Numune toplama ile ilgili tüm prosedürler enstitünün IRB yönergelerine uygun olarak gerçekleştirilmiştir.
1. Dilimlerin Ekler Üzerine Kaplanması
- 6 oyuklu bir plakanın her bir kuyusunu 1.200 μl dilim kültür ortamı ile doldurun. Kullanılmayan kuyucukları 1.200 μl PBS ile doldurun ve plakanın orta alanını 5 ml 1x PBS ile doldurun. Bu plakayı 37 °C'de saklayın.
- Oluklu kaşık aletini kullanarak, ek parçadaki ortama bir beyin dilimi yerleştirin ve dilimi tamamen suya batırılacak şekilde hafifçe itin. Tüm dilimler için tekrarlayın.
- Ek parçanın üstünden 1 ml dilim kültür ortamı çekmek için bir p1000 kullanın ve bunu kuyunun dibine dağıtın. Beyin diliminin etrafındaki agarozun kenarları görünür hale gelene kadar fazla ortamı çıkarın ve atın. Kalan dilimler için bunu yapın.
- Ek parçayı forseps ile kenarından alın, eğin ve fazla ortamı çıkarın. Ardından, eki hızlı bir şekilde 1 ml dilim kültür ortamı içeren 35 mm'lik2'lik bir tabağa aktarın. Dokunun etrafındaki agarozu çıkarmak için 2 çift keskin forseps kullanın, zarı germeye/hasar vermemeye, dilimlememeye veya zarda bir delik açmamaya dikkat edin (en kolayı, agarozun en kenarından bir yırtık yaparsanız, ardından agarozu her iki taraftan da ayırın). Ardından, eki 6 oyuklu plakaya geri getirin ve kalan dilimler için tekrarlayın.
- Üfleyici kapalıyken bir doku kültürü başlığında (dilimlerin kurumasını önlemek için), her zardan agaroz parçalarını çıkarın.
- Dilimleri adım 1.1'de hazırlanan 6 oyuklu plakaya aktarın ve plakayı 37 °C'de saklayın. Dilimleri 24-48 saat inkübe edin.
2. Dilim Kültür Ortamını Değiştirme
- Adım 1.1'i 6 oyuklu yeni bir plaka ile tekrarlayın.
- Üfleyici kapalıyken bir doku kültürü davlumbazında, ekleri taze dilim ortamı içeren yeni 6 oyuklu plakalara aktarın.
3. Tümör Hücrelerinin Dilim Üzerine Kaplanması
- Cm-DiI boyasını sonikasyon yapın ve 2 dakika boyunca orta hızda döndürün.
- Kaplama için kullanılan tümör hücrelerini 5 dakika boyunca 201 x g'da döndürün. Daha sonra 2 ml dilim kültür ortamında tekrar süspanse edin.
- 2 ml hücre ve ortama 7 μl Cm-DiI ekleyin ve 37 ° C'de 20 dakika inkübe edin.
- Hücreleri 5 dakika boyunca 201 x g'da döndürün ve 200 μl dilimleme ortamında yeniden süspanse edin. Hücreleri ayırmak için hafifçe öğütün (10-20 kez veya pelet gidene kadar) ve ardından 1.000 μl toplam hacim elde etmek için 800 μl dilimleme ortamı ekleyin.
- Tripan mavisi kullanarak canlı tümör hücrelerini sayın. Tümör hücrelerine hücrelerle aynı konsantrasyonda yeşil floresan mikroküreler ekleyin. Bu inert mikro küreler bir kontrol görevi görecektir. Hücre / mikroküre karışımını 5 dakika boyunca 201 x g'da döndürün ve istenen miktarda dilim kültür ortamında yeniden süspanse edin. 65 μl hacimde 6.000 hücre/dilim yoğunlukta plaka hücreleri. Dilim başına kaplanan hücre sayısı, tercihe ve kullanılabilirliğe bağlı olarak artırılabilir.
- Doku kültürü başlığında, hücreleri 65 μl ortam/dilim halinde dilimin ortasına dağıtın.