Tarama tahlil için yaklaşım Şekil 1Aile özetlenir. Kinaz inhibitörleri ilk thymocyte canlılığı gizli etkileri için gösterildi. Apoptozis için olumlu bir denetim olarak deksametazon bir proapoptotic ajan olarak kullanıldı. İçin canlı hücre nüfus çoğunluğuna dayalı tedavi edilmezse olumsuz denetimleri ve deksametazon tedavi olumlu denetimleri (Şekil 1B) tespit edilmiştir. İnhibitörleri ilk 10 µM timositleri üzerinde test edildi ve hücrelerin yüzdesi için 18 h kuluçka sonra ölçüldü. Öyle ki bu bileşikleri indüklenen hücre ölümü için % 20 pencere seçildi bir daha büyük DMSO tedavi örnekleri için karşılaştırıldığında canlı hücre kapısında hücrelerinin kaybı düşük konsantrasyonlarda (Şekil 1B) test edildi. Seçili önleyici tedavi örnekleri ve temsilcisi FACS araziler canlılığı tahlil göstermek için gösterilir. LY294002 (2-(4-morpholinyl)-8-phenyl-4H-1-benzopyran-4-one; CA'ları 154447-36-6), bir PI3K inhibitörü22, büyük ölçüde hücre ölümü 10 µM, artış ve engelleyici 10 µM sonraki deneyleri için kullanıldı. CAY10626 (N-[2-(dimethylamino)ethyl]-N-methyl-4-[[[4-[4-(4-morpholinyl)-7-(2,2,2-trifluoroethyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-yl]phenyl]amino]carbonyl]amino]-benzamide; CAS 1202884-94-3), bir çift inhibitörü olan PI3Kα/mTOR23, indüklenen hücre ölümü 10 µM, yüksek düzeyde ve 1 µM ancak 0,1 µM ve 0,1 µM uygulamada aşağı akım deneyleri için uygun toplama olmak tespit edildi. Staurosporine (2,3,10,11,12,13-hexahydro-10R-methoxy-9S-methyl-11R-methylamino-9S,13R-epoxy-1H,9H-diindolo[1,2,3-gh;3',2',1'-lm]pyrrolo[3,4-j][1,7]benzodiazonin-1-one; CA'ları 62996-74-1), bir pan-protein kinaz C inhibitörü apoptosis24, ikna etmek için kurulan bir yetenek ile test, hatta 0,1 µM tüm konsantrasyonlarda önemli hücre ölüm indüklenen. 0,1 µM, sonraki deneyleri içinde ek bir olumlu denetim kullanıldı.
İnhibitörleri son konsantrasyonları neyin onlar hücre ölümü DMSO tedavi örnekleri fazla % 20 tarafından yükseltmek değil en yüksek konsantrasyonları dayalı seçildi. Öyle ki tüm inhibitörleri hücrelere uygulanan 500 kere konsantrasyonu olduğunu tespit inhibitörleri son konsantrasyonları ile inhibitörleri hisse senedi bir tabak hazırlanmıştır. Şekil 1 c hisse senedi plaka, plaka düzen inhibitörleri son konsantrasyonları ile gösterilmektedir. Küçük hacimli tabakalar laminar akış tahlil yıkama için doğrudan hücrelerde kuluçka, alternatif protokolünde küçük birimlerin kullanımını inhibitörleri başka bir seyreltme gerektirdiği. Öyle ki uygulandığında 100 kere amaçlanan konsantrasyonu, olduklarını inhibitörü ek hücreler için çok yüksek olmaz sonra kültürlerinin DMSO içeriği sağlamak için inhibitörleri daha fazla tam RPMI içinde 5, seyreltme faktörüyle seyreltilmiş hücreleri.
Toksik olmayan konsantrasyonları için seyreltilmiş inhibitörleri, tahlil TCR stimülasyon indüklenen apoptosis timositleri5,17için kullanılmıştır. Stimülasyon 18 h için anti-CD3/CD28 boncuklar kullanılarak gerçekleştirilmiştir ve hücreleri daha sonra caspase-3 harekete geçirmek içinde CD4 için lekeli+ ve CD8+ DP thymocyte nüfusu (Şekil 2). Caspase-3 harekete geçirmek ve CD69 ifade ve ayrıca TCR downregülasyon artış anti-CD3/CD28-teşvik ve nonstimulated örnekleri karşılaştırıldığında DMSO sahte tedavi anti-CD3/28-teşvik örnekleri, gözlendi. Deksametazon tedavi örnekleri caspase-3 harekete geçirmek içinde TCR uyarılması bağımsız olmak apoptosis indükleyici etkisini bekleniyor CD69 upregulation bağımsız bir artış gösterdi.
Şekil 3A tahlil için seçili inhibitörleri eleme Kütüphane sonuçlarını özetler. Caspase-3 harekete geçirmek ve CD69 potansiyel inhibitörleri ifade bastırılması nedeniyle ilgi tanımlamak için kullanılabilir. Beklendiği gibi ekranlarda pozitif sayısı olarak inhibitörleri TCR sinyal kurallı arabulucu ortaya çıktı. İnhibitör etki gücüne değişen derecelerde sergilenen, böyle inhibitörleri hedef birden çok kinaz ve ayrıca, daha fazla geniş spektrumlu inhibitörleri dahil belirli inhibitörleri. Bazı inhibitörleri caspase-3 harekete geçirmek ve CD69 upregulation (Şekil 3B, üst satır, sol kapı aynası) bastırmak başardık. Bir tür inhibitörü olan bisindolylmaleimide II (3-(1H-Indol-3-yl)-4-[1-[2-(1-methyl-2-pyrrolidinyl)ethyl]-1H-indol-3-yl]-1H-pyrrole-2,5-dione; CA'ları 137592-45-1), protein kinaz A ve PDK125,26,27ek olarak tüm protein kinaz C izoformlarının engeller. Bu kategorideki başka bir inhibitörü olan CAY10657 (3-[(aminocarbonyl)amino]-5-[4-(4-morpholinylmethyl)phenyl]-2-thiophenecarboxamide; CA 494772-86-0), önerilen bir inhibitörü olan IKK228.
CD69 upregulation inhibe ama caspase-3 harekete geçirmek (Şekil 3B, üst satır, doğru panelleri) zarar değil bileşikler vardı. CAY10626, PI3Kα ve mTOR23ve U-0126 bir inhibitörü (2,3-bis [amino [(2-aminophenyl) thio] metilen]-butanedinitrile; CAS 109511-58-2), bir MEK inhibitörü29, tanımlanan inhibitörleri bazıları. Sonuçlar farklı inhibitörleri belirli dalları TCR sinyal yolu üzerinden farklı kinaz özellikle son aşama kinaz, Hedefleme hedefleme T-hücre etkinleştirme olayları seçici bozulma neden olabilir gösterir.
Ayrıca CD69 upregulation ve caspase-3 harekete geçirmek (Şekil 3B, alt satır, sol kapı aynası) engelleme inhibitörleri idi. Paklitaksel (βS-(benzoylamino) - αR - hidroksi-benzenepropanoic asit, (2aR,4S,4aS,6R,9S,11S,12S,12aR,12bS)-6,12b-bis(acetyloxy)-12-(benzoyloxy)-2a,3,4,4a,5,6,9,10,11,12,12a,12b-dodecahydro-4,11-dihydroxy-4a,8,13,13-tetramethyl-5-oxo-7 , 11-methano-1H-cyclodeca[3,4]benz[1,2-b]oxet-9-yl ester; CA'ları 33069-62-4), bir topu Mikrotubul dynamics30ve necrostatin-5 (2-[[3,4,5,6,7,8-hexahydro-3-(4-methoxyphenyl)-4-oxo[1]benzothieno[2,3-d]pyrimidin-2-yl]thio]-acetonitrile; CA'ları 337349-54-9), bir inhibitörü RIP1 kinaz31, iki inhibitörleri bu kategoride olmak tespit vardır. Nerede CD69 upregulation ve caspase-3 harekete geçirmek zayıflatmak değildi bu gibi durumlarda, bu inhibitörleri nedeniyle ilgili kinaz yolu sinyal TCR hedefliyor değil.
Daha önce belirtildiği gibi staurosporine hala timositleri apoptosis indüklenen bir konsantrasyon, ekranlar kullanılmıştır. Beklendiği gibi caspase-3 harekete geçirmek (Şekil 3B, alt satır, sağ sütun) yüksek düzeyde staurosporine tedavi örnek gösterdi. Bisindolylmaleimide II, başka bir pan-PKC inhibitörü, ayrıca CD69 ifade bastırılmış olarak CD69 ifade seviyesinin düşük PKC, staurosporine-aracılı inhibisyonu için bağlanabilir. Alternatif olarak, onlar için upregulate önce staurosporine CD69 ifade hücrelerde apoptoz indüklenen.
İşlem hacmi ve otomasyon iletişim kuralının artırmak için bir otomatik plaka sistemi üzerinden laminar akış yıkama kullanımı dahil paralel iletişim kuralları hazırlanmıştır. Bu otomatik plaka çamaşır aygıtı kullanan iki ayrı protokol yargılandın ve 96-şey plakaları hücrelerde kültür ve Santrifüjü bağımlı Protokolü hücrelerde boyama geleneksel yöntemi ile karşılaştırıldığında. 96-şey kaplamalar, standart prosedür aynı derecede hücrelerde kültür bir yöntem dahil ve boyama için hücreleri plakaları otomatik plaka yıkayıcı ile uyumlu aktarma (Şekil 4, DA-çamaşır örnekleri) adımları. Diğer yöntem hücreleri doğrudan plaka çamaşır makinesi uyumlu plakaları kültür ve sürekli aynı plaka (Şekil 4, DA-kültür örnekleri) üzerinde boyama protokolü ile ilgili. Santrifüjü bağımsız iletişim kuralları etkin caspase-3, CD69 veya TCRβ test, geleneksel Santrifüjü bağımlı Protokolü (Şekil 4) ile karşılaştırıldığında farklı örnekleri arasında boyama birçok hissedilir farklar vermeyin. Boyama yoğunluk farklılıkları antikorlar biraz farklı konsantrasyonlarda boyama sırasında adımlarla için bağlanabilir.

Resim 1 : Thymocyte canlılığı inhibitörleri ile tedavi sonrası. (A)tarama tahlil temel adımlardan deneysel anahat. Stimülasyon ve yani (1 bir geleneksel Santrifüjü tabanlı iletişim kuralını kullanarak boyama tarafından takip standart 96-şey tabak içinde timositleri, kültür etkinleştirme yöntemi, kullanılan timositleri ile boyama için üç önerilen yöntem vardır (2) Santrifüjü bağımsız çamaşır Protokolü ve (3) kullanarak boyama tarafından izlenen standart 96-şey tabak içinde timositleri, küçük hacimli kaplamalar içinde timositleri kültür kültür takip kullanarak aynı levha boyama tarafından bir Santrifüjü bağımsız çamaşır protokolü. (B) canlılık deneyleri kullanılan stratejiler geçişi. Canlı hücre kapısı ileri dağılım (FSC) elde edildi ve yan dağılım (SSC), yukarıda açıklanan17olarak çizer. Tabi 10 kat daha düşük konsantrasyonlarda daha fazla canlılık testleri test edilen konsantrasyon çok toksik olmak kabul edildi inhibitörleri vardı. Temsilcisi önleyici tedavi örnekleri gösterilir. 1 µM ve 0,1 µM örnekler için kullanılan ortak denetim (DMSO tedavi [DMSO]) unutmayın. (C) seyreltilmiş inhibitörleri yerleşimini plaka. 500 x amaçlanan son konsantrasyonu konsantrasyonu DMSO içinde seyreltilmiş inhibitörleri plakaları şematik gösterimi. Her şey bir benzersiz inhibitörü temsil eder; gri kuyu bomboş. Gösterilen konsantrasyonları hücre kültürleri için yani 10 µM (Bordo), 1 µM (Fuşya) ve 0,1 µM (mavi) eklendiğinde son konsantrasyonu vardır. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Resim 2 : Thymocyte harekete geçirmek tahlil plaka yerleşimini. (Üst) Sütun 2-11 önleyici tedavi örnekleri (bej) iken sütun 1 ve 12 denetimler için ayrılmıştır. Kuyu A1 D1 için negatif kontrol (nonstimulated [NS]; gri) kaplar ve hücre ölümü (deksametazon tedavi [DEX]; mor) için pozitif kontrol wells E1 H1 için kaplar. Sütunlar 2-12 timositleri anti-CD3/CD28 boncuk ile uyarılan içerir. Pozitif kontrol için thymocyte harekete geçirmek (uyarılmış örnekleri [α-CD3/CD28]; yeşil) kuyu A12 D12 ve araç kontrolü için kaplar (uyarılmış ve DMSO tedavi [α-CD3/CD28 + DMSO]; kırmızı) kuyu E12 H12 için kaplar. (Alt) Akış Sitometresi araziler active caspase-3 (ActCasp3), CD69 ve çift-pozitif (DP) kapı içinde kapı timositleri, TCRβ boyama. Farklı denetim temsilcisi araziler gösterilir. NS nonstimulated; = DEX deksametazon tedavi örnekleri; = Α-CD3/CD28 + DMSO CD3/CD28-kaplı boncuk ile uyarılmış ve DMSO ile; tedavi örnekleri = Α-CD3/CD28 örnekleri CD3/CD28-kaplı boncuk ile uyarılan =. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Şekil 3 : Thymocyte etkinleştirme hakkında inhibitörü Kütüphanesi eleme. (A)özetlenmiş verileri harekete geçirmek testin. Bu hücrelerin aktif caspase-3 ve CD69 ifade için seçili inhibitörleri ile Normalleştirilmiş değerleri gösteren temsili bir denemenin sonuçları vardır. Normalleştirme aktif-caspase-3-pozitif veya 0 grafik içinde göreli değeri ayarlanır DMSO tedavi denetiminin değerini kapıya CD69 pozitif hücreler yüzdesi karşılaştırarak yapıldı. (B) seçili FACS çizer. Caspase-3 harekete geçirmek ve CD69 upregulation (sol üst), bastırılmış inhibitörleri ve akış sitometresi araziler sadece CD69 upregulation (sağ üst) bastırılır veya caspase-3 harekete geçirmek ve CD69 upregulation (sol alt) üzerinde bir etkisi vardı. Staurosporine tedavi edilen örnek ve araziler toksik konsantrasyonları (sağ altta) bir inhibitörü kullanarak etkilerini göstermek için gösterilir. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Şekil 4 : Farklı tahlil protokollerinin karşılaştırılması. Akış Sitometresi araziler active caspase-3 (ActCasp3), CD69, ve TCRβ üç farklı takip DP timositleri boyama tahlil protokolleri. Dört farklı koşullarda test, yani negatif kontrol (nonstimulated [NS]), hücre ölümü (deksametazon tedavi [DEX]) için pozitif kontrolü, araç kontrol (uyarılmış ve DMSO tedavi [α-CD3/CD28 + DMSO]) ve bir önleyici tedavi örnek (uyarılmış ve PIK-75-tedavi [α-CD3/CD28 + PIK-75]). Geleneksel = standart 96-şey tabak içinde timositleri, kültür ve boyama geleneksel Santrifüjü tabanlı protokol ile; DA-çamaşır = standart 96-şey tabak içinde timositleri kültür ve laminar akış protokolü; yıkama kullanarak boyama DA-kültür küçük hacimli tabak içinde timositleri kültür ve laminar akış protokolü yıkama kullanarak aynı levha boyama =. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.