который подходит для секвенирования.

Общая цель этой процедуры состоит в том, чтобы выделить отдельные варианы из смешанных консорциумов и секвенировать полученный геномный материал для идентификации вирусов из различных сред без необходимости культивирования. Это достигается путем выделения отдельных вариан с помощью цитометрической сортировки потока на шариках aro. Захват одиночных ионов затем проверяется с помощью конфокальной микроскопии.

Затем геномный материал выделяют из ионов и амплифицируют с помощью амплификации множественного смещения или MDA для получения количества ДНК, необходимого для секвенирования. Наконец, вирусная ДНК секвенируется с использованием высокопроизводительных технологий для создания избыточного покрытия генома вириона, что существенно помогает в сборке и аннотации генома. В конечном счете, биоинформатические методы, направленные на использование подходов субвыборки последовательностей для увеличения размера конуса, позволяют анализировать изолированные воны.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

Генетика выпуск 75 микробиологии иммунологии вирусологии молекулярной биологии наук об окружающей среде геномики экологической геномики одним вирусом геномика одного вируса SVG усиления целом геноме проточной цитометрии вирусных экологии вириона анализ генома ДНК ПЦР секвенирование

Related Videos

Подготовка вирусных ДНК из нуклеокапсидов

12:45

Подготовка вирусных ДНК из нуклеокапсидов

Related Videos

21.6K Views

Простая и надежная В естественных условиях И В пробирке Подход к изучению вируса Ассамблеи

09:47

Простая и надежная В естественных условиях И В пробирке Подход к изучению вируса Ассамблеи

Related Videos

12.7K Views

Подготовка образцов для одной микроскопии атомной силы Virion и флуоресценции супер-разрешения

05:31

Подготовка образцов для одной микроскопии атомной силы Virion и флуоресценции супер-разрешения

Related Videos

10.1K Views

Очищение нечистых: секвенирование метагеномов и Metatranscriptomes от сложных образцов животного связано

11:23

Очищение нечистых: секвенирование метагеномов и Metatranscriptomes от сложных образцов животного связано

Related Videos

37.7K Views

Моделирование жизненного цикла Эбола Вирус Меньше уровень биологической безопасности 2 Условия вирусом типа частиц, содержащих Tetracistronic Minigenomes

10:11

Моделирование жизненного цикла Эбола Вирус Меньше уровень биологической безопасности 2 Условия вирусом типа частиц, содержащих Tetracistronic Minigenomes

Related Videos

37.1K Views

С открытым исходным кодом Анализ Одночастичного для супер-разрешение микроскопии с VirusMapper

07:38

С открытым исходным кодом Анализ Одночастичного для супер-разрешение микроскопии с VirusMapper

Related Videos

10.5K Views

Очистка вирусной ДНК для идентификации связанных вирусных и клеточных белков

08:26

Очистка вирусной ДНК для идентификации связанных вирусных и клеточных белков

Related Videos

14.3K Views

Объединяя анализ ДНК в добыче сырой вириона с анализом РНК от зараженных листьев, чтобы обнаружить новый вирус геномов

08:56

Объединяя анализ ДНК в добыче сырой вириона с анализом РНК от зараженных листьев, чтобы обнаружить новый вирус геномов

Related Videos

11.6K Views

Одноклеточная микро-аспирация в качестве альтернативной стратегии для флуоресценции активированной сортировки клеток для гигантского разделения вирусной смеси

09:50

Одноклеточная микро-аспирация в качестве альтернативной стратегии для флуоресценции активированной сортировки клеток для гигантского разделения вирусной смеси

Related Videos

7.6K Views

Профилирование эпитопов поверхностных белков на вирусных частицах с помощью мультиплексной стратегии двойного репортера

08:07

Профилирование эпитопов поверхностных белков на вирусных частицах с помощью мультиплексной стратегии двойного репортера

Related Videos

1.4K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code