Makrofajlar doğuştan gelen bağışıklık sisteminde ve homeostazda önemli bir rol oynar. Fagositoz 1,2 adı verilen bir işlemle patojenleri ve kalıntıları içselleştiren ve ortadan kaldıran profesyonel fagositlerdir. Parçacıklı materyalin yutulmasından sonra oluşan kapalı bölme olan fagozom, endositik bölmelerle bir dizi füzyon ve fisyon olayına uğrar ve bu da fagolizozom adı verilen parçalayıcı bir bölmeye yol açar. Bu bölme, proton pompalayan v-ATPazların edinilmesi nedeniyle asidik bir pH'a sahiptir, hidrolitik enzimler içerir ve lizozomal ilişkili zar proteinleri (LAMP'ler) bakımından zenginleştirilmiştir. Fagozomların olgunlaşmasına, lizozomların biriktiği perinükleer bir konuma ulaşmak için hücre merkezine doğru 3,4 mikrotübüller üzerindeki göçleri eşlik eder.
Birçok patojenin, bulundukları vakuolar ortamı değiştiren hücre içi yaşam tarzlarına sahip bakteriler de dahil olmak üzere fagozom olgunlaşmasını kaçırdığı bildirilmiştir 5. İnsan İmmün Yetmezlik Virüsü (HIV)-1, T hücrelerine ek olarak makrofajları da hedef alır. Makrofajlar, T hücrelerinden farklı olarak virüsün sitopatik etkilerine karşı dirençli olduklarından, virüs için bir rezervuar olarak düşünülebilirler. Ek olarak, HIV-1 ile enfekte olan makrofajlar kusurlu fagositik fonksiyonlar gösterir ve fırsatçı hastalıkların ortaya çıkmasına katkıda bulunur. Özellikle, Salmonella Typhimurium ST313'ün neden olduğu şiddetli invaziv tifo dışı Salmonella hastalığı, HIV 6 ile enfekte olmuş Sahra altı Afrikalı çocuklarda veya yetişkinlerde son otuz yıldır yaygındır. HIV ile yaşayan kişilerde tüberküloz gelişme riskinin, HIV enfeksiyonu olmayanlara göre 20 kat daha fazla olduğu tahmin edilmektedir.
Tüm bu nedenlerden dolayı, HIV ile enfekte makrofajlardaki fagositik defektlerin altında yatan moleküler mekanizmaların daha iyi tanımlanması önemlidir. HIV ile enfekte makrofajlarda partikül materyal, opsonize partiküller, bakteri veya mantarların alımının inhibe edildiğini gösterdik 7. Bu inhibisyonun kısmi olduğu göz önüne alındığında, daha sonra HIV ile enfekte olmuş insan makrofajlarındaki içselleştirilmiş fagozomların kaderini analiz etmeye başladık 8. Fagozom olgunlaşması, hücre merkezine göç ve lizozomlarla füzyon ile sıkı bir şekilde bağlantılı olduğundan, fagozomal olgunlaşmadaki bir kusur, enfekte hücredeki kaçakçılık modalitelerinin modifikasyonlarına bağlı olabilir. Burada tarif edilen yöntem, reseptör aracılı fagositozu ve özellikle immünoglobulinlerin (FcR) Fc kısmı için reseptörleri hedeflemek için bir model olarak IgG-opsonized Koyun Kırmızı Kan Hücrelerini (IgG-SRBC'ler) kullanır. Bu parçacıkların parlak alanda (BF) görüntülenmesi lateks boncuklara göre daha kolaydır, çünkü hücre dışı ve hücre içi SRBC'ler farklı kırılma özellikleri gösterir 9. HIV ile enfekte makrofajlarda çekirdeğe doğru hareket eden fagozomların hızını ölçmek için bir floresan virüs 10 kullandık ve burada açıklanan basit bir manuel izleme yöntemi oluşturduk. Yöntem gelişmiş programlama gerektirmez ve sadece ImageJ'yi kullanır. Parlak alan mikroskobu veya floresan görüntüleme ile görüntülenebilen yapışık hücrelere ve her türlü parçacık veya patojene uygundur.