Summary
Biz Tat duyarlı LTR ek olarak, bu tür bir lentiviral vektör geliştirdik, HIV-1 Tat ve Rev-bağımlı bir moda muhabiri gen ekspresyonu düzenleyen Rev-yanıt elemanı (RRE). Vektör GFP ifadesi üzerinden canlı hücreler kopyalayan HIV özel algılama izin verir.
Abstract
HIV duyarlı ifade vektörlerin çoğu HIV organizatörü, uzun terminal tekrar (LTR) dayanmaktadır. LTR erken HIV protein, Tat duyarlı iken, hücresel aktivasyon devletler ve entegrasyonu oluştu yerel kromatin aktivite duyarlı. Bu yüksek HIV bağımsız aktivite neden olabilir ve işareti HIV pozitif hücreler 1,2,3 LTR-tabanlı muhabiri yararlılığı sınırlı. Burada, Tat duyarlı LTR, Rev-yanıt elemanı ve HIV ekleme siteleri 4,5,6 olmak üzere pek çok HIV DNA dizilerinin yanı sıra, sahip bir ifade lentiviral vektör inşa edilmiştir. Vektör yaşayan hücre popülasyonlarının kopyalayan HIV son derece özel bir algılama izin lentiviral bir muhabir virüs içine dahil oldu. Vektör aktivitesi yeşil floresan proteininin (GFP) ifadesi ile ölçüldü. Burada bildirilen bu vektör uygulama, HIV-pozitif hücreleri belirlemek için mevcut yöntemlere in situ PCR veya HIV antijeni boyama gibi bir roman alternatif bir yaklaşım, sunuyor . Vektör aynı zamanda HIV-pozitif hücreleri hedef için temel veya klinik deneyler için terapötik genleri ifade edebilir.
Protocol
1. Rev-bağımlı lentiviral Parçacıklar üretimi için Plazmidler, Transfeksiyon
Set up: Rev-bağımlı GFP lentiviral vektörü, PNL-GFP-RRE-SA, daha önce açıklanan 4,5,6 . Viral bir parçacık içinde bir araya getirmek için, HIV-1 ambalaj inşa, pCMVΔ8.2 (kibarca Dr Diğer Trono tarafından sağlanan) HEK293 T hücrelerinin içine plazmid contransfected ve VSV-G glikoprotein (pHCMV-G) taşıyan bir plazmid . Transfeksiyon kalsiyum fosfat yöntemi kullanılarak gerçekleştirilmiştir.
Tamponlar Hazırlanması: 10 X HBS (HEPES Tamponlu Salin) HEPES 5 g eriterek tarafından hazırlanan, 8 g NaCl, Na 2 HPO 4 (susuz) 100 ml KCl Dekstroz 1 g, 0.103 g, 0.37 g H 2 O Kısım the10 X HBS 1 ml alikotları içine tampon ve -20 ° C'de saklayın Transfeksiyon zaman, H 2 O (1: 5 seyreltme), 2 X HBS 10 X HBS dönüştürmek ve pH ayarlamak arasında 7.05 - 7.12 . (10 ml 2 X HBS, genellikle 1M NaOH yaklaşık 50 mcL gerektirir). Filtre 0.22 mcM Millipore filtre geçerek 2X HBS tampon sterilize. CaCl 2 tampon, nihai konsantrasyonu 2M 10 mM HEPES CaCl 2 eriterek yapıldı . PH 5.8 ayarlayın, 4 tampon ve mağaza sterilize filtre ° C
Prosedür:
- Bir gün önce transfeksiyon, tohum 2 x 10 6 HEK293T 100 mm Petri-çanak hücreleri, ve 37 ° 10 ml DMEM +% 10 FBS geceleme hücrelerin büyümesine ° C,% 5 CO 2.
- Ertesi gün, hücreleri süpernatant kaldırmak ve 5 ml taze DMEM +% 10 FBS, 4 saat boyunca sürekli olarak kültür hücreleri ile değiştirin.
- 5 ml polistiren tüp, 480 mcL 2X HBS tampon ekleyin.
- Ikinci bir 5 ml polistiren tüp, 480 mcL toplam hacmi 60 mcL 2M CaCl 2 tampon, plazmid DNA ve transfeksiyon TE tamponu (1 mM Tris, 25 mM EDTA, pH 8.0) ekleyin. Her Petri yemek için plazmidler PNL-GFP-RRE-SA, pCMVΔR8.3, 7.5 mg, 2.5 mg ve pHCMV-G 10 mikrogram oranında ilave edilmelidir.
- 2 X HBS tüp damla damla plazmid DNA CaCl 2 karışımı ekleyin ve 30 dakika oda sıcaklığında inkübe edin. A fine çökelti oluşacaktır.
- Pipet tarafından hücrelere damla damla karışım 960 mcL ekleyin. Bir gecede 37 ° C,% 5 CO 2 inkübe edin.
- Ertesi gün, süpernatantı kaldırmak ve 10 ml taze DMEM +% 10 FBS eklemek ve hücrelerin sürekli olarak 37 ° C,% 5 CO 2 gece boyunca inkübe edin.
- 48 saat transfeksiyon anda, hasat süpernatantı kaldırılması ve 50 ml steril tüpler içine transfer virüs. 10 ml taze taze DMEM +% 10 FBS her Petri yemek ve gece boyunca kültür devam. 4 virüs süpernatant Mağaza ° C.
- Süpernatantı toplayarak 72 saat transfeksiyon hasat devam edin. Süpernatantlar birleştirin ve pelet ila 15 dakika boyunca 500 xg'de süpernatantlar santrifüj ve hücre artıkları çıkarın.
- Süpernatant 0.22 mcM Millipore filtre aracılığıyla toplanan ve süzülür. Bu virüs, daha fazla boyut dışlama sütun yoluyla konsantre oldu.
2. Viral Parçacıklar Konsantre ve Viral titresi tespit
- Viral parçacıkların bir boyut dışlama sütun (100.000 MW kesti, Centricoin) yoğunlaşmıştır. Viral süpernatant sütuna yüklenen ve 4 ° C 15 dakika boyunca 6.000 xg'de santrifüj edildi.
- Konsantre viral süpernatant, toplanan aliquoted ve -80 ° C'de saklanır oldu
- Viral titresi TNF tedavi, HIV-1 pozitif Ceket hücre hattı, J1.1 7 enfeksiyon tespit edildi. Hücreler 96 plaka ml başına 2.5 x 10 5 hücreleri (100 ml toplam hacim) kültür ve bir hafta boyunca seri olarak seyreltilmiş VNL-GFP-RRE-SA 100 ml ile enfekte edildi. Reed ve Muench 8 yöntemi takip GFP pozitif kuyu sayarak parçacığın titresi (TCID50) tahmin edilmiştir.
3. Markalama HIV-1 lentiviral Tane Pozitif Hücreler, VNL-GFP-RRE-SA
Set up: bir insan CD4 T hücre hattı, CEM-SS, ilk HIV-1 ile enfekte oldu. 48 saat enfeksiyonu, hücreler lentiviral parçacıklar, VNL-GFP-RRE-SA ile süperenfekte. Bir iki gün süperenfeksiyonu sonra, GFP pozitif hücreler flow sitometri ile analiz edildi. Kontrol olarak, HIV-1 enfekte olmamış CEM-SS hücreleri aynı VNL-GFP-RRE-SA ile enfekte edildi. Sadece HIV-1 ile enfekte CEM-SS hücreleri, HIV-1 enfekte olmamış CEM-SS hücreleri GFP pozitif hücreler doğurdu değil.
Prosedür:
- Enfeksiyon iki saat önce, nihai konsantrasyonu 4 mg / ml polybrane ekleyin. Hücre sayımı ve her enfeksiyon için 2 x 10 5 hücreleri alır. 2 saat boyunca 200 ng (p24), HIV-1 NL4-3 hücreleri enfekte.
- Tekrar süspansiyon, 10 dakika boyunca 300 xg'de santrifüj hücreleri Yıkama37 2 x 10 5 hücre / mL ve kültür içine hücreleri ° C 48 saat boyunca.
- Hücre sayımı ve VNL-GFP-RRE-SA ile enfeksiyon başına 2 x 10 5 hücre almak. ° C gecede 37 VNL-GFP-RRE-SA ve inkübe 100 ml ekleyin. Hücreleri yıkayın ve 2 x 10 5 hücre / ml içine tekrar süspansiyon.
- 48 saat yazılan süperenfeksiyon flow sitometri analizi gerçekleştirin. Enfekte hücrelerin pelet ve 20 dakika oda sıcaklığında inkübe 500 ml% 1 paraformaldehede, içine yeniden süspanse edildi ve daha sonra bir FACScan analizörü (Becton Dickenson) analiz.
4. Temsilcisi Sonuçlar
Deneyleri başarıyla yapılmaktadır kontrolü, GFP pozitif hücreler, HIV-1 enfekte olmamış CEM-SS tespit edilebilir, ancak, kayda değer bir GFP nüfus, akış sitometresinin tarafından HIV-1 ile enfekte CEM-SS hücreleri tespit olacaktır hücreleri.
Deneyleri başarıyla yapılmaktadır, Rev-bağımlı lentiviral vektör, VNL-GFP-RRE-SA, yeşil floresan protein (GFP) ifade ölçümü yoluyla, hücre popülasyonlarının yaşayan kopyalayan HIV son derece özel bir algılama izin verecektir. Bu örnekte, hasat CEM-SS hücreleri fare CD24, HSA karşı PE-etiketli sıçan monoklonal antikor ile boyandı ve daha sonra HSA ve GFP ifade hem de bir akış sitometresinin analiz.
Şekil 1'de görüldüğü gibi, oldukça büyük bir GFP nüfus VNL-GFP-RRE-SA (Şekil 1c) süperenfekte HIV-1 ile enfekte olan hücreleri tespit edildi. Buna karşılık, GFP pozitif hücrelerin lentiviral süperenfeksiyon (Şekil 1a) veya HIV-1 enfekte olmamış hücrelerdeki lentiviral süperenfeksiyon (Şekil 1b). Olmadan ya HIV-1 enfekte olmamış CEM-SS hücreleri tespit edildi
Discussion
Önceki gelişmiş Tat bağımlı ekspresyon vektörleri olduğu gibi, Rev sistemi gelişmiş bir HIV sürecinin bir sömürü burada anlatılan. Rev-bağımlılık dahil LTR tabanlı ifade vektör kopyalayan HIV varlığı son derece bağımlı hale getirir. Burada bildirilen bu vektör uygulama, HIV-bağımlı bir muhabir virüs, HIV-pozitif hücrelerin tanımlamak için yeni bir yeni bir yaklaşım sunuyor. Vektör canlı hücrelerin incelenmesine izin veren, temel veya klinik deneyler için herhangi bir gen ifade ve bir sözde-daktilo lentivirüs olarak, en hücre tipleri ve dokulara erişimi vardır.
Disclosures
Çıkar çatışması ilan etti.
Acknowledgments
Iş NIAID gelen YW Halk Sağlığı Servisi hibe 1R01AI081568 ve cömert bağışlar M. Rosen ve Day2 A.Ş. tarafından düzenlenen 2009 NYCDC AIDS Ride donörler ve biniciler tarafından kısmen desteklenmiştir.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Biosafety Cabinet | |||
| 37°C 5%CO2 incubator | |||
| Flow cytometer | FACSCalibur | ||
| Centrifuge | Beckman Coulter Inc. | Allega®6KR | |
| 4°C regrigerator | |||
| -20°C refrigerator | |||
| -80°C refrigerator | |||
| Cell counter | Nexcelom Bioscience | Cellometer® AutoT4 | |
| HEK293T cell line | National Institutes of Health | ||
| CEM-SS cell line | National Institutes of Health | ||
| Jurkat cell line J1.1 | National Institutes of Health | ||
| DMEM | Invitrogen | 11965-118 | |
| RPMI 1640 | Invitrogen | 21870 | |
| HI FBS | Invitrogen | 10438-018 | |
| HIV-1NL4-3 | prepared by tranfsection of HeLa cells with cloned proviral DNA | ||
| pNL-GFP-RRE | copmlete deletion of all HIV ORFs of pNL4-3 | ||
| pNL-GFP-RRE-SA | Insert HIV-1 A5 and D4 into pNL-GFP-RRE | ||
| pCMVΔ8.2 | provided by Dr. Dider Trono | ||
| pHCMV-G | |||
| 10 x HBS (Hepes Buffered Saline) | Invitrogen | 11344-041 | |
| 2M CaCl2 buffer | Invitrogen | S-013-154-10 | |
| 1% paraformaldehy | Sigma-Aldrich | 158127 | |
| Bleach | |||
| 50ml Falcon tubes | BD Biosciences | 358206 | |
| 5ml round bottom tubes | BD Biosciences | 352063 | |
| 0.45μM Millipore filter | EMD Millipore | SLHA033SS | |
| 0.20μM Millipore filter | EMD Millipore | SLFG85000 | |
| 100mm Petri-dish | Sigma-Aldrich | CLS430588 | |
| Size-exclusion column (100,000MW cut off) | Sartorius AG | VS2041 | |
| 2ml frozen tube | Axygen Scientific | SCT-200 | |
| 96-well plate | BD Biosciences | 353227 | |
| 1.7mL Microcentrifuge Tube | Axygen Scientific | MCT- 175-C |
References
- Garcia, J. A., Wu, F. K., Mitsuyasu, R., Gaynor, R. B. Interactions of cellular proteins involved in the transcriptional regulation of the human immunodeficiency virus. EMBO Journal. 6, 3761-3770 (1987).
- Merzouki, A. HIV-1 gp120/160 expressing cells upregulate HIV-1 LTR directed gene expression in a cell line transfected with HIV-1 LTR-reporter gene constructs. Cell Mol Biol (Noisy-le-grand. 41, 445-452 (1995).
- Aguilar-Cordova, E., Chinen, J., Donehower, L., Lewis, D. E., Belmont, J. W. A sensitive reporter cell line for HIV-1 tat activity, HIV-1 inhibitors, and T cell activation effects. AIDS Res Hum Retroviruses. 10, 295-301 (1994).
- Wu, Y., Beddall, M. H., Marsh, J. W. Rev-dependent lentiviral expression vector. Retrovirology. 4, 12-12 (2007).
- Wu, Y., Beddall, M. H., Marsh, J. W. Rev-dependent indicator T cell line. Current HIV Research. 5, 395-403 (2007).
- Young, J., Tang, Z., Yu, Q., Yu, D., Wu, Y. Selective killing of HIV-1-positive macrophages and T Cells by the Rev-dependent lentivirus carrying anthrolysin O from Bacillus anthracis. Retrovirology. 5, 36-36 (2008).
- Perez, V. L. An HIV-1-infected T cell clone defective in IL-2 production and Ca2+ mobilization after CD3 stimulation. Journal of Immunology. 147, 3145-3148 (1991).
- Reed, L. J., Muench, H. A simple method of estimating fifty percent endpoints. American Journal of Hygiene. 27, 493-497 (1938).
