Yöntem makalesi

Streptomyces coelicolor'un Vahşi Tip ve Mutant Suşlarının Fenotipik Karşılaştırması

26 Eylül 2025

Bu makalede

Özet

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Kaynak: Bennett, J.A., ve diğerleri. Streptomyces Gelişimsel Mutantlarının Görsel ve Mikroskobik Değerlendirmesi. J. Vis. Uzm. (2018)

Bu video, vahşi tip ve mutant Streptomyces coelicolor suşlarının yetiştirilmesini ve fenotipik karşılaştırmasını göstermektedir. Spontan mutasyonları en aza indirmek, çapraz kontaminasyonu önlemek ve uygun kaplama teknikleri yoluyla bakteri üremesini teşvik etmek için prosedürleri özetlemektedir. Son olarak video, bakteri suşlarındaki mutasyonların gelişimsel etkilerini göstermek için koloni morfolojisindeki görsel farklılıkları vurgulamaktadır.

Protokol

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

1. Aletleri, Kültür Ortamlarını, Solüsyonları ve Petri Kaplarını Hazırlayın

1. Kürdanları steril tutmak için alüminyum folyo ile kaplanmış 50 mL'lik bir beherde otoklavlayın.

2. Kullanılacak tüm kuru ürünleri (uçlar, çubuklar, cam eşyalar vb.) otoklavda sterilize edin.

NOT: Dikkat! Kullanılan otoklav modeli için tüm güvenlik talimatlarına uyun. Otoklavlar patlama, buhardan kaynaklanan yanıklar ve sıcak yüzeyler, malzemeler ve ortamlarla temas riski taşır.

3. Kültür yetiştirmek için MS agarı (Mannitol Soya Unu (SFM)) hazırlayın.

1. 1 L'lik bir şişeye 5 gr soya unu ve 5 gr agar ekleyin.

2. 5 g mannitol'ü 250 mL musluk suyunda eritin ve soya unu ve agar içeren şişeye dağıtın.

3. Şişenin ve otoklavın açıklığına 121 °C, 15 psi'de en az 30 dakika boyunca bir köpük tapa ve folyo ekleyin.

DİKKAT: Bu ortam kolayca kaynar. Otoklavlanan MS agarın gerçek hacminin en az dört katını tutabilen bir şişe kullanın. Benzer güvenlik hususlarına sahip bir otoklav yerine standart bir düdüklü tencere kullanılabilir. Alternatif olarak, otoklava erişim mümkün değilse, ortamı ve malzemeleri sterilize etmek için bir mikrodalga fırın kullanılabilir. Lise öğretmenleri ayrıca otoklavlanmış malzemelere erişmek için yerel kolejler veya üniversitelerle işbirliği yapmak isteyebilir.

4. Medyayı işlemek için yeterince rahat olana kadar soğutun. Agar 50 °C'nin altındaki sıcaklıklarda katılaştığı için çok uzun süre soğutmamaya dikkat edin.

5. MS agarı şişeden steril Petri kaplarına, her Petri kabının tabanı yaklaşık yarısı dolana kadar (Petri kabı başına yaklaşık 25 mL ortam) dökün. Agar plakalarını kullanmadan önce katılaşmasını bekleyin. Agar plakalarını ihtiyaç duyulana kadar oda sıcaklığında plastik bir torba içinde saklayın.

NOT: Agar plakaları, özellikle ortamda antibiyotik gerekiyorsa, buzdolabında da saklanabilir.

2. Streptomyces'i Yayılma için Plakalara Çizin

1. Streak Streptomyces , kadran çizgi yöntemi gibi standart bir yöntem kullanarak MS agar plakalarına tek kolonilere suşlanır.

NOT: Bir aşılama halkası veya steril kürdan kullanılabilir. İsteğe bağlı: Streptomyces türleri için R2YE ve minimal ortam gibi diğer ortamlar yaygın olarak kullanılır.

2. Plakaları 30 °C'de inkübe edin.

3. Her 4-6 günde bir tek bir koloni seçerek plakaları yeniden çizin. Koloniler yaşlandıkça rastgele mutasyona yatkın hale gelirler.

3. Görsel Görünümü Karşılaştırın ve Kaydedin

1. Adım 2'deki gibi tüm suşları çizdikten sonra, vahşi tip ana suşla karşılaştırıldığında her mutant için koloni morfolojisini not edin. Yeni Streptomyces türlerini karakterize ederken, yeni izolatı S. coelicolor veya S. venezuelae gibi iyi çalışılmış bir türün izolatıyla karşılaştırın. Temel şekil, koloni yüzeyi (bulanık, kel, buruşuk vb.), opaklık, yükseklik ve pigmentasyon gibi özelliklere (Şekil 1) dikkat edin (bitkisel miselyum, hava miselyumu ve/veya çevreleyen ortam arasında ayrım yapın).

2. Bir MS agar plakasını etiketleyin ve kama desenlerinde vahşi tip ve mutant suşları çizin (Şekil 1). Çapraz kontaminasyonu önlemek için hiçbir suşun başka bir suşa temas etmemesine dikkat edin. Suşların plaka üzerine çizildiği tarih ve saati not edin. Plakaları 30 °C'de inkübe edin.

3. Arka planı homojenleştirmek için yetiştirilen Petri kaplarını renkli veya beyaz kağıda yerleştirin. Kağıda suş adını, tarihini, inkübasyon sıcaklığını ve ilk plaka çizgisinden itibaren geçen süreyi yazın. Karışıklığı en aza indirmek için plakanın dijital bir fotoğrafını/resimlerini çekin ve ikinci bilgiler kağıt arka plan üzerine yazılmıştır.

NOT: Yazı, şekil hazırlığı için kullanılacaksa daha sonra fotoğraftan kırpılabilir.

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Sonuçlar

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
figure-results-1

Şekil 1: Makroskopik koloni fenotiplerini gösteren temsili bir agar plakasının fotoğrafı S. coelicolor. Agar plakası, gelişimsel fenotiplere sahip çeşitli rastgele transpozon yerleştirme mutantlarına kı...

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Malzemeler

Bu makalede kullanılan malzemelerin listesi
AdŞirketKatalog numarasıYorumlar
Steril SuGen ArkadaşıG-3250-1L 
Kürdan (düz)Hedef081-22-1957 
Pipet Uçları (10 mL)Gen ArkadaşıP-1240-10 
Pipet Uçları (200 mL)Gen ArkadaşıP-1240-200Y 
Pipet Uçları (1.250 mL)Gen ArkadaşıP-1240-1250 
Pamuklu çubuklarBalıkçı markası23-400-124 
Soya unuBob'un Kırmızı Değirmeni1516C164 
D-MannitolSigma-AldrichM4125-1KG 
AgarSigma-AldrichA1296-1KG 
Gliserol %100VWR amresco yaşam bilimleri0854-1L 
%0,8 NaCl (Tuzlu Yaşam)Sigma-AldrichSLBB9000V 
Petri kaplarıSigma-AldrichP5856-500EA Serisi 
Kapak fişleri #1.5Thomas Bilimsel64-0721 
SlaytCarolina63-2010 
OtoklavTuttnauer2540E 
ForsepsCarolina Biyolojik624504 
Bunsen BrülörüCarolina Biyolojik706706 
MetanolSigma-Aldrich34860-1L-R 
PBS (fosfat tampon salin)Sigma-AldrichP4417-50SEKME 
100 mL beherPyrex ABD1000-T 
1 L beherCarolina Biyolojik721253 

Yeniden basım ve izinler

Bu JoVE makalesinin metnini veya şekillerini yeniden kullanmak için izin iste

İzin iste

Etiketler

Koloni MorfolojisiYabani Tip Su larKadran Ekim Y ntemiHavai Filament Geli imiSpor Pigmentasyonuapraz Kontaminasyonun nlenmesiSteril Teknik

İlgili makaleler