"Freeze-kırma," nematod C iç dokuları sergilemek için bir yöntem protein lokalizasyonu için antikorlara elegans, gösterilmiştir.
Yöntem makalesi
"Freeze-kırma," nematod C iç dokuları sergilemek için bir yöntem protein lokalizasyonu için antikorlara elegans, gösterilmiştir.
C leke antikorlar ile elegans, nispeten geçirimsiz manikür kimyasal veya mekanik yöntemlerle atlanmalıdır. "Freeze-çatlama" fiziksel, iki yapışık slaytlar arasındaki nematod sıkıştırarak onları dondurma, ve ayrı slaytlar çekerek nematodlardan manikür çekmek için kullanılan bir yöntemdir. Dondurarak çatlama kimyasal muamele olmadan dokulara erişmek için basit ve hızlı bir yol sağlar ve fiksatif çeşitli kullanılabilir. Ancak, bu örneklerin birçok kaybına yol açar ve gerekli sıkıştırma mekanik olarak örnek deforme eder. Pratikte iyi bir morfolojisi olan numunelerin kurtarma en üst düzeye çıkarmak için gereklidir. Dondurarak çatlama özel sabitleme koşulları, numune kazanımı veya düşük spesifik olmayan boyama için optimize edilmiş, ancak tüm parametreler için aynı anda olabilir. Çok sert sabitleme koşulları gerektiren ve kimyasal manikür permeabilize için gerekli kimyasal tedaviler, Arıtma tahammül antikorlarınçözelti içinde sağlam nematodların t tercih edilebilir. Antikor hafif bir düzeltme gerektiren veya optimum sabitleme koşulları bilinmediği takdirde, dondurularak çatlama hızlı bir antikor ve tahlil, ilgi konusu antijen için spesifik hücre içi ve hücre lokalizasyonu bilgi verebilir çok yararlı bir şekilde kalmasını sağlar.
Proteinlerin hücre ve hücre içi lokalizasyonu belirlemek için, bilim adamları, belirli geleneksel özellikle 1 proteinleri tanıyan seçilmiş antikorlar ile dokuların etiketli var. C gibi bazı model organizmalar elegans, antikor boyama, genellikle daha hızlı sonuç moleküler genetik teknikler ile değiştirilmiştir. Bunlar, promotör ve ilgi ve yeşil floresan protein geninin kodlama bölgeleri arasında gen füzyonlarının oluşan yapıları ile transforme organizmaları içerir. Bununla birlikte, moleküler teknikler doğru promotör ve yüksek kopya sayısında (C. elegans alışılmış teknikler) 2,3 at yapıları ifadesindeki değişiklikler bilerek ile ilgili sorunlar gibi eşyaların, bir dizi tabidir. Bu nedenle, antikorlarla boyama in vivo protein işlevi araştırmalarında pek çok bilim adamı için bir hedef olmaya devam etmektedir.
Antikorları ile dokular boyandığında, zor olabilir çünkü birantikorlarının verilmesinin sadece belirli bir konformasyonda 1 kendi antijeni tanıyabilir. Örneğin, antikorlar belirli bir şekilde sabit, sadece denatüre ya da sağlam antijeni tanıyabilir ve yerinde antijeni tanımayabilir. Nematod antikor lekelenme problemi nematodun kütikül dokulara antikor erişimi engelleme, nispeten geçirimsiz bir bariyer oluşturur gerçeği ile daha da artmaktadır.
C. antikor lekeleme için kullanılan birkaç farklı yöntem vardır elegans (önceki çalışmaları gözden 4). Sağlam leke 'solucan' yöntemleri donma ve nispeten sert sabitleştirici (formaldehit ya da glutaraldehit) olarak çözülme geliştirildi; donma-çözülme döngüleri sabitleyici 5 hızlı nüfuz etmesini sağlamak için manikür çatlamak yardımcı. Yöntem maddeler, kolajenaz ya da her ikisi 5-7 azaltılması ile tedavisi dahil, tespit edildikten sonra, kütikül antikorun girmesine izin vermek üzere permeabilize edilmiştir. Bu treatments morfolojisi korunmuş, ancak genellikle antikor tanınmasını azalır ya da yok. Alternatif yöntemler, antikor girmesine izin vermek üzere diseksiyon 8 içerir.
"Freeze-kırma" Antikor 9-10 boyama sağlamak için yarı sağlam solucan iç kısmına erişmek için bir yoldur. Kollajenaz ve azaltma tedavisini kaçınarak Freeze-çatlama tespit çeşitli koşullar ile yapılabilir. Nematodlar, iki yapıştırıcı slaytlar arasında yerleştirilmiş dondurulur ve daha sonra slaytlar ayrılır, alt slayt üzerinde nematod çoğu ve üst kızak üzerindeki kütikül çok ayrılıyor. Alt sürgü sabitleyici yerleştirilebilir ve yapışık nematodlar ile tüm kaydırma antikor lekeleme prosedürü aracılığıyla aktarılır. Yöntem mevcut iki büyük zorluklar yok. İlk olarak, bu ciddi bunları deforme olmadan nematod bölmek için gerekli olan basınç, doğru miktarda uygulamak zordur. İkinci olarak, solucanların çok s olmazya slayt kene ve sabitleştirici veya durular kaybolur. Ancak, uygun slaytlar ve uygulama ile, yöntem, hızlı bir şekilde tespit ediciler ve antikorların çeşitli kullanılabilir makul bir morfolojisi olan nematodlar verecektir.
Yöntem, deneyci amacına bağlı olarak, biraz değiştirilebilir. Tek bir nematod boyama (örneğin, tek bir transformant antikoru boyamasını değişmiş olup olmadığını belirlemek için) isteniyorsa, o zaman maksimum yapışma ile slaytlar (ancak yüksek bir arka plan boyaması) (aşağıya bakınız) bu tür ilave polilisin ile laboratuarda hazırlanmış slaytlar olarak kullanılabilir. Nematodlar, bu tespitler sonra polilisin daha zayıf bağlı Başlangıcı formaldehid veya glutaraldehid tespit için, daha yüksek bir yapışma slaytlar (laboratuar hazırlanan slaytlar polilisin) kullanılmalıdır. Vahşi tip nematodları, metanol ve / veya aseton ile tespit edilmektedir, daha sonra daha düşük bir yapışma özelliğine sahip slaytlar ve alt arka plan boyaması kullanılmalıdır (ticari veya l) slaytlar aboratory hazırlanmış. Antikorlar ve fiksatif çeşitli laboratuarda kullanılıyorsa, slaytlar bir seçim vaktinden önce hazırlanabilir ve gerekli olana kadar saklanır.
Nematod dokuya erişim elde edilmiştir sonra, antikor, boyama işlemleri (daha uzun dokuların karakteristik inkubasyon yerine hücreleri 1,11) ile standart yöntemler takip edin.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
NOT: Birden fazla protokol adımları set-up ve deney özel koşullarına bağlı olarak hazırlanması için seçenekleri ile sunulmaktadır. Bu gibi durumlar için, alternatif adımlar alternatif adımlar Protokol, Şekil 1 'de ana hatları ile A, B, C, vb olarak sunulmuştur.
1.. Polilisin Kaplı Slaytlar hazırlanması
Slaytlar üç farklı hazırlama, göreceli yapışma ve antikorun spesifik olmayan bağlanma kolaylığı arasında arzu edilen ticaret-off bağlı olarak kullanılabilmektedir. Slayt hazırlama alternatifleri Detaylar yapışma ve karmaşıklığı artan sırayla adımları 1A-1C aşağıda verilmiştir. Bu farklı yöntemlerle hazırlanan slaytlar bir deneme için birlikte kullanılabilir.
1A. Hayır slayt hazırlama
Ticari olarak temin edilebilen polilizin kaplı slaytlar düşük yapışma ve düşük arka plan sağlamak.
1B. Slayt prmetanol-aseton fiksasyonu Ayırma optimum
Orta yapışma ve düşük arka plan.
1C. Formaldehit tespiti için hazırlık optimumu Slide
En yüksek yapışma ancak yüksek arka plan.
2. Dondurulmuş Nematod Slaytlar hazırlanması
Tamamen (nematod plakaları) yöntemi 2A kullanılarak bakteri ya da ile durulanarak boyanması için nematod hazırlanması2B (bireysel nematodlara).
2A. Nematod slaytların plakalarından hazırlanması
2B. Bireysel nematod slaytların hazırlanması
3. Tespit
Sabitleyici iki çökeltilmesiyle "düzeltme", hücrede yer antijen ("hafif tespit") ya da çapraz bağlama ("sert tespit") antijen için gereklidir. Fixation antijenitesini bozabilir; en bilinen antikorlar belirli bir sabitleme koşulu ile iyi çalışır. Yeni antikorlar için, sabitleme koşulları, bir dizi test edilmelidir.
Herhangi bir tespit için ilk aşama, fosfat tamponlu tuzlu su çözeltisi yapmaktır. Yöntemi A (ışık kullanarak antikor boyama nematod ile sonraki düzeltme slaytlarmetanol ve aseton) veya B (formaldehit ya da glutaraldehit kullanılarak sert düzeltme) sabitleyin.
3A. Metanol-aseton kullanılarak ışık düzeltme
3B. Formaldehit ya da glutaraldehit kullanılarak sert düzeltme
4. Antikor Boyama
Antikor boyama protokolü slaytlar üzerinde herhangi bir doku için, standart protokollere benzer. Bu protokol, bağımsız olarak 1-3 adımlar olarak hazırlanması tüm slaytlar için aynıdır.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Solucanlar düzgün, sıkıştırılmış kırık ve hafif sabit tutulduğunda, hemen hemen tüm solucan (bkz. Şekil 2) antikor boyama için erişilebilir olabilir. DAPI lekelemesi ile gösterildiği gibi çekirdek konumu solucanın parçaları solucanlar formaldehit gibi daha sert bir sabitleyici, tâbi tutulduğu zaman en doğal olmayan dalgalı görünümü ile görüldüğü gibi, solucan morfolojisi (bozulabilir sağlam olduğu gösterilmektedir Şekil 3A-D kas). Başka bir yaygın sorun düzensiz sabitleme ya da belirli ...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Dondurularak-kırma protokol C antikor lekelemesi için çeşitli yöntemlerden biridir elegans. Bu solucanlar leke için nispeten basit bir yol sağlar, ancak belirli reaktifler gerektiren ve optimum sonuçlar için pratik yapar. (Şekil 1'de) Kritik adımlar şunlardır: 1) slayt hazırlama () adım 3 (bkz. adım 2 ve 3) hızlı tespiti (bkz. adım 1 ve nematod 2) elle sıkıştırma bkz. İlk olarak, slaytlara nematodların yapışmasını en üst düzeye çıkarmak için, bunun yerine ticari olarak hazırlanan s...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yazar o hiçbir rakip mali çıkarlarını sahip olduğunu beyan eder.
Fonlama NSF CCLI # 0633618 ve Ohio Üniversitesi tarafından sağlandı. Bazı suşları Caenorhabditis Genetiği Merkezi tarafindan temin edilmiştir. Lisansüstü öğrenci Reetobrata Basu video görüntülenir.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| poli-L-lizin slayt (ESCO markası) | Fisher | 12-545-78 | Sigma marka slaytlar da uygun |
| poli-L-lizin hidrobromür | Sigma | P1524 | < güçlü > ÖNEMLİ: < / güçlü> Polilisin kritik tek buzlu kenar slaytlarının markası ve yüksek moleküler ağırlığı |
| Fisher | 48312-002 | Diğer markalar uygun | |
| sodyum azid | Sigma | S2002-25G | ZEHİRLİ,% 10 stok yapmak için tozu tartarken eldiven ve maske giyin. Stok çözeltisini pipetlerken eldiven giyin |
| coplin boyama kavanozu | VWR | 47751-792 | Diğer markalar uygundur |
| 5 slaytlı posta gönderici Elektron | Mikroskobu Bilimi | 71549-01 | boyamaya uygun birçok farklı küçük kayar tutucu markasından biri |
| ÖNEMLİ: Düzenli formalin çözeltileri (% 37 formaldehit) uygun DEĞİLDİR. Ya 1) Krisatlali paraformaldehiti fosfat tamponunda çözün ve donmuş küçük alikotlarda saklayın. Veya 2) alikotlarda elektron mikroskobu dereceli paraformaldehit satın alın. ZEHİRLİ -eldiven giyin; Fazla lavaboyu suyla atın. | |||
| Gluteraldehit çözeltisi, suda %25 | Sigma | G 5882 | ÖNEMLİ: ampullerde elektron mikroskobu dereceli glutaraldehit satın alın; ZEHİRLİ -eldiven giyin; Fazla lavaboyu suyla atın. |
| Triton X-100 | VWR | EM-9410 | Diğer markalar uygundur |
| Sığır Serumu Albümin | Fisher | ICN820451 | Diğer markalar uygundur |
| Eşek Serumu, liyofilize | Jackson Immunoresearch | 017-000-121 | Diğer markalar uygundur |
| Cy3 Eşek anti-Fare IgG çoklu etiketleme | Jackson Immunoresearch | 715-165-150 | Bu şirket, yüksek kaliteli çok etiketli (afinitesi tükenmiş) antikorlar için önerilir. Uygun boya ve antijeni seçin (birincil antikoru yükseltmek için kullanılan hayvan). |
| n-propil gallat | Fisher | ICN10274750 | Diğer markalar DAPI |
| , 4 ', 6'-diamidino-2-fenilindol dihidroklorür | Sigma | D 9542 | TOKSİK uygundur. Eldiven giyin ve maruziyeti en aza indirmek için küçük alikotlara ve feeze'ye dağıtın |
| Whatman #1 15 cm çaplı filtreler | Fisher | 09805G | |
| Lamel #1 1/2 dikdörtgen 24 x 60 mm | VWR | 48393-252 | 1 1/2 kalınlık optik olarak en iyisidir |
| Mikroskop slayt klasörü | VWR | 48429-092 | Diğer markalar uygundur |
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Bu JoVE makalesinin metnini veya şekillerini yeniden kullanmak için izin iste
İzin iste