Bu iletişim kuralı, biz teknikleri için uygun diseksiyon Arabidopsis çiçek ve siliques, bazı temel Temizleme teknikleri tarif ve yordamlar yapılar gözlemleri bütün-mount için boyama seçili.
Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliğiniz gereklidir. Giriş yapın veya ücretsiz denemenizi bugün başlatın.
Yöntem makalesi
Bu iletişim kuralı, biz teknikleri için uygun diseksiyon Arabidopsis çiçek ve siliques, bazı temel Temizleme teknikleri tarif ve yordamlar yapılar gözlemleri bütün-mount için boyama seçili.
Moleküler genetik araştırmalar onun müthiş araçlar nedeniyle Arabidopsis thaliana bitki Biyoloji ve başta bitki üreme biyolojisi en önemli modeli türlerinden biridir. Ancak, bitki morfolojik, anatomik ve ultrastructural analizler geleneksel olarak zaman alıcı gömme ve yordamlar parlak alan, tarama ve elektron mikroskopi kesit olarak içerir. Confocal floresan mikroskopisi, state-of--art 3-b bilgisayar destekli Mikroskopik analizler ve minimal işlenmiş bütün Dağı numuneler üzerinde kullanılmak üzere moleküler teknikleri sürekli arıtma son ilerleme için artan bir talep yol açmıştır verimli ve en az bir örnek işleme teknikleri geliştirmek. Bu iletişim kuralı ' biz düzgün Arabidopsis çiçek ve siliques, temizleme teknikleri, temel anatomi tekniklerini tanımlamak ve bazı boyama işlemleri için bütün yapılar gözlemleri montaj.
Çiçekler arasında en önemli organları kapalı tohumlular tanımlıyoruz. Çiçekli bitkiler ortaya çıktı bazı 90-130 milyon yıl önce1ve çeşitlendirilmiş hızlı rapid görünüşleri Charles Darwin2tarafından bir "iğrenç gizem" nitelendirildi. Bitki araştırmacılar çıkarlarını çiçek geliştirme çeşitlidir. Bir bütün veya belirli anatomik, yapısal ve işlevsel özellikleri çiçekler3,4,5,6 evrimi çiçek evrimsel kökeni anlamayla ilgili biraz araştırma odaklı . Çiçek formu ve yapısı, hem de onlara, güvenerek cinsel ve eşeysiz üremenin biçimi yüksek değişim son derece karmaşık bir yapı çiçek olun. Çiçek organlarını, genetik ve moleküler İncelemeler7ile kombine edilebilir ışık ve elektron microscopical teknikleri kullanarak anatomi ve yapısal özelliklerini tanımlamak için çeşitli çabalar yol açmıştır. Ayrıca, kaynak, meyve ve tohum, çiçek büyük önem insan ve hayvan beslenmesi için vardır. Bu nedenle, çiçek ve meyve geliştirme karakterizasyonu uygulamalı araştırma, gıda güvenliği için bir artan insan nüfusu ve ekolojik koruma stratejileri değişen çevre8 altında da dahil olmak üzere birçok etkileri vardır , 9 , 10.
Arabidopsis geliştirmede çiçek çiçek indüksiyon ve önümüzdeki (çiçek grubu) meristem için bitkisel meristem dönüşüm başlar. Çiçek primordia yanal önümüzdeki meristem11Açıl başlatılır. Çiçek organ primordia giderek çiçek ortasına dışarıdan konsantrik gözlemleyebileceğiniz form ve sonunda sepals, yaprakları, stamens ve carpels7geliştirmek. Çiçek Bu organların farklı besin, koruyucu ve fonksiyonel (örneğin, tozlayıcı cazibe) yerine farklı bitki türü, erkek ve dişi gametophytes, sırasıyla12 gelişimi sürdürülmesi cinsel organları ile rolleri , 13. gametophytes, buna karşılık, her bir çift erkek (sperm) ayırt etmek ve kadın gametler (yumurta ve merkezi hücre), üzerine birleştirmek çift döllenme nesil, zigot ve birincil endosperm oluşturmak için bir terminal doku destekleyen embriyo14,15geliştirilmesi. Meyve ve tohum geliştirme desteği büyüme, olgunlaşma ve embriyo ve sonunda, onun dağılma korunması. Kapsamlı bir araştırma modeli tür Arabidopsis7,16,17, özellikle farklı bitki türleri çiçek ve embriyo geliştirilmesinde karakterize etmek için yapıldı.
Çiçek gelişiminin erken Mikroskopik analizler zaman alıcı örnek işleme ve gözlem teknikleri, parafin veya reçine katıştırma ve kesit, gibi ışık ya da elektron mikroskobu ile birlikte dayalı idi. Bu geleneksel mikroskobik teknikler kez mutantlar, RNA Yerelleştirme in situ hibridizasyon tarafından veya IMMUNO-algılama proteinlerin microscopical analizleri gibi moleküler genetik araştırmalar ile birlikte kullanılmaya başlanmıştır. State-of--art 3 boyutlu bilgisayar destekli görüntü analizleri ve minimal işlenmiş bütün Dağı numuneler üzerinde kullanılabilir moleküler yöntemler sürekli arıtma geniş alanlı ve confocal floresan mikroskopi son ilerleme için bir ihtiyaç yol açmıştır verimli ve en az bir örnek işleme teknikleri kantitatif analizleri için tercihen mükellef bulunmaktadır. Son yıllarda, önemli bütün Dağı hayvan numune Temizleme teknikleri geliştirme konusunda ilerlemeler kaydedilmiştir. Onlar render örnek şeffaf Sulu üre veya şeker tabanlı reaktifler (örneğin, ölçek, SeeDB, kübik) kullanarak18,19,20, veya seçici (SDS deterjan kullanarak) lipidler sonra kaldırarak örnekleri istikrarlı hydrogels katıştırma; lipidler kaldırılması olabilir pasif Difüzyon tarafından elde (örneğin, değiştirilmiş NETLİK protokolü21, PAKTI-PARS-jantlar22) veya aktif Elektroforez (orijinal NETLİK protokolü23 ve hareket-PRESTO24). Bu hızlı ilerleme tarafından teşvik, türetilmiş bazı teknikler de bitkiler kullanmak için ortaya çıkıyor.
Bu yöntemleri kağıt model Arabidopsisüzerinde duruldu, biz için prosedür çiçek tomurcukları, çiçek ve genç siliques uygun diseksiyon ve tüm montaj örnekleri çeşitli boyama için takas ve gözlem yordamları kullanarak tarif Klasik veya son SDS-esaslı temizleme yöntemi. Nişasta, callose ve Kromatin boyama örnekleri verilmiştir. Her ne kadar bu yordamları daha fazla geliştirmeleri ve diğer türler ile kullanıldığında uyarlamalar ihtiyacınız, onlar için daha fazla araştırma birçok araştırma projelerinin başlangıç noktası olan bu basit ama kritik yöntemlere sahne umuyoruz.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
1. çiçek ve Silique fiksasyon
2. Stereomicroscope altında diseksiyon
3. kloral hidrat tabanlı takas ve kombine takas boyama
Not: En iyi sonuç için takas kloral hidrat tabanlı malzeme sabit FPA50 ile elde edilir.
4. kombine boyama Alexander ve nedir Herr'ın 4½ takas
Not: Özgün Alexander Protokolü boyama önce polen taneleri slayt üzerinde bırakmadan üzerinde dayanır. Bir verimli ve daha bilgilendirici, modifiye boyama ve yordam temizlemek olduğunu olgun ama dehiscent sigara nedir içinde olgun polen taneleri boyama Alexander.
5. kaldırma Exine polen taneleri
Not: Carnoy'nın sabitleştirici DAPI boyama için kullanmanızı öneririz.
6. Sodyum Lauryl Sülfat (SDS) Temizleme
Not: Bağlı olarak çözümlenmesi için çiçek organ ve çok yumuşak ve küçük örnekleri incelemek için araştırmacı becerileri, SDS tedavi (için deneyimli araştırmacılar) ya da daha önce yapılabilir veya diseksiyon adım sonra (daha az deneyimli için araştırmacılar) metanol Asetik asit malzeme sabit.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Arabidopsis bir corymb (şekil 1) biseksüel tanzimi ile çiçek taşıyan Brassicacea ailesine ait. Her çiçek dört sepals, dört yaprakları, altı stamens (dört uzun lafın kısası iki) ve dört konsantrik gözlemleyebileceğiniz25,26yılında düzenlenmiş iki doğuştan erimiş carpels (şekil 1F-H) oluşan bir syncarpous gynoecium var. Arabidopsis tenuinu...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Birçok çiçek tomurcukları Arabidopsistüm çiçek gelişim aşamalarında, kapsayan, tek bir önümüzdeki içinde varlığını bir tedavi ya da bir gelişimsel özelliği bir etkisi karakterize yönelik çalışmalar için eşsiz bir fırsat sunuyor aynı anda farklı gelişimin çiçek arasında. Farklı bireysel bitkiler arasında iyi bir referans noktası ana önümüzdeki ilk çiçek açıyor. Bitkiler çiçekli eşitlenir şekilde tedavi edilir (örneğin, 3-4 gün stratifikasyon 4 ° C'de en üst düzeye çıkarır zaman uyumlu tohum çimlenme ve d...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yazarlar ifşa gerek yok.
Bu eser Zürih Üniversitesi tarafından bir IEF Marie Curie Grant desteklenmiştir (Hayır verin. A.H. TransEpigen-254797), Avrupa Araştırma Konseyi gelişmiş verilmesi (Hayır verin. MEDEA-250358 U.G. için) ve bir araştırma ve teknoloji geliştirme projesi (grant MecanX U.G. için) SystemsX.ch, İsviçreli girişimi sistemleri Biyoloji.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| Reaktifler ve Malzemeler< / güçlü > | |||
| Etanol | Scharlau | ET00102500 | |
| Asetik Asit Uygulaması | A3686,2500 | % 100 Moleküler biyoloji sınıfı | |
| Buzul Asetik Asit | Sigma-Aldrich | 320099 | Moleküler Biyoloji Sınıfı |
| Metanol | Scharlau | ME03062500 | |
| Formaldehit | Çözeltisi Sigma-Aldrich | F1635 | |
| Propiyonik asit | Sigma-Aldrich | 81910-250 ml | |
| Kloral hidrat | Sigma-Aldrich | 15307 | |
| Gliserol | Roth | 3783.1 | |
| Arap zamkı | Fluka | 51198 | |
| Laktik asit | Fluka | 69773 | |
| Fenol | Sigma-Aldrich | 77607-250ML | Sıvı fenol kullandık (çözeltiniz için gerekli hacmi bulmak için yoğunluğu kullanın) |
| Karanfil | yağı Sigma-Aldrich | C8392-100ML | |
| Ksilen | Roth | 4436.1 | |
| İyot | Fluka | 57665 | |
| Potasyum iyodür | Merck | 5043 | |
| Malakit Yeşil | Fluka | 63160 | |
| Fuchsin asit | Fluka | 84600 | |
| Turuncu G | Sigma | 7252 | |
| Sodyum Dodesil Sülfat | Sigma-Aldrich | L3771 | Moleküler Biyoloji Sınıfı |
| Sodyum hidroksit | Sigma-Aldrich | 71690 | |
| Sodyum di-Hidrojen Fosfat | Uygulaması | A1047,1000 | |
| Sodyum fosfat dibazik | Sigma-Aldrich | S9763-1KG | |
| Potasyum fosfat | Sigma-Aldrich | 04347 | |
| EDTA | Uygulaması | A2937,1000 | |
| Calcofluor | Sigma | F6259 | Floresan parlatıcı 28 |
| Auramine | Chroma | 10120 | |
| DAPI | Sigma | D9542 | toksik |
| Triton-X-100 | Sigma | T8787 | |
| Anilin mavisi | Merck | 1275 | |
| MS orta | Carolina | 19-57030 | |
| Besin açısından zengin substrat | Einheitserde | ED73 | |
| Saat yapımcısının camı | Belirli bir marka yok | ||
| 15 ml falcon santrifüj tüpleri | VWR | 62406-200 | |
| Dumond Forseps | Onaylı | 0208-5SPSF-PS | |
| Forseps | DUMONT BIOLOGY | 0108-5 | |
| Şırınga | BD | BD Plastipak 300013 | 1 ml |
| Hazırlık iğnesi | BD | BD Microlance 304000 | |
| Mikroskop slaytları | Thermo Scientific | 10143562CE | kesik |
| kenarlar Lameller | Thermo Scientific | DV40008 | |
| Nemli kutu | İçinde nemli kağıt havlu ve sürgülü destekler bulunan plastik bir kutu | ||
| Adı | güçlü<>Şirket<> | Katalog Numarası | Yorumlar |
| Çözümler> | |||
| Fiksatifler | |||
| Carnoy'un (Çiftçinin) fiksatifi | Mutlak etanol : buzlu asetik asit, 3:1 (ml:ml) | ||
| Metanol/asetik asit fiksatif | %50 (h/h) metanol, deiyonize suda %10 (h/h) buzlu asetik asit | ||
| FPA50 fiksatif | Formalin, propiyonik asit, %50 etanol; 5:5:90 (ml:ml:ml) | ||
| Temizleme çözeltileri | |||
| Kloral hidrat/gliserol | Kloral hidrat: gliserol: su, 8:1:2 (g:ml:ml). DIC mikroskobu ile tüm çiçek gelişim evrelerinde ve silique gelişiminde kullanılabilir. En iyi fiksatif formalin bazlı FPA50 | ||
| Modifiye Hoyer | Gum arap 7.5 g, kloral hidrat 100 g, gliserol 5 ml , su 30 ml'dir. DIC mikroskobu ile tüm çiçek gelişim evrelerinde ve silique gelişiminde kullanılabilir. En iyi fiksatif, formalin bazlı FPA50 | ||
| Herr's 4 & frac12'dir; temizleme sıvısı | Laktik asit, kloral hidrat, fenol kristalleri, karanfil yağı, ksilen; ağırlıkça 2:2:2:2:1. Tüm çiçek gelişim aşamaları için (özellikle ercik gelişimi için) ve DIC mikroskobu ile silique gelişimi için kullanılabilir. En iyi fiksatif, formalin bazlı FPA50 | ||
| SDS / NaOH çözeltisidir | SDS ve NaOH stok çözeltisini %1 SDS / 0.2 N NaOH'ye (10x seyreltme) karıştırın-seyreltin. Çiçek ve silique gelişim aşamalarının tüm aşamaları için. En iyi fiksatif metano/asetik asit fiksatifidir; Diğer iki fiksatif de kullanılabilir. Kalkoflor, auramin, DAPI ve anilin mavisi boyama çözeltisi ile birleştirilebilir. | ||
| SDS stok çözeltisi | %10 (a/h) sodyum dodesil sülfat. 10 g sodyum dodesil sülfatı 80 ml deiyonize suda çözün ve deiyonize su ile 100 ml'ye kadar yapın. | ||
| NaOH stok çözeltisi | 2 N NaOH çözeltisi: 4 g NaOH'yi 40 ml deiyonize su içinde çözün ve deiyonize su ile 100 ml'ye kadar yapın | ||
| Kombine temizleme ve boyama çözeltileri | |||
| Herr's IKI-4½ | Standart bir 4½'ye; (toplam 9 g) ekleyin: 100 mg iyot, 500 mg potasyum iyodür. Bu temizleme çözeltisi, kontrastı artırmak veya nişasta dinamiklerini karakterize etmek için tüm çiçek gelişim aşamaları ve silique gelişimi için kullanılabilir. Yapısal analiz için FPA50'yi ve kantitatif nişasta analizi için Carnoy'un fiksatifini kullanın. | ||
| İskender boyama | Etanol %95 10ml, malakit yeşili (%95 EtOH içinde %1) 1 ml, fuksin asit (%ddH2O içinde %1) 5ml, turuncu G (ddH2O içinde %1) 0.5ml, fenol 5g, kloral hidrat 5g, buzlu asetik asit 2ml, gliserol 25ml. Bu temizleme / boyama tek başına veya Herr's 4½ ile kombinasyon halinde; Çözelti, olgun ve üç hücreli polen taneleri olan çiçeklerde polen düşükünü değerlendirmek için kullanılabilir. Yeni yontulmuş, sabitlenmemiş malzemede kullanılır. | ||
| < güçlü > boyama çözeltileri< / güçlü > | |||
| Calcofluor çözeltisi | Calcofluor% 0.007 suda (g: ml). Başlangıçta optik parlatıcı olarak kullanılır. Hücre duvarlarında selüloz, karboksilatlı polisakkaritler ve kallozu boyamak için kullanılabilir. Polen tanesinin iç kısmını lekelemek için sıklıkla kullanılır. Her üç fiksatif de bu çözelti ile kullanılabilir. | ||
| Auramin çözeltisi | Auramin suda %0.01 (g:ml). Bu lipofilik floresan boya, diğerlerinin yanı sıra tırnak etlerini, kütikülleri ve ekzini boyamak için kullanılabilir. Her üç fiksatif de bu çözelti ile kullanılabilir | ||
| Calcofluor-Auramine karışımı | Auramin çözeltisi : Calcofluor çözeltisi, 3:1. Her iki çözelti ile kombine boyama için kullanılabilir. Auramine göre daha küçük bir kalkoflor oranını koruyarak diğer oranlar test edilebilir. | ||
| DAPI çözeltisi | DAPI 0.4 ug / ml, 0.1 M sodyum fosfat tamponu (pH 7),% 0.1 Triton-X-100, 1 mM EDTA. Bu çözelti, erkek ve dişi mayoz bölünme sırasında kromozom yayılımlarını ve herhangi bir dokunun hücre çekirdeğini boyamak için kullanılabilir. Polen tanesi gelişimini incelemek için sıklıkla kullanılır. Carnoy ve metanol / asetik asit bu çözelti için en iyi fiksatiflerdir. FPA50 gibi formaldehit bazlı fiksatifler lekelenmeyi engelleyebilir. UV'de uyarılma ve maksimum emisyon 461 nm civarındadır. | ||
| Sodyum fosfat tamponu (0.1 M) | Proton reseptörü: 0.2 M Na2HPO4, proton vericisi: 0.2 M NaH2PO4, oran proton vericisi / proton reseptörü: 1.364 (pH 7 için) | ||
| Anilin mavisi çözeltisi | %0.1 (a/h) anilin mavisi, 108 mM K3PO4 (pH 11), %2 gliserol. Bu çözelti, gelişimin birçok aşamasında kalloz ve selülozu boyamak için kullanılabilir (örneğin, erkek ve dişi teradlarda kalloz birikimi, polen tüplerinde kalloz tıkaçları). UV'de uyarılma ve maksimum emisyon 455 civarındadır. Hücre içeriği boyama için kırmızı emisyon ile 514 nm'de de uyarılabilir. |
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.