Numune toplamıyla ilgili tüm prosedürler, kurumun IRB kılavuzlarına uygun olarak gerçekleştirilmiştir.
1. Sendai Virüsü ile Transdüksiyon
- Transdüksiyon (Gün 0)
- Kan hücrelerini toplayıp 15-ml'lik konik bir tüpe aktarın ve bir hemositometre kullanarak sayın.
- Her transdüksiyon için 3 x 105 hücre hazırlayın ve hücreleri RT'de (oda sıcaklığı) 515 x g'de 5 dk santrifüjleyin.
- Süpernatantı vakumla uzaklaştırın ve hücreleri 0.5 ml kan hücresi besiyerinde yeniden süspanse edin.
- Hücreleri kaplanmamış 24 kuyucuklu bir plakanın bir kuyucuğuna aktarın.
- Sendai virüsü karışımını buz üzerinde çözün ve süspanse edilen hücrelere ekleyin. Sendai virüsünü üretici tavsiyelerine göre hücrelere ekleyin.
- Plakayı sızdırmazlık filmi ile kapatın ve 30 °C'de 1.150 x g'de 30 dk santrifüjleyin.
- Santrifüjden sonra hücreleri %5 CO2 ortamında 37 °C'de gece boyunca (O/N) inkübe edin.
- Hücrelerin besleyici matrise aktarılması (Gün 1)
- Ertesi gün, 24 kuyucuklu bir plakayı vitronectin ile kaplayın. Vitronectin çözeltisini, nihai konsantrasyon 5 µg/ml olacak şekilde PBS içinde seyreltin. 24 kuyucuklu bir plakanın bir kuyucuğuna 1 ml vitronectin ekleyin ve RT'de en az 1 saat inkübe edin. Kullanmadan önce kaplama çözeltisini uzaklaştırın. Kaplanmış plakalar RT'de 3 gün boyunca saklanabilir.
- Hücreleri ve virüsü içeren tüm besiyerini kaplanmış kuyucuğa aktarın.
- Kalan hücreleri 0.5 ml taze kan hücresi besiyeri ile toplayın ve hücre içeren kuyucuğa ekleyin.
- Plakayı 35 °C'de 1.150 x g'de 10 dk santrifüjleyin.
- Santrifüjden sonra süpernatantı uzaklaştırın, 1 ml iPSC besiyeri ekleyin ve hücreleri %5 CO2 ortamında 37 °C'de O/N olarak muhafaza edin.
- İkinci hücre aktarımı (Gün 2)
- Yeni bir 24 kuyucuklu plakanın kuyucuklarını, adım 1.2.1'de açıklandığı gibi 5 µg/ml vitronectin ile kaplayın. Her transdüksiyon için plakanın bir kuyucuğunu kullanın.
- Hücre süspansiyonunu birinci plakadan yeni kaplanmış vitronectin plakasına aktarın.
NOT: Gerekli değilse, süspansiyon hücreleri uzaklaştırılabilir. Adım 2.3'te belirtilen prosedür, süspansiyon hücreleri ile 2-3 kez tekrarlanabilir. Adımlar tekrarlanırsa, hücreleri hasat edin. - Bu sırada, bakım için birinci plakanın kuyucuğuna 1 ml iPSC (indüklenmiş pluripotent kök hücre) besiyeri ekleyin ve %5 CO2 ortamında 37 °C'de O/N inkübe edin.
- Yapışmış hücreleri 37 °C ve %5 CO2 ortamında muhafaza edin ve taze iPSC besiyeri ile günlük besiyeri değişimi yapın. Koloniler, transdüksiyondan sonraki 14-21. günlerde ortaya çıkacaktır.
- Süspansiyon hücrelerini içeren yeni kaplanmış plakayı 35 °C'de 1.150 x g'de 10 dk santrifüjleyin.
- Santrifüjden sonra hücreleri %5 CO2 ortamında 37 °C'de O/N inkübe edin.
- Ertesi gün süpernatantı uzaklaştırın ve taze iPSC besiyeri ile değiştirin.
NOT: Adım 1.3'te belirtilen prosedür, süspansiyon hücreleri ile 2-3 kez tekrarlanabilir. Adımlar tekrarlanacaksa, süpernatanttaki hücreleri hasat edin ve adım 1.3'ü tekrarlayın. - Yapışmış hücreleri, %80 konfluens seviyesine ulaşana kadar günlük besiyeri değişimleri ile muhafaza edin.