Genom Karşılaştırmaları Yoluyla Evrimsel İlişkiler

Linnaeus'un geleneksel organizma sınıflandırması, organizmanın fiziksel özelliklerindeki farklılıklara dayanan kladistik olarak adlandırılır ve bilim adamları, bu bölünmelerin ve grupların görsel temsillerini vermek için yaygın olarak dendrogram adı verilen ağaçlar inşa etmişlerdir.

Bununla birlikte, modern teknolojinin ortaya çıkmasıyla birlikte, DNA'yı karşılaştırmak bu tür ağaçları inşa etmenin yaygın bir yolu haline geldi. Dizi verileri, insanlar gibi tek bir türde incelenirse, genetik kodda çok yüksek derecede benzerlik vardır, yaklaşık% 99.9 civarındadır, çünkü bir organizmanın genetik kodu ebeveynden yavruya geçer.

İnsanlar ayrıca bu DNA kodunun çoğunu şempanzeler ve fareler gibi diğer türlerle paylaşırlar, ancak insan DNA'sı ile onlarınki arasındaki genel benzerlik derecesi önemli ölçüde farklıdır. Bu, genetik kodları arasındaki benzerliklere veya farklılıklara dayalı olarak tür grupları için ağaçların oluşturulabileceği anlamına gelir. İstatistik, matematiksel modelleme ve bilgisayar bilimini birleştiren bu analiz alanı, biyoinformatik olarak bilinen bir alanın parçasıdır.

Bu ağaçları oluşturmak için kullanılan genetik veriler birçok şekilde olabilir. Örneğin, moleküler filogenide bir veya iki anahtar genetik lokus sıralanır ve daha sonra ilgilenilen türler arasında karşılaştırılır.

Bununla birlikte, bireysel genler veya genetik bölgeler, farklı türlerde çok farklı oranlarda evrimleşebildiğinden veya hatta yatay gen transferi yoluyla farklı türler arasında değiş tokuş edilebildiğinden, bu küçük ölçekli genetik araştırmalar her zaman doğru filogeniler sağlayamayabilir.

Bakteriyel filogenilerde, çok lokuslu dizi tiplemesi veya MLST adı verilen bir teknik sıklıkla kullanılır. Bu yöntem, birden fazla genetik bölge boyunca diziler üretir - tipik olarak hücresel işlev için gerekli olan ve bu nedenle türler arasında korunan temizlik genleri.

Bununla birlikte, temizlik genleri yavaş yavaş gelişebilir, bu nedenle MLST ile gerinim düzeyinde çözünürlük elde etmek zordur.

Son olarak, tüm genom dizilimi veya WGS, evrimsel ilişkileri aydınlatmak için kullanılabilir. Bu yöntem, ökaryotlarda mitokondriyal DNA ve hatta bitkilerde kloroplast DNA dahil olmak üzere bir organizmanın tüm genomunun dizilenmesini içerir.

WGS, tüm genomları ince ölçekli çözünürlükte hizalar ve mutasyonları veya türe özgü belirteçleri, dallanma noktalarını ve hatta tek bir türün suşlarını veya popülasyonlarını tanımlayabilir. Bu tür ince ayrıntılar, daha hedefli sıralamada gözden kaçabilir.