双组分GAL4-UAS系统是一种多功能工具,可用于在可控的时空条件下调控基因表达,从而在Anopheles gambiae中进行功能性遗传学分析。本文所述该系统的使用方法包括半标准化的克隆策略、基于荧光蛋白标记对蛹进行性别鉴定和筛选,以及胚胎固定。
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双组分GAL4-UAS系统是一种多功能工具,可用于在可控的时空条件下调控基因表达,从而在Anopheles gambiae中进行功能性遗传学分析。本文所述该系统的使用方法包括半标准化的克隆策略、基于荧光蛋白标记对蛹进行性别鉴定和筛选,以及胚胎固定。
双组分 GAL4-UAS 系统是一种多功能且强大的功能遗传学分析工具。该系统的核心在于将转基因“驱动”品系与转基因“响应”品系进行杂交:驱动品系以组织特异性方式表达酵母转录因子 GAL4,而响应品系携带一个候选基因或 RNA 干扰结构,其表达受上游激活序列(UAS)控制,而 UAS 可与 GAL4 结合。在杂交后代中,目标基因或基因沉默结构便按照预设的时空模式表达,从而可对所产生的表型进行检测,并据此推断基因功能。该双元系统使实验设计具有高度灵活性,能够在多种组织特异性表达模式下筛选转基因表达所引发的表型,即使这些表型伴随严重的适合度代价亦可进行。我们已将此系统应用于非洲主要疟疾传播媒介——Anopheles gambiae。
本文介绍了一些在 GAL4-UAS 分析过程中常用的实验方法。我们描述了已建立的冈比亚按蚊(An. gambiae)GAL4-UAS 品系,以及用于基因上调和 RNAi 沉默的新效应子载体的克隆方法。我们提供了按蚊蛹期性别鉴定的逐步操作指南,以建立遗传杂交,并包括对后代进行筛选,以追踪标记驱动子和效应子插入的荧光基因标记的遗传情况。此外,我们还介绍了一种用于透明化冈比亚按蚊(An. gambiae)胚胎以研究胚胎发育的实验方案。最后,我们提出了通过 CRISPR/Cas9 技术将 GAL4 插入目标基因下游以构建驱动子品系的潜在改进方法。
双组分GAL4-UAS系统是昆虫模式生物Drosophila melanogaster1,2,3中基因功能鉴定的主要工具。使用GAL4-UAS系统时,将携带酵母转录因子GAL4的转基因驱动品系(其表达受特定调控序列控制)与响应品系(携带由GAL4识别的上游激活序列(UAS)控制的目的基因或RNA干扰(RNAi)构建体)进行杂交。该杂交后代中,目的转基因的表达模式由驱动GAL4表达的启动子决定,呈现特定的时空表达特征(图1)。通过分析驱动品系与响应品系杂交后代所表现出的表型,可揭示候选基因的功能。尽管D. melanogaster已被用于研究其他生物的基因4,5,6,7,但目前GAL4-UAS系统已拓展应用于具有医学和农业重要性的其他昆虫物种,以实现对目标物种的直接功能分析8,9,10,11,12,13,14。
在非洲疟疾按蚊Anopheles gambiae中,GAL4-UAS系统最初通过细胞系共转染实验进行了测试9。研究人员对多种构建体在不同成对组合中的效率进行了检测,发现当与一系列GAL4驱动子联合使用时,含有14个串联重复UAS并添加一个小的人工内含子(UAS-14i)的构建体表现出最广泛的激活潜力。为验证该系统在体内的功能,随后利用PiggyBac转化技术8构建了两个独立的转基因An. gambiae品系:一个驱动品系,其GAL4由中肠特异性启动子驱动;另一个响应品系,其萤光素酶和增强型黄色荧光蛋白(eYFP)基因均受UAS序列调控。子代中肠特异性的萤光素酶活性和荧光信号表明,该系统在Anopheles中具有高效性。此后,研究人员已构建出在其他与媒介能力及杀虫剂抗性相关的重要组织中表达转基因的驱动品系,包括oenocytes15和血细胞16,以及接近泛组织表达的品系10。同时,还构建了大量UAS响应品系,用于检测参与代谢与隔离介导的杀虫剂抗性、表皮碳氢化合物合成的基因,并对不同细胞和组织类型进行荧光标记(表1)。对于响应品系,目前通过ΦC31介导的重组盒交换技术实现转基因的定点整合17,18,以固定UAS调控基因的基因组环境。该方法可消除基因组插入位点对表达水平的影响,从而更准确地比较不同候选基因的表型效应。
目前已创建的响应品系旨在通过RNA干扰(RNAi)实现外源基因的高水平表达或降低特定基因的表达。 通常将cDNA克隆与UAS序列融合以构建合适的表达质粒,但若全基因组序列长度适合克隆,也可使用。为构建沉默结构,我们采用了三种不同方法获得可形成发夹双链RNA(dsRNA)并诱导RNAi的串联反向序列,包括融合PCR、不对称PCR以及发夹结构的商业合成。这些方法的共同点是在反向重复序列之间插入一段内含子序列,以提高克隆的稳定性。现已开发出可插入目的基因或RNAi结构的响应质粒15。这些质粒还含有进行RMCE所必需的ΦC31 attB位点(详见Adolfi在JoVE上发表的配套论文,该论文详细描述了RMCE技术)。本文包含了在选择用于过表达的插入序列时所需关键步骤的操作方案。此外,还描述并图示了两种构建RNAi发夹结构的实验方案。
在创建新品系时,鉴定稀有的转基因个体至关重要,这是建立和维持转基因品系的基础。对于GAL4-UAS系统而言,最关键的是要能够区分应答子(responder)和驱动子(driver)品系,以便设计杂交实验,并鉴定出同时携带两种转基因的后代个体。这一目标通过在驱动子和应答子载体上连接不同的显性可筛选标记基因来实现。最常用的是荧光标记基因,它们可通过光学滤光片清晰区分(例如 eYFP、eCFP、dsRed)。标记基因的表达需具有已知且稳定的时空模式,这有助于更容易地识别异常情况和污染。荧光标记基因的表达通常由合成的3xP3启动子调控,该启动子在An. gambiae发育的各个阶段均特异性地驱动眼部和腹神经节的表达19。本文所描述的所有转化质粒均包含由3xP3调控的荧光标记基因。此处提供了一套详细的实验方案,用于筛选荧光标记的An. gambiae蛹期GAL4-UAS品系。
GAL4-UAS 系统的一个关键要素是必须将带有不同标记的驱动系和响应系进行杂交。为此,在交配前需将各品系的雄性和雌性个体分开。成虫可通过外观轻易区分,但在建立遗传杂交时,为确保交配尚未发生,宜在成虫羽化前即进行性别分离。雄性和雌性之间普遍存在体型差异 An. gambiae 蛹的形态变异过大,无法作为高效且可靠的性别鉴定方法20. 相反,外生殖器存在明显的形态学差异,可作为性别鉴定的可靠依据 An. gambiae. 本文中,我们描述了一种可靠的性别鉴定方法 An. gambiae 蛹以建立适当的杂交组合。

图1 —在冈比亚按蚊中使用双组分GAL4-UAS系统流程的示意图。(A)展示了一个示例载体(pSL-attB-UAS14-gyp[3xp3-eYFP])的主要组成部分,详细标明了多克隆位点内可用于插入目标基因发夹结构或编码序列的限制性酶切位点(EcoRI、NheI、XhoI 和 NcoI)。图中还展示了整合位点品系的结构。(B)展示了杂交步骤,使用驱动品系的雄性个体(携带由目标启动子驱动的GAL4以及由3xP3启动子驱动的eCFP)与响应品系的雌性个体(携带由UAS启动子控制的目标基因或发夹结构,以及由3xP3启动子控制的eYFP标记)进行交配。(C)图示说明了在B步骤杂交后代中,GAL4驱动目标基因表达的情况,以及部分常规检测的表型列表。缩写:多克隆位点(MCS)、重组酶介导的盒式交换(RMCE)、上游激活序列(UAS)、增强型黄色荧光蛋白(eYFP)、增强型青色荧光蛋白(eCFP)。请点击此处查看此图的放大版本。
正是杂交的使用赋予了GAL4-UAS系统双组分的特性,使其相较于更为线性的方法具有显著优势。例如,通过该系统可评估的驱动系与响应系组合数量远超每种启动子/基因组合均需独立构建并维持一个转基因品系的线性方法所能实现的范围。更重要的是,该系统使得研究人员能够分析那些在表达受到干扰时导致致死或不育表型的基因,而这类基因在线性系统中难以构建和维持。此类致死表型可能在发育的各个阶段出现,具体取决于基因功能及其时空表达模式,但最常在胚胎发育期间被观察到。要观察蚊子胚胎的发育过程,需去除覆盖在卵表面的不透明卵壳。我们参照Trpiš(1970)21和Kaiser等(2014)22所描述的方法,介绍了我们在保持胚胎结构完整性的前提下进行固定以及漂白以去除内卵壳、从而实现显微观察与成像的实验方案。
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1. UAS 载体的设计与构建

图2 —通过两种方法构建用于插入pSL-attB-UAS14-gyp[3xP3-eYFP]载体的RNAi表达载体的示意图:(A)单步不对称PCR(改编自Xiao Y H 等,2006);(B)多步融合PCR。请点击此处查看该图的放大版本。
2. An. gambiae 蛹的筛选

图3 — 在3xP3启动子驱动下表达荧光标记的冈比亚按蚊蛹:(A) eYFP,(B) dsRed 和 (C) eCFP。 放大倍数:A=16X,B、C=20X。

图4 —冈比亚按蚊蛹的性别鉴定。 单个蛹显示其外部生殖器:(A)雌性,(B)雄性,以及(C)因幼虫外骨骼未完全脱落而难以明确识别的个体。下方为放大图像,突出显示外部生殖器。图中带有♀(雌性)和♂(雄性)标记的蛹分别显示:(D)约50%蛹体浸没在水中,以及(E)完全去除水分后的情况,以突出外部生殖器可视化的难易差异。放大倍数:A、B、C = 40×,D、E = 30×。 请点击此处查看该图的高清版本。
3. An. gambiae 胚胎透明化方案

图 5 — 卵产装置示例:(A)拆解状态以突出显示各组件,(B)组装完成状态。 请点击此处查看本图的放大版本。
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3xP3 启动子驱动的 eYFP、dsRed 和 eCFP 表达可在An. gambiae蛹的眼部和腹神经节中产生可靠且易于区分的标记,从而准确识别携带这些标记基因的个体(图3)。雄性和雌性外部生殖器在形态上的差异可用于性别鉴定,图4展示了这一特征及一个无法识别性别的蛹样例。去除蛹体表面所有水分会增加性别鉴定难度,因为肛门桨状结构会遮挡生殖器的观察(图4D、E)。双组分GAL4-UAS系统可实现基因表达的时空特异性调控,通过将泛表达驱动系(图6A、C)和油胞细胞特异性驱动系(图6B、D)与响应子品系UAS-mCD8:mCherry10杂交,可直观观察到基因表达...
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了解蚊子基因功能对于开发控制 Anopheles 并影响疟疾传播的新方法至关重要。本文所述的GAL4-UAS系统是一种多功能且强大的候选基因功能分析工具,迄今为止,我们已利用该系统研究了杀虫剂抗性的遗传基础17 以及表皮碳氢化合物的产生15,23,同时还实现了对不同蚊子细胞群体的荧光标记8。目前,响应子构建体主要通过限制性内切酶克隆方法插入含有多个克隆位点的质粒中,该位点位于UAS下游(图1、表1)。然而,由于这些构建体具有模块化特征,包含多个元件(attB位点、 3xP3-YFP和gypsy绝缘子序列),因此可采用更为现代的技术来构建新的响应子质粒。通常,过表达序列可通过PCR从cDNA或gDNA中扩增获得,但商业合成有时可减少构建新载体所需的人力和时间。在...
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作者无任何利益冲突需要披露。
我们衷心感谢LSTM和IVCC(Adriana Adolfi)、BBSRC(新研究者奖,AL)、MRC(BCP博士生奖学金:MR/P016197/1)以及Wellcome(Sir Henry Wellcome博士后奖学金,LG:215894/Z/19/Z)提供的资助,这些资助项目均在提案中纳入了Gal4UAS分析。
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