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Article de méthode

Un procédé de criblage et de validation des mutations de résistance aux inhibiteurs de kinase

14.7K vues

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DOI :

10.3791/51984

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7 décembre 2014

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Dans cet article

Résumé

Emergence de la résistance génétique contre la thérapie d'inhibiteur de kinase pose défi important pour la thérapie efficace contre le cancer. Identification et caractérisation des mutations de résistance contre un médicament nouvellement développé contribue à une meilleure gestion clinique et la conception de médicaments de la prochaine génération. Ici, nous décrivons notre protocole pour le dépistage in vitro et la validation de mutations résistantes.

Résumé

La découverte de BCR / ABL comme un oncogène du pilote dans la leucémie myéloïde chronique (LMC) ont abouti à l'élaboration d'Imatinib, ce qui, en fait, a démontré le potentiel de cibler la kinase dans les cancers en traitant efficacement les patients atteints de LMC. Cette observation a révolutionné le développement de médicaments afin de cibler les kinases oncogènes impliqués dans diverses autres tumeurs malignes, telles que, EGFR, B-RAF, KIT et PDGFR. Cependant, un inconvénient majeur des thérapies anti-kinase est l'émergence de mutations de résistance aux médicaments rendant la cible pour avoir réduit ou perdu affinité pour le médicament. Comprendre les mécanismes employés par variants résistants non seulement aide à développer les inhibiteurs de la prochaine génération, mais donne aussi une impulsion à la gestion clinique utilisant la médecine personnalisée. Nous avons signalé une stratégie rétroviral de vecteur à base de dépistage pour identifier le spectre de résistance conférant mutations dans BCR / ABL, qui a aidé à développer la prochaine génération BCR / ABL inhibiteurs. Utilisation Ruxolitinib et JAK2 comme une paire de cibles pharmaceutiques, ici nous décrivent des méthodes de dépistage in vitro qui utilise les cellules BaF3 de la souris exprimant la bibliothèque de mutation aléatoire de kinase JAK2.

Introduction

Les protéines kinases sont des enzymes intracellulaires réglementaires clés de voies de transduction du signal qui modulent apparemment tous la fonction cellulaire. Un contrôle approprié de médiation par la kinase de signalisation est essentielle à l'homéostasie et le développement, qui repose essentiellement sur une bonne régulation des kinases, des phosphatases et sa dégradation par UPS (système de protéasome ubiquitine). Kinases régulées sont au centre de la scène de nombreux cancers et l'hôte impliqués dans des maladies humaines 1. Génome humain code pour plus de 500 protéines kinases qui ont été liés, directement ou indirectement, à ~ 400 mala....

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Protocole

NOTE: Toutes les procédures dans ce protocole ont été menées selon l'Institut national de lignes directrices de la santé pour le traitement et le soin éthiques des animaux, et selon un IACUC protocole d'utilisation d'animaux approuvé.

Ligne 1. maintenance des cellules

  1. Culture des cellules BAF3 dans du milieu RPMI-1640 complété avec 10% de sérum bovin fœtal et de la pénicilline / streptomycine (100 unités / ml et 100 pg / ml) et le milieu de culture usé de cellules WEHI. Cultiver les cellules HEK293T dans du DMEM supplémenté avec 10% de sérum bovin fœtal et de la pénicilline / streptomycine (100 unités / ml et 100 pg....

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Résultats

Émergence de mutations génétiques pose grand défi pour la thérapie de kinase lutte ciblée. Des études mutationnelles, en plus de fournir un aperçu mécanistes et fonctionnelles qui jouent un rôle dans la sélection et la conception de développement de médicaments de nouvelle génération, permet également une meilleure prise en charge clinique et peuvent à l'avenir être plus utile pour le traitement personnalisé. Dans cette expérience, nous montrons le dépistage de mutations de résistance à ruxolitinib JAK2 V617F-kinase

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Discussion

Le succès clinique de l'imatinib dans le traitement de la LMC a démontré non seulement le potentiel de cibler les kinases de rouge par les inhibiteurs de petites molécules, mais également les limites à découvert de thérapie ciblée: rechute clinique et l'émergence de mutations de résistance aux médicaments dans le gène cible. Identification de mutations de résistance contribue à une meilleure prise en charge clinique et le développement d'inhibiteurs de la prochaine génération. Ce protocole décrit une méthodo.......

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Déclarations de divulgation

Aucun conflit d’intérêts n’a été déclaré.

Remerciements

Cette étude a été financée par des subventions à M.A. du NCI (1RO1CA155091), du NHLBI (1R21HL114074) et de la Fondation de recherche sur la leucémie. M.A. est récipiendaire du prix V-Scholar de la Fondation V. Les auteurs sont reconnaissants à la Dre Sara Rohrabaugh pour l’édition.

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Culture cellulaire et tissulaire  ;
Cellules BaF3ATCC
HEK293T cellulesATCC
pMSCV-JAK2-V617F-puro.GWUn don de Ross Levine
pMSCV-JAK2-V617F/Y931C. GWFabriqué en interne
pMSCV-JAK2-V617F / L983F. GWFabriqué en interne
pMSCV-JAK2-V617F/P58A. GWFabriqué sur place
pMSCV-V617F-Cherry.GWFait maison
pMSCV-JAK2-V617F/Y931C-cherry.GWFabriqué sur place
pMSCV-JAK2-V617F/L983F-cherry.GWFabriqué sur place
pMSCV-Luciferase-puro.GWFait maison
RPMICellgro (corning)15-040-CV
DMEMCellgro (corning)15-013-CV
Penn/StrepCellgro (corning)30-002-CI
FBSAtlanta biologiqueS11150
Trypsine EDTA 1XCellgro (corning)25-052-CI
1x PBSCellgro (corning)21-040-CV
L-GlutamineCellgro (corning)25-005-CL
PuromycinGibco (technologies du vivant)A11138-03
Sulfate de protamineSigmaP33695 mg/ml stock dans l’eau
Solution de bleu de trypan (0,4 %)SigmaT8154
DMSOCellgro (corning)25-950-CQC
INCB018424 (Ruxolitinib)ChemieTeK941678-49-5
WST-1Roche11644807001
0,45 micron filtre à disquePALL2016-10
70 microns filtre à cellules en nylonBecton Dickinson352350
Bacterial Culture
XL-1 E. coli cellulesAgilent Tech200129
SOCNew England BiolabsB90920s
AmpicillineSigmaA0166100 mg/ml solution mère  ;
Bacto agarDifco214050
Terrific brothBecton Dickinson243820
AgaroseGenemateE-3119-500
Kits
Dneasy Blood& tissue kitQiagen69506
Expand long template PCR systemRoche1168134001
Wizard Système de nettoyage Sv gel et PCRPromegaA9282
Système de mini-préparation de plasmide Pure YieldPromegaA1222
Système de clonage PCR avec technologie Gateway avec pDONR 221 & OmniMAX 2 Competent CellsInvitrogen12535029
Gateway  ; Mélange d’enzymes clonases LR  ;Invitrogen11791019
Réactifs
Vivo-Glo Luciferin in-vivo GradePromegaP1043
1/2 cc Lo-Dose u-100 seringue à insuline 28 G1/2Becton Dickinson329461
Mortor pestleCoor tek  ;60316 et 60317
Isoflorane (Isothesia TM)Butler Schien29405
Instruments
NAPCO series 8000 WJ Incubateur CO2Thermo scientific
Centrifugeuse à rotor à godets oscillants 5810Rautomatisé Eppendorf
TC-10Bio-RADCe n’est pas nécessaire, on peut utiliser l’hémocytomètre standard pour le comptage des cellules
pour souris Compteur de cellules

Références

  1. Huse, M., Kuriyan, J. The conformational plasticity of protein kinases. Cell. 109, 275-282 (2002).
  2. Melnikova, I., Golden, J. Targeting protein kinases. Nat Rev Drug Discov. 3, 993-994 (2004).
  3. Cohen, P.

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Réimpressions et autorisations

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