1. GFP İnşaat EGL-4 İfade Hayvanlar Etiketli
- ODR-3 gen (doğrudan yukan başlama kodonunun kullanımı 2678 bp) promotörü altında translasyonel füzyon GFP :: EGL-4 klonlama: (p) ODR-3 :: GFP :: EGL-4. ODR-3 promotör sürücüler amphid nöron çiftleri ifade: AWA; AWB, AWC ve zayıf AKY.
- (P) ofm-1: plazmid (p) ODR-3 :: GFP :: 50 yabani-tip (N2) hayvanların içine EGL-4 standart germ-line transformasyon teknikleri 8 kullanılarak ko-enjeksiyon belirteçleri ile ul ng / Inject: : GFP 9 (ul / 25 ng), ve (p) ODR-1 :: DsRed 10 (25 ng / ul). AWC ve AWB amphid nöron çiftleri ODR-1 promotör sürücüler ifade ve coelomocytes yılında ofm-1 promotör sürücüler ifade.
- Ultra Violet (UV) / Trimethylpsoralen (TMP) entegrasyon protokole Adım 1.2 'de ayrıntılı ekstrakromozomal diziler ifade transgenik hayvanlar koşuluyla11.
- Bleach hayvanlar 12 senkronize ve OP50 E. içeren Nematod Büyüme Medya (NGM) plakalar üzerine onları yetiştirmek L4 sahneye coli. OP50 E. kaldırmak için M9 tamponu ile NGM plakalar kapalı L4 hayvanlar yıkayın coli bakterisinin.
- M9 tampon çıkarın ve 30 mikrogram / 1,5 ml mikrosantrifüj tüp solucanı pelet üzerine ml TMP çalışma çözüm 50-100 ul ekleyin. Ortam ışığı bloke ve folyo sarılı 1,5 ml mikrosantrifüj tüp içinde 15 dakika süreyle bir rotator yavaşça karıştırma folyo 1,5 ml mikrosantrifüj tüpü sarın. Büyük bir dereceye giremeyen NGM tabağa TMP / solucan çözüm solucanlar aktarın.
- Bir Stratalinker 2400 kullanarak UV 350 μJ (X100) NGM tabakta solucanlar Açığa. Sonra bir OP50 içeren NGM plaka solucanlar ekleyin ve 5 saat boyunca karanlıkta inkübe edin.
- Yaklaşık 10 numaralı seribaşı tabak (2-5 solucanlar her plaka) 50 transgenik solucanlar seçin. Transferi P0 yeni plakalar için 3 gün boyunca her 24 saat var.
- 250 klonal F1 Seçimnimals (plaka başına 1 hayvan). Her F1 plaka 2-4 F2 hayvanları klonlama. Ofm-1 (p) de :: diseksiyon floresan mikroskop altında GFP ifade deseni bakarak% 100 iletim hattı aramak için F3 hayvanları kontrol edin.
- Outcross yabani-tip N2 hayvanlar ile nihai entegre hat (lar) 5 kez. Biz pyIs500 olarak nihai entegre hattı bakın ve GFP gibi GFP etiketli EGL-4 molekülünün :: EGL-4 olacaktır.
2. Nükleer Translokasyon Tahliller için Yetiştirme ve Hayvan Bakımı
- 25 pyIs500 hayvanlar Yetiştirmek ° OP50 E. ile standart 10 cm NGM plakalar üzerine C (tarifi için aşağıya bakınız) tohumlu coli bakterisinin 13 (Şekil 1).
- 1. Günde beş ayrı 10 cm OP50 E. üzerine 25 ekili plakaları 4-5 L4 pyIs500 hayvanlar ° C almak coli 25 plaka ve inkübe seribaşı ° C (yani, plaka başına 4-5 L4 hayvanlar).
- 4. Günde, yetişkin p yıkayınS-Bazal tampon kullanarak büyük NGM plakalar kapalı pyIs500 hayvanların opulations (tarifi için aşağıya bakınız). Onlar plastik pipet uçları yan sopa gibi, hayvanlara aktarmak atılabilir cam pipetler kullanın.
3. Uzun vadeli Koku Induced Nükleer Translokasyon Tahliller
- PyIs500 hayvanlar bakterileri temizlemek için S-Bazal 3 kez yıkayın. Yıkamalar arasında hayvanlar santrifüj etmeyin; yerine hayvanların sabit bir 1,5 ml mikrosantrifüj tüp içinde yerçekimi ile yerleşmek için izin. Bu tüm bakteri kaldırılır sağlamak için kritik olduğunu ve NGM pates kalan bakteriler olumsuz translokasyon testin sonucunu etkileyecek gibi kirlerden arınmış vardır. Ayrıca, 1.5 ml mikrosantrifüj tüpleri otoklav tarafı ayrılmamak hayvanların neden olur ve bu nedenle non-otoklavlanmış 1.5 ml mikrosantrifüj tüpleri kullanmak tüpün iç duvarları üzerinde bir "yapışkan" özelliği üretir olduğunu bulduk.
- Hayvanlar Yıkamalar arasında ödeyecekseniz ise t makyajO uyum çözüm. 100 ml'lik bir mezun silindir S-Bazal tamponu 100 ml ilave edilir. S-Bazal için koku adapte ekleyin ve Parafilm bir şerit kullanılarak silindir mühür. Butanon adaptasyon S-Bazal 100 ml 2-butaone 11 ul eklemek için benzaldehid adaptasyon, S-Bazal 100 ml benzaldehidin 7.5 ul ilave edin. Halinde icra Yavaşça (sallamayın) içeren mezun silindir S-Bazal ve koku 30 kez bir üniforma emülsiyon oluşturmak için ters.
- S-Bazal içinde son yıkamadan sonra, tüm hayvanlara sıvı yerleştirmek ve çıkarmak için izin verir. Etiket bir tüp "+ ve" ya da "uyum" ve diğer boru "-ve" ya da "unadapt". Daha sonra adaptasyon mikrosantrifüj tüpü (+ ve) ile uyum karışımı 1 ml ekleyin ve uyumsuzlar kontrol mikrosantrifüj tüpü (-ve) sonucu, S-Bazal 1 ml ekleyin. Her tüpte 100 ve 200 arasında hayvan sayıları tutmaya çalışın. Bazı uygulama ile, bu gözle bir pelet hayvanların yaklaşık sayısını tahmin etmek mümkündür.
- 1,5 ml mikrosantrifüj tüp kapağı koruyucusu yerleştirinHer bir tüp (haşhaş açık kapaklarını önler) ve 80 dk için bir rotator üzerine tüpleri yerleştirmek için. Biz 60 dk ve 80 dk arasında koku pozlama benzer sonuçlar (uzun dönem uyum yanıtı hem sonucu) verdiğini bulduk. Ancak, 80 dakika maruz elimizde daha tutarlı sonuçlar sağlar. Böylece tüm uzun vadeli uyum testleri 80 dk koku pozlama (Şekil 2) kullanılarak standardize edilmiştir.
- 80 dakika sonra, S-Bazal hayvanlar 3 kere yıkayın. Hayvanların her yıkama arasındaki yerçekimi tarafından yerleşmek için izin verin.
4. Kısa vadeli Koku indüklenen Nükleer Translokasyon Tahliller
- Kısa süreli koku uyum halinde, ancak bunun yerine 80 dakika için koku adapte pyIs500 hayvanların kuluçka, 30 dakika maruz kalma kullanımı, uzun süreli başına koku indüklenen translokasyon deneyleri (Basamak 3,1-3,4) ile aynı protokol kullanabilir . Aşağıda özetlenen koku indüklenen nükleer translokasyon testlerinin ölçümü (Adım 5) Uzun vadeli ve kısa-ter için aynıdırm poz.
5. Koku bağlı Nükleer Translokasyon Olay Skorlama
- DH 2 0 içinde, agaroz jel elektroforezi ile çözülmesi ile 5 mM sodyum azid (NaN3) ihtiva eden% 2 agaroz pedleri edin. Bir cam mikroskop lamı üzerine NaN 3 içeren erimiş agaroz tek bir damla yerleştirin. Hemen erimiş agaroz açılan düzleştirmek için ilk slayttan başka bir cam mikroskop lamı yerleştirin. 30 saniye bekletin ve sonra yavaşça mikroskop ~ 1 mm düz agaroz pad ile bir mikroskop lamı bırakarak slaytlar dışında tease.
- S-Bazal finalinde yıkama sonra, solucanlar 1,5 ml mikrosantrifüj tüp yerleşmek ve tüm sıvı kaldırmak için izin verir. Sonra birkaç mikroskop lamı agaroz pabuçlarına açılan bilge hayvanlar ekleyin. Bu 50 ile 100 arasında, slayt başına hayvan sayıları tutmak için önemlidir. Slayt başına çok fazla hayvan puanlama komplike ve genellikle mavi ışık uyarma sonra bir saçılma parlaklık yaratacaktır. Aşırı sıvı olabilirKim-silin küçük kullanılarak agaroz takımından kötülük. Ped üzerine 0,5 mm cam kapak kayma yerleştirin ve hayvanların hareketsiz NaN 3 için izin vermek için 2 dakika bekletin. Not, hayvanlar puanlama sonra slaytlar kurtarılabilir. M9 Tampon bir damla içine numaralı seribaşı NGM tabağa aktarılır eğer hayvanlar ~ 1 saat sonra NaN 3 anestezi kurtarmak olacaktır.
- Bu noktada her deneyci slayt deneysel (+ ve) slayt ve hangi slayt (-negatif) slayt kontrolü olan izlemek için bir anahtar bulurlar ve körü körüne GFP atar başka bir kişiye slaytlar geçmek zorunludur: EGL-4 lokalizasyonu deseni. Bu, herhangi bir deneyci önyargı için kontrol edecek.
- , 10X 40X ve 63X büyütme hedefleri ve GFP / TTT filtreleri ile dik bir floresan mikroskop kullanılarak slayt başına 50 ile 100 hayvanlar arasındaki Puanını. Öncelikle, parlak alan aydınlatma kullanılarak 10X büyütme altında hayvanları bulun. İkincisi, brigh kapatarak AWC nöron bulunt-alan aydınlatması ve RFP filtre kullanarak. AWB ve AWC nöronlarda (p) ODR-1 :: DsRed sürücüler ifade. Şeklinde küçük ve dairesel AWB hücre gövdeleri (Şekil 2) ile karşılaştırıldığında AWC nöronlar belirgin oval hücre gövdeleri var.
- AWC hücre gövdesi bulunur edildikten sonra, GFP filtresi geçmek ve GFP localisation kaydedin: nükleer veya sitoplazmik olarak EGL-4. Bir sayaç kullanarak deneyci slayt puanlama yaparken mercek bakarak tutmak için izin verir. Not: Adımları 5,1-5,5 istatistiksel olarak önemli verileri (Şekil 1-2) üretmek için iki ayrı günde en az 3 kez tekrarlanır.
6. Uzun vadeli Koku İntibak Kurtarma sırasında EGL-4 GFP etiketli izleme işlemi
- Adım 3.5 sonra zaman noktasında sıfır AWC birden alikotları ve nükleer karşı sitoplazmik GFP için skor :: EGL-4 içine pyIs500 hayvanların popülasyonlarının bölün (yani 80 dakika maruz kaldıktan sonra,) ve moklu sonraki zaman noktalarında (Şekil 3).
- NGM plakalar üzerine atılabilir cam pipet kullanılarak kontrol (-ve) ve deneysel (+ ve) hayvanlarda hem aktarın.
- Hayvanların çeşitli zaman uzunlukları için kurtarmak için bekleyin ve her zaman noktasında GFP :: EGL-4in AWC yeniden değerlendirmek yerelleştirme 5.1 5.5 Adımlar gibi.
7. Malzemeler
NGM plakalar:; 3 g Sodyum Klorür (NaCl); 2,5 g Bacto-pepton 21 g Bacto-Agar: 1 L için 1 L GKD 2 0 ekleyin. Otoklav Medya. Sıcaklık 54 ° C okur otoklav, serin agar sonra kadar , 1 ml 1 M magnezyum sülfat (MgSO4), 1 ml 1 M kalsiyum klorür (CaCl2), etanol içinde 1 ml kolesterol (5 mg / ml stok) 25 ml 1 M potasyum fosfat tamponu: aşağıdaki çözümler ekleyin.
1 M Dibazik K 2 HPO 4 174.2 g / mol: 500 ml için: 400 ml GKD 2 O olarak çözülür 87.1 g Dibasic K 2 HPO 4. GKD 2 O. ile 500 L seviyesini ayarlama 500 ml Steril Filtre Ünitesi kullanılarak sterilize filtreleyin.
1 M mono KH 2 PO 4 136,1 g / mol: 1 L için: 800 ml GKD 2 O olarak, 136.1 g mono KH 2 PO 4 çözülür. GKD 2 O. ile 1 L seviyesini ayarlama 500 ml Steril Filtre Ünitesi kullanılarak sterilize filtreleyin.
1 M Potasyum Fosfat (K 3 PO 4) Tampon pH 6.0: 1 L için: 1 L Steril Filtre Ünitesi, 1 M mono KH 2 PO 4 868 ml ekleyin. Birim süzülmeye bırakın ve daha sonra 1 M Dibazik K 2 HPO 4 132 ml ekleyin. Ünitesi tüm sıvı filtre için izin verin. Filtre ünitesini çıkarın ve 6.0 pH ayarı. Oda sıcaklığında saklayın.
S-Bazal: 1 L için: 50 ml 1M K 3 PO 4 Tampon eklemek, pH ~ 6.0; ve 20 ml 5M NaCl aq. 1 L doldurunGKD 2 O. Çözüm otoklavlayınız.
M9: 3 g KH 2 PO 4, 6 gr Na 2 HPO 4, 5 g NaCl, 1 ml 1 M MgSO4, H2 O.: 1 L için GKD 2 0 1 L doldurun. Otoklavda sterilize edin.