RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
tr_TR
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Metabolik yeniden programlama, M1 ve M2 makrofaj polarizasyonu için bir özellik ve önkoşuldur. Bu el yazması, fare kemik iliği türevli makrofajlarda glikoliz ve mitokondriyal fonksiyonun temel parametrelerinin ölçümü için bir testi açıklamaktadır. Bu araç, belirli faktörlerin makrofajın metabolizmasını ve fenotipini nasıl etkilediğini araştırmak için uygulanabilir.
Spesifik metabolik yollar, makrofaj alt kümelerinin kritik ayırt edici özellikleri olarak giderek daha fazla kabul edilmektedir. LPS ile indüklenen klasik olarak aktive edilen M1 veya M (LPS) makrofajları proinflamatuar iken, IL-4 alternatif makrofaj aktivasyonunu indükler ve bunlar M2 veya M (IL-4) olarak adlandırılır ve inflamasyonun çözülmesini ve yara iyileşmesini destekler. Son kanıtlar, M1 ve M2 makrofaj polarizasyonunun düzenlenmesinde metabolik yeniden programlamanın önemli rolünü göstermektedir.
Bu makalede, naif, M1 ve M2 polarize fare kemik iliği türevi makrofajların metabolik özelliklerini değerlendirmek için bir hücre dışı akı analizörü uygulanmıştır. Bu cihaz, glikolitik ve mitokondriyal oksidatif metabolizma ile ilişkili olabilecek hücre dışı asitlenme oranını (ECAR) ve oksijen tüketim oranını (OCR) ölçmek için pH ve oksijen sensörlerini kullanır. Bu nedenle, hem glikoliz hem de mitokondriyal oksidatif metabolizma, tek bir tahlilde gerçek zamanlı olarak ölçülebilir.
Bu tekniği kullanarak, burada inflamatuar M1 makrofajlarının artmış glikolitik metabolizma ve azalmış mitokondriyal aktivite gösterdiğini gösteriyoruz. Tersine, anti-inflamatuar M2 makrofajları yüksek mitokondriyal oksidatif fosforilasyon (OXPHOS) gösterir ve gelişmiş bir yedek solunum kapasitesi (SRC) ile karakterize edilir.
Sunulan fonksiyonel test, belirli sitokinlerin, farmakolojik bileşiklerin, gen nakavtlarının veya diğer müdahalelerin makrofajın metabolik fenotipini ve inflamatuar durumunu nasıl etkilediğini araştırmak için bir çerçeve görevi görür.
Makrofajlar hemen hemen tüm hastalıklarda önemli bir rol oynarken, kendi fenotip düzenleyen moleküler mekanizmalar hala tam olarak sökülmüş değildir. Makrofajlar yüksek heterojenlik gösterir ve mikroçevresinin cevaben farklı fenotipleri 1 benimsemek. LPS (+ IFNy) klasik M1 veya M (LPS) makrofajlar iltihabı teşvik ve mikrobiyal tehdit 2 farklı türlerine karşı konakçıyı korumasına aktive araştırmaktı. Diğer M1 polarizasyon ortaya çıkarmak için uyaran olarak TNF ile tek başına ya da kombinasyon halinde IFNy kullanın. IL-4 ve / veya IL-13, alternatif makrofaj aktivasyonuna neden olur ve bu M2 veya M (IL-4) hücreleri güçlü bir bastırma ve 3 devam eden bağışıklık tepkilerinin kontrol cihazları bulunmaktadır. Polarize makrofajlar LPS ile aktive makrofajlar M1 gelişmiş glikoliz 4-6 metabolik anahtarı geçiren hücresel metabolizmanın farklı bir yönetmelik görüntüler. Bunun aksine, geliştirilmiş yağ asidi oksidasyon (FAO) ve mitokondriyal oxidative fosforilasyonu (OXPHOS), IL-4 ile uyarılan M2 makrofajlar 7-9'da sürekli enerji sağlar. Böylece, değişmiş metabolizma bu doğru kutuplaşma ve inflamatuvar düzenlenmesi için bir ön koşul değil, sadece polarize makrofaj altkümelerini bir özelliği de olmasıdır. Önemlisi, glikoliz veya OXPHOS engellenmesi / FAO sırasıyla 8,10, M1 veya M2 aktivasyonunu bozduğu gösterilmiştir. Bu nedenle, makrofajlarda belirlenmesi metabolik değişiklikler polarizasyon durumu ve inflamatuar potansiyelinin değerlendirilmesi için bir araç olarak uygulanabilir.
Makrofaj metabolizmasını ölçen tutarlı bir tahlil bu nedenle ilaç, gen yıkmak olmadığını tahmin etmek için kullanılan olabilir veya diğer tedavi makrofaj kutuplaşma ve işlevini etkiler. Bu videoda, bir hücre dışı akı analizör naif, M1 ve M2 makrofajlar biyoenerjetik profillerini tanımlamak için kullanılır.
Bu el yazması ölçümünü sağlayan bir optimize edilmiş protokol detaylarıtüm ilgili glikoliz parametreleri (glikoliz, maksimal glikolizis ve glikolitik rezerv) ve bir tek deneyde mitokondriyal fonksiyon özellikleri (toplam solunum, bazal mitokondriyal solunum, ATP üretimi, proton sızıntısı, maksimal solunum ve yedek solunum kapasitesi). Bu deney düzeneği kullanarak, biyoenerjetik hücreleri (transgenik ifadesinin veya farmakolojik tedavi yıkmak gibi geni) kontrol ve 'değiştirilemez' arasında mukayese edilebilir.
1. Kültürleme ve Polarizasyon Kemik İliği-türevli Makrofajlar
Hücre dışı Akı Testinin 2. Hazırlık
| Karışım / Enjeksiyon | Bileşikler | Cilt 10x Karışımı (ul) almak eklendi | Cilt Analiz Ortamı (mi) | Çalışması sırasında enjekte edilen hacim (ul) | Deneyde nihai konsantrasyonu |
| A | 2.5 M (% 45) glukoz | 300 | 2.7 | 20 | 25 mM |
| B | A oligomycin 5 mM (OM) | 9 | 3,0 | 22 | 1,5 uM |
| C | 5 mM FCCP | 9 | 2.7 | 25 | 1,5 uM |
| 100 mM Sodyum Privat çözeltisi | 300 | 1 mM | |||
| D | 5 mM antimycin A (AA) | 153,0 | 28 | 2,5 uM | |
| 5 mM rotenone (Rot) | 7.5 | 1.25 uM |
Tablo 1. Enjeksiyon karışımlarıdır.
Bir Ekstrasellüler Flux Analyzer kullanarak Polarize M1 ve M2 BMDM 3. Bioenerjetik Karakterizasyonu
Hücre-dışı akı tahlili ve hücre ölçümü bittikten sonra, veri hücre sayımı için normalize edildi ve analiz edilebilir. Şekil 1A ve Şekil 1B 'de gösterildiği gibi, tipik olarak bu ECAR ve OCR araziler verecektir.
Glikoz (A) 'lerin enjeksiyonundan sonra, ECAR artış glikoliz hızını temsil eder. Oligomycin (B) ile ATP sentaz inhibisyonu sonra ECAR ek artış glikolitik rezerv ve kapasite (Şekil 1A) hakkında bilgi sağlar. OCR değerlerini analiz ederken, enjeksiyon (B) oligomycin mitokondriyal ATP sentezi için kullanılan oksijen tüketiminin hesaplanmasını sağlar. FCCP (C) mitokondriyal solunum koparan ve ilgili OCR ölçümleri maksimal ve yedek solunum kapasitesi hakkında veri elde. Son olarak, rotenone enjeksiyonu (Rot) ve antimycin A (AA) mitokondriyal kompleks I engellemek ve III ve artık OCR olmayan mitokondriyal oksijen eksilerini temsilumption (Şekil 1B).

Şekil 1: XF Ekstrasellüler akı deneyinde elde edilen Metabolik parametreler. (A) hücresel glikoliz ardından parametreleri (mph / dk) ECAR değerlerinden hesaplanır: glikoliz, maksimum glikolitik kapasite ve glikolitik rezerv. Bazal solunum, ATP üretimi, proton sızıntısı, maksimum solunum ve yedek solunum kapasitesi: (pmol / dk) (B) OCR ölçümleri mitokondriyal fonksiyon sonraki temel parametrelerini hesaplamak için kullanılır. Gluc = glükoz; OM = oligomycin A; FCCP = karbonil siyanit 4- (triflorometoksi) fenilhidrazon; AA = antimycin A; Rot = Rotenone bu rakamın büyük halini görmek için buraya tıklayınız.
Çalıştırdıktan sonra, ECAR ve OCR ölçümleri 1 tilaşağıdaki gibi ECAR ölçümlerinden her bir kuyunun l 15 Excel'e ihraç edilebilir ve aşağıdaki glikolitik parametreler hesaplanabilir:
Sigara glikolitik asitlenme = ort. ECAR (1,2,3)
Glikoliz = ort. ECAR (4,5,6) - ort. ECAR (1,2,3)
Maksimum glikolitik kapasite = ort. ECAR (7,8,9) - ort. ECAR (1,2,3)
Glikolitik rezerv avg =. ECAR (7,8,9) - ort. ECAR (4,5,6)
OCR oranlarından sonraki metabolik özellikleri tespit edilebilir:
Sigara mitokondriyal solunum = ort. OCR (13,14,15)
Bazal solunum = ort. OCR (4,5,6) - ort. OCR (13,14,15)
ATP üretimi = ort. OCR (4,5,6) - ort. OCR (7,8,9)
Proton kaçak =ort. OCR (7,8,9) - ort. OCR (13,14,15)
Maksimum solunum = ort. OCR (10,11,12) - ort. OCR (13,14,15)
Yedek solunum kapasitesi (SRC) = ort. OCR (10,11,12) - ort. OCR (4,5,6)

Şekil 2:. Naif metabolik özellikleri (M0), LPS (M + -1) ve IL-4 (M2) polarize makrofajlar 8 ayrı kuyuların ortalama (SEM) her bir ölçüm, ortalama ve standart hata için sunulmuştur. (A) Hücre dışı asitlenme oranları (MPH / dak ECAR) ve (B) oksijen tüketimi oranları (OCR, pmol / dk) farklı şekilde polarize (M1 ve M2) ve naif makrofajlar (M0) için ölçülür. (CyQUANT ile ölçülen) ve saf makrofajlar ortalama hücre sayısı, 1. ayarlandı Tüm ölçümler hücre sayımı için normalize edildijection A = glükoz; B = oligomycin; C = FCCP; D antimycin A + rotenone =. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Şekil 2A'da gösterildiği gibi, LPS ile makrofaj aktivasyonu glikolitik metabolizma artışa yol açar. Şekil 2B'de oksijen tüketimi oranlarına (OCR) bakarken, LPS ve IL-4 ile tedavi edilmiş makrofajlar arasındaki farklar çok daha belirgindir. Maksimal oksidatif metabolizması yüksek M (LPS) ile bastırılır olsa da, bu, IL-4 M2 makrofajlar, bazal ve özellikle de maksimum solunum indükler. Bir artmış glikolitik M (LPS) makrofajlar oldukça benzersiz ve M (IFNy) makrofajlar glikolizi geliştirmek göstermek yok çünkü ille M1 makrofajların karakteristik olmadığına dikkat edilmelidir.
Genel olarak, bu, hücre dışı akı analizi tha göstermektedirLPS ile aktive makrofajlar görüntüleme glikolitik metabolizma geliştirilmiş herhangi bir fazlalık solunum kapasiteye sahip değildir, oysa t, M2 makrofajlar gelişmiş oksidatif metabolizması ile karakterize edilir ve özellikle de yüksek bir yedek solunum kapasiteli (SRC) IL-4 ile uyarılan.
Bu maddeye ücretsiz erişim Seahorse Bioscience tarafından desteklenmektedir.
Metabolik yeniden programlama, M1 ve M2 makrofaj polarizasyonu için bir özellik ve önkoşuldur. Bu el yazması, fare kemik iliği türevli makrofajlarda glikoliz ve mitokondriyal fonksiyonun temel parametrelerinin ölçümü için bir testi açıklamaktadır. Bu araç, belirli faktörlerin makrofajın metabolizmasını ve fenotipini nasıl etkilediğini araştırmak için uygulanabilir.
Jan Van den Bossche, Hollanda Kalp Vakfı'ndan (2013T003) Junior Postdoc bursu ve ZonMW'den (91615052) VENI hibesi aldı. Menno de Winther, Hollanda Kalp Vakfı'nın (2007T067) Yerleşik Araştırmacısıdır, Hollanda Kalp Vakfı hibesi (2010B022) tarafından desteklenmektedir ve AMC bursuna sahiptir. Ayrıca Hollanda Kardiyovasküler Araştırma Girişimi, Hollanda Üniversite Tıp Merkezleri Federasyonu, Hollanda Sağlık Araştırma ve Geliştirme Örgütü ve Hollanda Kraliyet Bilimler Akademisi'nin "Ateroskleroz için en iyi kanıta dayalı farmasötik hedeflerin oluşturulması" (CVON2011-19) GENIUS projesine verdiği desteği de kabul ediyoruz. Açık erişimli yayını mümkün kıldığı için Seahorse Bioscience'a teşekkür ederiz. Yazarlar, Denizatı analizörü ile ilgili önceki tüm yardımları için Riekelt Houtkooper ve Vincent de Boer'e (Genetik Metabolik Hastalıklar Laboratuvarı, Akademik Tıp Merkezi, Amsterdam, Hollanda) teşekkür eder.
| 23G ve 25G iğneler | Becton Dickinson | # 300800 ve # 300600 | Yıkanmış kemik iliğine |
| 10 ml şırınga | Becton Dickinson | # 307736 | Kızarmış kemik iliği |
| için Petri kapları | Greiner | # 639161 | Kemik iliği hücrelerini kültürlemek için |
| CyQUANT Hücre Proliferasyon Test kiti ve nbsp; | Moleküler Problar | #C7026 | Daha sonraki bir zaman noktasında hücre ölçümü için (yalnızca yapışık hücreler için çalışır) |
| CyQUANT Doğrudan Hücre Proliferasyon Test kiti & nbsp; | Moleküler Problar | # 35011 | Testten hemen sonra hücre ölçümü için (yapışmayan hücreler) |
| XFe< / sup>96 hücre kültürü mikroplakası | Denizatı Biyobilimi | # 101085-004 | Hücrelerin kültürlendiği ve testin yapıldığı 96 kuyulu plaka |
| rekombinant fare interlökin-4 (IL-4) | Peprotech | # 214-14-B | Alternatifmakrofaj aktivasyonunu |
| indüklemek için kullanılırlipopolisakkarit (LPS) | Sigma | #L2637 | Proinflamatuar uyaran |
| Denizatı Sensör Kartuşu | Denizatı Biyobilimi | #102416-100 | pH ve O2 ölçümü için probları içerir |
| Denizatı XF Kalibrasyonu | Denizatı Biyobilimi | #100840-000 | Probları gece boyunca nemlendirmek için gerekli |
| XF baz orta | Denizatı Biyobilimi | #102353-100 | pH değişikliklerinin verimli bir şekilde ölçülmesini sağlayan tamponsuz ortam |
| L-glutamin | Yaşam Teknolojileri | #25030-081 | |
| D-(+)-Glikoz | Sigma | #G8769 | Hücrelere eklendikten sonra glikolizi yakıtlar |
| oligomisin A | Sigma | #75351 | Mitokondriyal ATP sentazı inhibe eder |
| FCCP( Karbonil siyanür 4-(triflorometoksi)fenilhidrazon) | Sigma | #C2920 | Mitokondriyal solunumu ayırır |
| 100 mM Sodyum Piruvat çözeltisi | Lonza | #BE13-115E | Glikolize ihtiyaç duymadan maksimum mitokondriyal solunuma izin verir |
| Antimisin A | Sigma | #BE13-115EA8674 | Mitokondri kompleksi III'ü inhibe eder |
| Rotenone | Sigma | #BE13-115EA8674R8875 | Kompleks I'i inhibe eder. mitokondri |
| Casy Hücre Sayacı | Roche Teşhis | # 05 651 697 001 | Hücreleri saymak için alet |
| anti-CD16 / CD32 | eBioscience | # 14-0161 | Fc reseptör blok akış sitometrisi |
| anti-F4 / 80-APC-eFluor780 eBioscience | # 47-4801 | Makrofajları lekelemek için antikor | |
| , anti-CD11b-FITC | eBioscience | # 11-0112 | Makrofajları lekelemek için antikor |