Method Article

Bilgisayar destekli Büyük ölçekli Görselleştirme ve Pankreas Adacık Kütle, Boyut Dağılımı ve Mimarlık Niceleme

DOI:

10.3791/2471

March 4th, 2011

In This Article

Summary

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Immünohistokimyasal lekeli pankreas örneklerin büyük ölçekli satın alma ve analiz Roman bilgisayar destekli yöntemler açıklanmıştır: (1) Sanal Dilim yakalama bölümün tamamını, büyük ölçekli veri (2) Kütle analiz 2D Sanal Dilimleri (3) İmar (4) 3D adacık haritalama ve (5) matematiksel analizi.

Abstract

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Pankreas adacık beta-hücrelerinin (insülin), alfa-hücrelerinin (glukagon) ve delta-ekzokrin dokularda gömülü ve 1 oluşturan hücreleri (somatostatin) gibi birçok hormon salgılayan endokrin hücrelerde oluşan benzersiz bir mikro-organ- tüm pankreas% 2. Vücut ve pankreas ağırlığı arasında yakın bir korelasyon vardır. Toplam beta hücre kitlesinin de vücutta insülin talebi telafi etmek için orantılı olarak artar. Bu orantılı genişleme adacık boyutu dağılımı kaçar. Büyük hayvanların insanlar gibi, bu mikro-organ işlevsel olması için belirli bir boyut sınırı olduğunu düşündüren, fare ile benzer bir adacık boyutu dağılımları paylaşıyoruz. Orantılı olarak daha büyük adacıklar oluşturmak için büyük hayvan pancreata yetersizlik adacık sayısında bir artış ve genel adacık boyutu dağılımı büyük adacıklar oranında bir artış ile telafi edilmektedir. Ayrıca, adacık hücre yapısı ve mimarisi, farklı türler arasında ve aynı zamanda çeşitli patofizyolojik koşullar altında aynı türün içinde çarpıcı bir plastisite sergilerler. Bu çalışmada, geniş ve heterojen veri toplama ve analiz için dinamik biyolojik süreçlerin ve karmaşık yapılara sahip çalışmaya izin analitik süreçlerin otomasyonu kolaylaştırmak için biyolojik görüntü verilerini analiz için yeni yaklaşımlar açıklanmaktadır. Böyle çalışmalar tarafsız örnekleme teknik zorluklar nedeniyle engellendiği ve büyük ölçekli veri üreten adacık biyoloji biyolojik süreçlerinin karmaşıklığı tam olarak yakalamak için ayarlar var. Burada örneklerin sınırlı sayıda (ya da örnek toplama en aza indirmek için) ve standart deneysel ayarları içinde tarafsız "temsili" verileri toplamak ve adacık karmaşık üç boyutlu yapısını tam olarak analiz etmek için yöntemler göstermektedir. Bilgisayar destekli otomasyon, büyük ölçekli veri setleri toplama ve analiz sağlar ve aynı zamanda verilerin tarafsız bir yorumlama sağlar. Ayrıca, adacık boyutu dağılımı ve mekansal koordinatları (yani X, Y, Z-pozisyonlar) kesin kantifikasyon sadece pankreas adacık yapısı ve bileşimi doğru bir görselleştirme için değil, aynı zamanda bize, geliştirme ve adaptasyon sırasında desen değiştiren koşulları tanımlamanıza olanak sağlar matematiksel modelleme yoluyla. Bu çalışmada geliştirilen yöntemlerin yanı sıra birçok diğer sistemlerin ve organizmaların çalışmaları için geçerli.

Protocol

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

1. İmmünohistokimyasal Vitray Resimler Sanal Dilimleri oluşturma

  1. Açık StereoInvestigator. Örnek mikroskop sahibinin tutan temiz bir slayt yerleştirin ve "Canlı Image" sonra "Acquisition" (Toplama → Canlı Görüntü) tıklayarak ve Stereo Araştırmacı görselleştirmek. Her kanal için maruz kalma seviyeleri belirlemek; bizim belirli bir örnek, Kanal 2 Cy7 DAPI, Kanal 3 Cy5 için GFP, RFP, Kanal 5 Kanal 4 ve Kanal 6 için kullanılır. Maruz kalma düzeyini belirlemek için, floresan yoğunluğu görüntüler "Video Histogram" penceresini kullanın. Uygun floresan yoğunlukları ulaşıldığında Video Histogram sağ ucunda yoğunluğu kuyrukları kapalı. Maruz kalma seviyeleri "Kamera ....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Discussion

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Büyük ölçekli bilgisayar destekli görselleştirme ve miktar burada pankreas adacık çalışmalarında dört temel nokta göze sundu: (1) büyük ölçekli pankreas örneklerin analizi, genel adacık boyut dağılımı ve adacık mimarisi kapsamlı bir bakış sağlar. (2) hücresel bileşimi ve mimarinin 3 boyutlu rekonstrüksiyon ve matematiksel analiz, bir adacık içerisinde endokrin hücreler mekansal düzenleme inceleme daha kolaylaştırır. (3) ve çeşitli patofizyolojik koşullar altında aynı türün farklı türler arasında çarpıcı bir adacık plast.......

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Disclosures

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
Çıkar çatışması ilan etti.

Acknowledgements

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Çalışma tarafından desteklenen ABD Kamu Sağlığı Servisi Hibe DK-081.527, DK-072.473, Chicago Diyabet Araştırma ve Eğitim Merkezi (Hayvan modeller Core) Üniversitesi ve Kovler Aile Vakfı hediye DK-20.595.

....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
Floresan mikroskopMikroskopOlympus CorporationIX-81
Stereo AraştırmacıProgramıMBF Biyobilim
MIP-GFP farelerFarelerJackson Laboratuvarı
MathematicaProgramıWolfram
Image JProgramıUlusal Sağlık Enstitüleri
Slayt KitabıProgramıOlympus

References

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Steiner, D. J., Kim, A., Miller, K., Hara, M. Pancreatic islet plasticity - Interspecies comparison of islet architecture and composition. ISLETS. 2, 135-145 (2010).
  2. Kim, A., Miller, K., Jo, J., Wojcik, P. l, Kilimnik, G., Hara, M. Islet architecture - a comparative study. ISLETS.

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Tags

Pancreatic Islet VisualizationIslet Size DistributionIslet ArchitectureBeta Cell Mass3D ReconstructionImmunohistochemical StainingImage J AnalysisStereo InvestigatorCell MappingDiabetes Research

Related Articles