Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliğiniz gereklidir. Giriş yapın veya ücretsiz denemenizi bugün başlatın.

Yöntem makalesi

Hızlı Bir adım enzimatik sentezi ve Trehaloz Analoglarının All-sulu Arıtma

9.8K görüntülenme

⸱

DOI:

10.3791/54485

⸱

17 Şubat 2017

 ,  ,  ,  ,  ,  , 

Bu makalede

Özet

Trehaloz analogları, biyo(teknolojik)olojik ve biyomedikal uygulamalar için önemli moleküller olarak ortaya çıkmaktadır. Basit, verimli, hızlı ve çevre dostu olan trehaloz analoglarını enzimatik olarak sentezlemek ve saflaştırmak için optimize edilmiş bir protokol açıklıyoruz. Mikobakterilerin tespiti için bir probun hızlı üretimi ve uygulanmasına uygulanması gösterilmiştir.

Özet

Kimyasal trehaloz veya trehaloz analogları sürümlerini değiştirilmiş, diğer alanlar arasında biyoloji, biyoteknoloji ve ilaç bilimi uygulamaları var. Örneğin, tespit etiketleri taşıyan trehaloz analoglan Mycobacterium tuberculosis tespit etmek için kullanılmıştır ve tüberküloz tanısal görüntüleme maddeleri gibi uygulamalar olabilir. trehalozun hidrolitik olarak kararlı versiyonları da bağlı kalorisiz tatlandırıcılar ve Bio koruyucu maddeler olarak kullanım için potansiyel takip edilmektedir. Çeşitli uygulamalar için bileşikler sınıfının itiraz rağmen, potansiyel nedeniyle bunların üretimi için güçlü bir yol olmadığı için tamamlanmamış kalır. Burada, kimyasal sentez ile ilgili sorunlarını ortadan trehaloz analoglarının hızlı ve etkili bir tek-aşamalı biyokatalitik sentezi için ayrıntılı bir protokol sunulmuştur. Thermoproteus Tenax gelen ısı ayarlı trehaloz sintaz (tRet) enzimini kullanarak, trehaloz analoglan generat olabilirEd glükoz analogları ve yüksek verimle üridin difosfat glukozdan tek bir aşamada (kantitatif dönüşüme kadar) 15-60 dakika içinde. sıkma diyaliz ve iyon değişim oluşur basit ve hızlı bir sigara kromatografik saflaştırma protokolü gibi az 45 dakika içinde sulu bir çözelti içinde bilinen konsantrasyonda bir çok trehaloz analoglarını sağlayabilir. reaksiyona girmemiş glükoz analoğu hala devam durumlarda, trehaloz analog ürününün kromatografik saflaştırması gerçekleştirilebilir. Genel olarak, bu yöntem olup, özelliği kimyagerler etkin ve erişilebilir hızlandırılmış sentezi ve trehaloz analogları saflaştırılması için bir "yeşil" biyokatalitik bir platform sağlar. Bu yöntemin uygulanabilirliği örnek için, sentez seyahati sulu arıtma bir protokol açıklar ve mikobakterilerin floresens az 1 saat sürdü ve etkinleştirilmiş her biri mikobakteriler için trehaloz-bazlı tıklama kimyası prob uygulanması. Gelecekte, oth arasında, o tasavvurUygulamalar er, bu protokol, tüberküloz teşhis için trehaloz-bazlı prob hızlı sentezi uygulanabilir. Böyle pozitron emisyon tomografisi-bilgisayarlı tomografi (PET-BT) olarak (örneğin, 18 F-modifiye trehaloz) ileri klinik görüntüleme yöntemleri için kullanılan olabilir Örneğin, kısa ömürlü radyonüklid modifiye trehaloz analogları.

Giriş

Trehaloz, bir 1,1-α, α-glikosidik bağ (Şekil 1A) ile bağlanmış iki glukoz gruplarından oluşan simetrik indirgeyici olmayan disakkarittir. Trehaloz, insan ve diğer memelilerde eksik olsa da, bakteri, mantar, bitki ve omurgasız 1 yaygın olarak bulunur. En organizmalarda trehaloz birincil rolü, kuruma 1 ile çevresel strese karşı korumaktır. Buna ek olarak, bazı insan patojenleri hücre kılıfı sentezi bir aracısı olarak ve bağışıklık glikolipitler 2 yapımı için bir yapı bloğu olarak trehaloz kullanan tuberculosis neden Mycobacterium tuberculosis dahil olmak üzere, hastalık ol....

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Protokol

Top10 E.coli'den 1. Ekspresyonu ve Saflaştırılması tRet

NOT: Tret-ifade eden E. coli suşu istemek için yazarları irtibata geçiniz ve beraberindeki malzeme transferi anlaşması (Top10 E. dönüştü AraC proteinin kontrolü altında T. tenax tret geni içeren, pBAD Tret plazmid 19 coli) . Aşağıdaki protokol, tipik olarak, yaklaşık 4 mg / L'lik bir protein verimi verir.

  1. E. coli Tret ifade eden bir 3 mL gecede kültür hazırlayın.
    1. Bir lizojeni etsuyu (LB), 100 ug / ml ampisilin ihtiva eden agar plaka üzerine pBAD-tRet ifade vektörü ile transforme edilen bir çizgi Top1....

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Sonuçlar

T. Tenax tRet yaklaşık 4 mg, standart protein ekspresyonu ve saflaştırma teknikleri kullanılarak / L'lik bir verimle elde etmek üzere, E. coli 'den elde edilmiştir. Tek bir nikel afinite kromatografisi adım (a Örnek FPLC izleme Şekil 4'te gösterilmiştir), E. coli lizattan tRet saflaştırmak için yeterliydi. TRet sentez işlemi üzerindeki ilk yayında kurulmuş olarak, yeniden birleştirici T. Tenax tRet çeşitli glükoz analogları-çoğu, geniş.......

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Tartışma

Trehaloz analogları gıda ve ilaç korunması mikrobiyal enfeksiyonların 6 tanı ve tedavi, çeşitli alanları etkileme potansiyeline sahiptir. Mevcut çok basamaklı kimyasal sentez yöntemi (doğal karmaşık mikobakteriyel glikolipitler ortaya çıkan gibi) modifikasyon birden fazla site kompleks trehaloz analoglarını üretmek için de yararlıdır. Bununla birlikte, bu yöntemler, nispeten basit bir tekli ikame edilmiş trehaloz analogları 9, 13,.......

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Açıklamalar

Yazarların açıklayacak hiçbir şeyi yoktur.

Teşekkürler

Bu çalışma, Ulusal Sağlık Enstitüleri'nden (R15 AI117670) BMS ve PJW'ye verilen bir hibenin yanı sıra Research Corporation'dan (20185) P.J.W.'ye verilen Cottrell College Scholar Ödülü ile finanse edilmiştir. L.M.M., CMU'dan bir Provost Bursu tarafından desteklenmiştir.

....

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Malzemeler

Bu makalede kullanılan malzemelerin listesi
AdŞirketKatalog numarasıYorumlar
LB agarAraştırma Ürünleri UluslararasıL24021
Ampisilin sodyum tuzuSigma AldrichA9518
Luria suyuAraştırma Ürünleri UluslararasıL24045
Müthiş Et SuyuAraştırma Ürünleri UluslararasıT15050
L-(+)-ArabinozSigma AldrichA3256
Fosfat tamponlu TuzluSu GE HealthcareSH30256
İmidazolSigma AldrichI5513
Sodyum klorürBDHBDH9286
Sodyum fosfat, monobazikFisher ScientificS374
Şırınga filtresi, 0.45 ve mikro; mFisher Scientific09719D
Proteaz İnhibitörü mini tabletler, EDTA içermeyenThermo Scientific88666
HisTrap HP nikel afinite sütunu, 5 mLGE Healthcare17-5248-02
TRIS bazlı ultra safAraştırma Ürünleri UluslararasıT60040
Diyaliz tüpü, MWCO 12– 14.000Fisher Scientific21-152-16
Glikoz analoglarıCarboSynth, Sigma Aldrich, Santa Cruz Biyoteknoloji, Amerikan Radyoaktif İşaretli KimyasallarÇok sayıda glikoz analogu sunan satıcı örnekleri
6-Azido-6-deoksi glukopiranoz (6-GlcAz)CarboSynthMA02620
UDP-Glikozabcam Biyokimyasallarab120384
Magnezyum klorür hekzahidrat Fisher ScientificM33
Amicon Ultra-15 santrifüj filtre ünitesiEMD MilliporeUFC901008
Bio-Rex RG 501-X8 karışık yataklı iyon değiştirici reçineBio-Rad444-9999
Ekstra İnce Biyo-Jel P2 ortamıBio-Rad150-4118
Cam destekli silika jel ince tabaka kromatografi plakalarıEMD Millipore 1056280001
n-ButanolFisher ScientificA399
EtanolFisher ScientificS25310A
Sülfürik asitFisher ScientificA300
AsetonitrilEMD MilliporeAX0145
Döteryum oksit,% 99.8Acros Organics351430075
Aminopropil HPLC sütunuSigma Aldrich58338
Sığır serum albüminiSigma Aldrich5470
Para-formaldehitTed Pella18505
Alkin-488Sigma Aldrich761621
Sodyum askorbatSigma AldrichA7631
Tris [(1-benzil-1H-1,2,3-triazol-4-il) metil] amin (TBTA)Kimya Araçlarını Tıklayın1061
tert-BütanolSigma Aldrich360538
DimetilsülfoksitSigma AldrichW387520
Bakır(II) sülfatSigma AldrichC1297
Fluoromount-G montaj ortamıGüney Biyoteknolojisi10001

Kaynaklar

  1. Elbein, A. D., Pan, Y. T., Pastuszak, I., Carroll, D. New insights on trehalose: a multifunctional molecule. Glycobiology. 13, 17-27 (2003).
  2. Tournu, H., Fiori, A., Van Dijck, P. Relevance of trehalose in pathogenicity: some general rules, yet many exceptions. PLoS Pathog....

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Yeniden basım ve izinler

Daha fazla makale keşfet

TreT EnzimiSpin Diyalizİyon DeğişimiGlukoz AnaloguUDP-GlukozKlik Kimyası ProbuMycobacterium TuberculosisKromatografik Olmayan Saflaştırma