$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Bitki büyümesi için besin gereksinimleri. Hidroponik bitki büyüme ortamına (Taşyünü) ve besin çözeltisi kullanılması N. muntazamlığını benthamina büyüme ve ortadan kaldırır karmaşıklığı (mekanik, düzenleyici ve verim) bitki yetiştirme için toprak kullanarak ilişkilidir. Biz N. büyüdü benthamina bitki büyüme ve biyokütle birikimi için uygun koşulları belirlemek için piyasada mevcut gübre ıslatılır Taşyünü levhalar üzerine. Biz,% 95-100 tohum çimlenmesi görülmektedir. Biz fosfor eksik besin solüsyonu çimlenmeyi ve N. büyümesini desteklemek için başarısız bulundu, çünkü biri, fosfor gibi çimlenme ulaşmak için kritik olduğuna dikkat etmelidir benthamina tohumları (Şekil 1A).
Agrobacterium büyüme ve bitki sağlığı ve protein üretimi sızma medyanın etkileri. Biz t verimliliğini optimize etmek için çeşitli medya koşulları test ettikBüyük ölçekli üretim için o agroinfiltration tekniği. Bakteriler (A. tumefaciens GV3101 suşu) pBID4-GFP yapıyı taşıyan farklı ortam koşulları (YEB, LB veya AB) O / N yetiştirilen ve santrifüje tabi tutulur ve 1 x Murashige ve ihtiva eden indüksiyon ortamına (MMA) (içerisinde yeniden süspanse edildi, ya Skoog [MS] temel tuz karışımı, 10 mM MES pH 5.6, 20 g / L sukroz ve 200 uM asetosiringon) ya da bitki infiltrasyon için kullanmadan önce, 0.5 'lik bir 600 Milli-Q su içinde seyreltilmiştir. Bu, su içinde seyreltilmiş bakteri ile bitkilerin vakum infiltrasyonu önceki raporlarda 42,48 herhangi infiltrasyon ortam ile elde edilen sonuçlarla karşılaştırılabilir protein üretiminin neden olduğu görülmektedir. Bunun aksine, YEB veya LB ortamında yetiştirilen seyreltilmemiş Agrobacterium ile infiltrasyon N. tam solma ile sonuçlanmıştır AB ortamı içinde büyütülmüştür seyreltilmemiş Agrobacteria infiltre bitkilerin sağlık üzerinde herhangi bir etkiye sahip değildi benthamiana dat, (en az 24 saat sonrası infiltrasyonunda yapraka) gösterilmemiştir. Şekil 1B 'de gösterildiği üzere, bitkiler YEB, LB ya da AB ortamı içinde büyütülmüş ve Milli-Q su (01:05, 600 0,6-0,8 veya 1:10, A 600 0.3-0.4) göstermiştir ile seyreltilmiş Agrobacterium kültürleri ile infiltre herhangi bir belirti ve sırasıyla 1645, 1520 ve 1839 arasında bir ortalama GFP üretimi arzetmiştir. Agrobacteria (MMA), doğrudan Milli-Q su içinde seyreltilmiş Agrobacterium (göre protein üretiminde belirtileri ve anlamlı bir farklılık gösterdi santrifüjlenmiş ve herhangi bir endüksiyon ortamı içinde yeniden süspansiyon haline sırasıyla 1671 ± 102 ve 1667 ± 131 mg / kg). Bu nedenle, Milli-Q su tasfiye tesisi ile infiltrasyon Agrobacterium kültürleri seyreltilmesi önerilir ve rutin 0.5 arasında bir bir 600 elde etmek için, daha sonraki deneylerde kullanılmıştır.
Hedef ifadesi üzerine Agrobacterium süspansiyon hücre yoğunluğu ve zaman tabii Etkileri. Önümüzdeki incelendiğinde, bakteri hücre yoğunluğuinfiltrasyon ve hedef ekspresyon düzeyleri etkinliğini etkiler. Bu amaç için, pBID4-GFP, 1.0 'lık bir 600, 0.5, 0.1 ve 0.05 taşıyan Agrobacterium dört farklı hücre süspansiyonu yoğunlukları değerlendirildi. Ardından sızma, N. benthamiana bitkileri 4, 7 ve 10 dpi'de numune toplama ile görünür semptom gelişimi ve hedef ekspresyon zaman süreci izlenmiştir. 4 dpi çözünürlükte, biz Agrobakteryum farklı hücre süspansiyonu yoğunlukları ile sızmış bitkiler arasında GFP floresan fark edilebilir farklılıklar (hiçbir GFP ifade 0.05, 600 gözlendi) görülmektedir. 7 dpi olarak, GFP floresan A 600, 1.0, 0.5 ve 0.1 'lik bir hücre süspansiyonu yoğunluklarda Süzülmüş bitkilerin içindeki, ancak 0.05 arasında bulunan bir A 600 ° Süzülmüş bitkilerin daha düşüktü. Şekil 1C 'de gösterildiği gibi, bu veriler, Western lekeleme yolu ile teyit edildi, 600 A da çok düşük bir protein üretimini gösteren 4 dpi'de toplanan numunelerin analizi 600 en yüksek ve ub>. 0.05 600 alt GFP üretimi (1.199 mg / kg) gösterdi 7 dpi, bitkiler, (sırasıyla 1.662, 1.870 ve 1.890) 1.0, 0.5 ve 0.1 A 600 olarak tahmin GFP üretiminde anlamlı farklılık gösterdi. Bunun aksine, 10 dpi GFP üretiminde bir farklılık dört hücre süspansiyonu yoğunlukları (1218, 1181, 1197 ve 1304) her iki ile infiltre bitkiler arasında gözlenmiştir.
Agrobacterium alternatif suşları ile infiltrasyon. Geçici protein üretimi için uygun Agrobacterium soylarının çeşitliliğini artırmak için, vahşi tip izole test edilmiştir. Doğal ana taç-safra izole edilen bu suşlar, lütfen Dr Gelvin (Purdue Üniversitesi, West Lafayette, Indiana) tarafından verilmiştir. Geçici protein üretimi kendi programını incelemek için, N. sızmış Aşağıdaki suşlar carr ile benthamianaying pBID4-LicKM 18: A. rhizogenes (A4) ve A. vahşi tip Neşter A348, A208, A281 ve suşları (AT6, AT10 adlandırılır ve At77, sırasıyla), hem de A işlenmiş laboratuar suşları Agrobacterium tumefaciens tumefaciens GV3101, C58C1, ve 4404. Infiltre yaprakları 7 dpi'de toplandı ve LicKM ekspresyon seviyesinin, Western blot analizi ile tahmin edilmiştir. • Şekil 2A, LicKM üretimin en üst düzeyde gösterildiği gibi suşlar GV3101, A4 ve LBA4404 (~ 1750 ± 163, 1650 ± 26 ve 1450 ± 117 mg / kg, sırası ile) küçük farklılıklar ile, ile elde edilebilir İfade en düşük seviyesi C58C1 ile (~ 900 ± 102 mg / kg); (sırasıyla ~ 1.250 ± 19, 1100 ± 42 ve 1200 ± 111 mg / kg) AT6, AT10 ve At77 ile ara üretim. Likenaz enzimatik aktivitesi Zymogram tahlili kullanılarak ortaya çıkartılmıştır. Şekil 2B, herhangi biri kullanılarak infiltre bitki dokularında likenaz ürettiğini gösterirAgrobacterium türleri, enzimatik olarak aktif oldu. AT10 ile belirtiler hafif vardı zorlanma iken bir de, patolojik semptomlar (bodurluk, yaprak sapı uzaması ve curling ve yaprak curling) gösterdi A4 ve At77 suşları ile sızmış olduğunu N. benthamiana bitkiler dikkat etmelisiniz. Semptom laboratuvar GV3101 ırkına (Şekil 2C) ile infiltre N. benthamiana bitkileri gözlenmiştir.
Alternatif Nicotiana türlerin infiltrasyonu. Biz Nicotiana cins (N. benthamiana ve N. yonga) ve bir melez türler, N. iki vahşi tür türlerde biyomas üretimi ve protein üretim oranları karşılaştırılmıştır excelsiana (N. excelsior × N. benthamiana). Test edilen türler, N. benthamiana, Agrobacterium-tabanlı ya da viral bazlı ekspresyon sistemi 2,34,4 kullanılarak geçici protein üretimi için yaygın olarak kullanılan bir ev sahibi9, çimlenme 4-5 hafta içinde sızma hazır ulaşır. Biyokütle optimal düzeyde oluşturmak için gerekli büyüme dönemi de N. için 4-5 hafta excelsiana ancak N. (6-7 hafta) daha uzundur excelsior. Buna ek olarak, bitki internod N. nispeten kısadır excelsior diğer Nicotiana türlere kıyasla.
Ayrıca, N. bu vakum infiltrasyon ve N. benthamiana 60 saniye boyunca 50-250 mbar'da excelsiana, bütün yaprak agroinfiltration için son derece etkili iken, N. talaş, bir vakum bu Sillwet-77 ya da S240 gibi non-iyonik yüzey aktif maddelerin varlığında, 1 dakika her biri için üç defa uygulanmıştır bile nedeniyle alt örtü ve kösele yapraklara sızmak için zordur. Ayrıca, N. çimlenme oranı excelsiana ve N. excelsior tohumları ~% 40-50 idi; % 90-100 için çimlenme oranını artırmak amacıyla, tohumlar,% 10 blea ile muamele edilmelidirtohumlamadan önce 1 saat boyunca ch. Aynı büyüme şartları, N. elde edilebilecek en yüksek biyokütle yaprak aşamasında excelsiana N ile karşılaştırıldığında yaklaşık olarak iki kat daha yüksek olduğu benthamiana (Tablo 1).
Protein üretimi N. incelenmiştir benthamiana, N. talaş ve N. excelsiana pBID4-GFP barındıran Agrobacterium GV3101 ırkına ile süzüldü. GFP birikimi Western blot analizi ile, ardından UV ışığı kullanılarak bütün infiltre yapraklarda 7 dpi'de değerlendirildi. Şekil 3A, N. GFP dağılımını göstermektedir benthamina ve N. excelsiana ve N. dengesiz dağılımı Excelsior (nedeniyle N. Excelsior bir bütün yaprak alanına sızan bir zorluk). Şekil 3B 7 dpi de üç Nicotiana türlerinden toplanan sızmış yapraklar UV ışık aydınlatması ile tahmin GFP üretim düzeyini gösterir. GFP birikebilecekyon seviyesi N. yüksekti N. benthamiana göre (~ 2.23 g / kg) excelsiana ve N. yonga (sırasıyla, ~ 1.89 ve 1.54 g / kg). N. protein üretiminin düşük düzeyde talaş düzensiz infiltrasyonu ve toplanan yaprak biriken GFP dağılımı kaynaklanmaktadır.
Biz doğrudan ışığa maruz üst yaprakları genellikle gölgelik altında yapraklarından daha (2-4 dpi) geçici GFP birikiminin erken ve yüksek düzeyde sergiledikleri görülmektedir. Ancak, bizim çalışmalarda, GFP birikimi 7 dpi en yüksek ve hiçbir GFP birikimini uninfiltrated yeni büyüyen yaprakları hariç, en yaprakları eşit olarak dağıtıldı.
Geçici protein üretimi. Vakum infiltrasyon üzerinde vakum basıncı ve süresi etkileri önemli ölçüde bir iğnesiz şırınga 42 ile elle enjeksiyonu ile uygulanan basınca kıyasla geçici ekspresyon seviyelerini artırır. Bir uygulanmasıvakum stoma yoluyla bırakır batık bitki boşaltmalarını gazları neden olur. Vakum ayrılmış ve basınç hızlı bir şekilde artar edildiğinde, Agrobacterium süspansiyon, boşaltılan gazların 50 yerine yapraklar içine sürülür.
N. yapraklarında vakum basıncı etkisini test etmek için benthamiana, 30 veya 60 saniye boyunca çeşitli vakum basıncı (50-400 mbar) altında pBID4-GFP barındıran Agrobacterium GV3101 ırkına bitkilerin infiltre. Bu (50 mbar) güçlü vakum kısaca infiltrasyon (24-48 saat) sonra doku solma ve bitki ölüme, sızmış yaprakların mekanik hasar 30 veya 60 sn sonuçlarına uygulanması olduğu gösterilmiştir. Sadece 50 yaprak alanı% 'si ve GFP üretimi (303 ± 90 mg / kg) (Şekil 4A) bir azalma düzeyi sızmasında daha hafif vakum (400 mbar) sonucu, diğer yandan, uygulama günü. Önemlisi, biz 50, 10, altında GFP üretiminde anlamlı bir fark gözlenmedi0 ve 200 mbar (1.651 ± 107, 1.688 ± 40, 1594 ± 26 mg / kg, sırasıyla) (Şekil 4A) ve hafif hayır, bitki sağlığı üzerinde zararlı etkileri 50-200 mbar vakum basınçları 30 veya 60 için uygulanmıştır sn. Bu nedenle, vakum basıncı 50-100 mbar infiltrasyonu deneyler için tavsiye edilir.
Hedef ifadesi üzerindeki vakumun süresinin etkisi, N. biri düz süzülmesiyle değerlendirildi benthamina bitkiler pBID4 barındıran GV3101 0.5 bir A 600 ile her saat -. aynı Agrobacterium kültürüne 8 saat GFP Şekil 4B GFP üretim düzeyi benzer tüm-zaman düşündüren, 8 saat kadar işaret olduğunu gösterir bu aşkın Zaman süresi, Agrobacterium, tek sarmallı DNA başlatmak kabiliyetini korur.
Protein üretimi kimyasal indüksiyon etkisi. Bazı bitki fenolik metabolitleri ve şekerler ind olabilirA. UCE virülans genleri 1,52 Tumefaciens. Bunun bir sonucu olarak, birçok kimyasal ve monosaccharaides çeşitli bitki türlerinde geçici protein üretimini artırmak için bildirilmiştir. Acetosyringone en sık A. kültürlerine ilave edilir agroinfiltration 40,53-57 önce vir operon uyarılması için tumefaciens.
Bu N. geçici GFP protein üretimi üzerindeki asetosiringon farklı konsantrasyonlarda (0, 100, 200 ve 400 uM) ve glukoz (0-4%) etkisini değerlendirmiştir GFP - benthamiana Agrobacterium GV3101 ırkına pBID4 barındıran ile süzüldü. Bu amaçla, daha önce sızma 1-3 saat boyunca asetosiringon ve glikoz konsantrasyonunu ihtiva eden farklı MMA uyarma ortamı içinde Agrobacterium hücreleri yeniden askıya alındı. Hem görsel gözlem (veriler gösterilmemiştir) ve Western blot analizi (Şekil 4C), test edilen konsantrasyon hiçbiri sonuçlarına göre,Bu bileşiklerin herhangi bir indüksiyon ortamı asetosiringon veya glukoz ihtiva kontrol ile karşılaştırıldığında GFP floresan ya da protein üretiminde önemli bir artışa neden oldu.
N. GFP ve HAC1 genlerin geçici üretimi üzerinde bir susturma bastırıcı eş infiltrasyon etkisi benthamiana bırakır. Daha önce, bir raportör protein 34 nin arttırılmış üretimi ile sonuçlanan bir susturma bastırıcı (domates çalılık büyümeyi durdurucu virüs p19 [TBSV]), transkripsiyon sonrası gen susturma (PTGS) müdahale bu ko-ekspresyonu gösterilmiştir.
Biz N. eş sızma etkisini değerlendirdi GFP raportör gen (pBID4-GFP) ve syf 19 taşıyan fırlatma vektör ile benthamina. A. önce infiltrasyonu, bir A 600 0.5 seyreltileri pBID4-GFP ve P19 barındıran tumefaciens GV3101 kültürleri, sırasıyla 1:1, 2:1, 3:01 ve 4:01. Express oranlarında karıştırılmıştırsusturma baskılayıcı iyon Karnabahar mozaik virüsü 35S promotörü tarafından kontrol edildi. 7 dpi (Şekil 5A) ile Western blot analizi sonuçları ile gösterildiği gibi, P19 mevcudiyeti arttırmak veya N GFP üretimini azaltmak yoktu benthamiana iki Agrobacterium süspansiyonları her oranda.
P23and p19 - - HAC1 için PTGS önlenmesi üzerine biz de iki viral gen susturma bastırıcılarının etkilerini karşılaştırdık. Fırlatma vektör pBID4-HAC1 (H1N1 A/California/04/2009) ve iki viral susturma baskılayıcı plasmidlerin bir taşıma Agrobacterium kültürleri, sırasıyla 04:01, bir oranında karıştırılmış bir 0.5 A 600 seyreltildi edildi ve 4-5 haftalık N. içine co-sızmış benthamina. A. bir süspansiyonu pBID4 taşıma turnefaciens - HAC1 tek başına kontrol olarak infiltre edildi. Infiltre yaprak örnekleri 3 ila 8 dpi toplanmıştır. Deney repe olduHAC1 ifade ated üç kez ve ortalama seviyeleri Western blot analizi ile tespit edilmiştir.
Şekil 5B'de, N. eş infiltrasyonu gösterildiği gibi p23 veya p19 ile benthamiana (sırasıyla 642 ± 157 ve 764 ± 108 mg / kg) 6 dpi (sırasıyla, yaklaşık olarak% 15-25) herhangi bir susturma baskılayıcı kullanılarak kıyasla HAC1 üretiminde bir artış ile sonuçlanmıştır. Bu p23 ve p19 sistemimizde etkili olduğunu göstermektedir. Bununla birlikte, pBID4-HAC1 P19 ile birlikte infiltre olduğu zaman HAC1 birikimi bir gün önce meydana geldiği not edilmelidir. Bu nedenle, sonuçlar HAC1 üzerinde susturma bastırıcı P19 ve GFP birikiminin etkisi geçici ifade ve / veya N, bazı proteinlerin stabilitesi selektif geliştirme düşündüren farklı olduğunu göstermektedir benthamina.
Ayrıca, gözlemlenen mevcudiyetinde ve bir susturma bastırıcı HAC1 protein eşya seviyesinin yokluğunda hem deuction 7 dpi düşüş başladı. Bu fırlatma vektör ile infiltre N. benthamiana geçici protein üretimindeki düşüş zamanlaması, hedefe-özgü olduğuna işaret etmektedir.
Fırlatma vektörü barındıran Agrobacterium hücre bankası Hedef gen stabilite, Agrobacterium canlılığı ve protein birikimi seviyesinin her yıl değerlendirilmiştir. -80 ° C'de saklanmıştır pBID4-HAC1 ile transforme GV3101 soyunun hücre bankasının gliserol stoku infiltre N geçici protein üretim düzeyinde değişiklik olmadan fazla üç yıl boyunca çok stabil olduğu gösterilmiştir benthamina bitkiler. Şekil 5C 2010, 2011, 2012 ve 2013 yıllarında Western blot tarafından tahmin HAC1 protein üretimi sırasıyla 670, 685, 566 ve 683 mg / kg, olduğunu göstermektedir. N. ortalama HAC1 üretimi benthamiana bitkileri 651 ± 49.4 mg / kg olmuştur.
Tablo 1. N. karşılaştırılması benthamina ve N. excelsiana bitki biyokütle üretimi. 
Şekil 1. N., geçici gen ekspresyon Western blot analizi benthamina. (A) Altı haftalık N. benthamiana 1)% 4.8 fosfor içeren bir suni gübre solüsyonunda bitkileri ve 2) bitkileri 0% fosfor ihtiva eden bir çözelti içerisinde artan gübre. Taze yaprak ağırlık eşdeğeri Yirmi beş mikrogram kulvar başına yüklenmiştir. GFP üretimi (B) Karşılaştırma pBID ile sızmış bitkiler vakumÜç farklı ortamlarda yetişen 4-GFP-barındıran Agrobacterium GV3101 kültürler: YEB, AB ve LB. GV3101 kültürler YEB olarak O / N yetiştirilen veya LB ortamı düşük hızda santrifüj edildi ve (MMA) (sütun: MMA-1 ve MMA-2, sırasıyla) indüksiyon ortamı içinde yeniden süspansiyon haline veya YEB olarak O / N yetiştirilen, LB veya AB ortamı doğrudan 01:05 veya Milli-Q su ile 1:10 seyreltilmiş (sütun: YEB / 5 ve YEB/10, AB / 5 ve AB/10, LB / 5 ve LB/10) (C) karşılaştırılması. A. farklı konsantrasyonları (1.0 A 600, 0.5, 0.1 ve 0.05) ile vakum infiltrasyonu takip eden 4, 7 ve 10 dpi'de GFP ekspresyon pBID4-GFP taşıyan GV3101 Agrobacterium tumefaciens suşu.

N. Şekil 2. Geçici likenaz üretim ve etkinliğinin karşılaştırılması, aşağıdaki vakum infiltrasyonu hatlarıyla benthamina bitkilerAgrobacteria'nın suşları kira. Agrobacteria'ı suşları (GV3101, A4, At77, C58C1, AT6, AT10 ve LBA4404'ün) Kültürleri pBID4-LicKM N. yapraklarına tek tek sızmış edildi fırlatma vektörü barındıran benthamina. Sızma yaprakları 7 dpi'de toplanmıştır. Western blotting ile nicelleştirilmiştir (A) likenaz üretimi. (B) tahlili Zymogram enzimatik aktivite ile likenaz üretimi ortaya çıkarmaktadır. Agrobacterium (C) etkisi (vahşi tip A4, AT10, At77 ve laboratuar gerilme GV3101) N. üzerine sızma 7 dpi benthamina bitki sağlığı. Taze yaprak ağırlık eşdeğeri Yirmi beş mikrogram kulvar başına yüklendi.

N. yapraklarında Şekil 3,. Geçici GFP ekspresyon benthamiana A. ile vakum süzmesi sonra 7 dpi N. excelsiana ve N. talaş GFP - fırlatma vektör pBID4 barındıran Tumefaciens. GFP birikim UV ışığı altında GFP ekspresyon (A) Görsel inceleme. (B) Western leke analizi.

Şekil 4,. Geçici GFP ekspresyonu ve bitki sağlığı ile ilgili vakum basıncı (A) etkileri. N. benthamiana bitkileri pBID4 ile infiltre edilmiş olan -. 400, 200, 100 ya da 50 mbar'lık vakum basınçlar altında GFP, 30 ya da 60 saniye vakum tutma süresi (B) Denge ve A. enfekte N. tumefaciens benthamiana Agrobacterium GV3101 pBID4-GFP AB ortamı içinde yetiştirilen ve 0.5 'lik bir A 600 seyreltildi barındıran ile süzüldü. Agroinfiltration N. bir düz süzülmesiyle gerçekleştirildi GFP geçici ifadesi üzerindeki asetosiringon ve glikoz farklı konsantrasyonlarda aynı seyreltilmiş Agrobacterium kültürü (şerit 0-8). (C) in etkisi benthamiana bitkileri her saat. PBID4 barındıran Agrobacterium GV3101 ırkına - GFP, YEB ortam içinde O / N yetiştirilen santrifüj ihtiva eden ve, 200 0, 100, 200 ya da 400 uM asetosiringon ile de% 2 glukoz içeren MMA veya MMA ya da 0.5 arasında bir A 600 için yeniden süspanse edildi 0 ° C'de glukoz ile uM asetosiringon, 1, 2 veya% 4. Agrobacterium süspansiyonları sızma önce oda sıcaklığında 3 saat boyunca muhafaza edildi.

Şekil 5,. N. geçici protein üretimine susturma bastırma etkisi benthamiana bırakır. (APBID4-GFP ko-infiltrasyonu ve farklı oranlarda P19 aşağıdaki GFP protein) Western leke analizi. 7 dpi (taze yaprak ağırlık eşdeğeri 25 ug, sıra başına yüklenmiştir.) (B)-pBID4 HAC1 taşıyan Agrobacterium kültürü toplanan numuneler bireysel p19 ya da p23 susturma baskılayıcı taşıyan bir kültürü ile 04:01 oranında karıştırılmıştır plazmidler. Agrobacterium kültürleri edilen kombinasyonları vakum bitkiler içine infiltre edilmiştir. HAC1 infiltre dokuları rekombinant protein miktarının belirlenmesi için 8 dpi kadar her gün toplandı. Agrobacterium hücre bankasının (C) kararlılık. Bitkiler protein birikimi değerlendirmek için her yıl Agrobacterium hücre bankası aynı parti ile infiltre edilmiştir. Taze yaprak ağırlık eşdeğeri elli mikrogram sokağın başına yüklenmiştir. inci büyük bir versiyonunu görmek için buraya tıklayınızrakamdır.