Method Article

Patojenik bir bakteri tarafından domates fidanlarının kök kolonizasyonunun canlı hücre sayıları kullanılarak değerlendirilmesi

February 26th, 2026

In This Article

Abstract

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Kaynak: Matthysse, A. G. Laboratuvarda Ölçülen Bitki Yüzeylerine Bakterilerin Yapışması. J. Vis. Exp., (2018)

Bu video, vahşi tip ve selüloz eksikliği olan patojenik bakteriler tarafından domates fidelerinin kök kolonileşmesini ölçmek için bir protokol gösterilmektedir. Sıkı yapışan bakteri sayımları, vahşi tip suşun daha fazla yapışma ve mikrokoloni oluşumu göstererek, selülozun stabil kök kolonizasyonundaki rolünü vurgular.

Protocol

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

1. Uygulanabilir hücre sayıları kullanılarak yapışma ölçümü

  1. Kumda yetiştirilen bitkilere bağlı yaşayan bakteri sayısını belirleyin
    1. Bitkiyi kaptan çıkarıp zımparalayın. Bitkileri kaplardan çıkarmak için önce kabın üst ve altındaki sızdırmazlık malzemesini çıkarın. Kabı steril bir kağıdın üzerine yerleştirin ve tüm kumu veya toprağı nazikçe çıkarıp malzemeyi gevşetmek için kabı bir yüzeye hafifçe vurarak büyük konik bir silindir olarak dikin.

1. Gerekirse, kabın altından giren kenarları çevresindeki malzemeyi gevşetmek için spatula veya çubuk kullanın.

  1. Bitkiyi içeren kum veya toprak silindiri kağıt üzerinde serbest olduğunda, onu ortadan ikiye bölerek bitki kökünü ortaya çıkarın. İsterseniz, kabın kenarına yakın ve kök yakınından kum örnekleri alın. Bu, bakterinin yayılımını (ve birikimi ve büyümesini) belirlemek için faydalı olabilir.
  2. Kökün uzunluğunu ölç. Kökü alıp köke (rizosfer malzemesi) gevşekçe yapışan kum ve bakterileri ölçülü bir su veya tampon hacmine batırıp hafifçe sallayarak temizleyin. Ortaya çıkan süspansiyondaki bakterilerin canlı hücre sayısını, uygun bir ortamda, örneğin Luria agar üzerinde kaplama ile belirleyin. Bu, kökle gevşek şekilde ilişkili bakteri sayısını temsil eder.
  3. Sıkı bağlanmış bakterileri sonikasyon ile çıkarın ve sayılarını belirleyin.

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
TohumlarHerhangi birYokTohum partisi numarasını ve çeşit listesini not alın
KumDeniz kumu Balıkçısı BilimselS25 
KumSigma-AldrichS9887 
ConetainerlerStuewe & Sons, Inc.Ray-Leach konik tainerleriYetiştirmek istediğiniz bitki türüne uygun birçok farklı boyutta mevcuttur
Banyo sonikatörüHerhangi bir bilimsel tedarik şirketiYok 
ParafilmHerhangi bir bilimsel tedarik şirketiYok 

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Tags

Root ColonizationTomato SeedlingsPathogenic BacteriaViable Cell CountsSerial DilutionsAgar PlatingSonication TreatmentBacterial AdhesionCellulose DeficiencySand Culture

Related Articles