1. Fare gelen Meme veya Deri Doku Diseksiyon
- Farelerin istenilen doku diseksiyon önce, aşağıdaki sarf malzemeleri ve reaktifler hazırlamak:
Malzemeleri:
- Cerrahi araçları (deterjan ile yıkandı ve daha sonra% 70 etanol içinde batırılmış).
- Strafor yüzey diseksiyonu sırasında fare dinlenmek için.
- Veya iğne diseksiyonu sırasında fare tutun.
- Manyetik karıştırıcı (otoklav) içeren sindirim için kapaklı cam kavanoz,.
- 37 Su banyosu ° C, heyecan plaka üzerinde dinlenirken, bir dalgıç manyetik karıştırıcı ve batığın sindirim kavanozu için yeterli miktarda su içeren.
Reaktifler:
- FACS tampon I: (4 ° C): Dulbecco Fosfat (Kalsiyum Magnezyum Ücretsiz) Salin CMF Buffered +% 0.5 BSA
- Kollajenaz çözeltisi (kullanımdan hemen önce yapılmış):
0.05 g kollajenaz II
0.05 g kollajenaz IV
0.01 g deoksiribonükleaz
20ml FACS tampon I. kullanıma kadar buz üzerinde kollajenaz çözüm tutun. - PharmLyse (Amonyum Klorür Parçalama Reaktifi).
- FACS tampon II: Dulbecco'nun Fosfat Tamponlu Tuzlu CMF +% 1 FCS.
- Meme bezlerinin diseksiyonu (ayrıca 17 bakınız).
- Karbon dioksit (CO 2) inhalasyon kullanmaya dişi farelerde Euthanize.
- Strafor yüzey üzerinde, sırtında fare yerleştirin ve sıkıca 25 gauge iğneler (Şekil 1A) kullanarak tüm dört bacağı pin. % 70 etanol ile cömertçe fare püskürtün.
- Forseps kullanarak, orta hatta karın cildi yukarı çekin ve keskin bir makas ile küçük bir kesi yapmak.
- Abdominal veya torasik kavite delinme kaçınarak kesi başlayarak, hayvanın boynuna deri yukarı kesti.
- "Y şekli" ile sonuçlanan, bacak karşı orta hattan bir kesik, arka bacaklar üzerine deri kesin.
- Fare vücuttan uzakta deri çekin ve aşağı pin, teşhirsalgı derinin alt (Şekil 1B) tutturulmuştur.
- Fare omurganın doğru meme bezi ayırmak için küçük keskin bir makas ile katılgandoku kesim sırasında cildi nazikçe gelen meme bezleri ayırmak için Q-ipuçlarını kullanın.
- Karın bezleri (# 4, 5) Bu protokol için en iyisidir. Ayrıca 2. meme bezi kullanabilirsiniz, ancak bu bezlerin anatomik karışık dokusu kaynaklı hücreler neden ayırmak zor olabilir pektoral kas yakın bulunan aklınızda olabilir.
- Not: Tümör dokusunda diseksiyon, bu nekrotik bölgelerin çıkarılması tavsiye edilir.
- Cilt dokusunun Diseksiyonu: epilasyon ile uğraşmak zorunda kalmadan, cilt dokusu elde etmek için en kolay yolu fare kulakları kullanmaktır. Doku büyük miktarda gerekiyorsa, fare gövde saç kapalı tıraş ve cilt teşrih edebilirsiniz.
- CO 2 kullanarak farelerde Euthanize inhalation.
- Keskin bir makas kullanarak, buz PBS küçük hacimli (~ 0.5 ml) içeren sindirim kavanoza hemen kulakları ve yer hem kesti.
2. Meme Bezi / cilt Tek Hücre Süspansiyon hazırlanması
- Meme bezlerinin / buz PBS küçük bir hacim içeren sindirim kavanoza cilt yerleştirin. Doku sonra PBS ile kanlı yıkama x2 ise ve aşırı PBS atın.
- Kavisli makas ile iyice kıyın.
- 20 ml kollajenaz çözüm (Not: kollajenaz çözüm bu miktar verimli 15 fareleri kadar gelen meme veya tümör dokusunun ve kulakları yaklaşık 5 g ayrıştırmaları) ekleyin.
- 37 plaka karıştırın üzerine hemen yerleştirin ° 15 dakika C su banyosu, ve inkübe orta hızda karıştırmaya devam.
Not: diğer dokuları sindirerek, optimum inkübasyon sürelerinde farklılık gösterebilir.
- Reaksiyon durdurmak için, 30 ml soğuk DMEM +% 10 FCS ekleyin.
- Stra50 ml'lik bir konik boru üzerine yerleştirilmiş bir 70 mikron hücre süzgecinden doku / medya karışım halinde.
- 4 az 450 x g'de 5 dakika boyunca konik bir tüp Santrifüj ° C.
3. Kırmızı Kan Hücreleri Lizis
Not: öldürülmeden önce fareler PBS ile kalp-perfüze olsaydı bu adım gerekli değildir.
- Hücre peleti bozmadan, vakum bağlı bir cam pipet kullanılarak süpernatan aspire.
- Oda sıcaklığında 5 dakika boyunca 10 ml PharmLyse çözelti ve inkübe içinde RBC, tekrar süspansiyon hücre peleti lyse.
- FACS tampon I'in yaklaşık olarak 40 ml ilave edilerek PharmLyse çözelti Nötrleştir
- 4 ° C'de 450 x g'de 5 dakika için hücreler ile konik bir tüp döndürme
- Süpernatant aspire.
4. Endojen Fc Engelleme
- İsteğe bağlı: Aşağıdaki adımlar için uygun hacmini belirlemek için sayım hücreleri.
- Hücreler süspanse1-3 ml FACS tampon I (hücre sayısına bağlı olarak, ve kullanmak istediğiniz antikor miktarı).
- 1:50 seyreltme (10 ug / ml) ulaşır, ve 10-20 'için buz üzerinde inkübe FcBlock (anti-fare CD16/CD32) ekleyin.
Hayır FcBlock yıkayın gerekir.
5. Lekelenme
- Un-lekeli kontrolü ve tek renk denetimleri (kullanılan floresan antikor sayısına göre) olarak kullanılmak üzere Eppendorf tüplere 100 ul hacimde çıkarın.
- Etiket fibroblastlar için: 1:50 seyreltme (10 ug / ml) ile (florofor ile direkt olarak konjuge) anti-PDGFRα ekleyin.
- Diğer hücre popülasyonlarının (örneğin bağışıklık hücreleri, makrofajlar, endotel hücreleri vb) etiketlemek için: 1:50 seyreltme, yüzey belirteçleri için uygun floresan konjuge antikor ekleyin.
Not: PDGFRα fibroblastlar için bir işaretleyici güçlü olmasına rağmen, bağışıklık hücreleri için ve ord epitel hücreleri için antikorları içerir tavsiye edilirer herhangi bir çift pozitif nüfus dışlamak ve dolayısıyla izole fibroblastların saflığı geliştirmek için.
- Tek bir renk kontrol eppendorf tüpleri her birinin her bir antikorun 2 ul ekle.
- Karanlıkta buz üzerinde 1 saat için antikorlar ile hücreler inkübe edin.
- Yıkamak için: FACS tampon I tüpleri doldurmak ve 4 ° C'de 450 x g'de 5 dakika daha dönmeye
- Yaklaşık olarak 2 x 10 6 hücre / mL, veya hangisi uygun FACS sıralayıcı ile sıralama için en uygun konsantrasyon arasında bir konsantrasyonu için bir FACS buffer içinde süpernatant, tekrar süspansiyon hücreleri aspire.
İsteğe: Hücreler bir sıralama süre için FACS tampon II içinde yeniden süspanse edilebilir. Bu hücre canlılığı artırabilir. Bununla birlikte, serum içinde faktörlere maruz kalma, test edilmiş ve göz önüne alınması gereken bir gen ekspresyonunu etkileyen sahip olabilir.
- Hücre kümeleri önlemek için tüpleri içine filtre hücreleri: Filtre üst FACS tüpler içine etiketli hücreleri aktarın.
- Ölü hücre dışlamak içins, eklenti 7AAD (0.5 mg / ml) veya örnekleri (un-lekeli kontrolü hariç) Propidium İyodür (PI).
Not: hücre kaybını önlemek için, FACS kaydettikten sonra un-lekeli örnek 7AAD/PI eklemek ve 7AAD-tek kontrol yeri olarak tekrar kullanabilirsiniz.
- Analiz ederken buz örnekleri tutun.
6. FACS tarafından Hücre İzolasyonu
(Not: protokol bu bölümü bir FACS sıralayıcı, örn. BD FACS AriaII, ya da bir teknisyen yardımı işletim önceki bilgi gerektirir).
- FACS sıralayıcı yazılımı (BD FACSDiva) kullanarak ileri saçılım (FSC), yan dağılım (SSC), 7AAD, FITC, PE ve etiket hücreleri (Şekil 2) için kullanılan herhangi bir fluorofor analiz etmek için uygun analiz araziler hazırlar.
- Hücre sıralayıcı her örnek yüklemeden önce, vorteks kısaca hücreleri tekrar süspansiyon.
- Veya boyanmamış numune analiz ederek başlayınder hücre artıkları dışarı kapısına, total hücre nüfus için yolluk ayarlamak ve otofloresans veya arka plan boyama belirlemektir.
- Toplam hücre popülasyonunun canlı hücre nüfusu belirlemek ve kapısı unstained örnek + 7AAD analiz edin.
- Tazminat gibi parametrelerin belirlenmesi ve kalibre etmek için her bir renk kontrolü analiz edin.
- Sıralama için kapılarının konumunu tanımlamak için lekeli numune analiz edin.
- Sonra istenilen hücre popülasyonlarının için parametreler ve kapıları set edilmiştir, Eppendorf tüpler veya kültür ortamı veya RNA lizis tamponu (örneğin RLT tampon veya Trizol gibi) içeren 15 ml konik tüpler içine etiketli hücre popülasyonu sıralama başlar.
Not: hücreler, çok sayıda ayırma, bu hücreler lizis tamponu ile seyreltik verimi düşer eşlik eden kılıf sıvının büyük bir hacim olarak, RNA lizis tamponu içine direkt olarak sıralamak için tavsiye edilmez.
- Immediat aşağı Spin hücreleriely sonra sıralama bitmiş ve deneme amacına bağlı olarak taze orta veya RNA lizis tamponu, içine transfer edilir.
- Kültürü izole hücreler için sıralama ise, steril sıralama yapmak. Hücrelerin daha iyi bir iyileşme için, fenol kırmızısı ücretsiz DMEM +% 5 FCS yerine FACS tampon II kullanımı ve% 20 FCS ile kültür ortamında hücreleri toplamak.
- Kültür fibroblastlar kriteri ise, kendi gen ekspresyonu değişiklikleri neden fibroblast aktivasyonunu bu sonuç olarak plastik Kollajen kaplı plakalar üzerinde alwaysplate ve asla doğrudan.