Tek nöronal birimlerin hücre dışı aktivitesini izlemek için çeşitli teknikler vardır. Bununla birlikte, bu aktivitenin davranan hayvanlardaki derin beyin yapılarından izlenmesi, özellikle yapıların stereotaksik olarak hedeflenmesi gerekiyorsa, teknik bir zorluk olmaya devam etmektedir. Bu protokol, hayvanın kafasını stereotaksik düzlemde tutan ve tek nöronların ani aktivitesini açık bir şekilde izole eden uygun cerrahi ve elektrofizyolojik teknikleri açıklar. Protokol, post-hoc histolojide nöron konumunu belirlemek için uyarı kemirgenlerinin baş desteğini, mikropipet elektrotlarla juxtaselüler izlemeyi ve iyontoforetik boya enjeksiyonunu birleştirir. Bu tekniklerin her biri kendi içinde iyi kurulmuş olsa da, protokol tek bir deneyde birleşik kullanımlarının özelliklerine odaklanır. Bu nörofizyolojik ve nöroanatomik teknikler davranışsal izleme ile birleştirilir. Mevcut örnekte, somatosensoriyel talamus içindeki nöronların aktivitesinde kendi kendine üretilen vibrissa hareketlerinin nasıl kodlandığını belirlemek için kombine teknikler kullanılmıştır. Daha genel olarak, sıçanlarda, farelerde ve diğer hayvanlarda çeşitli davranışsal görevlerle birlikte nöronal aktiviteyi izlemek için bu protokolü uyarlamak kolaydır. Kritik olarak, bu yöntemlerin kombinasyonu, deneycinin anatomik olarak tanımlanmış nörofizyolojik sinyalleri davranışla doğrudan ilişkilendirmesine izin verir.