Protein-protein etkileşimlerini incelemek için pek çok yöntem vardır. Bu çalışmada sunulan yöntem hangi biotinylated yem etkileşim kurulmasını sağlamak için hücre lysates ile inkübe yaygın olarak kullanılan biotin-avidin açılan sistemine bağlıdır. Bu çalışmada sunulan değişiklik bu teknik hücre Penetran serileri ile kombinasyonu içerir. Canlı hücreler yerine hücre lysates ile inkübe hücre Penetran yemler tasarım için teklif ve bu nedenle bulundu etkileşimleri bu hücresel bağlamı içinde gerçekleşen yansıtır.
Burada TAT hücre Penetran sıralaması, biotin açılan etiket ve hücre içi etkileşimler insan GSCs bulmak için hedef olarak amino asitler 266-283 arasında oluşan Cx43 bölge olarak kullanırız. Yapısal Cx43 ve c-Src arasındaki etkileşimi için iyi bilinen11,12temelidir. C-Src gliyom hücreleri24,13oncogenic aktivitesini inhibe önemli bir etkileşim olmasıdır. Aslında, bu bölge (TAT-Cx43266-283) içeren CPPs Cx43 antioncogenic özellikleri gliyom hücreleri19,20,21üzerinde taklit. Sıçan gliyom C6 hücrelerinde c-Src, endojen inhibitörleri CSK ve PTEN20ile birlikte alımı hangi c-Src TAT-Cx43266-283 engeller mekanizması içerir. Çünkü onlar konvansiyonel tedavilere dirençli ve bu nedenle bu kötü huylu beyin tümörü27tekrarını sorumlu bir subpopulation teşkil GSCs çok ilginç bir hedef olarak tümörü tedavisi, belirtilmelidir. Ayrıca, onlar zor transfect hücreleri ve bu nedenle hücre içi etkileşimler çalışmanın daha zor olur. CPPs hızla ve verimli bir şekilde GSCs19 kullanımları için hücre içi etkileşimler çalışmanın lehine içselleştirilmiş. Bu çalışma, biz Cx43266-283 sıra etkileşim c-Src CSK ve PTEN insan GSCs içinde endojen inhibitörleri ile birlikte onaylamak için biotin erimiş CPPs kullanarak.
Bu yöntem biyoaktif bileşiklerin hücre içi mekanizması çalışmaya çok güçlüdür. Ancak, biotinylated hücre içine işleyen yem biyolojik etkisini farklı sigara-biotinylated ile bir elde değildir onaylamak çok önemlidir. Biyoaktif bileşik etkisi ile bulundu etkileşimleri ilişkilendirmek için bu adım gereklidir. Ayrıca, bileşik, onun olası bozulma proteaz tarafından yanı sıra olası onun toksisitesi, kararlılığını olmalı dikkatle test ve deneme planlamadan önce göz önünde. Sunulan örnekte, önceden belgelenen20G166 insan GSCs anti-proliferatif TAT-Cx43266-283 etkisi olmuştur. Bu çalışmada, biz bunu teyit TAT-Cx43266-283anti-proliferatif etkisi -B ve TAT-Cx43266-283 çok benzerdir. Buna ek olarak, bu α-tübülin hücresel Morfoloji analizi ortaya ve F-aktin dağıtım çok G166 TAT-Cx43266-283ile tedavi GSCs içinde benzer -B veya TAT-Cx43266-283. Özet olarak, bu sonuçlar dahil biotin c-terminus, TAT-Cx43266-283 , insan GSCs üzerine bu bileşik etkisi değiştirmek değil gösterir. Biotin biyoaktif molekül etkilerini değiştirmek istiyorum, ancak, diğer Etiketler protein arıtma, bayrak octapeptide (DYKDDDDK)28gibi insan grip hemagglutinin kaynaklı etiket HA (YPYDVPDYA) ya da glutatyon test edilebilir S-transferaz (GST)29. Benzer şekilde, TAT faiz hücre nüfusu hedef değil, diğer penetratin, MPG (için bir daha gözden geçirme, bkz:30) gibi delici dizileri, hücre veya hücre belirli dizileri-ebilmek var olmak kullanılmış31.
Özellikle hedef sıra ile etkileşim çalışma proteinler yanı sıra, hem denetim hem hedef sıra ile etkileşim proteinler ve bileşenlerle, pozitif ve negatif denetimleri etkileşimli olarak proteinler varlığı en ideali ele. Bu anlamda Cav-1 denetimde bulunan ve daha önce26gösterilmiştir gibi caveolae içselleştirilmesi, mekanizma içinde yer düşündüren durum, tedavi. Ayrıca, c-Src ile etkileşim kurar ama Cx43 c-terminal ile etkileşimli olarak beklenir, FAK yok oldu hem denetim hem de tedavi durumu. Bu sonuçlar TAT-Cx43266-283- B, c-Src, CSK ve PTEN arasındaki etkileşimi özgüllük güçlendirmek. Bu iletişim kuralı ile elde edilen sonuçları onaylamak için confocal mikroskobu etkileşen proteinlerin dağılımını görselleştirmenizi ve onların ortak yerelleştirme eğitim için kullanılabilir. Böylece, eş yerelleştirme sonuçları teyit bazı noktaları ile benzer bir hücre içi dağıtım açılan deneylerden elde edilen bu TAT-Cx43266-283- B ve c-Src sergi bulduk. Aslında, TAT-Cx43266-283- B kargo, bu çalışmada Cx43266-283, hücre içi ortaklarına molekül yönlendirir düşündüren plazma zarı yakın dağıtılır.
Bir önerilen yöntemi sınırlamaları gibi yem düzgün pas için başarısız olabilir kullanılan molekül ve beklenen etkileri değil bulunur. Bu durumda bulunan etkileşimleri efekte ilişkili olabilir. Ancak, çünkü onlar genellikle özünde düzensiz bölgeler32 tarafından yapılır ve bu nedenle onlar bir sıralı katlama gerektirmeyen bu yöntem özellikle ilginç etkileşimleri sinyal iletim yollarının içinde dahil olabilir. Ayrıca, önerilen yöntemin avantajları, etkileşimin zaman ders, için geçici etkileşimler özellikle ilgili olduğu izlenebilir olduğunu biridir. Ayrıca, her kalıntı etkileşimi alaka kolayca okudu olabilir. Nitekim, Glutamat serin veya treonin phosphomimetic ikame tarafından protein-protein etkileşimi, örneğin, ardından değişiklikleri uygunluğunu incelemek mümkündür. Benzer şekilde, serin veya treonin alanin için veya fenilalanin tirozin ikame phosphorylatable serin, treonin veya tirozin. etkisini test sağlarFosfo-tirozin taklit etmek için Tyr ikame p-Tyr33için en doğru yoldur.
Çünkü bu sistem RNA dizileri, nano tanecikleri, virüsler veya biotin için erimiş ve CPP ile çalışmaya transduced diğer moleküller gibi biyoaktif diğer yükleri için uygulanabilir son olarak, bu iletişim kuralı çok protein-protein etkileşimi kapsamıdır onların hücre içi etki mekanizmaları.