Summary
Denne protokollen fokuserer på kvantitativ analyse av neuronal dendrittiske arborization kompleksitet (NDAC) i Drosophila, som kan brukes for studier av dendrittiske morphogenesis.
Abstract
Dendrites er forgrenet anslagene av en Nevron dendrittiske morfologi gjenspeiler synaptic organisasjon under utvikling av nervesystemet. Drosophila larver neuronal dendrittiske arborization (da) er en ideell modell for å studere morphogenesis nevrale dendrites og gen funksjon i utviklingen av nervesystemet. Det er fire klasser av da neurons. Klasse IV er de mest komplekse med en forgrening mønster som dekker nesten hele området av larver kroppen veggen. Vi har tidligere preget effekten av silencing Drosophila ortholog av SOX5 i klasse IV neuronal dendrittiske arborization kompleksitet (NDAC) med fire parameterne: lengden på dendrites, areal dendrite dekning, den Totalt antall grener, og strukturen forgrening. Denne protokollen presenterer arbeidsflyten NDAC kvantitativ analyse larver disseksjon, AC confocal mikroskopi og bildet analyse prosedyrer bruker ImageJ programvare. Videre innsikt i da neuronal utvikling og dens underliggende mekanismer vil øke forståelsen av neuronal funksjon og gi hint om de grunnleggende årsakene til nevrologiske og neurodevelopmental lidelser.
Introduction
Dendrites, som forgrenet anslagene av en Nevron, dekker feltet som omfatter nevrons sensoriske og synaptic innspill fra andre neurons1,2. Dendrites er en viktig komponent av synapse formasjon og spille en avgjørende rolle i integrere synaptic innganger, samt spre elektrokjemiske stimulering i en Nevron. Dendrittiske arborization (da) er en prosess som neurons danne nye dendrittiske trær og grener for å opprette nye synapser. Utvikling og morfologi av da, som grenen tetthet og gruppering mønstre, opprettes flere trinn biologiske prosesser og er sterkt korrelert til nevronale funksjon. Målet med denne protokollen er en metode for kvantitativ analyse av neuronal dendritric arborization kompleksitet i Drosophila.
Kompleksiteten i dendrites bestemmer synaptic typer, tilkobling og innspill fra partner neurons. Forgrening mønstre og tetthet av dendrites er involvert i behandler signalene som sammen på dendrittiske feltet3,4. Dendrites har muligheten for justering i utvikling. For eksempel har synaptic signalering en effekt på dendrite organisasjonen somatosensory Nevron under utviklingsfasen og modne nervesystemet5. Etableringen av neuronal tilkobling avhengig av morphogenesis og modning av dendrites. Misdannelse av dendrites er assosiert med svekket neuronal funksjon. Studier har vist at abnormiteten av da neuron morphogenesis kan bidra til etiologies av flere nevrodegenerative sykdommer, inkludert Alzheimers sykdom (AD), Parkinsons sykdom (PD), Huntingtons sykdom (HD), og Lou Gehrig sykdom / Amyotrofisk lateral sklerose (ALS)6,7,8. Synaptiske endringer vises i den tidlige fasen av Annonsen, sammen med nedgang og nedskrivning av Nevron funksjon7,8. Informasjon om hvordan dendrite patologi bidrar til patogenesen i disse nevrodegenerative sykdommer er imidlertid fortsatt flyktig.
Utviklingen av dendrites er regulert av gener som koder et kompleks nettverk av regulatorer, som Wnt familie proteiner9,10, transkripsjonsfaktorer og ligander på cellen overflate reseptorer11,12 . Drosophila da neurons består av fire klasser (Class I, II III, IV), av hvilken klasse IV da neurons har mest komplekse forgrening mønstre og har vært ansatt som en kraftig eksperimentelle system for bedre forståelse morphogenesis13, 14. Under tidlig morphogenesis, overuttrykte og/eller RNAi stanse gener i klasse IV da neurons medføre endringer i forgrening mønstre og dendrite beskjæring13. Det er viktig å utvikle en praktisk metode for kvantitativ analyse av neuronal dendrittiske arborization.
Vi har tidligere vist at stanse Drosophila ortholog av SOX5, Sox102F, førte til kortere dendrites av da neurons og redusert kompleksitet i klasse IV da neurons15. Her presenterer vi prosedyren kvantitativ analyse for neuronal dendrittiske arborization kompleksiteten (NDAC) i Drosophila. Denne protokollen, tilpasset fra tidligere beskrevet metodikken, gir en kort metode for å analysen utviklingen av da sensoriske neurons. Det illustrerer den robuste bildet merking og da Nevron i den tredje skikkelsen larver kroppen veggen16,17,18,19. Det er en verdifull protokoll for forskere som ønsker å undersøke NDAC og utviklingsmessige forskjeller i vivo.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
1. eksperimentelle forberedelse
- Klargjør følgende reagenser: Dulbeccos fosfat bufret saltvann (PBS); Triton X-100; 0,2% PBST (PBS + 0,2% Triton X-100); 32% paraformaldehyde (PFA), utvannet til 4% før bruk; silikon drivverk og herding agent; Antifade montering medium (f.eksforlenge gull); og negl polsk.
- Klargjør følgende utstyr: disseksjon mikroskop, to skarpe tang og et par saks for microdissection, en antall pinner for microdissection, en Petriskål for å gjøre disseksjon parabol, objektglass og coverslips, en AC confocal mikroskop, og datamaskin med Fiji ImageJ programvare installert.
2. Larvene samling
- Kompis UAS-Sox102F-RNAi fluer med UAS-GFP, ppk-GAL4 eller W1118 vill type fluer, henholdsvis. Kultur fluer i standard forhold ved 25 ° C.
- ~ 5-6 dager, samler tredje skikkelsen larver UAS-Sox102F-RNAi / ppk-GAL4, UAS-GFP eller UAS-GFP og ppk-GAL4 / + kontroll med tang for disseksjon.
3. Disseksjon av larver
Merk: Alle prosedyrene i denne delen drives under microdissection mikroskop. Forstørrelsen er opp til etterforskerne. Prøv å justere visningen optimal synet. ~ 4-6 X forstørrelse anbefales.
- Plass en larve på en disseksjon rett laget av silikon base og en vev kultur Petriskål.
- PIN Larven munnen kroken for å tillate dorsal side å møte opp, og deretter feste halen av larve. Plass dorsal side i midten som mulig å avsløre midtlinjen, som vil være opp markøren.
- Legge til 200 µL av PBS Larven å opprettholde kroppsfuktigheten.
- Gjøre et kutt med en saks langs dorsal midtlinjen mellom de to tracheas, fra caudal til rostral. Gjør et lite kutt på hver av de fire hjørnene av Larven kroppen.
- Plass en pin på hver av de fire hjørnene av kroppen så kroppen ligger flatt.
- Fikse Larven kroppen veggen i 4% PFA for 25 min ved romtemperatur.
- Vask i PBST for 5 min. Gjenta to ganger mer.
- Fjerne pinner fra vevet. Deretter overføre vev på et glass lysbilde, dekk med antifade montering medium, og montere med en cover slip. Lufttørke 1t og forsegle kantene med negl polsk.
4. bildebehandling behandling
Merk: Bilder ble tatt med en invertert AC confocal mikroskop system. Brukeren kan fotografere prøven ved hjelp av en 20 X målsetting (anbefales).
- Ta bilder av Z-serien. Åpne dialogboksen "Fange Z-serien" i AC confocal mikroskop programvaren. Fastslå rekkevidden for å fange Z serie bilder.
- Klikk på "Toppen og bunnen"-knappen. Angi øverst og nederst posisjon og inngang verdier til "bunnen:" og "Top:" bokser. Angi "Skritt" i "Fange Z-serien" dialogboksen som 0,5 µm. Klikk på "Kjør nå"-knappen for å Z-serien bildene.
- Lagre fått bildene som *.tiff eller *.nd2.
- Lagre lysbilder i en mørk holder på 4 ° C etter bildebehandling.
5. dendrite evaluering
Merk: GFP protein var co-overexpressed i UAS-GFP og ppk-GAL4 fluer i da nervecellene for GFP fluorescens imaging analyse. Lengde, forgrening og struktur av da nerveceller i tredje skikkelsen Larvene kvantifisert. Analyse parametere inkluderer lengden på dendrites (µm), areal (µm2), antall grener, og strukturen forgrening (%). Figur 1 viser analyseparametrene i detalj.
-
Lengden på Dendrites
Merk: Lengden på dendrites er summen av alle dendrites merket i tracer plugin.- Installere og kjøre Fiji ImageJ (https://fiji.sc/)20 programvare. Deretter dele bilder i separate kanaler, hvis det er flere kanaler av bilder.
Merk: Bildet i denne protokollen har bare en kanal av GFP. - Kjøre "bilde | Stabler | Z prosjektet"å få en Z-projeksjon; et nytt vindu vises med navnet "Z-projeksjon." Klikk "max intensitet" for projeksjon-type, og organisere tall mellom start skive og stopp skive avhengig på individuelle preferanser. Klikk "OK". En Z-projeksjon bildet vises presenterer dendrite projeksjon klart.
- Spor av neurites.
- Velg "Plugins | Segmentering | Enkel Neurites Tracer"i vinduet til å spore dendrites. Finn Nevron soma, og klikk deretter ett punkt på en dendrite fra celle kroppen og et annet punkt på spissen av denne dendrite.
Merk: Programmet vil koble de to punktene med en blå linje. - Trykk "Y" i vinduet plug-in hvis banen er klare; dendrite banen spores til endepunktene på den merkede banen i synlig bilder. Klikk "fullstendig bane" på samme plugin vinduet; segmentet er fullført (figur 2).
Merk: Noen dendrites endte lenger fra startpunktet, der veien var inndelt i mindre segmenter. Segmentene ble kombinert for å gi en fullstendig bane for tracer.
- Velg "Plugins | Segmentering | Enkel Neurites Tracer"i vinduet til å spore dendrites. Finn Nevron soma, og klikk deretter ett punkt på en dendrite fra celle kroppen og et annet punkt på spissen av denne dendrite.
- Når en bane er ferdig, gå tilbake til et nytt punkt der grenene er. Den nye banen kan bygges på; "Alle stier" vinduet boksen viser lengden verdiene av alle banene (Figur 3). Lagre filen sporing og hekles uferdig spor som vist i figur 2.
- Eksportere dendrite lengde dataene ved å klikke, "fil | Eksportere som *.cvs"i vinduet"Plugin". Deretter oppsummere alle veien lengder, og eksportere dataene til en analyse/regneark programvare. (Figur 3).
- Installere og kjøre Fiji ImageJ (https://fiji.sc/)20 programvare. Deretter dele bilder i separate kanaler, hvis det er flere kanaler av bilder.
-
Areal på da Neurons
- Velg Frihånd tegneverktøyet i vinduet 'Fiji ImageJ'. Spore banen, og deretter Koble endepunktene. Menyen "Analysere", velg "Angi mål | Område." Klikk "tiltak" menyen 'Analyser'. Resultatet vises i en ny boks med verdien for området valgte (Figur 4). Kopiere den til den analyse programvaren.
-
Totalt antall av grener og forgrening oppbygning da Neurons
- Beregne antall grener ved å åpne "Analyse" og deretter "Render | Analysere Skeletonized baner"i vinduet plugin av sporing (figur 5).
Merk: Strukturen av arbor er summen av greiner. Banen ble definert mellom celle kroppen og dendrite tips, og en bane kan inneholde flere grener, som de primære arbors er dendrites fra Nevron celle kroppen. De sekundære arbors er grener fra primært og så videre med Tertiær, kvartær og quinary arbors. Strukturen til dendrite ved deles avhengig av nivået av greiner. For eksempel er den primære % antall med totalt antall forgrening, og så videre.
- Beregne antall grener ved å åpne "Analyse" og deretter "Render | Analysere Skeletonized baner"i vinduet plugin av sporing (figur 5).
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
Dendrites av da neurons var merket av co-overexpressing GFP (UAS-GFP, ppk-GAL4) i da nevrale soma og dendrittiske arbors til GFP fluorescens imaging analyse. Morfologi av da Nevron dendrites ble avbildet av en invertert AC confocal mikroskop (figur 2).
Dendrites av da neurons var spores ved hjelp av Fiji ImageJ programvare. Filen ble brukt til å beregne dendrite lengden (Figur 3). Stanse Sox102F i da neurons (N = 21) (UAS-Sox102F-RNAi/ppk-GAL4; UAS-GFP) førte til en betydelig reduksjon i antall dendrites og en kortere lengde for gren med en enklere sammenlignet med kontrollene (N = 20) (UAS-GFP; ppk-GAL4 / +) i tredje skikkelsen Larven (figur 6). Spesielt fluer som Sox102F var forstummet utstilt en reduksjon i gjennomsnittlig dendrite lengde til 127 µm sammenlignet 249 µm i kontroller (p = 0,02), og hadde en mindre gjennomsnittlig arbor areal av 552,476 µm2 sammenlignet 847,571 µm2 i Kontroller (p = 0,04). I tillegg stanse Sox102F resulterte i et mindre antall grener og en enklere strukturen forgrening av arbors med totalt grener av 17 (17.3 ± 6,7), sammenlignet med 28 (28,4 ± 9,5) kontroller (p = 0,04). Student t-tester ble utført for å sammenligne forskjellene mellom gruppene og betydning var satt til 0,05.
Figur 1 : Skjematisk av dendrite analyse av Drosophila da Nevron. Panelet (A) er det opprinnelige bildet av en da Nevron. (B) Dendrite lengden var gjennomsnittet av alle dendrite lengder i alle målt da neurons. (C) areal på da neuron dendrite ble manuelt definert av verktøyet ImageJ frihånd. (D) dette skjematisk viser hvordan å telle antall grener og analysere strukturen forgrening av en da Nevron. 1: primære arbor. 2: sekundær arbor. 3: tertiær arbor. 4: kvartær arbor. Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.
Figur 2 : Representant sporing av dendrites av en da Nevron. En da Nevron ble avbildet med en AC confocal fluorescens mikroskop. (A) første sporingen ble opprettet med utgangspunkt fra celle kroppen og endepunktet for en dendrite ved hjelp av verktøyet plugg/segmentering. Den blå linjen (hvit pil) representerer banen som er definert. Etter å klikke "ja" (rød pil), endres linjen fargen fra blått til rødt. (B) å klikke på "Ferdig bane" vises lilla (C). (A-C) Viser prosessen med sporing en enkelt dendrite; (D) hele sporet bilde. Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.
Figur 3 : Måling av spores baner. Bildet til venstre viser hvordan måle spor banene etter running det "analyse | Måle baner." Eksportere banen lengdeverdier til en regnearkfil og beregne summen av lengden. Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.
Figur 4 : Et eksempel på å definere dendrite areal manuelt. En definert bilde ble oppnådd ved hjelp av verktøyet Frihånd i ImageJ Vindu-menyen (vist med rød pil). Angi målene ved å velge område. Kjøre funksjonen "Tiltak" for å få området som vises i den røde boksen. Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.
Figur 5 : Et eksempel på analyse av forgreninger. Kjør "Analysis_Render | Analysere Skeletonized baner"i vinduet"Segmentering"plugin. Gjengitte stier og deres ble oppnådd ved å velge "gjengi alle banene | Få Sammendrag." Banen ble definert mellom celle kroppen og dendrite tips, og en bane kan inneholde flere grener; for eksempel var de primære arbors dendrites fra Nevron celle kroppen; de sekundære arbors var grener fra primært og så videre med Tertiær, kvartær og quinary arbors. Strukturen til dendrite forgrening ble skilt avhengig av nivået av greiner. For eksempel var primære % antall med totalt antall forgrening, og så videre. Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.
Figur 6 : Representant resultatene av stanse Sox102F i da neurons. Slå av Sox102F i da neurons (UAS-Sox102F-RNAi/UAS-GFP, ppk-GAL4) førte til betydelig redusert dendrite lengde og kortere forgrening med enklere strukturen i tredje skikkelsen Larven sammenlignet med kontrollene. Forskjellene mellom Sox102F-RNAi fluer (UAS-Sox102F-RNAi/UAS-GFP; ppk-GAL4, N = 21) og kontroll (UAS-GFP; ppk-GAL4 / +, N = 20) flyr var på (A) dendrite lengden (B) arbor areal (C) antall grener og (D, E ) strukturen forgrening av da neurons. Student T-test var perfomed for statistisk analyse. * Angir statistisk signifikans (p < 0,05). Feilfeltene er gjennomsnittlig ± standardavvik. Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
Dendrites som innervate overhuden er input områdene av neurons, og deres morphologies bestemmer hvordan informasjon er mottatt og behandlet av individuelle neurons. Utvikling dendrite morfologi gjenspeiler genet modulering av dendrite organisasjon. Drosophila larver da Nevron av perifere nervesystemet er en viktig modell for å studere dendrite utvikling fordi: 1) den funksjonell likheten med pattedyr11,12; 2) fire klasseskille basert på dendrite struktur11,12; og 3) de genetiske faktorene som regulerer morphogenesis. I denne protokollen presenterer vi arbeidsflyten fra Larvene forberedelse bildeanalyser Drosophila da neurons. Metodene beskriver fire viktige parametere for å analysere dendrites i da nerveceller i detalj, som lengden på dendrites, areal, det totale antallet grener og strukturen forgrening. Det avgjørende skrittet var å fjerne så mange vev fra larve kroppen veggen som mulig å fullt avsløre da neurons for bildebehandling og analyser. Det kan være noen korte grener kutte på grunn av det begrensede antallet Z-projeksjon bilder. Denne metoden er relativt måling av dendrites lengde med kontrollene, bør et stort antall bilder for hver da neurons tas øke Dekningsområder Z-projeksjon bilder.
Drosophila klasse IV da neurons har vært fokus for forskning om dendrite arbor morfologi15,21,22,23. Morphogenesis av dendrittiske arbor utvikling kan bli forstyrret ved tap eller gevinst på gen funksjon, viser at da nervecellen utvikling er følsom for genetiske endringer24. Genetiske studier er det viktig å analysere morfologi nøyaktig for å forstå dens innvirkning på da neurons. Klasse IV da neurons er komplekse, men fortsatt tilgjengelig for høykvalitets tenkelig fordi de ligger like under semi-transparent kroppen veggen og gren, nesten utelukkende i to-dimensjonale rommet. Den dynamiske GFP fluorescensen merket da neurons (ppk-GAL4; UAS-GFP) gir en lett visualisert modell for å undersøke neuronal utvikling. Retning av morfologi endring varierer, arbors kan bli overbranched eller forenklet. Her vi kategorisert disse morfologiske endringer av kvantitative parametere, f.eks dendrite lengden, areal, det totale antallet grener og strukturen forgrening av da neurons. Resultatene reflekterer svaret i Sox102F uttrykk regulere neuronal utvikling, som vist i denne studien.
Våre protokollen ble brukt til å vise morfologiske endringen av klasse IV da neurons i fluer i som Drosophila ortholog av SOX5, Sox102F, ble silenced, som angir en viktig funksjonelle rolle for SOX5 i dendrite utvikling og morphogenesis. Wnt proteiner er en familie av utskilles glykoproteiner som har vært innblandet i regulering av dendrite morphogeneis. Wnt2 og Wnt7b fremme da og neuronal kompleksitet9,10. I Wnt kanoniske veien, er denne aktivisering etterfulgt av aktivering av GSK3β, en serine-threonin kinase, som igjen aktiverer β-catenin mediert transkripsjon10,25. Vi har tidligere funnet at stanse SOX5 i SH-SY5Y neuroblastom menneskeceller ført til en betydelig undertrykkelse av Wnt signalnettverk aktivitet og regulert uttrykk for en rekke Wnt gener inkludert en overuttrykte GSK3β 15. Økt uttrykk for GSK3β er tilknyttet hallmark kjennetegner annonse, inkludert hukommelsestap, β-amyloid plager og unormal hyperphosphorylation tau26. Stanse SOX5 økt GSK3β uttrykk, noe som kan indikere en funksjonell kobling mellom SOX5 og GSK3β.
Klasse IV da neurons har mest komplekse dendrites av alle sensoriske neurons. I denne protokollen, har vi utviklet en metode for å analysere kompleksiteten i arbor og grener abstrakte egenskapene til klasse IV da nerveceller i Drosophila basert på konvensjonelt tilgjengelige plugins og programvare. Bilder som ble tatt fra AC confocal mikroskop ble analysert, og plugin oppdeling av en enkel neurite tracer gitt et ideelt verktøy for å spore dendrite grener27,28. I tillegg kan denne kvantifisering metoden for detaljert analyse av dendrite kompleksitet ved å presentere forholdstall på ulike nivåer av forgrening fra soma til de mer fjerntliggende dendrite. Videre er kan denne metoden brukes til å analysere andre klasser av da neurons. For eksempel klasse I da neurons utvide sekundære dendrites til side av kroppen veggen; klasse II har bifurcating grener symmetrisk; og klasse III da neurons har mer komplekse forgreninger og pigger. I sammendraget, har vi gitt protokollen bildebehandling og analyse av klasse IV da neurons for neuronal dendrite analyser i Drosophila.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Disclosures
Forfatterne ikke avsløre.
Acknowledgments
Vi vil gjerne takke William A. Eimer for bildebehandling kundestøtte. Dette arbeidet ble støttet av kur Alzheimers fondet [R.E.T], National Institute of Health [R01AG014713 og R01MH60009 å R.E.T; R03AR063271 og R15EB019704 til Al], og National Science Foundation [NSF1455613 til Al].
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Phosphate buffered saline(PBS) | Gibco Life Sciences | 10010-023 | |
| TritonX-100 | Fisher Scientific | 9002-93-1 | |
| Paraformaldehyde(PFA) | Electron Microscopy Sciences | 15714-S | |
| Sylgard 184 silicone elastomer base and curing agent | Dow Corning Corportation | 3097366-0516;3097358-1004 | |
| ProLong Gold Antifade Mountant | Thermo Fisher Scientific | P36931 | |
| Fingernail polish | CVS | 72180 | |
| Stereo microscope | Nikon | SMZ800 | |
| Confocal microscope | Nikon | Eclipse Ti-E | |
| Petri dish | Falcon | 353001 | |
| Forceps | Dumont | 11255-20 | |
| Scissors | Roboz Surgical Instrument Co | RS-5611 | |
| Insect Pins | Roboz Surgical Instrument Co | RS-6082-25 | |
| Microscope slides and cover slips | Fisher Scientific | 15-188-52 |
References
- Wassle, H., Boycott, B. B. Functional architecture of the mammalian retina. Physiol Rev. 71 (2), 447-480 (1991).
- MacNeil, M. A., Masland, R. H. Extreme diversity among amacrine cells: implications for function. Neuron. 20 (5), 971-982 (1998).
- Losonczy, A., Makara, J. K., Magee, J. C. Compartmentalized dendritic plasticity and input feature storage in neurons. Nature. 452 (7186), 436-441 (2008).
- Spruston, N. Pyramidal neurons: dendritic structure and synaptic integration. Nat Rev Neurosci. 9 (3), 206-221 (2008).
- Jaworski, J., et al. Dynamic microtubules regulate dendritic spine morphology and synaptic plasticity. Neuron. 61 (1), 85-100 (2009).
- Kweon, J. H., Kim, S., Lee, S. B. The cellular basis of dendrite pathology in neurodegenerative diseases. BMB Rep. 50 (1), 5-11 (2016).
- Baloyannis, S. J. Dendritic pathology in Alzheimer's disease. J Neurol Sci. 283 (1-2), 153-157 (2009).
- Masliah, E., Terry, R. D., Alford, M., DeTeresa, R., Hansen, L. A. Cortical and subcortical patterns of synaptophysinlike immunoreactivity in Alzheimer's disease. Am J Pathol. 138 (1), 235-246 (1991).
- Wayman, G. A., et al. Activity-dependent dendritic arborization mediated by CaM-kinase I activation and enhanced CREB-dependent transcription of Wnt-2. Neuron. 50 (6), 897-909 (2006).
- Rosso, S. B., Sussman, D., Wynshaw-Boris, A., Salinas, P. C. Wnt signaling through Dishevelled, Rac and JNK regulates dendritic development. Nat Neurosci. 8 (1), 34-42 (2005).
- Grueber, W. B., Jan, L. Y., Jan, Y. N. Different levels of the homeodomain protein cut regulate distinct dendrite branching patterns of Drosophila multidendritic neurons. Cell. 112 (6), 805-818 (2003).
- Sugimura, K., Satoh, D., Estes, P., Crews, S., Uemura, T. Development of morphological diversity of dendrites in Drosophila by the BTB-zinc finger protein abrupt. Neuron. 43 (6), 809-822 (2004).
- Jan, Y. N., Jan, L. Y. Branching out: mechanisms of dendritic arborization. Nat Rev Neurosci. 11 (5), 316-328 (2010).
- Sears, J. C., Broihier, H. T. FoxO regulates microtubule dynamics and polarity to promote dendrite branching in Drosophila sensory neurons. Dev Biol. 418 (1), 40-54 (2016).
- Li, A., et al. Silencing of the Drosophila ortholog of SOX5 leads to abnormal neuronal development and behavioral impairment. Hum Mol Genet. 26 (8), 1472-1482 (2017).
- Misra, M., et al. A Genome-Wide Screen for Dendritically Localized RNAs Identifies Genes Required for Dendrite Morphogenesis. G3 (Bethesda). 6 (8), 2397-2405 (2016).
- Emoto, K., et al. Control of dendritic branching and tiling by the Tricornered-kinase/Furry signaling pathway in Drosophila sensory neurons. Cell. 119 (2), 245-256 (2004).
- Olesnicky, E. C., et al. Extensive use of RNA-binding proteins in Drosophila sensory neuron dendrite morphogenesis. G3 (Bethesda). 4 (2), 297-306 (2014).
- Parrish, J. Z., Xu, P., Kim, C. C., Jan, L. Y., Jan, Y. N. The microRNA bantam functions in epithelial cells to regulate scaling growth of dendrite arbors in drosophila sensory neurons. Neuron. 63 (6), 788-802 (2009).
- Schindelin, J., et al. Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nat Methods. 9 (7), 676-682 (2012).
- Corty, M. M., Matthews, B. J., Grueber, W. B. Molecules and mechanisms of dendrite development in Drosophila. Development. 136 (7), 1049-1061 (2009).
- Jinushi-Nakao, S., et al. Knot/Collier and cut control different aspects of dendrite cytoskeleton and synergize to define final arbor shape. Neuron. 56 (6), 963-978 (2007).
- Crozatier, M., Vincent, A. Control of multidendritic neuron differentiation in Drosophila: the role of Collier. Dev Biol. 315 (1), 232-242 (2008).
- Copf, T. Importance of gene dosage in controlling dendritic arbor formation during development. Eur J Neurosci. 42 (6), 2234-2249 (2015).
- Rosso, S. B., Inestrosa, N. C. WNT signaling in neuronal maturation and synaptogenesis. Front Cell Neurosci. 7, 103 (2013).
- Engel, T., Hernandez, F., Avila, J., Lucas, J. J. Full reversal of Alzheimer's disease-like phenotype in a mouse model with conditional overexpression of glycogen synthase kinase-3. J Neurosci. 26 (19), 5083-5090 (2006).
- Longair, M. H., Baker, D. A., Armstrong, J. D. Simple Neurite Tracer: open source software for reconstruction, visualization and analysis of neuronal processes. Bioinformatics. 27 (17), 2453-2454 (2011).
- Pool, M., Thiemann, J., Bar-Or, A., Fournier, A. E. NeuriteTracer: a novel ImageJ plugin for automated quantification of neurite outgrowth. J Neurosci Methods. 168 (1), 134-139 (2008).
