9.6: Остановка трансляции
Большая субъединица рибосомы обладает несколькими важными структурами, необходимыми для трансляции. К ним относятся пептидилтрансферазный центр (ПТЦ), который является местом, где образуется пептидная связь, и большая внутренняя заполненная водой трубка, через которую движется возникающий полипептид. Эта последняя структура называется туннелем выхода пептида, и она начинается в ПТЦ и пронизывает тело большой субъединицы рибосомы. Во время трансляции, когда синтезируется возникающая полипептидная цепь, она проходит через туннель выхода пептида. Затем выходит на стороне, погруженной в растворитель, где пептидная цепь впоследствии сворачивается в белок.
Этот туннель, образованный рибосомной 23S РНК, создает большую гидрофильную поверхность, содержащую крошечные гидрофобные участки. Размеры туннеля (приблизительно 10 нм × 1,5 нм) позволяют разместить растущие неструктурированные полипептидные цепи, а также молекулы растворителя. Внутренняя часть туннеля выхода пептида не комплементарна ни одному пептиду. Следовательно, полипептидная цепь не “прилипает” к стенкам и может легко пройти сквозь них. Как только она достигает места в туннеле выхода, где достаточно пространства, возникающая пептидная цепь начинает сворачиваться и может успешно образовывать некоторые α-спиральные области. Однако большая часть сворачивания белка происходит, когда полипептид выходит из рибосомы.
