Method Article

Süreksiz yoğunluk gradyanı kullanılarak bakterilerin kapsül miktarına göre ayrılması

August 29th, 2025

In This Article

Abstract

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Kaynak: Feltwell, T., et.al. süreksiz bir yoğunluk gradyanı kullanarak bakterileri kapsül miktarına göre ayırmak. J. Vis. Uzm. (2019)

Bu video, kapsül miktarına göre bakteri suşlarını ayırmak için süreksiz bir yoğunluk gradyanının kullanımını göstermektedir. Bir transpozon mutant kütüphanesini gradyan boyunca santrifüjleyerek, farklı kapsül yoğunluklarına sahip bakteriler farklı katmanlara lokalize olur. Ayrılan fraksiyonlar daha sonra aşağı akış analizi için toplanabilir.

Protocol

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

1. Hazırlanan Hücrelerin Degradelere Eklenmesi ve Santrifüjleme ile Ayrılması

:
  1. 600 μL hazırlanmış hücreleri tüpteki gradyanın üstüne çok yavaş ve arayüzü karıştırmadan ekleyin.
  2. Tüpleri tüp adaptörlerine yerleştirin ve dengeli olduklarından emin olmak için birleşik adaptörleri ve tüpleri tartın.
    1. Tüp adaptörlerini tezgah üstü santrifüj içindeki sabit açılı bir rotora yerleştirin. 3.000 x g'da 30 dakika santrifüjleyin.
    2. Santrifüjlemeden sonra, tüpleri dikkatlice çıkarın, uygun bir rafa yerleştirin ve sonuçları bir kayıt olarak fotoğraflayın.
  3. Üronik asit miktar tayini veya DNA ekstrak....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
PercollGE Healthcare17-0891-01
Rotor A-4-81 ve 500ml kovalı Santrifüj 5810REppendorf5810 718.007
15 ml tüpler için adaptörlerEppendorf5810 722.004
Sabit açılı rotor F-34-6-38Eppendorf5804 727.002
2.6 - 7 ml tüp adaptörüEppendorf5804 739.000
Santrifüj 5424 Rotor dahil FA-45-24-11Eppendorf5424 000.460
5 ml polipropilen yuvarlak tabanlı boruFalcon352063

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Tags

Discontinuous Density GradientBacterial Capsule SeparationDensity Gradient CentrifugationCapsule Amount AnalysisTransposon Mutant LibraryBacterial Strain IsolationColloidal Silica GradientFixed Angle RotorBench top CentrifugeDownstream Analysis

Related Articles