$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Fagositoz, doğuştan gelen bağışıklık hücrelerinin büyük parçacıkları yuttuğu, tek hücreli organizmaların yeme mekanizmasından evrimleşen ve bir hedefe bağlanmayı, onu bir zarla sarmayı ve sitozol içinde fagozom adı verilen bir vakuol oluşturmak için zarı sıkıştırmayı içeren süreç. Fagozomal zar, plazma zarından türetilirken, aktif protein ve lipit ayırmanın yanı sıra fagozom oluşumu sırasında endomembranlarla füzyon, fagozomu, yutulan materyalin öldürülmesine, nötralizasyonuna ve parçalanmasına izin veren parçalayıcı özelliklere sahip hücre içinde ayrı bir organele dönüştürür1-3. Fagozomal olgunlaşma olarak adlandırılan bu süreç, elektronları güçlü oksidan O2- ve türevi reaktif oksijen türlerini (ROS) üreten fagozomlara aktaran nikotinamid adenin dinükleotid fosfat (NADPH) oksidaz dahil olmak üzere bir dizi proteolitik ve mikrobisidal enzimin verilmesine dayanır 2,4.
Fagozomların lümen pH'ı, fagozom işlevi için gerekli olan çeşitli olaylar üzerinde derin bir etkiye sahiptir. Birincisi, pH genel olarak endomembran kaçakçılığını etkiler, çünkü transmembran kaçakçılık düzenleyicilerinin pH'a bağlı konformasyonel değişiklikleri, Arfs, Rabs ve veziküler kaplama proteinleri gibi kaçakçılık belirleyicilerinin alımını değiştirir ve bu da hangi veziküllerin fagozomlarla kaynaşabileceğini tanımlar 5-8. İkincisi, fagozomal lümenin iyonik bileşimi de fagozomlar olgunlaştıkça dönüştürülür ve fagositik fonksiyonu destekleyen Na+/H+ değiştirici veya ClC ailesi Cl-/H+ antiporterleri gibi bazı iyon taşıyıcıları H+ translokasyonuna dayanır 9,10. Benzer şekilde, ROS üretimi fagozomal pH ile yakından bağlantılıdır. ROS ve toksik oksidan yan ürünleri, nötrofiller 4,11,12'de fagozomal öldürme için çok önemli olarak kabul edilmiştir ve makrofajlar, dendritik hücreler (DC'ler) ve amip 13-16 dahil olmak üzere diğer fagositlerde kritik roller oynadığı gösterilmiştir. NADPH oksidaz, NADPH tüketilirken sitozolde H+ salgılayan ve aksi takdirde enzim 17-21'in kendi kendini inhibisyonuna yol açacak büyük depolarizasyonu hafifletmek için, taşınan elektronların yanı sıra H+'nın eşlik eden HVCN1 kanallarından fagozomal lümene eşzamanlı transferini gerektiren elektrojenik bir enzimdir. Son olarak, birkaç proteolitik enzim farklı pH'ta optimal aktiviteye sahiptir, bu nedenle zamana bağlı fagozomal pH değişiklikleri hangi enzimlerin ne zaman aktif olduğunu etkileyebilir. Fagozomal pH'ın önemi, fagozomal pH 22-24'ü değiştirerek fagositik öldürmeyi en azından kısmen bozan Mycobacterium tuberculosis, Franciscella tularensis ve Salmonella typherium gibi organizmalar tarafından vurgulanmaktadır.
Memelilerde ana fagositler nötrofiller, makrofajlar ve dendritik hücrelerdir ve hücre tipine bağlı olarak, zamana bağlı fagozomal pH değişiklikleri büyük ölçüde değişebilir ve farklı roller oynuyor gibi görünebilir. Makrofajlarda, ATP'ye bağımlı proton pompası vakuolar ATPaz'ın (V-ATPaz) aracılık ettiği güçlü ve hızlı bir asitleşme, 25-27'yi öldürmeye aracılık eden anahtar faktörlerden biridir ve fagositozu bir yeme mekanizması olarak kullanan amiplerde bulunan mekanizmalara benzer 28. Bu hücrelerde asidik proteazların aktivasyonunun önemli bir rol oynadığı düşünülmektedir. Buna karşılık, nötrofil öldürme, miyeloperoksidaz (MPO)11 tarafından üretilen HOCl'nin yanı sıra ROS'a daha fazla dayanır ve pH, ilk 30 dakika boyunca nötr veya alkali kalır, ancak daha sonra asitleşir 29,30. Nötr pH'ın, bazı katepsinler gibi oksidatif proteazların aktivitesini desteklediği öne sürülmüştür. DC'lerde fagozomal pH tartışmalıdır, bazıları asitlenme bildirirken diğerleri nötr veya alkali pH 31,32'dir, ancak ROS ve pH, bu hücrelerin ana işlevlerinden biri olan T hücrelerine antijen sunma yeteneğini derinden etkileyebilir 33.
Daha da önemlisi, hormonlar, kemokinler ve sitokinler, olgunlaşmayı ve fagosit davranışında değişiklikleri indükleyen ve dolayısıyla fagozomal pH 34,35'i etkileyen sinyal olayları üretebilir. Benzer şekilde, ilaçlar, örneğin anti-kanser tedavileri için de düşünülen antimalaryal klorokin 36, fagozomal pH'ı ve dolayısıyla bağışıklık sonuçlarını etkileyebilir. Bu nedenle, çeşitli hücre biyologları, immünologlar, mikrobiyologlar ve ilaç geliştiricileri, belirli bir genetik bozulmanın, biyoaktif bileşiğin veya mikroorganizmanın doğuştan gelen ve adaptif bağışıklık tepkileri üzerindeki etkilerinin altında yatan mekanizmaları anlamaya çalışırken fagozomal pH'ın ölçülmesiyle ilgilenebilirler.
Burada, nötrofil fagozomal pH 19'un düzenlenmesinde HVCN1 kanalının önemini göstermemize izin veren nötrofillerde fagozomal pH'ı ölçmek için bir yöntem açıklıyoruz. Yöntem, 535 nm'de floresan emisyonu 490 nm'de uyarıldığında pH'a duyarlı olan ancak 440 nm'de değil olan floresein izotiyosiyanatın (FITC) oransal özelliğine dayanmaktadır 37. Bu boya kimyasal olarak bir hedefe, bu durumda zimozana bağlandığında, hücrelerin fagositoz olurken görüntülendiği ve fagozomal pH değişikliklerinin fagozom olgunlaştıkça gerçek zamanlı olarak ölçüldüğü geniş alanlı floresan mikroskobu kullanılarak takip edilebilir. Gerçek pH daha sonra, fagosite uğramış hücrelerin, fagozomlar içindeki pH'ın harici çözelti ile hızlı bir şekilde dengelenmesine izin veren nigerisin ve monensin iyonoforlarını içeren farklı pH çözeltilerine maruz bırakıldığı bir kalibrasyon deneyi yapılarak toplanır. Oran değerleri daha sonra çözeltilerin bilinen pH değeri ile karşılaştırılır, doğrusal olmayan regresyon ile bir kalibrasyon eğrisi oluşturulur ve elde edilen denklem oran değerinden pH'ı hesaplamak için kullanılır.