$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Yoğun çabaları microbiome çeşitlilik ve bolluk, fark ve sağlıklı ve patolojik koşullarda bireyler arasındaki benzerlikler yakalamak bir diğer yönü olarak daha iyi anlamak için yapılmıştır. Yaş2,3, coğrafi konum4, yaşam tarzı5,6ve hastalık5 gut microbiome kompozisyon ile ilişkili olduğu gösterilmiştir, ancak birçok koşul ve nüfus henüz tam olarak henüz karakterize. Son zamanlarda microbiome için tedavi uygulamaları7,8,9değiştirilebilir bildirilmiştir. Bu nedenle, çeşitli fizyolojik şartlarda ve mikrobiyal kompozisyon ilişkisi içine ek fikir potansiyel gelecek değişiklikler duruma getirilmesi doğru ilk adımdır.
Geleneksel mikrobiyal kültür yöntemleri düşük verimleri10,11tarafından sınırlı olduğunu ve ikili bir devlet ya da nerede bir bakteri kavramsallaştırma gut ya da mevcut. Yüksek işlem hacmi DNA tabanlı sıralama mikrobiyal ekoloji, mikrobiyal toplumun tüm üyelerinin yakalama etkinleştirme devrim yarattı. Ancak, sıra uzunluğu ve kalite önemli engelleri doğru taksonomi atama12kalır okuyun. Ayrıca, yüksek üretilen iş tabanlı deneyler nerede ölçümleri biyolojik olmayan veya bilimsel olmayan değişkenler13tarafından etkilenen toplu etkileri muzdarip olabilir. Son yıllarda, çeşitli programlar insan microbiome Amerikan Gut proje, Amerika Birleşik Devletleri (ABD) insan Microbiome projesi ve Birleşik Krallık (UK) MetaHIT projesi de dahil olmak üzere, eğitim için kurulmuştur. Bu girişimler tutarlılık onların yaklaşımlar eksikliği nedeniyle kolayca karşılaştırılabilir değildir verileri oluşturmuş. Bazı bu sorunları14 yönelik olarak uluslararası insan Microbiome Konsorsiyumu, uluslararası insan Microbiome Standartları Projesi ve National Institute of Standards ve Technology (NIST) gibi uluslararası projeler çeşitli çalıştı ve geliştirilen güvenilir üreme sonuçlar ulaşılmasına izin vermesi gerekir microbiome ölçümleri için standartları. Burada açıklanan 16S rRNA yüksek üretilen iş (16S-seq) sıralama veri analizleri aracılığıyla dışkı örneği koleksiyonundan başlatmak için birkaç genel olarak kullanılan yöntemlerin15,16 entegre bir protokoldür. Bitki DNA16doğrudan çıkarma için tasarlanan bir sütun ücretsiz PCR yaklaşım, protokolünü açıklar, dışkı çok sayıda eşzamanlı işlemeyi etkinleştirmek IÇIN örnekleri nispeten kısa sürede yüksek kalitede DNA hedef için güçlendirilmiş mikrobiyal değişken V4 bölgenin ortak bir sıralama platformu üzerinde sıralanıyor. Bu iletişim kuralı bilim adamları sağlam, üreme, kullanımı kolay, detaylı bir şekilde 16S rRNA amplicon sıralaması kullanımına başlatılıyor baktılar önemli denetimlerini kullanma kılavuzu amaçlamaktadır. Bir rehber eşliğinde ve detaylı adım-tarafından adım protokolü olan toplu etkisini en aza indirmek ve böylece daha karşılaştırılabilir sıralama sonuçları labs arasında izin verir.