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방법 논문

Oncogene 의존에 c Fos의 역할 및 Dusp1를 평가 하기 위한 방법

8K 조회수

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DOI:

10.3791/58194

⸱

2019년 1월 7일

 ,  , 

이 논문에서

요약

여기, 우리는 생체 외에서 그리고 vivo에서 유전자 및 인간 답게 된 마우스 모델을 사용 하 여 백혈병에서 마약 대상으로 c Fos와 Dusp1의 유전과 화학 유효성 검사에 대 한 프로토콜을 설명 합니다. 이 메서드는 유전 유효성 검사 및 치료 개발에 대 한 모든 대상에 적용할 수 있습니다.

초록

만성 골수성 백혈병 (CML) 치료에 tyrosine kinase 억제제 (TKIs)의 데모는 암 치료에 새로운 시대를 예 고 했다. 그러나, 세포의 작은 인구에 반응 하지 않는 TKI 치료 결과 최소 잔여 질병 (MRD); 이 세포를 근절 하기 위해 심지어는 가장 강력한 TKIs 실패. 이러한 MRD 세포 치료에 저항을 개발 하는 저수지 역할을 합니다. 왜 TKI 치료 MRD 셀에 대 한 효과 알 수 없습니다. TKI 치료 동안 MRD 세포의 생존을 지 원하는에 연루는 성장 인자 신호 하지만 기계적 이해 부족. 최근 연구는 높은 c-Fos와 Dusp1 집중 결과로 종양 표현과 MRD 셀에 신호 하는 성장 인자 중재 TKI 저항을 설명 했다. C-Fos와 Dusp1의 유전과 화학 억제 CML를 TKIs에 절 묘하게 과민 한 렌더링 하 고 두 유전자 및 인간 답게 된 마우스 모델에 CML을 치료. 우리는 TKI-민감하고-내성 세포에서 여러 microarrays를 사용 하 여이 대상 유전자 발견. 여기, 우리는 생체 외에서 그리고 vivo에서 마우스 모델을 사용 하 여 대상 유효성 검사 메서드를 제공 합니다. 이러한 메서드는 쉽게 유전자 유효성 검사 및 치료 개발에 대 한 모든 대상에 적용할 수 있습니다.

서론

BCR-ABL1 퓨전 oncogene의 제정 티로신 키 니 아 제 활동 하면 CML, 작은 분자 억제제 여 키 니 아 제 활동에 근거를 제공 한다. CML 환자 치료에 TKIs의 성공 타겟된 치료1,2의 개념을 혁명. 그 후, 안티 니 정밀 의학으로 치료는 단단한 종양을 포함 한 다른 여러 악성 종양에 대 한 개발 되었다. 지금까지, 30 개 이상의 kinase 억제제는 다양 한 악성 종양 치료를 위한 미국 국가 FDA에 의해 승인 되었습니다. TKI 치료 질병 억제에 매우 효과적 이다, 그러나 그것은 치료입니다. 게다가, 암 세포의 작은 인구는 치료 기간 동안 지속: MRD3,,45. 완전 한 사 함을 보여도 환자가 결국 결과에 재발 하지 않을 경우 지속적으로 억제 MRD 남아 있습니다. 그러므로, MRD 세포의 박멸 내구성 또는 치료 응답을 달성 하기 위해 필요 합니다. CML은 발암, 합리적인 대상 감독 치료제, 질병의 진행, 그리고 약물 저항 메커니즘, 정밀 의학의 개념을 정의 하기 위한 귀중 한 패러다임을 나타냅니....

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프로토콜

모든 동물 실험 기관 동물 관리 및 사용 위원회 (IACUC)에서 신시내티 아동 병원 의료 센터 (CCHMC)의 지침에 따라 실시 했다. 인간의 표본 (일반 BM 그리고 CML에서 (p210-BCR-ABL +) 백혈병) 기관 검토 위원회 승인 프로토콜을 통해 얻은 했다 (기관 검토 위원회: Federalwide 보증 #00002988 신시내티 아동 병원 의료 센터) 및 CCHMC, 신시내티 대학에서 기부자 정보 동의.

1. 실시간 정량 분석

  1. BaF3 셀 인터 루 킨-3 (IL-3)의 원천으로 10 %FBS 10% 지출 WEHI 문화 매체와 보충 RPMI에 성장에서 총 RNA 격리 합니다.
  2. 로그 단계 (99% 살아) 대우 (IL-3 및 imatinib) 뿐만 아니라 치료 샘플에서 세포를 수확 하 고 3 분 435 x g 에서 원심. 건강과 세포의 성장 단계는 그들의 유전자 식 프로필 극적으로 변경할 수 있습니다 중요 합니다.
  3. 총 RNA22를 정화 하 여 RNA를 분리. 계량 총 RNA; 그런 다음, DNase 치료23주제. 동일한 양의 RNA DNA-무료 변환 (2 µ g) cDNA 역전사<....

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결과

Oncogene 중독 TKIs의 치료 효능에 연루 되었습니다. 그러나, oncogene 의존 운전 메커니즘 이해 되지 않는다. 우리는 중독을 계획에 관련 된 유전자 구성 요소를 식별 하기 위해 여러 편견된 유전자 식 분석을 수행. 이러한 분석 3 유전자, c Fos, Dusp1, 및 Zfp36, 암 세포는 생존을 위한 종양 신호에 의존 하 고, 따라서, TKI 치료를 구분 하지 않습니다의 upregulation를 공개 했다. ShRNA 중재 최저에 의해 c-Fos와 Dusp1의 downregulation는 달리 TKI 방지에서 약물 감도 복원 하는 충분 한 세포.

백혈병의 치료 대상으로 c Fos와 Dusp1의 역할의 유효성을 검사 하려면 그들의 overexpression BCR ABL1 oncogene를 표현 하는 BaF3 세포를 사용 하 여 처음 확인 됐다. .......

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토론

암 세포의 대량에 대 한 치료 응답 TKI은 티로신 키 니 아 제 oncoprotein 신호는 종양은 중독의 봉쇄에 의해 중재 됩니다. 그러나, 상대적으로 작은 MRD에 기여 하는 암 세포의 소수 oncogene 의존과 치료4를 탈출 하는 방법에 대 한 알려져 있다. 최근 연구는 백혈병에 단단한 기관 종양 약물 저항을 중재 성장 인자 신호 밝혀. 이 다양 한 분자 메커니즘 본질적인 저항10,,1112기초 수 있습니다 제안 합니다. 하는 메커니즘을 이해 하 고 유전자 치료 개발을 위한 목표를 식별, 우리는 포괄적인 전체-게놈 식 프로필 마우스 (BaF3)과 인간 (K562) 셀을 사용 하 여 수행 합니다. 우리, 기본 골 수 샘플은 상당히 이질적인, 그들은 것입니다 마스크 관련 유전자/대상의 신원을 의심 때문에 leukem.......

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공개 사항

저자는 공개 없다.

감사의 글

저자 BaF3 및 WEHI 세포를 제공 하기 위한 G. Q. 데일리 감사 이며 T. Reya MSCV-BCR-ABL-Ires-YFP에 대 한 구성. 저자는 M. 캐롤 감사 CML 폭발 위기에서 환자 샘플을 제공 합니다. 이 연구 NCI (1RO1CA155091), 백혈병 연구 재단 및 V 재단, 그리고 NHLBI (R21HL114074-01)에서 석사를 교부 금에 의해 지원 되었다.

....

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재료

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이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
Biological Materials
RPMICellgro (corning)15-040-CV
DMEMCellgro (corning)15-013-CV
IMDMCellgro (corning)15-016-CVR
RetroNectin 재조합 인간 피브로넥틴 단편TakaraT100B
MethoCult GF M3434 (마우스 CFU용 메틸셀룰로오스)줄기세포3434
MethoCult H4434 Classic (인간 CFU용 메틸셀룰로오스)줄기세포4434
4-하이드록시타목시펜시그마H6278
재조합 쥐 SCFProspecCYT-275
재조합 쥐 Flt3-LigandProspecCYT-340
재조합 쥐 IL-6ProspecCYT-350
재조합 쥐 IL-7Peprotech217-17
DFCLKT Laboratories Inc.D3420
BCIChemzon ScientificNZ-06-195
ImatinibLC LaboratoryI-5508
커큐민시그마458-37-7
NDGA시그마500-38-9
Penn/StrepCellgro (corning)30-002-CI
FBS애틀랜타 생물학적S11150
트립신 EDTA 1xCellgro (corning)25-052-CI
1x PBSCellgro (corning)21-040-CV
L-글루타민Cellgro (corning)25-005-CL5 mg/mL 물
스톡 PuromycinGibco (life technologies)A11138-03
HEPESSigmaH7006
Na2HPO4.7H2O시그마S9390
프로타민 설페이트시그마P33695 mg/mL 물
스톡 Trypan Blue 용액(0.4%)SigmaT8154
DMSOCellgro(corning)25-950-CQC
WST-1Roche11644807001
0.45 &뮤; M 아크로 디스크 필터PALL2016-10
70 μ m nylon cell starinerBecton Dickinson352350
FICOL (Histopaque 1083) (polysucrose)Simga1083
PBSCorning21040CV
LS ColumnsMiltenyi130-042-401
프로테아제 억제제 칵테일RocheCO-RO
포스파타제 억제제 칵테일 2SigmaP5762
니트로쿨룰로오스 멤브레인Bio-Rad1620115
SuperSignal West Dura Extended Duration Substrate ( chemiluminiscence substrate)Thermo Scientific34075
CD5eBioscience13-0051-82
CD11beBioscience13-0112-75
CD45R (B220)BD biosciences553092
CD45.1-FITCeBioscience11-0453-85
CD45.2-PEeBioscience12-0454-83
hCD45-FITCBD Biosciences555482
Anti-Biotin-FITCMiltenyi130-090-857 
Anti-7-4eBioscienceMA5-16539
Anti-Gr-1 (Ly-6G/c)eBioscience13-5931-82
Anti-Ter-119eBioscience13-5921-75
Ly-6 A/E (Sca1) PE Cy7BD 
CD117 APC BD 
BD Pharm LyseBD 
BD Cytofix/Cytoperm (고정 및 투과화 솔루션)BD 
BD 펌/워시  (Phospho Flow를 위한 투과화 및 세척 용액)BD 
phospho p38세포 신호 기술4511S
총 p38세포 신호 기술9212
마우스 IgG 제어BD 
Alexa Flour 488 활용 InvitrogenA-11034
염화칼슘InvitrogenK278001
2x HBSInvitrogenK278002
EDTAAmbionAM9261
BSASigmaA7906
혈액 모세관Fisher22-260-950
혈액 채취 튜브Giene Bio-One450480
신생아 송아지 혈청애틀랜타 생물학적S11295
ErythropoieinAmgen5513-267-10
인간 SCFProspecCYT-255
인간 IL-3Prospec CYT-210
G-SCFProspecCYT-220
GM-CSFProspecCYT-221
MyeloCult (LTCIC 분석을 위한 미디어)줄기세포 기술5100
하이드로코르티손 나트륨 헤미숙시네이줄기세포 기술7904
MEM 알파Gibco12561-056
1/2 cc Lo-Dose u-100 인슐린 주사기 28 G1/2Becton Dickinson329461
Mortor pestleCoor tek 60316 및 60317
Isoflorane (Isothesia TM)Butler Schien29405
SOCNew England BiolabsB90920s
AmpicillinSigmaA0166100 mg/mL stock in water
Bacto 한천(한천)Difco214050
Terrificbroth Becton Dickinson243820
AgaroseGenemateE-3119-500
독시사이클린 차우TestDiet.com52662수정된 RMH1500, 오토클레이브 가능한 5LK8  0.0625% 독시사이클린 
타목시펜시그마T5648
요오도니트로테트라졸륨 클로라이드 SigmaI10406
Kits
Dneasy 혈액 및 조직 키트Qiagen69506
GoTaq Green (녹색 로딩 염료가 함유된 taq 중합효소)PromegaM1722
miRNeasy 미니 키트  (RNA 분리 키트)Qiagen217084
DNA Free Dnase Kit(RT PCR을 위한 DNAse 처리)Ambion, Life TechnologiesAM1906
Superscript III First Strand Synthesis(cDNA 합성을 위한 역전사 효소)Invitrogen18080051
SYBR Green(qPCR을 위한 녹색 interchalating dye와 taq 중합효소 혼합물)Bio-Rad1725270
CD117 MicroBead KitMiltenyi130-091-224
인간 장기 배양 시작 세포 분석Stemp Cell Technologies
Instruments
NAPCO 시리즈 8000 WJ CO2 인큐베이터Thermo scientific
스윙 버킷 로터 cetrifuge 5810REppendorf
TC-10 자동 세포 계수기Bio-RAD
C-1000 Thermal cyclerBio-RAD
Mastercycler, Real Plex 2Eppendorf
ChemiDoc Imaging System(겔 및 웨스턴 블롯용 이미징 시스템)Bio-RAD17001401
Hemavet(볼드 카운터)Drew-Scientific
LSR II(FACS 분석기)BD 
Fortessa I (FACS 분석기)BD 
FACSAriaII (FACS 분류기)BD 
자석 스탠드Miltenyi
Irradiator J.L. Shepherd and Associates, San Fernando CAMark I Model 68Asource Cs 137
Mice
ROSACreERT2Jackson Laboratory
Scl-tTA 클라우디아 휘트너 박사 s 랩
보이J CCHMC
C57Bl/6 CCHMC의 Jackson Laboratory
NSGS마우스 코어 시설
사내에서
ROSACreERT2/c-Fosfl/fl내에서
Cells
BaF3George Daley, Harvard Medical School, Boston
WEHIGift from George Daley, Harvard Medical School, Boston
CML-CD34+ 및 Normal CD34+ cells신시내티
558612553356555899554714554723554121트 , , , 의 마우스 코어 시설; ROSACreERT2/c-FosDusp1 제작 사 제작 대학교 대학 병원

참고문헌

  1. Daley, G. Q., Van Etten, R. A., Baltimore, D. Induction of chronic myelogenous leukemia in mice by the P210bcr/abl gene of the Philadelphia chromosome. Science. 247, 824-830 (1990).
  2. Druker, B. J., et al. E....

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