Bu makale, tek hücreli FISH, blastomer çekirdeklerinin yayılmasını teknikleri, in situ hibridizasyon ve klinik bir ortamda pre-implantasyon genetik tanı (PGD) uygulanan sinyal puanlama için uygun probların seçim açıklamaktadır.
Yöntem makalesi
Bu makale, tek hücreli FISH, blastomer çekirdeklerinin yayılmasını teknikleri, in situ hibridizasyon ve klinik bir ortamda pre-implantasyon genetik tanı (PGD) uygulanan sinyal puanlama için uygun probların seçim açıklamaktadır.
Pre-implantasyon genetik tanı (PGD), doğum öncesi tanı için kurulmuş bir alternatif ve Yardımla üreme teknolojileri (ART) tarafından oluşturulan bir kohort pre-implantasyon embriyoların seçiminde içerir. Bu seçim, çünkü ailevi monogenik hastalığı (örneğin, kistik fibrozis), veya bir ortak bir kromozom taşır, çünkü (örneğin iki yönlü karşılıklı translokasyon) olabilir. PGT kromozom düzenlerinde, tekrarlayan düşükler, kısırlık durumunda önceki etkilenen çocuklar ve / veya çiftler için kullanılabilir. Oosit aşağıdaki over stimülasyonu semen (IVF), in vitro daldırma veya intrasitoplazmik enjeksiyonu (ICSI) bireysel bir spermatozoa tarafından döllenir aspire. Pre-implantasyon bölünme-dönem embriyoların genellikle 3. gün sonrası döllenme tek bir hücrenin kaldırılması suretiyle, biyopsi, biyopsi hücre, embriyonun genetik durum kurmak için test edilir. Floresan in situ hibridizasyon (FISH) sabit hedef spesifik DNA probları ile biyopsi hücrelerinin çekirdekleri X'e bağlı bir hastalık olduğu kromozom düzenlerinde ile ilişkili kromozom dengesizliği tespit etmek ve aile içinde kadın embriyolar seçmek için tercih edilen bir tekniktir mutasyon-özel test. BALIK Yardımla üreme etkinliğini denemek ve geliştirmek amacıyla da spontan kromozom anöploidi (PGS veya PGD-AS olarak bilinen) için ekran embriyolar kullanılır olmuştur, ancak, yayma ve FISH tekniği kullanarak bu testin prediktif değeri burada açıklanan çoğu kişinin elinde kabul edilemeyecek kadar düşük olması muhtemeldir ve bu rutin klinik kullanım için tavsiye edilmez. Biz tek hücreli FISH, blastomer çekirdeklerinin yayılmasını teknikleri, in situ hibridizasyon ve klinik bir ortamda PGT uygulanan sinyal puanlama için uygun probların seçim açıklar.
1. Parçalama ve biyopsi blastomer Nucleus Yayılma
2 Tek bir blastomer Nucleus Situ Hibridizasyon
3. Floresan Mikroskobu kullanılarak analiz uygun Kullanılan Problar için uygun filtreler ile donatılmıştır.
4. Temsilcisi Sonuçlar:
Metafaz ve interfaz çekirdekleri kültürlü periferik kan lenfositleri seçilen probları (subtelomere probları transloke segment ve sentromer probu (ler) merkezli sadece melezleşme kesmenoktaları için bilgilendirici, translokasyon kromozom için özel olduğunu onaylamak için muayene edilmelidir segment (ler)) ve interfaz çekirdekleri sinyalleri parlak ve ayrık olmalıdır. 100 interfaz çekirdeği her sonda her bir ortak işaretlerinin sayısı, puanlama testinin etkinliğini değerlendirmek için tavsiye edilir. Bu durumda 2 sinyal 95% -99% çekirdeğinin her sonda skorlandı. Şekil 1 kromozom 5 ve 9 kısa kolları arasında karşılıklı translokasyon için bir hazırlık metafaz ve interfaz çekirdeğinde gösterir.
Embriyonun blastomer interfaz çekirdekleri sinyaller parlak ve ayrık olmak ve kullanılan renkler için ayrı bir bant geçiren filtreler kullanılarak attı. Şekil 2 blastomer kromozom 5 ve 9 için normal ya da dengeli bir kromozom normal sinyal tutarlı bir deseni (test edilen tüm lokuslar için 2 kopya) ve anormal bir sinyal deseni ile translokasyon dengesiz bir ürün ile tutarlı bir çekirdek ile çekirdeği gösterir kromozom 5 ve kromozom 9 transloke segment için trizomi (3 nüsha) transloke segment için monozomi (bir nüsha).

Şekil 1 A metafaz yayıldı ve kısa kromozom 5 silah ve 5p14.3 ve 9p24.1 kesme noktaları ile 9 arasında bir karşılıklı translokasyon taşıyıcısı kültürlü periferik kan lenfositleri hazırlanan bir interfaz çekirdeğinde: 46, XY, t (5 9) (p14.3; p24.1) ish t (5, 9) (5ptel48-9ptel30 +; 9ptel30, 5ptel48 + 9cen +). FISH probları hem transloke segmentleri için seçilmiştir (5p14.3 → 5pter, kırmızı Cytocell subtelomere5ptel48 TexasRed; 9p24.1 → 9pter, yeşil Cytocell subtelomere 9ptel30 FITC) ve kromozom 9 merkezli segment (9p24.1 → 9qter, mavi Abbott CEP 9 alfa uydu SpectrumAqua).

Şekil 2 gün-3 embriyolar interfaz blastomer çekirdekleri. Sinyaller her florokrom ve kompozit bir görüntü oluşturmak için birleşti için farklı bir filtre kullanılarak ele geçirdi. (A), normal ya da dengeli translokasyon kromozomlar için bir tamamlayıcı ile tutarlı her lokus, iki nüsha gösteren her sonda için iki sinyal. (B) Bir kırmızı sinyal, üç yeşil sinyalleri ve 5. kromozomun transloke segmentinde bir kopyasını, komşu ile tutarlı kromozom 9 transloke segmentinde üç nüsha ve iki nüsha kromozom 9, merkezli segmentinde gösteren iki mavi sinyal 9p24.1 → 9pter 5p14.3 → 5pter ve trizomi monozomi dengesiz bir ürün olarak ortaya çıkan translokasyonu -1 segregasyon.
Tek bir embriyo hücresi (blastomer) in situ hibridizasyon (FISH) floresan uygulama, pratik ve sinyal paterni yorumlanması hem de özel zorluklar sunulur . Biyopsi hücre slayt, yerelleştirme aşağıdaki BALIK kolaylaştırmak için önceden tanımlanmış bir alan içinde yayılır; hücre sitoplazmasında dağınık olduğunu, parçalanmış olduğunu sağlanmasında çok dikkatli alınması gerekir, ve bu çekirdeğin Tanı bu tek hücre, sıkı puanlama ve yorumlama kurallar uygulanmalıdır sonuçlarına bağlı olarak, görünür ve bozulmamış. Ancak, deneyimli ellerde, BALIK pre-implantasyon genetik tanı (PGD) klinik uygulamada sağlam bir tekniktir. FISH ile PGT prensibi farklı fluorochromes veya hapten etiketli hedef-spesifik DNA probları özel lokusların kopya sayısı tespit etmek için kullanılan olabilir ve böylece Robertsonian kromozom düzenlerinde mayotik segregasyon (1) ile ilişkili kromozom dengesizliği, algılamak için translokasyonlar, karşılıklı translokasyonlar, inversiyon ve karmaşık düzenlenmeleri (2). BALIK da herhangi bir mutasyon-spesifik bir test (3, 4) olduğu, X-bağlantılı hastalığı olan ailelerde kadın embriyolar seçmek için kullanılabilir. Daha tartışmalı BALIK da yardımlı üreme (5, 6) etkinliğini denemek ve geliştirmek için sporadik kromozom anöploidi ekrana kullanılır olmuştur vardır; Ancak, FSIH kullanarak bu testi prediktif değer olarak kabul edilemeyecek kadar düşük olması için muhtemel olan çoğu kişinin elleri ve rutin klinik kullanımı (7) için tavsiye edilmez. Bu makale, klinik, tek hücreli tanı uygulanan FISH teknik yönlerini ve sınırlamalar üzerinde yoğunlaşmaktadır.
Tek blastomer yayma ve düzeltme yöntemleri, metanol / asetik asit (5, 8), Tween / HCl (9) ve Tween / HCl ve metanol / asetik asit (10) bir kombinasyonu içerir. Çeşitlemeler fiksasyon sonra ve / veya pepsin ve paraformaldehid tedavisi yayılıyor önce hücre hipotonik tedavi içerir. Bu yöntem uygun laboratuar (14) için kontrol edilmelidir. Tween / HCl yöntemi bu makalede ayrıntılı olarak açıklanmıştır. Tween / HCl yöntemi farklı laboratuvarlarda teknik olarak basit ve son derece tekrarlanabilir. Bu yöntem, kabul edilebilir bir tanısal doğruluk (7) ile cinsiyet tayini ve kromozom düzenlenmeleri FISH tanı için tek çekirdekleri hazırlamak için kullanılabilir.
Probe karışımları, farklı üreticilerin, doğrudan etiketli ve dolaylı olarak etiketlenmiş probları, ve problar birleştirebilirsiniz. Hem üreme ortakları önceden test PGT için özel ve uygun olduğu gösterildiği takdirde kullanılabilir olsa da bilinen polimorfik kromozom bölgeleri için sondalar (11, 12), ya da bilinen diğer kromozom (13) ile anlamlı bir çapraz melezleşme kaçınılmalıdır . Ayrımcı problar için kullanılabilir fluorochromes / hapten ve stratejileri şunlardır: Texas Kırmızı (TR), floresein izotiyosiyanat (FITC) SpectrumGreen (Vysis), SpectrumOrange (Vysis), SpectrumAqua, TR-avidin ile tespit biotinlenmiş probları, FITC avidin, ya da Cy-5 streptavidin (bir FarRed filtre kullanılarak görüntülendi), sarı renkli bir sinyal üretmek için, bir melezleşme ikinci) TexasRed ve SpectrumGold filtre kullanarak SpectrumOrange sıralı yakalama tarafından oluşturulan yuvarlak ve üçüncü bir renk, kırmızı ve yeşil probları bir karışımı.
, X ve Y kromozomları ve autosome bir sentromer bölgeler için özel üç probları, içeren bir prob seti, cinsiyet tayini (14) için tavsiye edilir; otozomal prob (2n, 47, trizomi X ayırt ploidi ve böylece kurmak için kullanılır XXX) ve triploidi (3n, 69, XXX) ve tetrazomi X (48, XXXX) ve tetraploidy (4n, 92, XXXX) arasında. Bu prob seti, çok düşük polimorfizm oranı olduğu gösterilmiştir ve bu nedenle tedavi öncesi çalışma üreme ortakları; tipik bir prob seti bu ayarı uygulanan alfa-uydu, X, Y ve 18 içeren Abbott AneuVysion karışımı (14) gerekli değildir.
Herhangi bir özel düzenlenmesi için prob karışımı gerekir: İdeal olarak, kromozom dengesizlik ile düzenlenmesi beklenen tüm ürünleri tespit etmek için en azından yeterli probları içerir. Bu mümkün değilse, prob tanınabilir bir gebelik cansız undetected dengesiz ürünler değerlendirilecek ve çok düşük prevalansı (14) kabul edilebilir olması muhtemel olduğu karıştırır. Hem de üreme ortaklarından kültürlü lenfosit metafaz üzerinde test edilecek. En az on metafaz yayılır prob özgüllük, polimorfizmleri ve çapraz hibridizasyon probları olarak yeniden düzenlenmesi farklı kesimleri bekleniyor melezleşme sağlamak için incelenir ve kromozom taşıyıcı için, olmalıdır. Buna ek olarak, bu hazırlıkların en az 100 interfaz çekirdekleri sinyal özgüllük, parlaklık ve Bağımsızlık (14) değerlendirmek için atılır gerekir.
Commercial PGS prob setleri mevcuttur (örneğin Abbott MultiVysion PB veya PGT), en sık anlayışının ürünleri anöploidi olarak bulundu kromozom hedefleme ve tek başına bir hedef kromozom prob oluşan. Genellikle çekirdeğin kromozom 13, 15, 16, 18, 21, 22, ve XY (14) için bir test sağlayan ek kromozomlar için ikinci bir hibridizasyon probları ile olabilir. Yayılması ve burada açıklanan FISH tekniği kullanarak bu testin prediktif değeri çoğu kişinin elinde kabul edilemeyecek kadar düşük olması muhtemeldir ve bu, rutin klinik kullanım (7, 15) için tavsiye edilmez.
Gibi tek hücrelere uygulanan karşılaştırmalı genomik hibridizasyon (CGH) gibi teknikler (2001. Wilton ve ark) her kromozom kopya sayısı için test edebilmek ve tek nükleotid polimorfizmleri (SNP) diziler ve kantitatif analiz (Wells ve ark. 2008) ya da "karyomapping" genotipleme (Handyside ve ark 2009) kromozom anöploidi tespit etmek için alternatif teknikler umut vericidir . Ancak, segmenti dengesizlik için çözünürlük sınırı ve doğruluğu belirsiz ve FISH tekniği küçük segmentleri içeren kromozom düzenlerinde tercih olmaya devam edecektir muhtemeldir.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| Hidroklorik Asit, 2.5L | VWR international | 101254H | |
| Sodyum Klorür, 5 kg | VWR international | 443827W | |
| Potasyum Klorür, 250g | VWR international | 26764.232 | |
| Susuz disodyum hidrojen ortofosfat, 500g | VWR International | 102494C | |
| Potasyum Diyedrojen Ortofosfat, 500g | VWR international | 10203 4B | |
| Sodyum Hidroksit Peletleri, 500g | VWR international | 28245.265 | |
| Tween20, 500mL | VWR international | 663684B | |
| Etanol, 2,5L | VWR international | 8.18760.2500 | Gümrük Vergisi Ödenmiş |
| Tri-Sodyum Sitrat, 5Kg | VWR International | 27833.363 | |
| Sığır Sakızı, 250 mL | Cow Proofings Ltd. | Artık mevcut değil | Eski stoklar hala sanat malzemeleri mağazalarında bulunabilir |
| DAPI/Antifade ES, 0,125μg/mL, 500ul | Cytocell Ltd. | DES500L | 150μflakon kapama’her bir Cytocell TEL Probu ile birlikte sağlanır |
| Tırnak Cilası, 12 mL | Botlar | 10088316001 | |
| Amin Kaplı Lamlar, 25 | Genetix | K2615 | |
| DAPI, 0,1 mL | Sigma-Aldrich | D-9542 | |
| Vectashield, 10mL | Vector Laboratories | H1000 | |
| Texas-Red-avidin, 0,001 mL | Vector Laboratories | A-2016 | |
| FITC-avidin, 0,001 mL | Vector Laboratories | A-2011 | |
| Cy-5 Streptavidin, 0,001 mL | GE Healthcare | PA45001 | |
| Mikrosantrifüj Tüpleri, 1,75 mL, 500'lü kutu | Thistle Scientific | AX-MCT-175-C | |
| Mikrosantrifüj Tüpleri, 0,6 mL, 1000'li kutu | Thistle Scientific | AX-MCT-060-C-CS | |
| 30 ml Üniversal Kaplar, 400'lü paket | Steril olan | 128B | NHS Supply Chain'den temin edilebilir, Kat No. KCP053 |
| Isıtıcı Blok | |||
| İspirto Ocağı İspirto Ocağı Yuvası İspirto Ocağı Fitili | VWR international | 451-0107 451-3112 451-3111 | |
| Tıpalı Cam Pipetler | Fisher Scientific | PMK-300-052R | |
| Diseksiyon Mikroskobu | Wild Heerbrugg | ||
| Kağıt mendil, 100 kutu | NHS TEDARİK ZİNCİRİ | MJT058 | |
| Metal Kültür Tepsileri | |||
| Plastik Melamin Tepsiler | VWR international | 682-009 | |
| Fırın | |||
| Ağız Pipeti Ağızlığı | Scientific Laboratory Supplies LTD | HAE3700 | |
| Tüpler | |||
| Şırınga Filtresi, 0,2 µmμm gözenek boyutu, 25 mm çap | Fisher Scientific | FDM-340-010U | |
| Elmas Kalem | VWR international | 818-0021 | |
| Lamlar için Isıtma Bloğu | Thermo Fisher Scientific, Inc. | HBOSBB | |
| Hibridizasyon Odası | |||
| Doku Rulosu | NHS TEDARİK ZİNCİRİ | MJT004 | |
| Schieferdecker Kavanozu | VWR international | 631-9313 | |
| Coplin Kavanozu | VWR international | 631-9331 | |
| İnce uçlu pens (Forceps, Fine) | VWR International | 232-2123 | |
| Küt uçlu penset | VWR international | 232-2113 | |
| 1000 mL Beher | VWR international | 213-1642 | |
| Faz Kontrast Mikroskobu | Nikon Instruments | E200 | |
| Lif içermeyen Blotlama Kartları, 100'lü kutu | Fisher Scientific | SDE1 | |
| Mavi Buzlu Mikroskop Lamı, 100'lü kutu | Scientific Laboratory Supplies LTD | MIC3022 | |
| Lamel, 18x18mm, No. 1, 200'lü kutu | Scientific Laboratory Supplies LTD | MIC3110 | |
| Lameller, 22x22mm, No. 0, 200'lü kutu | Scientific Laboratory Supplies LTD | MIC3104 | |
| Lamel, 22x50mm, No. 0, 100'lü kutu | Scientific Laboratory Supplies LTD | MIC3206 | |
| 1 mL şırınga, 100'lü kutu | NHS Tedarik Zinciri | FWC045 | |
| 1 mL Pipet Ucu, 1000'li 10 rak | Thistle Scientific | AX-T-1000-C-L-R | |
| İnkübatör | LEEC | ||
| Benmari | Hibe Ekipmanları | W22 | |
| Alkol Termometresi | Kullanılabilir çeşitli kaynaklar | ||
| pH Metre | Jenway | 3305 | |
| pH Elektrodu | VWR international | 662-1759 | Jenway pH metre 3305'e uygun BNC Konnektör |
| Isıtıcılı Karıştırıcı | Bibby | HC502 | |
| 1 mL Pasteur Pipetleri, 500'lü kutu | Scientific Laboratory Supplies LTD | PIP4202 | |
| Parafilm, 50mm x 75m | VWR international | 291-1214 |