Mitokondriyal füzyon; mitokondriyal kalsiyum homeostazı, biyoenerjetik, otofaji ve kalite kontrolünde temel bir rol oynar. Füzyon, canlı hücrelerde mitokondrilerin bir kısmına hedeflenmiş matris içi fotoaktive edilebilir GFP'nin (mtPAGFP) fotokonversiyonu ile nicelleştirilir. Fotokonverte olan moleküllerin tüm mitokondri popülasyonu boyunca dengelenme hızı, füzyon aktivitesinin bir ölçüsü olarak kullanılır. Şimdiye kadar ölçümler, bir saat boyunca tek bir hücredeki dengelenmeyi nicelleştiren tek hücreli zaman geçimli (time-lapse) bir yaklaşım kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Burada, mtPAGFP ve düşük konsantrasyonlu TMRE (15 nm) kullanımına dayanan, daha önce yayınlanmış bir canlı hücre yöntemini ölçeklendiriyor ve otomatikleştiriyoruz. Bu yöntem, mitokondriyal ağın küçük bir kısmının fotoaktive edilmesini, 1 saat boyunca her 15 dakikada bir yüksek çözünürlüklü konfokal kesit dizilerinin toplanmasını ve sinyal yoğunluğundaki değişimin nicelleştirilmesini içerir. PAGFP eksprese eden hücreleri bulmanın kolaylığı ve fotoaktive edilen bölgelerin sinyali gibi çeşitli faktörlere bağlı olarak, 15 dakikalık aralıklarda yaklaşık 10 hücre toplamak mümkündür. Bu durum, yüksek çözünürlüklü subcellular nicelleştirmeyi ve mitokondriyal davranışın doğal sitoarkitektürel ortamındaki ayrıntıları yakalamak için gerekli olan kinetik parametreleri korurken, bu analiz yönteminin zaman verimliliğinde önemli bir iyileşme sağlar.
Mitokondriyal dinamikler; solunum, kalsiyum düzenlemesi ve apoptoz dahil olmak üzere birçok hücresel süreçte rol oynar1,2,3,13. Mitokondriyal ağın yapısı, mitokondrilerin işleyişini ve hücrenin geri kalanıyla etkileşim kurma biçimlerini etkiler. Sürekli bölünme ve füzyona uğrayan mitokondriyal ağlar, yüksek derecede kaynaşmış ağlardan daha fragmente olmuş yapılara kadar çeşitli şekiller alır. İlginç bir şekilde, Alzheimer hastalığı, Parkinson hastalığı, Charcot Marie Tooth 2A ve dominant optik atrofi, değişmiş mitokondriyal morfolojiyle, özellikle de fragmente ağlarla ilişkilendirilmiştir4,10,13. Çoğu zaman, fragmantasyon sonrası mitokondriler depolarize olur ve bu durumun birikmesi hücre fonksiyonlarının bozulmasına yol açar18. Mitokondriyal fisyonun, hücreye apoptoza doğru ilerlemesi için sinyal verdiği gösterilmiştir. Ayrıca, ağın genelini sağlıklı tutmak için depolarize ve inaktif mitokondrileri ayırmanın bir mekanizmasını da sağlayabilir14. Öte yandan, mitokondrilerin füzyonu; matriks proteinlerinin, çözünenlerin, mtDNA'nın ve elektrokimyasal gradyanın paylaşılmasını sağlar ve apoptoza ilerlemeyi önlediği görülmektedir9. Mitokondriyal fisyon ve füzyonun hücre homeostazını ve nihayetinde organizmanın işleyişini nasıl etkilediğinin daha iyi anlaşılması gerekmektedir; bu nedenle, bu fenomenler hakkında bilgi toplama yöntemlerinin sürekli geliştirilmesi ve optimize edilmesi gereklidir.
Mevcut mitokondriyal füzyon analizleri, her birinin kendine özgü avantajları olmak üzere, mitokondriyal fizyolojiye dair çeşitli bilgiler sağlamıştır. Hibrit PEG füzyon analizi7, farklı şekilde işaretlenmiş iki hücre popülasyonunu (mtRFP ve mtYFP) karıştırır ve füze olmuş, çok çekirdekli hücrelerdeki floroforların karışma ve kolokalizasyon miktarını analiz eder. Bu yöntem değerli bilgiler sağlamış olsa da, tüm hücre tipleri füzyon yapamaz ve füzyonun stimüle edildiği koşullar, muhtemelen normal füzyon sürecini etkileyen toksik ilaçların kullanımını içerir. Daha yakın zamanda, bir lüsiferaz analizine1,5 dayanarak füzyon olaylarını gözlemlemek için izole mitokondrilerin kullanıldığı hücre dışı bir teknik geliştirilmiştir. İki insan hücre hattı, karıştığında dimerizasyonu sağlamak için bir lösin fermuarı ile birlikte Renilla lüsiferazın ya amino veya karboksi terminal kısmıyla hedeflenir. Mitokondriler her bir hücre hattından izole edilir ve füzyon yaptırılır. Füzyon reaksiyonu, enerji, uygun sıcaklık ve iç mitokondriyal membran potansiyelinin varlığında, fizyolojik koşullar altında sitozol olmadan gerçekleşebilir. İlginç bir şekilde, sitozolün füzyon derecesini modüle ettiği bulunmuş ve bu da hücre sinyalizasyonunun füzyon sürecini düzenlediğini göstermiştir 4,5. Bu analiz, füzyon mekanizmasının bileşenlerini ve ayrıca mitokondriyal dinamikleri etkileyebilecek farmakolojik bileşikleri belirlemek için yüksek kapasiteli taramalarda oldukça yararlı olacaktır. Bununla birlikte, bu in vitro analizi tamamlamak ve bu olayları hücresel bir ortamda gözlemlemek için daha ayrıntılı tüm hücre mitokondriyal analizlerine ihtiyaç duyulacaktır.
Tüm hücre mitokondriyal dinamiklerini izlemek için bir süredir kullanılan bir teknik, mitokondriyal hedeflenmiş fotoaktive edilebilir GFP (mtPAGFP) kullanımı üzerine kuruludur6,11. mtPAGFP ekspresyonu sonrası, mitokondriyal ağın küçük bir kısmı (10-20%) fotoaktive edilir ve sinyalin mitokondriyal ağın geri kalanına yayılımı, zaman ayarlı konfokal görüntüleme kullanılarak 1 saat boyunca her 15 dakikada bir kaydedilir. Her füzyon olayı sinyal yoğunluğunun seyrelmesine yol açar, bu da füzyon hızının kantifikasyonuna olanak tanır. Hücrelerde füzyon ve fisyon sürekli olarak gerçekleşse de, fisyon PAGFP sinyalinin seyrelmesine yol açmadığı için bu teknik yalnızca füzyonu izler6. Düşük seviyelerde TMRE (INS1 hücrelerinde 7-15 nM) ile birlikte işaretleme, mitokondrilerin membran potansiyelinin kantifikasyonuna izin verir. Mitokondriler hiperpolarize olduğunda daha fazla TMRE alırlar ve depolarize olduklarında TMRE boyasını kaybederler. Depolarize olan mitokondriler artık yeterli membran potansiyeline sahip değildir ve hiç füzyon yapmasalar bile, verimli bir şekilde füzyon yapma eğiliminde değildirler. Bu nedenle, aktif füzyon yapan mitokondriler bu düşük TMRE seviyeleri ile takip edilebilir9,15. TMRE sinyali taşımayan depolarize mitokondrilerin birikimi, fototoksisitenin veya hücre ölümünün bir işareti olabilir. Yüksek TMRE konsantrasyonları mitokondrileri lazer ışığına karşı çok hassas hale getirir, bu nedenle TMRE ile aşırı işaretlemeden kaçınmak için büyük özen gösterilmelidir. Eğer mitokondrilerin depolarizasyon etkisi ilgi alanıysa, mitokondrileri kontrollü bir şekilde depolarize etmek için biraz daha yüksek TMRE seviyeleri ve daha yoğun lazer ışığı kullanan bir teknik uygulanabilir (Mitra ve Lippincott-Schwartz, 2010). TMRE kaynaklı toksisitenin bir sorun olmadığını doğrulamak için, yüklenmiş hücrelerin (3-15 nM TMRE) analizde kullanılacak görüntüleme parametrelerine (belki arka arkaya 6 optik kesitten oluşan 7 stack) maruz bırakılmasını ve 2 saat sonra hücre sağlığının değerlendirilmesini öneriyoruz. Mitokondriler çok fragmante görünürse ve hücreler ölüyorsa, TMRE yerine dsRED veya Mitotracker red gibi diğer mitokondriyal markerlar kullanılabilir.
mtPAGFP yöntemi, diğer yöntemlerle görselleştirilemeyen mitokondriyal ağ davranışına dair ayrıntıları ortaya çıkarmıştır. Örneğin, mitokondriyal füzyonun; matris içeriğinin genel ağ morfolojisini değiştirmeden karışabildiği tam veya geçici türde olabileceğini artık biliyoruz. Ayrıca, füzyon olasılığının temas süresinden ve organel boyutundan bağımsız olduğunu; organel motilitesi, membran potansiyeli ve önceki füzyon aktivitesi geçmişinden etkilendiğini biliyoruz8,15,16,17.
Bu makalede, subcellular çözünürlükten ödün vermeden aynı anda birden fazla hücreyi incelemek ve veri toplama zaman verimliliğini artırmak amacıyla, mtPAGFP ve 15nM TMRE8 kullanılarak daha önce yayınlanmış protokolün ölçeklendirilmesine yönelik bir metodoloji tanımlıyoruz. Bu, otomatik bir mikroskop tablası ve programlanabilir görüntüleme yazılımı kullanımıyla mümkün olmuştur. Zeiss'in Zen yazılımı, kullanıcının mtPAGFP eksprese eden belirlenmiş birkaç hücreyi işaretlemesine ve takip etmesine olanak tanır. Bu hücrelerin her biri, belirli bir ilgi bölgesinde fotoaktive edilebilir ve konfokal kesit yığınları, belirlenen aralıklarla hem mtPAGFP sinyali hem de TMRE için izlenebilir. Programlanabilir otomatik bir tabla, CO2 içeren bir inkübatör ve PAGFP'yi fotoaktive edecek bir yöntem (ya bir multifoton lazer ya da 405 nm diyot lazer) mevcut olduğu sürece, bu protokolü gerçekleştirmek için diğer konfokal sistemler de kullanılabilir.