Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliğiniz gereklidir. Giriş yapın veya ücretsiz denemenizi bugün başlatın.

Yöntem makalesi

2D Elektroforez ile Makrofagların proteomik Profil

12.7K görüntülenme

DOI:

10.3791/52219

4 Kasım 2014

 ,  ,  ,  ,  ,  , 

Yazışma yazarları: Florence Pinet <florence.pinet@pasteur-lille.fr>

Bu makalede

Özet

Makrofajlar, konak patojenitesinde rol oynayan anahtar hücrelerdir. Makrofajlar, proteomik analiz ile analiz edilebilen ve tespit edilebilen fenotipik ve fonksiyonel çeşitlilik gösterir. Bu makale, M1 veya M2 fenotipine farklılaşmış insan makrofajlarının birincil kültürlerinin 2D elektroforezinin nasıl gerçekleştirileceğini açıklamaktadır.

Özet

Burada açıklanan iki boyutlu (2B) elektroforez protokolünün amacı, insan kültürlü makrofajların fenotipinin nasıl analiz edileceğini göstermektir. Makrofajların anahtar rolü, inflamatuar, immünolojik ve enfeksiyöz hastalıklar gibi çeşitli patolojik bozukluklarda gösterilmiştir. Bu protokolde, M1 (pro-inflamatuar) veya M2 (anti-inflamatuar) fenotipine farklılaştırılabilen insan monosit türevi makrofajların birincil kültürlerini kullanıyoruz. Bu in vitro model, M1 ve M2 makrofajlarının biyolojik aktivitelerini incelemek ve ayrıca proteomik bir yaklaşım için güvenilirdir. Proteomik teknikler, konak patojenitesi sırasında M1 ve M2 makrofajlarının fenotipini ve davranışını karşılaştırmak için yararlıdır. 2D jel elektroforezi, çok sayıda proteini veya polipeptidi aynı anda haritalamak için güçlü bir proteomik tekniktir. 2D Diferansiyel Jel Elektroforezi (DIGE) adı verilen floresan boyalar kullanarak 2D elektroforez protokolünü açıklıyoruz. M1 ve M2 makrofaj proteinleri, birinci boyuttaki izoelektrik noktalarına ve ikinci boyuttaki moleküler kütlelerine göre, izoelektrik odaklama ile ayrılmadan önce siyanin boyaları ile etiketlenir. Ayrılmış protein veya polipeptit noktalar daha sonra protein veya polipeptit ekspresyon seviyelerindeki farklılıkları tespit etmek için kullanılır. Burada açıklanan proteomik yaklaşımlar, konak patojenitesi veya mikrobiyal toksinler gibi çeşitli bozukluklarla ilişkili makrofaj protein değişikliklerinin araştırılmasına izin verir.

Giriş

Makrofajlar, ayırt edici fonksiyonel fenotipleri elde edebiliyoruz heterojen ve plastik hücrelerdir. İn vivo olarak, bu hücreler mikrobiyal ürünler, sitokinler, vb. 1 mikro çevre signalssuch büyük bir çeşitlilik yanıt. İn vitro, pro-enflamatuar fenotip (M + -1) makrofaj lipopolisakarit (LPS) ve interlökin-4 (IL-4) gibi sitokinler tarafından anti-iltihabik bir fenotipe (M2) tarafından indüklenebilir. Dahası, makrofajlar belirli sinyalleri 2 üzerine, tersine M2 fenotip bir aktive M1 geçiş yapabilirsiniz.

Fenotip bağlı olarak, makrofajlar farklı işlevlere sahip olacaktır. M1 makrofajlar mikroo....

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Protokol

Protokolü kurumların insan araştırma etik kurulunun yönergeleri takip eder. Sağlıklı insan donörlerden Buffy coat Bölge Kan Transfüzyon Merkezi (Lille, Fransa) elde edilmiştir. Buffy kat elde edilen Numune bir Inserm koleksiyon (n ° DC2010-1209) olarak ilan edilmiştir.

1. Malzeme ve Kültür Medya Hazırlık

  1. 1x PBS elde etmek için steril damıtılmış su içinde, 10X fosfat tamponlu salin (PBS) ile seyreltilir.
  2. Ve% 10 toplanmış insan serumu olmadan gentamisin (40 ug / ml) ve L-glutamin (2 mM) ile takviye edilmiş RPMI 1640 ortamı sağlayın.

Monosit türevli makrofajlar 2. Primer Kültürleri (MDM),....

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Sonuçlar

Uygun diferansiyel proteomik analizi gerçekleştirmek için, analiz edilecek örneklerin işlenmesi doğrulanması gerekir.

Önce 5 yayınlanan sunulan örnekte, makrofaj hücre kültürü kalitesi, morfolojik ve moleküler özellikler için gereklidir. Makrofajlar monositlerin farklılaşması ve kültürün homojenliği faz mikroskobu ile takip edilmiştir. Şekil 1, M1 ve M2 makrofajların primer kültürlerinde bir örnek göstermiştir. Gösterildiği gibi, M1 (Şekil 1A, B) .......

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Tartışma

Bu tarifnamede tarif edilen protokol makrofajlar, M1 (pro-enflamatuar) ve M2 (anti-iltihap) olarak iki alt-tip farklı uyaranların etkisini analiz etmek için bir yöntem göstermektedir. Daha önce 7 yayınlanan M1 ve M2 makrofajların birincil kültürleri monositlerin farklılaşması elde edilmiştir.

2D DIGE jel elektroforezi prosedür, Cy3 ve Cy5 floresans bir tarayıcı için uyarım / emisyon dalga iki kez jel tarama yapmak için SDS-PAGE için izoelektro-odaklanma, düşük floresan levhaları I.......

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Açıklamalar

Beyan edilmiş bir çıkar çatışması yoktur.

Teşekkürler

Bu çalışma Inserm tarafından desteklenmiştir. Marion Bouvet, Fransa Araştırma ve Teknoloji Bakanlığı üyesidir. Annie Turkieh, Avrupa Birliği FP7 HOMAGE (305507) tarafından verilen bir bursiyerdir.

....

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Malzemeler

Bu makalede kullanılan malzemelerin listesi
AdŞirketKatalog numarasıYorumlar
RPMI 1640Canlandırıcı31870-074
PBX 10 XCanlandırıcı14200-083
L-glutamin-200 mM-100XCanlandırıcı25030-024
gentamisin 10 mg / mlİçleyici15710-049
insan serumuCanlandırıcı34005100
Ficoll d = 1,077ATGCL6115
LeucosepDutscher16760
  6 kuyulu plaka PRIMARIA Becton Dickinson353846
IL-4PromocellB-61410
lipopolisakkaritSigma-AldrichL-2654
GiemsaFluka48900
EDTA MM372,2Araştırma Organikleri 3.00E + 01
Filtre 0.22 ve mikro; mMilliporeSCGPTORE
100 ml silindirCorning430182
TCEPInterchimUP242214
Bradford reaktifiBio-Rad5000006
Cy3+Cy5-reaktif boyaGE Healthcare25-8009-83
IPG şeridi 3-10 24cmGE Sağlık17-6002-44
Protean IEF hücresiBio-Rad165-4000
Düşük erime noktalı agarozInvitrogen15517-014
Ettan-Daltsix sistemiGE Healthcare80-6485-08
Ettan DIGE Görüntüleyici tarayıcıGE Healthcare
Progenesis Samespot Doğrusalolmayan dinamikler
50 ml tüplerherhangi bir tedarikçiyok
15 ml tüplerherhangi bir tedarikçin/a
CHAPSSigma-AldrichC5070
sizin&ekanlığınız; eMerk108484-500
Thiouré eSigma-AldrichT7875
DTTBio-Rad1610611
APSSigma-AldrichA3678
TEMEDSigma-AldrichT9281
Tris BaseSigma-AldrichT1503
Tris HClSigma-AldrichT3253
Farmalitler 3-10GE Sağlık17-0456-01
SDSSigma-AldrichL3773
Bromofenol mavisiSigma-Aldrich114391
GliserolSigma-AldrichG6279
Akrilamid% 40Bio-Rad161-0148
2D temizlemeGE Healthcare80-6454-51
GlisinSigma-AldrichG7126
Loş ve eacute; thylformamideSigma-Aldrich22705-6
elektrot fitilleriBio-Rad165-4071

Kaynaklar

  1. van Ginderachter, J. A., et al. Classical and alternative activation of mononuclear phagocytes: picking the best of both worlds for tumor promotion. Immunobiology. 211, (2006).
  2. Porcheray, F., et al.

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Yeniden basım ve izinler

Etiketler

2B ElektroforezMakrofaj FenotiplendirmesiM1 M2 MakrofajlarProtein Etiketlemeİzoelektrik Odaklamaİkinci Boyut ElektroforezFloresan Boya DeteksiyonuGörüntü Analiz YazılımıNormalize Edilmiş Spot HacmiDiferansiyel Ekspresyon Analizi