Wnt-Signalwege spielen eine entscheidende Rolle während der Entwicklung der Atemwege. Die Definition präziser Mechanismen der Differenzierung und Morphogenese, die durch den Wnt-Signalweg gesteuert werden, ist erforderlich, um zu verstehen, wie Gewebe während der normalen Entwicklung strukturiert sind. Dieses Wissen ist auch entscheidend für die Bestimmung der Ätiologie von Geburtsfehlern wie Lungenhypoplasie und Tracheobronchomalazie. Die Analyse der frühesten Entwicklungsstadien der Atemwege stellt eine Herausforderung dar, da die begrenzte Menge an Gewebe die Durchführung von Standardprotokollen verhindert, die besser für postnatale Studien geeignet sind. In diesem Artikel diskutieren wir Methoden zur Untersuchung der Zelldifferenzierung und -proliferation in den Atemwegen. Wir beschreiben Techniken wie die Färbung des gesamten Passepartouts, die Verarbeitung des Gewebes für die konfokale Mikroskopie und die Immunfluoreszenz in Paraffinschnitten, die bei der Entwicklung der trachealen Lunge angewendet werden. Wir diskutieren auch Methoden zur Untersuchung der Differenzierung des trachealen Mesenchyms, insbesondere der Knorpelbildung. Die in der vorliegenden Arbeit diskutierten Ansätze und Techniken umgehen die Begrenzung des Materials bei der Arbeit mit embryonalem Gewebe und ermöglichen ein besseres Verständnis des Strukturierungsprozesses bei der Entwicklung leitender Atemwege.