Yöntem makalesi

Yüzmeye Bağlı Felç (SWIP) Testi: Dopamin Aracılı Hareketi Ölçmek İçin Bir Yöntem C. elegans

30 Nisan 2023

Bu makalede

Özet

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Kaynak: Kudumala, S., et al. Caenorhabditis elegans'ta Dopamin Sinyalini Değerlendirmek İçin Yüzmeye Bağlı Felç. J. Vis. Uzm.(2019).

Burada, yüzme gibi şiddetli hareketler sırasında ortaya çıkan davranışsal bir C. elegans fenotipi olan SWIP'yi ölçmek için bir test sunuyoruz. Örnek protokol hem manuel hem de otomatik analiz yaklaşımlarını tartışır.

Protokol

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Aşağıdaki protokol, Kudumala ve ark., Caenorhabditis elegans'ta Dopamin Sinyalini Değerlendirmek için Yüzmeye Bağlı Felç, J. Vis. Uzm.(2019).

SWIP

NOT: AMPH ile tedavi edilen vahşi tip solucanlarda SWIP'yi değerlendirmenin manuel yöntemini açıklıyoruz. Ayrıca, daha önce Hardaway ve arkadaşları tarafından tanımlanan otomatik bir solucan izleyici ve bir izleme yazılımı kullanarak solucanların izlenmesini ve solucan kinetiğinin daha fazla analizini kısaca tartışıyoruz.

  1. SWIP'yi test etmek için manuel yöntem
    1. 40 μL 200 mOsm/L sükroz çözeltisini, 0.5 mM AMPH ile veya 0.5 mM AMPH olmadan bir cam spot plakaya koyun. Stereoskopun altında, bir kirpik veya platin pena ile 8-10 geç L4 aşama solucanı toplayın ve solucanlar penadan ayrılıp solüsyona girene kadar penayı solüsyonu içeren plakaya daldırın. Kuyuya toplanan solucanların sayısını not edin, zamanlayıcıyı başlatın, her dakika işaretinde SWIP sergileyen solucanların sayısını gözlemleyin ve kaydedin.
    2. Ham verileri bir elektronik tabloya kopyalayın ve her dakika felç olan solucan sayısını test boyunca test edilen toplam solucan sayısına bölerek felç olan solucanların yüzdesini hesaplayın ve 100 ile çarpın. Yüzde değerlerini herhangi bir grafik ve istatistik yazılımına kopyalayın ve XY grafik biçimini kullanarak verileri Y ekseninde yüzde değerleri ve X ekseninde zaman ile çizin.
    3. Kontrol, AMPH grupları ve tedavi süresi arasında istatistiksel anlamlılığı test etmek için iki yönlü ANOVA ve ardından post-hoc analiz (örneğin, Bonferroni son testi) gerçekleştirin.
  2. SWIP'in otomatik analizi
    1. Bir kerede tek bir solucan üzerinde otomatik analiz gerçekleştirin. Kamerayı kurma protokolü, solucan izleme yazılımı ve izleme yazılımı analizini çalıştırmak için komut dosyası Hardaway ve ark.
    2. Kısaca, bölüm 1.1.2'deki manuel yöntemde açıklandığı gibi, tek bir geç L4 aşaması hermafroditi bir kirpik penası kullanarak bir cam spot plakaya yerleştirin. Aynı anda bir solucanın yüzme videolarını kaydedin ve vücut kıvrımlarının sıklığını hesaplamak için solucan izleme yazılımını kullanın.
    3. Solucan dövme sıklığını elde etmek ve solucan dövme verilerinden ısı haritaları oluşturmak için izleme yazılımıyla birlikte verilen komut dosyasını izleyin.

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Malzemeler

Bu makalede kullanılan malzemelerin listesi
AdŞirketKatalog numarasıYorumlar
AmfetaminSigma51-63-8
Çöküntü cam spot plakasıCorningCorning, Inc. 722085
Kirpik
Grafik ve istatistik yazılımıprizmaGrafik Defteri 5
OsmometreGelişmiş Aletler, IncÜrün Kodu: 3320
Elektronik TabloMS ofisiMicrosoft Excel
Stereo MikroskopZeissModel tlb3. 1 stemi2000
SucroseSigma-AldrichRB=S5016
SuperglueLoctite1647358 .14 oz.
SwimR yazılımı10.18129/B9.bioc.SwimR
Tracker 2Solucan İzleyici 2.0www.mrc-lmb.cam.ac.uk/wormtracker/
Video kayıt yazılımıSanal dubhttp://www.virtualdub.org/
Teknolojisi Gazetesi

Yeniden basım ve izinler

Bu JoVE makalesinin metnini veya şekillerini yeniden kullanmak için izin iste

İzin iste

Etiketler

C elegans AnaliziManuel SWIP AnaliziOtomatik SWIP AnaliziAmphetamine UygulamasWorm Tracker Yaz l mStereoskop G zlemiCam Spot PlakaL4 Evre Larvalar

İlgili makaleler