Tüm deneyler William and Mary College Kurumsal Hayvan Bakım ve Kullanım Kurulu tarafından onaylanan protokolleri takip yapılmaktadır. Bu protokolde atıfta Gelişim aşamaları Nieuwkoop ve Faber 46 göredir.
1. Teşrih
- Hücre Kültürü Orta ve oda sıcaklığına gelmesini Kalsiyum Magnezyum Ücretsiz Medium (CMF) izin verin. Ayrıca 0,1 X Marc Modifiye Ringer (MMR) pH 7.4-7.6 gerekir.
- Bir hücre kültür laminer akış başlık içinde 30 dakika süre ile bir UV ışını uygulanarak aşağıdaki öğeleri sterilize edin. (Davlumbaz yerleştirmeden önce% 70 etanol ile her öğenin püskürtün.)
- 35 mm plastik Petri kapları.
- 60 mm plastik Petri kapları.
- 35 mm Nunclon yüzey yemekleri.
- 1,5 ml mikrosantrifüj tüpleri.
- P1000 mikropipet (1.000 ul mikropipet).
- Aerosol dayanıklı P1000 ipuçları (1.000 ul mikropipet Aerosol dayanıklı ipuçları).
- Alkoldayanıklı kalem.
- Forseps diseksiyon Güzel.
- * 15 ml konik boru (sadece görüntüleme kalsiyum etkinlik için).
- * Sadece kalsiyum aktivite görüntüleme için.
- Kaput UV sterilize ve çözümleri oda sıcaklığına sahip edildikten sonra, kaputun% 70 etanol ve yerde medya şişeleri ile eldiven ve medya şişeleri yıkadığınız, kaputu laminer hava akışı açın.
- Kaput içinde uygun etiketleme sağlanması, hücrelerin her bir plaka için P1000 mikropipet ile aşağıdaki hazırlamak.
- Diseksiyon Levha - Bir 60 mm plastik Petri kabı 10 ml Hücre Kültürü Orta içeren.
- Kültür Levha - Bir 35 mm Nunclon yüzey çanak 2 ml Hücre Kültürü Orta içeren. (Nunclon plastik tabaklar başka herhangi bir yapıştırıcı ile tedavi edilmez.)
- Bir boş 1,5 ml mikrosantrifüj tüp-Eksplantasyon Ayrışma Tüp.
- * Bir adet 15 ml konik şahintüp 15 ml Hücre Kültürü Orta içeren. Aşırı Fluo4-AM görüntüleme kalsiyum aktivitesi zaman dışarı yıkamak için.
- Kaput içinde, her diseksiyonu oturum için P1000 mikropipet (birden fazla retinada tek oturumda disseke edilebilir) ile aşağıdaki hazırlamak.
- 2 ml CMF içeren bir 35 mm plastik Petri kabı - Eksplantasyon Plaka durulayın.
- Eksplantasyon Disosiyasyon Levha - 2 ml CMF içeren bir 35 mm plastik Petri kabı.
- Kaput dışında aşağıdaki hazırlayın:
- 10 ml 0,1 X MMR içeren hücre plaka başına biri 60 mm plastik Petri kabı - Plaka Holding.
- 10 ml 0,1 X MMR içeren hücre plaka başına biri 60 mm plastik Petri kabı - Kardeş Plate.
- Anestezisi Levha - 10 ml 0,1 X MMR + 0.5 mg / ml MS-222 (tricaine) içeren diseksiyon seans başına bir 60 mm plastik Petri kabı.
- Eksplantasyon Ayrılma Plakası (% 0.1 tripsin solüsyonu ile sonuçlanan), karıştırmak için girdap CMF 40 ul% 5 tripsin ekleyin ve bir kenara koyun.
- Aşamada 30 yaşından küçük bir embriyo diseksiyon varsa, Dissection Levha (bir 1 mg / ml kollajenaz B çözeltisi ile sonuçlanan), çözülür ve kenara girdap 10 mg Kollajenaz B ekleyin.
- Istenen aşamada bir embriyo seçin, steril olmayan bir transfer pipet ile Holding Tabak aktarmak ve ince forseps kullanarak vitellin membran (embriyo henüz yumurtadan değil ise) çıkartın.
- Transferi birkaç aynı steril olmayan bir transfer pipet ile Kardeş Plate embriyolar sahneledi.
- Embriyo 25 veya eski ise, steril olmayan bir transfer pipet ile anestezisi Plate embriyo transferi ve hareket ve uyaranlara yanıt durana kadar embriyo oturmasına izin aksi diseksiyon ile doğrudan devam. Bu sürebilirkadar bir dakika.
- Diseksiyon kapsamı (4X objektif, 10X oküler) altında diseksiyon (Şekil 2) ile devam edin.
Embriyo aşaması için 25 veya daha genç:
- Steril olmayan bir transfer pipet ile Diseksiyon Plate embriyo transfer.
- Ince forseps iki çift kullanarak, posterior ucundan başlayan ve embriyo ön kısmında çimento bezi mecraını, embriyonun ventral tarafında bir midsagittal kesim yapmak.
- Kesme ya da kenarından tutup sağ ve sol yayarak embriyo dikkatlice açın. Diseksiyon Tabak içine bakan sırt tarafında bir embriyo ve ventral ektoderm ile bu sonuçlar içinde endoderm ve mezoderm ortaya çıkarmak için açık yayıldı.
- Endoderm ve mezoderm (Şekil 2A ve 2B) kaldırarak başlayın. Bu doku ilk ve en büyük tabaka ile görünüş olarak çok "kabarık" olduğubüyük hücreler ve az belirgin organizasyonu.
- Bu katman çıkardıktan sonra, Somitlerin ve Notokordun görünür hale gelecektir. Daha iyi kontrast için, 10 ml Hücre Kültürü Orta ve Diseksiyon Plaka geri aktarmadan önce 2-3 dakika süreyle Nil Mavi Sülfat 1% çözelti 100 ul (suda) içeren ayrı bir 60 mm plastik Petri kabı embriyo taşıyın. Bu kolay tanımlama ve yönlendirme için ektoderm, Somitlerin ve Notokordun leke olacaktır.
- Embriyonun ön kısmı üzerinde yoğunlaşırken, dikkatle Notokordun ve beyin ve optik veziküller (Şekil 2C) maruz kalan mezoderm çıkarın.
- Beyin ve optik veziküller tamamen maruz sonra, beynin sadece posterior nöral tüp ve altta yatan ektoderm sever forseps kullanın.
- Ektoderm üstüne o kadar fazla bu kısmı (beyin ve optik veziküller) çevirin.
- Dikkatli, temel optik veziküller zarar vermemeye özen yeniden alınması(Şekil 2B) ektoderm taşıyın.
- Nihayet, forseps kullanarak, beyin (Şekil 2D ve 2E) gelen optik veziküller ayırın.
: Sahne 25 fazla embriyo yaşlı için
- Embriyo anestezisi Levha iken, forseps ile embriyonun ventral kısmı çıkarın.
- Daha iyi kontrast için, 10 ml 0,1 X MMR ve Diseksiyon Plaka aktarmadan önce 2-3 dakika süreyle% 1 Nile Blue Sülfat 100 ul içeren bir 60 mm plastik Petri kabı embriyo taşıyın. Bu ektoderm mavi leke olacaktır.
- Bir kez Diseksiyon Plate, retina (veya embriyo aşaması 26-30 için optik vezikül) (Şekil 2F ve 2G) örten ektoderm geri çekin. Nile Blue Sülfat kullanılmışsa, ektoderm mavi lekeli ama altında yatan retina dokusunun olmaz edilecektir.
- Fo ile dikkatlice retina veya optik vezikül kaldırrceps (Şekil 2H, 2I ve 2J). Bu forseps bir çift ile yerine embriyo tutun ve retina veya diğer optik vezikül kaldırmak için yardımcı olur.
2. Doku ve Hücre Kaplama Ayrışma
Önemli Not - dokuları aktarırken, retina veya optik vezikül herhangi bir hava-sıvı sınırları temas etmesine izin vermez; bu oluşursa olmuş akyuvarlar olacaktır.
- Optik vezikül veya retina diseke edildikten sonra, dikkatle Aerosol dayanıklı ipuçlarını kullanarak p100 mikropipet ile Tabak durulayın ve 30 sn için oturup izin Eksplantasyon aktarmak.
- Eksplantasyon Disosiyasyon Tube Eksplantasyon Ayrılma Levhadan CMF% 0.1 tripsin 80 ul aktarın.
- Bir p100 mikropipet ve aerosol dayanıklı ipuçlarını kullanarak, Eksplantasyon gelen retina veya optik vezikül aktarmak Eksplantasyon Dissociati için Plaka durulayınTube, eksplant transferi kaçınarak çözüm durulayın.
- Doku, oda sıcaklığında 1 saat boyunca Eksplant ayrışma Tüp içinde ayrıştırmak için izin verin. Bir retina plaka başına kullanıldı, ancak bunun çok plaka başına hücrelerin sayısını arttırmak için arzu edilirse, birden fazla levha başına kullanmak mümkün olduğunu not edin.
- Plaka hücreleri için, önce yavaş yavaş Eksplantasyon Ayrılma tüp solüsyon 40 ul kaldırmak ve p100 mikropipet ve aerosol dayanıklı ipuçlarını kullanarak atın. Bir p100 set 40 ul ve aerosol dayanıklı ipuçlarını kullanarak, Kültür Plate hücreleri (şimdi doku ayrışmış olduğunu) aktarın. Plaka üzerine hücreleri aspire zaman, yavaş yavaş, pipet ve plaka merkezinde, küçük bir alanda hücreler tutun.
Not: hücrelerinin birden fazla görüntü deney boyunca alınacak ise, Kültür Plate alt etmek için bir ızgara (Cellattice) ekleyin . Bu aynı yönlerde aynı hücrelerin görüntüleri prosedürü farklı noktalarda alınması gereken izin verecektir.
- Hücreler Nunclon plaka uymak için en az 1 saat süreyle rahatsız edilmeden bekletin. Bu süreden sonra, onlar çok nazikçe tedavi edilmelidir veya müstakil hale gelebilir.
- Hücreleri gibi, aynı sıcaklıkta yetiştirilir kardeş embriyolar izlenerek istenen aşamada Kültür hücreleri. Canlı hücreler ileri işleme için kullanılan değilseniz, onlar şu anda MEMFA solüsyonu ile tesbit edilebilir.
Önemli Not: Bizim deneylerin çoğu hücreleri kaplama 6 saat içinde sabittir. Kültür hücrelerin ömrü doku ayrılmakta aşamayı ve hücreler hala mevcut olan yumurta sarısı miktarına bağlıdır; hücrelerinden elde ederken küçük (neurula aşamaları) dan parçalanmış hücreler 5-6 gün boyunca kültür içinde sağlıklı kalır Büyük embriyolar (iribaş yüzme) aşamaları 2-3 gün kültüründe canlı kalacaktır.
3. Kalsiyum Görüntüleme 47-49
Bu protokol kalsiyum duyarlı bireysel hücrelerin kalsiyum geçici ölçmek Fluo4-AM ve konfokal mikroskopi kullanır. Fluo4-AM kullanan tüm adımlar Fluo4-AM, ışığa duyarlı olduğu için, ışıktan uzakta yapılmalıdır. Tüm yıkar eklenen veya P1000 mikropipet ve aerosol dayanıklı ipuçlarını kullanarak çıkarılmalıdır. Pipetleme yavaş yavaş ve hücreler rahatsız etmemek için levha kenarına doğru yapılması gerekir. Kültürler genellikle disseke 6 saat içinde sabit olduğundan Medya değiştirilmez. Daha uzun süreli kültürler için, her gün ortam değiştirilmesi gerekir.
- Fluo4-AM -20 ° C'de saklanır ve biz 5 ul alikotları saklamak öneririz. Kullanmadan önce, ışıktan uzak Fluo4-AM bir 5 ul kısım Çözülme ve doğrudan bu kısım için Pluronic F-127 2 ul ekleyin.
- Zaman, istenen miktarda için kültür sonrası hücreler (en azından1 saat), kültür plakasına hücre kültürü aracı maddesi 1 ml çıkarın. Nazik pipetleme tarafından karıştırılması, Fluo4-AM ve Pluronic Bu ekle.
- Yavaş yavaş görüntülenmek üzere hücrelerin kültür plakasının kenar geri Bu çözeltinin her aktarmak ve Fluo4-AM, emme ile 1 saat boyunca rahatsız edilmeden bu çözelti içinde hücreler bırakın.
- Yıkamak için hücre kültür ortamından Fluo4-AM fazlalığı, aşağıdaki yıkama serisi tamamlayın:
- Plaka ortam 1 ml çıkarın.
- Plaka taze hücre kültür ortamı, 3 ml (15 ml konik borudan) ekleyin.
- İki ek yıkama sıvıları, her zaman yavaş yavaş plaka çözeltisi, 3 ml taze çıkarılması ve hücre kültür ortamı, 3 ml ekleme yapın.
- Hücreler hemen hücre kültür aracı maddesi içinde 4 ml olmak ve Fluo4-AM içermelidir. Fluo4-AM, enzimatik olarak hücre difüzyon üzerinden ya da herhangi bir membrana bağlı bölme içine önlenmesi, hücre içinde bir kere kesildi.
- Kültür karışmasını işaretleyici partikülleri önlemek için kapağı tutarken görüntüleme için konfokal mikroskop sahneye plaka yüklemeden önce, yemeğin üzerine kalıcı bir kalem ile bir kırmızı dikey çizgi çizin. Dikey çizgi Petri kabı (Petri kabı değil, kapağın taban) bir tarafı aşağı çekilir. Bunun amacı, tek tek hücrelerin kesin oryantasyon ve hizalama sonraki bir noktada yeniden oluşturulmasını sağlar, öyle ki, görüş alanı ile ilgili olarak kültür plakasının yönünü göstermek içindir.
- Plaka hemen görüntüleme için eş odaklı mikroskop aşamasında üzerine yüklenmesi için hazır hale gelir. Konfokal mikroskop (objektif 20X) tarama bir lazer üzerinde parlak bir alan ayarları kullanarak hücrelerin gözünüzde canlandırın. Daha sonra daha kolay görüş aynı alanda bulma yapmak Cellatice lamel büyük ızgara numaralarını içeren bir görüş alanı ile, tercihen kümeleri içermiyor yoğun hücrelerin bir alan bulun yaparken si sonra görüntüleme kültürütu hibridizasyon. Görüntüleme öncesinde, kültür aracılığıyla aşağı odaklanmak ve hücre kültürü yerini ve yönünü kaydetmek için hücrelerin altındaki grid parlak bir alan görüntü çekmek. Bu, daha sonraki analiz için hücrelerin yeniden düzenlenmesi için olanak sağlar.
- Odak düzlemi kaldırın ve başlangıç kalsiyum görüntüleme (Şekil 3A) öncesinde hücrelerin parlak bir alan görüntü yakalayabilir.
- Hücrelerin orta odak düzleminde sonra, plaka kalsiyum etkinlik görüntülenmesi için hazır hale gelir. Ayarlar mikroskop ve uygulamaya bağlı olarak değişecektir. Bu görüntü, aşağıdaki parametreler ile, 1, 2, ya da 12 saat boyunca bir argon 488 nm lazer kullanarak hücreleri:
- 1 saat görüntüler:
- Argon 488 nm lazer maksimum 30 mW güç% 4 tarar.
- Her 4 sn (saat başına 900 taramalar) kez tarayın.
- 2 saat görüntüler:
- Argon 488 nm lazer maksimum 30 mW güç% 4 tarar.
- Her kez tarayın8 sn (saat başına 450 taramalar).
- 12 saat görüntüler:
- Argon 488 nm lazer maksimum 30 mW güç% 2 tarar.
- Her 48 sn (saat başına 75 taramalar) kez tarayın.
Bu parametreler, her bir zaman dilimi için 900 hareketsiz çerçeve görüntüleri bir dizi neden olur. Kalsiyum aktivite sonra bu ImageJ 50 gibi bir görüntü işleme uygulaması kullanımı ile zaman ders görüntüleri (Şekil 3B) üzerinde floresans düzeyleri analiz tarafından kaydedilebilir.
4. Hücreleri Tespit
- Görüntüleme takiben, hücreler plaka çözelti 3 ml kaldırma ve kültür ortamının kalan 1 ml 1 ml 2X MEMFA ekleyerek 30 dakika boyunca sabit olabilir.
- Tespit edildikten sonra, MEMFA kaldırmak ve 5 dk yıkama, her biri 1 ml'lik bir hacim, bir dizi olan hücreler kurutmak:
- 1X fosfat-tamponlu salin (PBS) içinde% 25 etanol.
- 1X PBS içinde% 50 etanol.
2 O (steril deiyonize saf su) li>% 75 etanol. - -20 ° C'de 1 ml% 100 etanol ve plaka deposu ile son yıkama yerine
Not: Metanol ayrıca, bu yıkama için ve depolama için de kullanılabilir.
5. Floresan in situ Hibridizasyon (FISH)
Anderson Lab 52 tarafından özetlendiği gibi hücre kültürü için modifikasyonlar ile 51 tarif Kültürleri Xenopus için standart FISH protokolü kullanılarak test edilebilir. Anderson Lab protokolü Değişiklikler aşağıda listelenmiştir. Aksi belirtilmediği sürece tüm yıkar, yaklaşık 1 ml hacminde 35 mm Nunclon plakalar üzerinde gerçekleştirilmiştir. Solutions olarak Sive et al tanımlandığı gibidir. 53 aksi belirtilmediği sürece.
Önemli Not: için görüntülü hücreleri üzerinde in situ hibridizasyon yaparken floresein etiketli RNA problar kullanmayınkalsiyum aktivite. Anti-floresein antikorları rezidüel hücreleri Fluo4-AM ve kültürün tüm hücrelerde pozitif sinyal neden olabilir bağlanacaktır.
1. Gün: permeabilization ve Hibritleşme
- Rehidrasyon yıkama depolama için kullanılan susuz çözücü ile derecelendirildi olmalıdır. Bizim deneyler için, yıkar 1X PBS içinde etanol kadar derecelendirildi.
- Rehidrasyondan sonra, oda sıcaklığında 5 dakika için her bir 1X PBS içinde hücreler üç ilave kez yıkayın.
- Falcon bir tüp içinde asetik anhidrit ile 62.5 ul 0.1 M trietanolamin (pH 8.0), 25 ml iyice karıştırılır ve Anderson, Lab 52 protokolü olarak ele dağılana kadar hızlı bir şekilde karıştırılır. Oda sıcaklığında 10 dakika için bu karışım içinde kültür inkübe edin. Asetik anhidrid tedaviden sonra, oda sıcaklığında 5 dakika için 1X tuzlu sodyum sitrat (SSC) içinde hücreleri yıkayın.
- Son SSC yıkama çıkarın ve hücrelerin geçirgenliği 10 dakika için 0.2 M HCl (sdd H 2 O) ile değiştirin.
- 5 dk için 1X PBS içinde iki yıkar ile HCl yıkayın.
- 6 saat 60 ° arasında, en az bir çalkalamalı su banyosu içinde C'de ISH tampon içinde Prehybridize, ancak bu ciddi bir şekilde işaret azaldıkça bir gecede prehybridize değildir.
- Seyreltilmiş prob 750 ul (saflaştırılmış probundan 1:250 dilüsyon) 8-14 saat boyunca 60 ° C sıcaklıkta gecede melezleşme. 1.0-1.5 gelen prob konsantrasyon aralıkları saflaştırılmış mikrogram / ul.
2. Gün: İlişkisiz Probe ve Antikor Kuluçka giderimi
- Sonda çıkarın ve 60 0,2 X SSC içinde 5 dakika için kültür durulama ° C. 60 ° C'de 1 saat boyunca taze 0,2 X SSC içinde yıkayın
- Su banyosundan kültürleri çıkarın ve 5 dakika boyunca oda sıcaklığına gelmesine izin verir.
- 5 dakika boyunca oda sıcaklığında 0,2 X SSC ile yıkayınız.
- % 0.1 Triton-X-100 (PBT) ile 1X PBS içinde 15 dakika süreyle yıkanır.
- Endojen peroksidaz inaktive için, PBT% 2 H 2 O 2 çözelti içinde 1 saat süreyle yıkayın.
- 1X Tris 15 dk yıkama ile durulayın% 0.1 Tween 20 (TBST) ile Tamponlu Salin.
- Oda sıcaklığında 1 saat boyunca Maleik asit tampon (MAB) içinde% 2 engelleme Reaktif olarak engelleme. Bu engelleme yönteminde, PBT% 20 koyun serum içinde bloke önceki yöntemlere göre hassasiyeti artar olduğunu bulduk.
- 4 ° C'de gece boyunca bir POD-konjuge antikoru içeren bir 1:1,000 seyreltme MAB içinde% 2 engelleme Reaktif 1 ml kültürler inkübe
3. Gün: İlişkisiz Antikor çıkarılması ve Floresans Geliştirme
- Antikor çözeltisi çıkarın ve oda sıcaklığında 5 dakika için TBST içinde 3 kez yıkayın.
- Sürekli olarak yavaş bir hızda sallanan ise, oda sıcaklığında 15 dakika süreyle TBST içinde 4 kez yıkayın.
- 10 dk için oda sıcaklığında PBT içinde iki kere yıkayın.
- PBT içinde seyreltilmiş 1:200 floresein-tyramide veya 01:25 Cy3 tyramide 750 ul uygulayın. Oda sıcaklığında 5 dakika için inkübe edin ve 2.5 ul% 0,3 'H 2 eklemek O 2. Sinyal geliştirmeye olanak 40 dk için sallayın.
- Sallama ile oda sıcaklığında TBST içinde 15 dakika her biri için en az 4 kez yıkayın.
- Sinyal tam gelişmiş bir kez, 1X PBT 5 dakika yıkayın.
- 4 ° C'de 1 saat oda sıcaklığında ve 1X PBS içinde depolamak için 1X MEMFA olarak saptamak
6. Görüntü BALIK Sonuçlar ve Co-kayıt Kalsiyum Görüntüleme Veriler
- BALIK tamamlanmasından sonra, hücre kültür plakaları hangi hücrelerin belirli bir prob için pozitif bir floresan sinyalinin gösterime belirlemek için görüntülü. Kalsiyum görüntüleme sırasında çalışılan görüş kesin bir görüş alanı bulmak ve kalsiyum görüntü kareleri yönüne plaka hizalamak için Cellattice lamel kullanın.
- Hücrelerin merkezinde düzlemine Odak ve maksimum 1 mW güç (Şekil 3C) 15% az Helyum-Neon HeNe 543 nm lazer kullanarak tek bir yüksek çözünürlüklü görüntü almak.
- Kalsiyum Görüntüleme protokolü alınan görüntülerin belirlenen orijinal 900 çerçevesinde,bir görüntü işleme programı (örneğin ImageJ 50 gibi) kullanımı yoluyla ilgi bölgeleri olarak tek tek hücrelerin (ROI) belirlemek. Zaman floresans çifti değerleri (Şekil 4) temsil eden veri noktaları kümesi olarak ROI floresans verileri ayıklayın.
- Kalsiyum görüntüleri (Şekil 3D) tespit ROI'ler ile FISH sonuçlarına görüntü bindirmesi.
- Prob için negatif, prob için pozitif ya da bilinmeyen bir şekilde her bir ilgi kayıt - YG karşılık gelen hücre artık FISH görüntünün görüş alanı içinde bulunabilir olması durumunda.
- Farklı disseke aşamaları (Şekil 5A ve 5C) veya farklı FISH probları (Şekil 5B ve 5D) için pozitif hücreler arasındaki kalsiyum aktivite seviyelerini karşılaştırmak için istatistiksel analiz komut (olarak MATLAB veya başka programlama dili ile tasarlanmış) kullanarak Süreci ROI floresans verileri. Bizim Laboratuarda kullanılan bütün betikler istek üzerine serbestçe kullanılabilir.