Caenorhabditis elegans (solucan)

Bu videoda, gelişimsel olarak senkronize bir steril yetişkin C. elegans popülasyonu üretme yöntemini gösteriyoruz. Örnek protokol, canlı hayvanlarda oksijen tüketim oranlarını incelemek için solucanları senkronize eder.

Bu videoda, PCR taraması ile tek bir nematodun genetik bir belirteç için hızlı bir şekilde taranması için kullanılan bir teknik açıklanmaktadır. Örnek protokolde, CRISPR tabanlı genom düzenlemeyi tarıyoruz.

Bu videoda, C. elegans'ın ömrünü ölçmek için geleneksel, plaka tabanlı bir yöntem açıklanmaktadır. Örnek protokol, RNAi ile tedavi edilen solucanların ömrünü ölçer.

C. elegans yumurtlama davranışı, gelişimsel, üreme ve anatomik çalışmalarda önemli bilgiler sağlayabilir. Bu video, bir yumurtlama testinin önemli adımlarını tanıtır ve bir ilacın üreme toksisitesi açısından test edildiği örnek bir deneyi gösterir.

Bu videoda, transgenik C. elegans suşları oluşturmanın yaygın bir yöntemi olan mikroenjeksiyon açıklanmaktadır. Örnekte, CRISPR bazlarının gen düzenlemesi için bir ribonükleoprotein (RNP) kompleksini tanıtmak için kullanılan mikroenjeksiyonu göreceğiz.

Bu videoda, kütikülü bozarak C. elegans dokularını antikor boyaması için erişilebilir hale getirme yöntemi olan donarak kırma işlemi açıklanmaktadır.

C. elegans'ın canlı görüntülemesi sırasında, nematodu zarar vermeden veya kurutmadan hareketsiz tutmak için bir agaroz pedi kullanılabilir. Bu video, mikroskopi için basit bir montaj pedinin nasıl hazırlanacağını açıklamaktadır.

Bu video, kalsiyum görüntülemenin arkasındaki kavramları tanıtır ve kalıplanmış agaroz kuyularında bulunan solucanların hızlandırılmış görüntülemesi için örnek bir protokol içerir.

Burada, yüzme gibi şiddetli hareketler sırasında ortaya çıkan davranışsal bir C. elegans fenotipi olan SWIP'yi ölçmek için bir test sunuyoruz. Örnek protokol hem manuel hem de otomatik analiz yaklaşımlarını tartışır.

Bu video, C. elegans'ın mekanosasyonu değerlendirmek ve alışmaya kadar geçen süreyi ölçmek için davranışsal bir yöntemi olan dokunma alışkanlığı testini tanıtmaktadır.

Bu video, nematod C. elegans'ta kemotaksisi tanıtıyor ve bakır sülfata karşı kemotaktik kaçınmayı test eden örnek bir protokolü gösteriyor.

Araştırmacılar, solucanların algıladığı ve tepki verdiği bir elektrik alanı uygulayarak C. elegans'ta isteğe bağlı hareketi tetikleyebilir. Bu videoda elektrotaktik davranış tanıtılır ve mikroakışkan bir cihazda yapılan örnek bir protokol gösterilir.

Bu videoda, bir arenada solucan hareketini kaydetmek için video ve izleme yazılımının kullanımı açıklanmaktadır. Örnek protokol, etanol maruziyetinin solucan hareketi üzerindeki etkisini ölçer.

Bu videoda, yetişkin C. elegans hermafroditlerinden gonadları incelemek için bir yöntem açıklanmaktadır, bu da immün boyama ve floresan görüntüleme için uygun dokularla sonuçlanır.

Bu video, akut toksisite tedavisini test eden veya genetik bir suşu toksik bir duruma direnç açısından test eden kısa süreli bir sağkalım testini tanıtmaktadır. Örnek protokol, solucanların paraquat (PQ) tarafından indüklenen oksidatif strese direnme yetenekleri açısından test edildiği örnek bir hayatta kalma testini göstermektedir.

C. elegans'ın tek sarkomer ve çoklu sarkomer veya çizgili kaslar olmak üzere iki tür kası vardır. Bu video, bir solucanın hareketinden sorumlu olan çizgili vücut duvarı kaslarının düzenini açıklar ve görüntü analiz yazılımı kullanarak kas morfolojisini ölçmek için örnek bir protokol içerir.

Bu video, solucan epidermisinde çok hassas yaralanmalara neden olmak için kullanılan bir lazer yaralama yöntemini tanıtmaktadır. Örnek protokol, yara tepkisi ve onarımı üzerine yapılan bir çalışmadan alınmıştır.

Bu video, solucanları FITC etiketli dekstran besleyerek C. elegans bağırsak lümeninin bütünlüğünü görselleştirmek ve ölçmek için bir yöntem sunar. Örnek protokol, 3,3'-diindolilmetan (DIM) ile muamele edilmiş ve patojenle beslenen solucanlarla yapılan testi göstermektedir.

Bu videoda, Nil Kırmızısı boyası kullanılarak lipitleri bütün, sabit solucanlar halinde boyamak için bir protokol açıklanmaktadır. Lipid damlacıklarının çekirdeğindeki nötr lipidleri spesifik olarak görüntülemek için, lekeli C. elegans'ın yeşil emisyon spektrumlarını görüntüleyin.

Bu videoda, tüm solucanları FACS veya sağlam hücrelerin immünopresipitasyonu için uygun tek hücreli bir süspansiyona ayırmak için bir yöntem açıklanmaktadır.

Burada, sabit, bozulmamış nematodlarda genomik DNA'yı görselleştirmek için kullanılan bir tekniği açıklıyoruz. Video, döllenmemiş C. elegans oositlerindeki kromatini saymak için örnek bir protokol içerir.

Bu video, erken embriyolardan C. elegans blastomerlerini izole etmek için bir yöntem sunar. Elde edilen hücreler, hücre kültürü veya ex vivo deneyler için uygundur.

Bu videoda, embriyonik C. elegans hücrelerinin in vitro olarak izole edilmesi ve steril olarak kültürlenmesi için bir yöntem tanıtılmaktadır.

Bu video, C. elegans'ta RNAi tedavisinin arkasındaki prensipleri açıklar ve bir transgenik solucan suşunda lin-35'i nakavt etmek için bir protokol gösterir.

RNAi, C. elegans araştırmacılarının kullanabileceği güçlü bir genetik araçtır. Bu video, sıvı kültür koşullarını kullanarak plaka beslemeden daha fazla solucanı RNAi ile tedavi etmek için bir yöntem sunmaktadır.

Nematodlar laboratuvarda kolayca çoğaltılabilir - çünkü hermafroditler kendi kendine döllenme yoluyla çoğalabilir. Bununla birlikte, genetik çaprazlamalar ve diğer deneyler çok sayıda erkek gerektirebilir. Bu videoda, erkek C. elegans için zenginleştirme yöntemi açıklanmaktadır.

Transgenlerin mikroenjeksiyonu genellikle büyük ekstrakromozomal dizilere sahip C. elegans suşları ile sonuçlanır, bu da transgenin değişken ekspresyonu ve iletimi ile sonuçlanır. UV Işınlaması, dizinin kromozomal entegrasyonunu ve daha kararlı transgen iletimini indükleyebilir.