Burada biz göstermek tek molekül fotoğraf-harekete geçirmek yerelleştirme mikroskobu canlı Drosophila melanogaster motor sinir terminal üzerinde yürütülen olabilir nasıl üçüncü larva biçim.
Yöntem makalesi
Burada biz göstermek tek molekül fotoğraf-harekete geçirmek yerelleştirme mikroskobu canlı Drosophila melanogaster motor sinir terminal üzerinde yürütülen olabilir nasıl üçüncü larva biçim.
Süper çözümleme mikroskobu teknikleri giderek artan sayıda Nano hücresel dünya yöneten mekanizmaları ortaya çıkarmak için yardımcı oluyor. Canlı hücreler içinde bireysel moleküllerin görselleştirme olağanüstü erişim sağlar gibi tek molekül görüntüleme ivme kazanıyor. Burada, tek-parçacık izleme fotoğraf-harekete geçirmek yerelleştirme mikroskobu (sptPALM) Drosophila larva gerçekleştirmek için geliştirdiğimiz bir tekniğini tanımlamak. Sinaptik iletişim kullanır bağlantı istasyonu, astar ve nörotransmitter içeren füzyon teşvik hareket anahtar presynaptic proteinler veziküller ile plazma zarı. Presynaptic proteinler bu nedenle bu önemli olaylar ile ilişkili hareket değişiklikleri sergi ve a sıra-in protein-protein ve protein-lipid etkileşimleri sıkıca bu işlemleri düzenler. Nasıl bu proteinler hareketliliğini sağlam bir canlı hayvan fizyolojik işlevleri ile ilişkili olan soruşturma kesin onların etki mekanizmaları anlamak için gerekli. Protein hareketlilik ile yüksek çözünürlüklü vivo içinde açılan optik şeffaflık, erişilebilirlik ve penetrasyon derinliği gibi sınırlamalar üstesinden gerektirir. Biz nasıl photoconvertible floresan proteinler ile hafif eğik aydınlatma görüntülenir ve motor sinir terminalinde veya üçüncü motor nöron akson boyunca izlenen sözdiziminin-1A presynaptic protein öğesini Drosophila biçim tarif larva.
Nöronal iletişim nörotransmitter içeren sinaptik veziküller plazma zarı1ile düzenlenmiş füzyon yoluyla oluşur nörotransmitter yayın kullanır. Ekzositozu2,3,4,5,6 adı verilen bu işlem son derece dinamik ve yukarı - veya aşağı-düzenlenmiş göre stimülasyon7oranı dalgalanmalar olabilir. Bu süreçlerle ilgili proteinler Albert hareket tabi vardır ve bu nedenle Ortaölçek organizasyon bu fizyolojik fonksiyonları temelini oluşturan eylemleri bağlama bir dizi sürdürülmesi yetenekli görüntüleyin. Plazma membran proteinlerinin plazma zarı7,8,9,10,11nanoclusters içine moleküllerin yanal yakalama sağlayan son derece dinamik, 12. Bu nedenle, bu proteinler hareketliliğini soruşturma eylem8onların modu aydınlatmak için yardımcı olur. Sinaptik proteinler çözünür N-ethylmaleimide hassas faktör ek protein reseptörü (tuzaklarına), örneğin sözdiziminin-1A, gibi şimdi yanı sıra yanal hızlı hareketlilik sergi lateral görüntü bindirme olarak moleküler sunabilir nanoclusters içinde olduğu bilinmektedir depoları ve siteleri vezikül füzyon9,13,14,15.
Monomeric (m) Eos16,17 ve Kaede18, gibi photoconvertible floresan proteinlerin son gelişmeler böyle nöronal plazma membran proteinlerinin yaklaşımlar kullanarak Ortaölçek çözünürlüğe sağladı Fotoğraf-harekete geçirmek yerelleştirme mikroskobu (PALM) ve Stokastik optik imar mikroskobu (fırtına)14,15,19. Bu gelişmeler hareketlilik ve nanoclustering kültürlü canlı hücreleri ve nöronlar biyolojik proteinlerin soruşturmalar etkinleştirdiniz. Daha yakın zamanlarda, çalışmalar (benzer yüksek çözünürlüklerde) dinamiği ve canlı olduğu gibi organizmalar nöronlar içinde bu membran proteinlerinin organizasyonu böyle Mus musculus, Caenorhabditis elegans ve aydınlatmak için gerçekleştirilen Drosophila melanogaster14,20,21,22.
Araştırma dynamics ve protein vivo içinde organizasyonu sadece (örneğin fluorophores) PALM, fırtına ve photoconvertible, son zamanlarda geliştirilen süper çözünürlük görüntüleme araçlarının kullanımı bu tür engelleri aşmak için de alması gereken Erişilebilirlik protein ve düşsel lazer penetrasyon derinliği. Sağlam bir hayvan hücre içi proteinlerin Imaging proteinler sağlam hayvan, sağlam bir farenin Hipokampus gibi dokuların yaşam içinde derin gömülü yapıları üzerinde görüntüleme doğal olarak meydan okuyor. Bu nedenle, proteinler veya doku yüzeyine yakın daha kolay görüntüsü. Vivo Imaging ile başka bir zorluk hayvanlar arasında tekrarlanabilirlik sağlamada olduğunu. Anatomi bir örnekten diğerine farklı olabilir gibi farklı olduğu gibi hayvan örnekleri çoğaltması kolaylığı ile bir yapı seçerek de zorlu kanıtlamak. Basmakalıp yapıların kullanımını gibi synapses, bazı bu zorlukların üstesinden ile yardımcı.
Diğer araştırmalar yüzeyi protein organizasyonu bir doku/organ, örneğin yansıma iken son yıllarda yapılan çalışmalarda protein hareketlilik Caenorhabditis elegans22gibi optik şeffaf bir epidermis ile hayvanlarda görüntüsü bir canlı fare21kafatası ile kortikal nöronlar aktin görüntüleme. Bazı durumlarda, anestezikler hayvan hareketsiz tutmak için kullanılmıştır; Ancak, belirli anestezikler faiz protein olumsuz etkileyebilir. Hayvanlar vivo içinde görüntüleme sırasında hareketsiz tutmak için alternatif yolları bu nedenle hata en aza indirmek için keşfedilmeyi.
Süper çözünürlük görüntüleme vivo içinde için başka bir uyarı faiz proteinlerin aydınlatmak için kullanılan lazerler çevreleyen doku olumsuz etkileyebilecek ve bu nedenle uyarma yoğunluk mümkün olduğunca düşük tutmak tavsiye edilir. Aydınlatma lazer tarafından çevreleyen doku aynı zamanda arka plan sinyal artırmak eğilimindedir. Düşük uyarma yoğunluğu kullanımı arka plan azaltmak yardımcı olur, olmak uyarı da floresan protein foton verim azalmasına neden olabilir. Alternatif arka plan sinyal görüntü analizi önce azaltmak aracı olarak arka plan çıkarma analizi sırasında kullanılabilir.
Drosophila belirli protein fonksiyon incelenmesi için köklü genetik araçları sağladığından vivo içinde görüntüleme için ideal bir organizma sunar. Ters yönde harekete geçirmek sıra (UAS)-Gal4 sistemi proteinlerin zamansal ve mekansal ifade sağlar ve bu nedenle neurotransmission23, işlemek için kullanılabilir öyle ki termo-genetik stimülasyon Drosophila geçici kullanma reseptör olası alt aile A1 (dTRPA1)24 veya opto-genetik uyarı far kırmızı kaymıştır CsChrimson25 kullanarak14Imaging ile birleştirilebilir. Vivo içinde tek molekül görüntüleme programında küçük bir sistem performans komplikasyonlar çoğunun üstesinden var ve şimdi nasıl tek-parçacık izleme Drosophila melanogaster üçüncü INSTAR larva içinde yürütülen olabilir açıklar.
1. tasarım transgenik Drosophila mEos2 öğesini proteinler ifade
2. üçüncü INSTAR Larva diseksiyon
3. hafifçe eğik aydınlatma tek-parçacık izleme mikroskobu
4. tek molekül yerelleştirme sabit larva içinde
Yukarıda listelenen, sözdiziminin-1A-mEos2 transgenik Drosophilamelanogaster vardı protokolü kullanılarak oluşturulan (şekil 1). Transgenik üçüncü Drosophila biçim larva PDMS silindirik Bankası (şekil 2A-F) disseke. Sözdiziminin-1a tek molekülleri görselleştirmek için PALM üzerinde hafifçe eğik lazer aydınlatma14TIRF mikroskopla kullandık.
Sözdiziminin-1a tek molekülleri kas 6 ikinci karın parçasının presynaptic motor sinir terminalde üzerinde takip. MEos2 yeşil Floresans sözdiziminin-1A-mEos2 düşük çözünürlüklü görüntü 488 nm lazer (şekil 3A) kullanarak heyecanlı zaman tip 1b boutons üzerinde görüldüğü gibi tespit edilemedi. Görüntüleme deneylerde, 405 nm ve 561 nm uyarma lazer görüntüleme derinliklerinde idi 133.5 nm ve 165.6 nm, anılan sıraya göre. Yeşil resim 16 tek tek kare ortalama satın alınmıştır. Bu yeşil görüntü bölge presynaptic motor sinir terminallere yalnız photoconverted filmi yerelleştirmeler analizini sınırlamak için kullanılan ilgi oluşturmak için kullanılan.
Çözümleme alınan photoconverted sptPALM film süper çözümlenmiş bir yoğunluk, difüzyon katsayısı, oluşturulan ve yörünge (şekil 3A) eşler. Sözdiziminin-1A-mEos2 hareketlilik daha fazla bireysel yörüngeler (şekil 3B) ortalama kare deplasman (MSD) analizi ile sayısal. İstatistiksel karşılaştırmalar yapılabilir (şekil 3B) MSD eğri altındaki alan kullanarak. Hareketlilik daha fazla çözümleme sözdiziminin-1A-mEos2 Difüzyon katsayısı dağılımı verir ve bu istatistiksel olarak hareketsiz nüfus (şekil 3 c) mobil karşılaştırma tarafından değerlendirilir.

Resim 1 : MEos2 öğesini yapıları oluşturuluyor. PFL44S-attB-MCS-w + vektör doğrusallaştırılmış BamHI ve XbaI ile. Faiz (POI) protein kodlama örtüşen Polimeraz zincir tepkimesi (PCR) parçaları ve mEos2, sırasıyla, örneğin, in vivo rekombinasyon ura3 - Maya hücrelerinde veya Gibson derleme klonlanmış. Sözdiziminin-1A-mEos2 transgene üretmek için biz endojen sözdiziminin-1A organizatörü ve Sonlandırıcı dizileri tarafından çevrili yapı klonlanmış olduğunu unutmayın. Elde edilen yapı daha sonra mEos2 için erimiş protein (POI) ilgi ifade transgenik bir sinek satır oluşturmak için Drosophila embriyo içine enjekte edilir. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Resim 2 : Drosophila larva diseksiyon ve eğik aydınlatma. Yarım silindirik PDMS üste yürütülen Drosophila larva diseksiyon gösteren(a)şema. Filetoların larva üzerine düzenlenen PDMS minutien iğne kullanımı ile jel. (B-C) Larva PDMS hazırlık Schneider'ın böcek orta içeren bir kültür cam popolu çanak yerleştirilmiştir. TIRF mikroskop hafifçe eğik aydınlatma yapılandırmasında sözdiziminin-1A-mEos2 motor sinir terminallerine görselleştirmek için kullanıldı. (D-F) Yarım silindirik PDMS Bankası disseke Drosophila larva ile. Larva PDMS hazırlık Schneider'ın orta ile dolu bir görüntüleme tabağına yerleştirildi ve larva süper çözünürlük PALM mikroskobunun görüntüsü. Ölçek çubuğu, 10 mm. (bu rakam14değiştirildi). Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Şekil 3 : Vivo sözdiziminin-1A-mEos2 presynaptic motor sinir terminal, bir izleme. (A) A düşük çözünürlüklü TIRF görüntü sözdiziminin-1A-mEos2 üzerinde bir tip 1b motor sinir terminal. Photoconversion film analizi 33 oluşturulan Hz sptPALM süper çözümlenmiş yoğunluğu, difüzyon katsayısı ve yörünge haritalar görüntüsü. 5,309 bireysel yörüngeleri görüntülü üzerinde 16.000 kare film satın alma olduğunu. Ölçek çubuğu, 3 mikron. (B-C) Ortalama kare deplasman (MSD) sözdiziminin-1A-mEos2 6 farklı motor sinir terminallerine çizildi; (AUC) MSD eğri altındaki alan hareketlilik düzeyini ölçmek için kullanıldı. Difüzyon katsayısı dağıtım birbirlerinin oranları sayısal telefon ve hareketsiz sözdiziminin-1A nüfus ortaya koymaktadır; ~ 2400 yörüngeleri ortalama motor sinir terminal elde (n = 3 larva). Ortalama ortalama standart hatası sunulan veri. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
Bu iletişim kuralı tek molekül izleme Drosophila Üçüncü INSTAR larva nöromusküler kavşakta mEos2 öğesini proteinlerin açıklar. Transgenik proteinin aşırı ifade önlemek için sözdiziminin-1A-mEos2 ifade endojen sözdiziminin-1A düzenleyici tarafından tahrik edildi. Sinaptik protein hareketlilik çalışmalar çoğunlukla kültürlü hücrelerin ve kortikal nöronlar9,11,12,13 vitro araştırmalar için sınırlı olmuştur. Bu proteinler canlı hayvan benzer hareketlilik imzalarında sergi büyük ölçüde bilinmiyor. Tek-protein hareketlilik içinde vivogörselleştirmek için aşılması gereken optik şeffaflık, erişilebilirlik ve penetrasyon derinliği gibi kısıtlamalar bulunmaktadır. Larva hazırlık anatomi ve kas yüzeyinde gömülü nöromüsküler kavşak görüntülenmesi, optik şeffaflık ve erişilebilirlik sorunu kaçının. Görüntü tek molekül hareketlilik normal TIRF yapılandırma girişimleri başarısız oldu. Ancak, hafifçe eğik aydınlatma için artan uyarma lazer derinlemesine nüfuz sağlar. Ayrıca, larva hareketsiz için kullanılan minutien iğne anestezik kullanım mümkün herhangi bir olumsuz etkisi protein hareketliliği üzerine önlemek için yardımcı oldu. Tek molekül içinde vivogörselleştirmek için 100 x yağı daldırma hedefleri, gibi daha yüksek büyütme hedefleri kullanmak mümkündür. Ancak, artan büyütme sürüklenir yak²n oluşumu artabilir. Buna ek olarak, biz-si olmak kullanılmış daha düşük yoğunluklu (~ %30) 561 nm lazer motor sinir terminallerinde görüntü tek moleküller için başarılı bir şekilde. Ek sınama daha düşük lazer güç kullanmak için gerekli.
Bu iletişim kuralı nöronal plazma zarı yakınlık içinde sinaptik proteinler hareketliliğini görselleştirmek uygundur. Bu yaklaşımı kullanarak, SNARE proteini - sözdiziminin-1A ve protein Atg18a bağlı autophagosome - hareketliliğini başarıyla görüntülü içinde vivo14,26olmuştur. Motor nöron aksonlar da olabilir proteinler hareketliliğini27araştırıldı. Ancak, soruşturma beyin veya ventral sinir kordonu proteinlerin hareketlilik nedeniyle temel doku tarafından üretilen yüksek arka plan sinyal değerlendirmek zor olabilir; Buna ek olarak, protein hareketlilik aynı beyin yapısı üzerinde görüntülenmesi fluorescently etiketleme (Yinelenebilirlik) sağlamak için beyin yapısı gerektirir ve çift-kamera görüntüleme kullanımını gerekli olacaktır.
Yerine daha üçüncü INSTAR larva38,39geliştirilen Drosophila süper çözünürlük mikroskopi için kullanılabilen geçerli yöntemleri çoğunlukla görüntüleme embriyolar için sınırlıdır. Bu protokoller ile ana konu onlar yörüngeleri görüntüsü alan az sayıda verim ve dolayısıyla hareketlilik Birleşik22,40derinlemesine analiz önlemek olduğunu. İletişim kuralı izleme bizim vivo içinde tek molekül yörüngeleri yüksek bir sayı üretmek için kapasitesine sahiptir ve bu nedenle Caenorhabiditis elegans ve Zebra balığı gibi diğer hayvan modellerinde kullanılabilir. Gerçekten de, her NMJ zinciri farklı mobil durumları ve geçişleri bu Birleşik14,27arasında analiz etmek için uygun hale ~ 2400 yörüngeleri oluşturulur. Ayrıca, birçok vivo içinde tek molekül görüntüleme stratejileri olan altında görüntüleme yapılır fizyolojik işlevi değiştirmek hayvan20,22, hareketsiz anestezi kullanımını güveniyor. Burada minutien iğne kullanarak larvaları hareketsiz bir 'anestezi-ücretsiz' protokolü optimize.
Bu iletişim kuralı bir potansiyel kullanımı proteinler üç boyutlu hareketliliğini görüntülenmesi için olabilir. Süper çözünürlük mikroskobu son gelişmeler izin görüntülenmeyecektir vitro 'x', içinde olmak protein hareketlilik 'y' ve 'z' boyutları41,42. Geçerli yöntem için hareket eden 'z' ekseninde proteinlerin hesaba katmaz. Henüz Drosophila motor sinir terminal küresel bir yapıdır ve protein hareketlilik bir üç boyutlu ses43ölçmek için değerli bir gelecek yaklaşım olacaktır. Z-boyut görüntüleme astigmatik bir lens ile mümkün olabilir. Alternatif olarak, TIRF modu44,45' z-çözünürlük da arttırılır. Ancak, bizim deneyler, syntaxin1A-mEos2 astigmatik lens olmadan tek molekülleri görselleştirmek için hafifçe eğik aydınlatma kullandık.
Sonuç olarak, proteinler ifade hem de bir transgenik Drosophila sinek stok kullanılabilirliğini değiştirme imkanı ile donatılmış TIRF mikroskop yanı sıra transgenik larva incelemek için bir photoconvertible protein, bir PDMS temel ile etiketlendi aydınlatma açısını tek proteinler bu protokol için açıklandığı gibi görselleştirmek için gerekli en önemli araç vardır.
Yazarlar ifşa gerek yok.
Biz Jean-Baptiste Sibarita ve Daniel Choquet (IINS, CNRS/Bordeaux Üniversitesi) tek molekül analizi ile tür destek için teşekkür ederiz. Nick Valmas özellikle teşekkür ediyoruz ve Jessica Mcgaw (QBI, Queensland Üniversitesi) video ile onların yardım için kayıt, ses hem de grafik tasarım rakam. Bu eser Avustralya Araştırma Konseyi (AR) keşif project tarafından desteklenmiştir (F.A.M. DP170100125), Avustralya Araştırma Konseyi (LIEF Grant LE0882864, F.A.M.) gelecek arkadaş grubu (B.V.S. FT100100725), Avustralya Araştırma Konseyi (LIEF Grant LE130100078 F.A.M için.) ve NHMRC Projesi (B.V.S. APP1103923) verin. F.A.M. NHMRC üst düzey araştırma görevlisi (ONT1060075) olduğunu.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| PDMS (Sylgard 184 silikon elastomer kiti) | Dow Corning Corporation | 000000000001064291 | |
| Cam Tabanlı Kültür Kabı | In Vitro Scientific | D29-20-1.5-N | |
| Optik Stereo-mikroskop | Olympus | SZ51 | |
| Kavisli Cımbız (Stil 5/45) | Elektron Mikroskobu Bilimleri | 0208-5AC-PO | |
| Minutien Pimleri (0,1 mm) | Güzel Bilim Araçları | 26002-10 | |
| Schneider'in Böcek Orta | Sigma, Yaşam Bilimleri | S0146 | |
| Vannas Yaylı Makas | Güzel Bilim Araçları | 15000-00 | |
| İnce Forseps (Dumont #5) | Güzel Bilim Araçları | 11254-20 | |
| ELYRA PS.1 Mikroskop | Zeiss | PS.1 | |
| Fosfat Tamponlu Salin (PBS) | Lonza | 17-515Q | |
| Paraformaldehit (% 16) | Elektron Mikroskobu Bilimleri | 15710 | |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T-9284 | |
| Normal Keçi Serumu | Sigma-Aldrich | G9023 | |
| Maxyclear geçmeli mikrosantrifüj Tüpü (1.7 mL) | Axygen | MCT-175-C | |
| Zen Black edinim yazılımı | Carl Zeiss, 2012 | ||
| Metamorph yazılımı | Moleküler Cihazlar | 7.7.8 | PALM İzleyici Eklentisi |
| Sinek suşu | w1118; HA-Sx1A-mEos2 |