Method Article

Işık desenli hidrojel bozunması kullanılarak hedeflenen bakteri kolonisi izolasyonu

September 26th, 2025

In This Article

Abstract

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Kaynak: Fattahi, N., vd. Bakteri taraması, seçimi ve izolasyonu için ışıkla parçalanabilen hidrojel arayüzleri. J. Vis. Uzm. (2021).

Bu video, UV ışığı kullanılarak ışıkla parçalanabilen bir hidrojelden bakteri kolonilerinin ekstraksiyonunu göstermektedir. Belirli bir koloni seçilir ve lokalize hidrojel bozunmasını başlatmak için desenli bir ışığa maruz kalma tasarlanır. Işık yoğunluğunu ve süresini ayarladıktan sonra UV ışığı uygulanarak koloni serbest bırakılır. Koloni daha sonra borulardan aspire edilir ve aşağı akış analizi için bir tüpe aktarılır.

Protocol

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

1. Bakteri suşları ve kültür protokolleri

  1. Uygun büyüme ortamı ile desteklenmiş agar plakaları üzerindeki bakteri kolonilerini çizin. Bu raporda, B. subtilis (suş 1A1135, Bacillus Genetik Stok Merkezi) ATGN (0.079 M KH2PO4 (Potasyum dihidrojen fosfat), 0.015 M (NH4) 2SO4 (Amonyum sülfat), 0.6 mM MgSO4·7H2O (Magnezyum sülfat heptahidrat), 0.06 mM CaCl2·2H2O (Kalsiyum klorür dihidrat), 0.0071 mM MnSO4·H2O (Manganez(II) sülfat monohidrat), 0.125 M FeSO4·7H2O (Demir sülfat heptahidrat), 28 mM glikoz, pH: 7 ± 0.2, 15 g....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Results

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
figure-results-1

Şekil 1: Tiyole cam lameller üzerinde hidrojel oluşumu. (A) 12,7 μm kalınlığındaki ara parçalar, reaktif tiyol grupları içeren bir taban lamel kaymasının karşılıklı iki tarafına yerleştirilir. (B) Hidrojel öncü çözeltisi, reaktif olmayan, fl.......

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
(3-Merkaptopropil)trietoksisilanSigma-Aldrich175617-25G> %95
Alconox deterjan tozuAlconox1104 
Amonyum sülfatFisher KimyasalA702-500 Cep TelefonuSertifikalı ACS Granül
Otoklav SK300CYamato Bilimsel18016 
Bacillus subtilis 1A1135Bacillus Genetik Stok Merkezi1A1135 Serisi 
Brightfield dik mikroskopOlympus ŞirketiBX51 Serisi 
Kalsiyum klorür, susuzFisher KimyasalC614-500 SerisiDesikatörler için Peletler, 4-20 Mesh
Santrifüj 5702Eppendorf Belediyesi5702 
Sitrik asit monohidratSigma-AldrichC1909-500GACS reaktifi, > %99,0
D-Glikoz (Dekstroz)VWR Amresco Yaşam Bilimleri0188-1KG 
DOWSIL 184 silikon elastomer tabanDow Silikonlar Şirketi Depolama sıcaklığı: -30-60 °C
DOWSIL 184 silikon elastomer kürleme maddesiDow Silikonlar Şirketi Depolama sıcaklığı: < 32 C
EPOCH2 mikroplaka spektrofotometresiBioTek EnstrümanlarıÇAĞ2 
Escherichia coli ATCC 25922Thermo Fisher BilimselR19020 Serisi 
Etanol, susuzFisher Kimyasal459844 
Fisherbrand mikroskop kapak camıFisher Bilimsel12540A Serisi 
Fisherfinest premium mikroskop slaytları düzFisher Bilimsel12-544-4 
Hidrojen peroksit çözeltisiSigma-Aldrich216763-500MLH2O'da ağırlıkça %30 inhibitör içerir
Incu-Çalkalayıcı MiniKriterE5-0014-01 
İzopropanolSigma-Aldrich190764 
Magnezyum sülfat, 7-hidratMacron İnce Kimyasallar6066-04Avantor Performans Malzemeleri A.Ş.
MetanolSigma-Aldrich179337-4LACS reaktifi, > %99,8
NanoDrop One spektrofotometreTermo BilimselND-ONEC-W 
Nitrojen, sıkıştırılmışMathesonUN1066 
Oksijen plazma temizleyiciHarrick PlazmaPDC-001-HP 
Pentaeritritol tetra(merkaptoetil) polioksietilen (4 kol-PEG)NOF Amerika ŞirketiPTE-100SHGüneş Işığı-PTE-100SH
Fosfat tamponlu salin (PBS), 10XVWR Amresco Yaşam BilimleriK813-500ML15 °C–30 °C arasında saklayın
Polidimetil siloksan (PDMS) Slygard 184Dow Corning4019862 
Çokgen400GüçlüDSİ-D-000 
Birinci sınıf mikroskop slaytlarıFisher Bilimsel12-544-425 x 75 x 1 mm
Sodyum klorürSigma Yaşam BilimleriS5886-500GBioreagent, hücre kültürü için uygun
Sodyum hidroksitSigma-AldrichS8045-500GBioXtra, > %98, peletler (susuz)
Sodyum fosfat monobazik dihidratSigma-Aldrich71505-250GBioUltra, moleküler biyoloji için > %99,0 (T)
Paslanmaz çelik kalınlık ölçerHassas Marka Ürünler77739 
sülfürik asitSigma-Aldrich320501-2.5L 
Toluen, susuz, %99,8Sigma-Aldrich244511-1LSusuz, > %99,8
Trikloro (1H,1H,2H,2H perflorooktil) silan (TPS), %97Sigma-Aldrich448931-10G 
Triptik soya suyuSigma-Aldrich22092-500GMikrobiyoloji için
Ultrasonik sonikatörFischer BilimselFS-110H Serisi 

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Tags

Photodegradable HydrogelBacterial Colony IsolationLight Patterned DegradationUV Light ExposureFluorescence MicroscopyColony AspirationHydrogel DegradationTargeted Colony ExtractionLight Pattern DesignSyringe Aspiration

Related Articles