Hayvanları içeren tüm yordamları araştırmacı kurumsal hayvan bakım ve kullanım Komitesi (IACUC) tarafından onaylanması gerekir.
1. bakteriyel Inoculum hazırlanması
- Bakteri kolonileri yalıtmak.
- Çizgi uygun steril agar Orta (Örneğin, Tryptic soya agar), bakteriyel strain (Örneğin, A. baumannii "HUMC1") izole kolonileri oluşturmak için dikkatli olmak.
- Uygun koşullar (Örneğin, bir gecede 37 ° C'de), kuluçkaya.
- Gecede kültür büyümek.
- Bir temsilci, steril bir inoculating döngü agar plakalı izole koloni seçin ve uygun steril broth Orta (Örneğin, Tryptic soya suyu) 10 mL aşılamak için kullanabilirsiniz.
- Durağan faz, uygun koşullar (Örneğin, Bacalı kapağı, 50 mL konik şişe geceleme 200 devirde sallayarak ile 37 ° C) ulaşmak örnek sağlar.
- Alt kültür büyümek.
- Gecede Kültür 100 μL 10 mL taze steril broth bir pipet kullanarak aktarın.
- Uygun koşullar (Örneğin, 3 h Bacalı kapağı, 50 mL konik şişe için 200 devirde sallayarak ile 37 ° C), üstel/log fazı ulaşmak için izin verir.
- Alt kültür yıkayın.
- Alt kültür incubating onun ortamdan kaldırabilirsiniz.
- Bakteri cips 5 min için 4.000 × g, santrifüj kapasitesi.
- Aspire edin ve süpernatant atın.
- 10 mL steril fosfat tamponlu tuz (PBS) Pelet ve şiddetle tamamen resuspended kadar girdap ekleyin.
- Adımları yineleyin 1.4.2 - 1.4.4 iki kez, toplam 3 yıkar.
- Bakteriyel süspansiyon konsantrasyon ayarlayın.
- 600 optik yoğunluk ölçer bir spektrofotometre kullanarak nm (OD600), bakteriyel süspansiyon optik yoğunluğunu ölçmek.
- İnoculum optik yoğunluğu bir OD600 0,5, düşünceye kadar steril PBS denklem Cben× Vben kullanarak bakteriyel süspansiyon Ekle "C" nerede konsantrasyon, Cf× Vf, = "V" ise birim, "ben" ilk, olduğunu ve "f", son. * Cf her zaman 0,5 olmalıdır; Vf çözmek için değişkendir.
- Bakteriyel süspansiyon bir OD600 0,5 düşerse, bakteri cips ve 0,5 OD600 ulaşmak için süpernatant uygun miktarda kaldırmak 5 min için 4.000 × g, santrifüj kapasitesi.
- Seri dilutions steril PBS (Örneğin, 1 × 10-6elde etmek için üç 1: 100 dilutions) gerçekleştirmek ve koloni oluşturan bakteri konsantrasyonu ortaya koymaktadır korelasyon katsayısı belirlemek için steril agar tabağa mL (CFUs/mL) başına birim bir OD600 0,5.
Not: Bu korelasyon katsayısının değeri için her tür her zor değişir ve inoculum hazırlık bir enfeksiyon için önce belirlenmelidir.
- Korelasyon katsayısı belirledikten sonra bunu bir inoculum (Örneğin, 2 × 108- 1 × 109 CFUs/mL); istenilen konsantrasyon oluşturmak için kullanın istenen inoculum OD600 0,5 büyükse bakteri cips ve istenen toplama ulaşmak için süpernatant uygun miktarda kaldırmak 5 min için 4.000 × g de bakteriyel süspansiyon santrifüj kapasitesi.
- Bu değerler aynı türden bakteri yalıtır ve farklı genetik kökenden fareler arasında değişir gibi her tür fare her bakteri izole virülans belirlemek için in vivo pilot çalışmalar gerçekleştirmek. Belirli suşları alt inocula öldürücü Ayagin Gram-negatif türleri için farelerde LD100 genellikle 1-5 × 108 CFUs/fare, olmasına rağmen.
- Daha önce yayımlanmış8 (isteğe bağlı) isteğe bağlı, kesin inocula olarak ileride kullanmak için aynı aliquots dondur.
- Bakteriyel inoculum 1 L iki 500 mL konik şişeleri ve 5 min için 4.000 × g, santrifüj yukarıda açıklanan transfer olarak hazırlayın.
- 450 mL süpernatant konik her şişe üzerinden atmak ve granül kalan süpernatant bakteri resuspend.
- Konsantre bakteriyel inoculum manyetik heyecan çubuğunu içeren bir 250 mL kabı transfer ve sürekli bir heyecan tabak 300 devirde üstüne karıştırın.
- Dikkatle konsantre bakteriyel inoculum (Örneğin, 1 × 1010 CFUs/mL) tam olarak 600 μL aktarım bir 1.6-mL kriyojenik flakon steril H2O tam olarak 300 μL ve 300 içeren bir pipet kullanarak μL steril gliserin; Mix ve-80 ° C'de depolayın
Not: Gliserol muhafazası için gerekli deneysel sonuçlar yıkmak ve bu nedenle onu yıkamak gerekli olan aşırı ölüm neden olur.
- Kullanım için hazır olduğunuzda, oda sıcaklığında 10 dakika için örnek çözülme.
- 1 mL 50 mL konik şişe aktarmak, 4.000 × g bakteri cips 5 min için de 9 mL steril PBS ve santrifüj ekleyin. Süpernatant Aspire edin ve PBS bulaşıcı inoculum için istenen toplama ulaşmak için uygun bir hacmine CFUs (CFUs/ml hisse senedi toplama donmuş 1 mL ×) önceden belirlenmiş miktar resuspend.
2. anesthetizing fareler
- Ketamin/Xylazine
Not: Anestezi ketamin/xylazine ile fare uyanır önce aşı yordamı tamamlamak için bu tekniği yeni araştırmacı için yeterli zaman sunan uzun bir süre vardır.
- Pharmaceutifcal sınıf PBS, 1 mL olarak 100 mg/mL ketamin hisse senedi çözüm 8,5 mL birleştirerek 10 mL enjekte edilebilir çözeltisi hazırlamak (son konsantrasyonu 10 mg/mL) ve 20 mg/mL Xylazine hisse senedi çözüm 0.5 mL (son konsantrasyonu 10 mg/mL).
- Enjeksiyonla mayi (IP) (Örneğin, bir 25-g fare için 250 μL) 10 μL/g yönetmek.
- Çünkü onların gözleri anestezi sırasında uzun bir süre zarar eğilimli ketamin/Xylazine ile anestezi fareler gözünde oftalmik merhem uygulamak.
- Fareyi bir kafese koyun ve anesteziden uyanana kadar izlemek.
Not: sternal recumbency korumak için yeterli kendine geldi kadar hayvan katılımsız bırakılmamalıdır.
- Isoflurane
Not: Fare hızlı bir şekilde isoflurane kaynaklı anesteziden anestezi bu yöntemi yalnızca aşılama yordam yetkin olduktan sonra kullanılmalıdır yüzden indüksiyon odasından sonra kaldırılmakta uyan.
- Saf fareler ile oksijen akan bir uygun ölçekli indüksiyon odası yerleştirin.
- Odası tamamen kapalı sonra fareyi kullanarak hassas Buharlaştırıcı %4 (v/v) en az 5 min için isoflurane eklemek anestezi; anestezi indüksiyon odasından bir fare kaldırma ve anesteziden uyanmaya ne kadar süreceği ölçerek onaylamak (~ 60 s).
Not: anestezi kez değişebilir üzerinde kurumsal yönergeleri dayalı ve bazı hayvanlar tam anestezi olmak için daha--dan 5 dk gerekebilir unutmayın.
- 10 dakikaya kadar için anestezi isoflurane konsantrasyonu % 2-3 ayarlayarak korumak; anestezi toplam süresi ise > 15 dk, oftalmik merhem imzalat fareler gözler için geçerlidir.
- Bir kafes içinde fareyi getirin ve anestezi, adım 2.1 olduğu gibi gelen uyanana kadar izlemek.
3. aşı/hastalık fareler
- İmzalat bir fare askıya alma, onun üst kesici dişler (Örneğin, diş ipi) güçlü, zayıf dizesini tarafından asılı bir yükseklikte sabit bir nesne için yaklaşık iki katı fare Gövde uzunluğu (Örneğin, 20 cm) çalışma yüzeyi (Örneğin yukarıda güvenli Laboratuvar tezgah).
- Fare dil steril, künt uçlu forseps kullanarak onun ağzından yavaşça çekin. Dil bir steril, eldivenli bir parmak fare dili yanlışlıkla kırma önlemek için transfer. Dil mastoidi erişmesine izin vermek ve inoculum tarafa, yutma engelleyen ağız dışında tutun.
- Fare dilini tutarak, 50-μL inoculum (bakteriyel süspansiyon) bir micropipette kullanarak mastoidi yerleştirin; mastoidi oral kavite ve farenks arka ağız kısmına doğru yer alır.
Not: Sadece ilk durak micropipette tarihinde pipetting tarafından sıvı sunmak çok önemlidir. Fareyi birkaç saniye ne zaman inoculum içinde mastoidi yerleştirilir nefes; sonunda, yansımalı aspirasyon pnömoni enfeksiyonu neden olan akciğerlere giren sıvı ayırt edici çatırtı gürültü ile gösterilen bakteriyel süspansiyon nefes için fareyi neden olur.
- İnoculum kadar koymamış durumunda normal solunum engellemek, siklikla ağız ve inoculum sonraki soluma yoluyla yansımalı aspirasyon zorlamak için forseps ile çimdik için yeterli geri.
- Aşı sonra dil yayın, fare süspansiyon dizeden kaldırmak, bir kafese koyun ve anestezi, adım 2.1 olduğu gibi gelen uyanana kadar izlemek.
4. hastalık ilerleme izleme
Not: hayvan acı nedeniyle, çeşitli göstergeler fareler can çekişen olunca belirtmek için kullanılmalıdır; ötenazi önceden onaylanmış bir IACUC protokol uyarınca bu tespiti takip yapılmalıdır; moribundity çeşitli işaretleri vücut ısısı, kilo kaybı, görünüm, yürüyüş ve kan (Örneğin, Istat üzerinden)9,10,11,12denelde edilebilir diğer biyolojik dahil, 13,14,15,16.
- Daha önce onaylanmış IACUC Protokolü (Örneğin, servikal çıkığı tarafından takip CO2 ) göre fareler ötenazi.
- Akciğerlere trakea, pulmoner arter ve pulmoner ven yakın akciğerlere keserek euthanized fareden kaldırın.
- Mikroskobu
- Akciğerler (veya bölümünün) bir örnek kalıp içine yerleştirin.
- Örnek kalıp tamamen doku batış en uygun kesme sıcaklık (O.C.T.) karışımla doldurun.
- Örnek-80 ° C'de dondurmak
- Örnek bir patoloji laboratuvar bölümü ve slaytları Mikroskopi için bağlama için gönderin.
- Bakteri yükü
- Akciğer dokusu bir analitik dengede tartın.
- Akciğer dokusu 50 mL konik flakon steril PBS (doku büyüklüğüne) 2-5 mL içeren aktarın.
- Akciğer doku doku homogenizer ile homojenize.
- Homogenate seri dilutions yaklaşık 1000 CFUs/beklenen bakteri yükü akciğerlerde dayalı mL, elde etmek için steril PBS gerçekleştirin.
- 1 × 109 CFUs/mg bekleniyor, örneğin, üç 1: 100 dilutions gerçekleştirin: PBS ve girdap; 9.9 ml homogenate Transfer 100 μL ilk 1: 100 seyreltme bu. İlk 1: 100 seyreltme 100 μL PBS ve girdap 9.9 mL transfer; ikinci 1: 100 seyreltme bu. İkinci 1: 100 seyreltme 100 μL PBS ve girdap 9.9 mL transfer; Bu üçüncü ve son 1: 100 seyreltme var.
- Akciğerlerde bakteri yükü bilinmiyorsa, beklenen aralığı yakalamak için dilutions gerçekleştirebilirsiniz.
- Steril agar üzerinde plaka dilution(s).
- Steril Tryptic soya suyu (TSB) agar (TSA) plakalı hazırlamak: birleştirin TSB 30 g, agar 15 g ve 1 litre su, mix ile manyetik karıştırıcı ve ısı ~ 100 ° C'de 5 dakika serin ve basınçlı kap üzerinde sıvı döngüsü için 15 dk. için soğutmak için izin ver sonra izin ver süreyle kaynar kadar ~ 55 ° C, transfer 10 mL taze autoclaved steril Petri yemekler, TSA ve oda sıcaklığına kadar soğumasını bekleyin. Kuru benchtop 2-5 d için üzerinde veya altında bir Biyogüvenlik 10 dakikadır kabine ortaya izin.
- Seyreltme 100 μL steril TSA içeren bir Petri kabına aktarın ve dağıtıcı veya cam boncuk kullanarak TSA yayılmış.
- Gecede 37 ° C'de Petri kabına bir oksijen kuluçka (yani, 37 ° C kuluçka makinesi su ele geçen bir 1-L kabı içeren) saklamak
- CFUs/mL akciğer homogenate üzerine agar kaplama göre belirler (Örneğin, yukarıda açıklanan üçüncü ve son seyreltme 100 μL ile TSA plaka üzerinde 100 CFUs 100 CFUs/100 μL × 100dil 1 × 100dil #2 × 100dil #3 olurdu = 1 × 109 CFUs/mL).
- CFUs/mg akciğer doku CFUs/mL akciğer homogenate mg akciğer doku/mL homogenate (Eğer yukarıda açıklanan örnek 100 mg 5 mL PBS, sonra 1 × 109 CFUs/mL ÷ 100 mg / 5 mL = 5 × 107 homojenize akciğer dokusunun kullanılanÖrneğin, tarafından bölerek dayalı hesaplamak CFUs/mg).