1. Organoid dilimlerin immün boyanması
- Organoid kesitleri içeren mikroskop slaytlarını, arka arkaya 50 slayta kadar tutarak 10 mL önceden ısıtılmış 1x PBS'li bir kopma kavanozuna yerleştirin.
not: Tüm organoid bölümler sıvıya batırılmalıdır.
- Slaytları dejelatinize etmek için 37 °C'de 45 dakika inkübe edin.
- RT'de 5 dakika boyunca 50 mL 1× PBS ile 1x'i yıkayın: Slaytları taze 1× PBS içeren bir koparma kavanozuna aktarın.
- Slaytları 50 mL taze hazırlanmış glisin (Tablo 1) içeren bir küpe kavanozuna aktarın ve RT'de 10 dakika inkübe edin.
- Slaytları 50 mL% 0.1 triton içeren bir başa çıkma kavanozuna aktarın (Tablo 1) ve RT'de 10 dakika geçirgenleştirin.
- 1× PBS ile 5 dakika 2 kez yıkayın.
- İmmün boyama kabını 1× PBS'ye batırılmış 3 mm kağıtla hazırlayın. Slaytları dilimlerin her tarafını mendille kurulayın ve 3 mm'lik kağıda yerleştirin. Bir Pasteur pipeti ile slaytların tüm yüzeyini, slayt başına 0,5 mL olacak bir bloke edici solüsyonla (Tablo 1) kaplayın. RT'de 30 dakika inkübe edin.
- Fazla engelleme solüsyonunu çıkarın ve slaytları dilimlerin her tarafında bir mendil ile kurulayın. Bölümlerin üzerine blokaj çözeltisi içinde seyreltilmiş 50 μL primer antikor (Tablo 2) yerleştirin ve lamellerle örtün. Dilimleri önceden hazırlanmış bir immün boyama kabına yerleştirin. Gece boyunca 4 °C'de inkübe edin.
- Slaytları 50 mL TBST (Tablo 1) içeren bir kovalama kavanozuna aktarın, lamellerin düşmesine izin verin ve TBST ile 5 dakika 3 kez yıkayın.
- Bölümlerin üzerine blokaj solüsyonu içinde seyreltilmiş 50 μL ikincil antikor yerleştirin ve lamellerle örtün. Dilimleri önceden hazırlanmış immün boyama kabına yerleştirin. RT'de ışıktan korunarak 30 dakika inkübe edin.
- Slaytları tekrar bir copling kavanozuna aktarın ve 50 mL TBST ile 5 dakika 3x yıkayın.
- Slaytları dilimlerin her tarafına doku ile kurutun ve dilimleri önceden hazırlanmış bir immün boyama kabına yerleştirin. Bir Pasteur pipeti ile slaytların tüm yüzeyine 0,5 mL DAPI solüsyonu ekleyin. RT'de 5 dakika inkübe edin.
- Adım 1.9'u tekrarlayın.
- Slaytları bir mendille dikkatlice kurulayın. Slayt boyunca damla damla 50 μL montaj ortamı ekleyin ve ardından kabarcıkları önlemek için hafifçe bükerek her bir lamel üzerine dikkatlice bir lamel indirin.
Tablo 1: Kriyoseksiyon ve immünoboyama için organoidlerin hazırlanması için çözeltiler. Kriyoseksiyon ve immüno-boyama için organoidlerin hazırlanmasında kullanılan çözeltileri hazırlamak için kullanılan tüm bileşenler ve hacimler listelenmiştir.
Jelatin / Sükroz
Nihai konsantrasyon:% 7,5 /% 15 w / w | 1. Steril bir Schott Cam Şişede 15 g sükroz ve 7.5 g jelatini tartın ve iyice karıştırın
2. PBS 1x'i 65 °C 'de önceden ısıtın
3. 100 g'lık son ağırlığa önceden ısıtılmış PBS 1x ekleyin ve iyice karıştırın
4. Schott Cam Şişeyi 65 °C'de bir ısıtma plakasına yerleştirin ve jelatin eriyene kadar sallayın
5. Çözelti stabilize olana kadar 37 ° C'de inkübe edin |
Glisin
Nihai konsantrasyon: 0,1 M | 50 mL taze hazırlanmış PBS 1x'e 0.37 g glisin ekleyin. |
Triton çözümü
Nihai konsantrasyon: %0,1 w/v | 1. %10'luk bir Triton X-100 stoğu hazırlayın: 50 mL PBS 1x içinde 5 g Triton X-100
2. 50 mL PBS 1x'e 0,5 mL Triton X-100 stoğu ekleyin. |
TBST
20 mM Tris-HCl pH 8.0, 150 mM NaCl, % 0.05 w/v Tween-20 | 20 mL tris 1 m
30 mL NaCl 5 M
5 mL Tween-20 (%10 stok: 50 mL suda 5 g Tween-20)
1 L'ye kadar su ile doldurun. |
| Engelleme Çözümü | 50 mL TBST'ye 5 mL fetal sığır serumu (FBS, nihai konsantrasyon:% 10 v / v) ekleyin. |
| DAPI çözümü | 10 mL damıtılmış suya 15 μL DAPI stok çözeltisi (1 mg / mL) ekleyin |
| Mowiol (Mowiol) | 1. 6 g gliserole 2,4 g Mowiol ekleyin ve önceden ısıtılmış bir plakada 50 °C 'de 1 saat çalkalayın
2. 6 mL damıtılmış su ekleyin ve 2 saat < br / > çalkalayın
3. 12 mL Tris 200 mM (pH 8.5) ekleyin ve 10 dk çalkalayın
4. 5.000 × g'da 15 dakika santrifüjleyin5. Aliquot ve -20 °C'de saklayın. |
Tablo 2: Birincil antikorlar. İmmün boyama için kullanılan primer antikorlar, klon ve optimize edilmiş dilüsyonlar listelenmiştir.
(İngilizce)
Serisi
| antikor | Ev sahibi türler | Seyreltme |
| BARHL1 | tavşan | 1/500 |
| CALBINDIN | tavşan | 1/500 |
| MAP2 | fare | 1/1000 |
| N-KADERİN | fare | 1/1000 |
| NESTIN (NESTIN) | fare | 1/400 |
| OLIG2 | tavşan | 1/500 |
| KIŞI 6 | tavşan | 1/400 |
| SOX2 | fare | 1/200 |
| TBR1 | tavşan | 1/200 |
| TBR2 | tavşan | 1/200 |
| TUJ1 | fare | 1/1000 |