A. rhizogenes dönüştürme Protokolü uyarlanmış ve boynuz vd.7 ' den değiştiren ve test genotip S. tuberosum ssp. tuberosum (cv. özellikle). A. tumefaciens dönüştürme Protokolü uyarlanmış ve düşük Banerjee ve ark.22 değiştiren ve test genotip S. tuberosum ssp edildi. tuberosum (cv. özellikle) ve S. tuberosum ssp. andigena. Her iki yordamlar ana adımları şekil 1 ve Şekil 2'de, anılan sıraya göre özetlenir.
Not: Vitro transferler gerçekleştirme yordamı tüm adımları, hızlı bir şekilde yapmak ve mümkün olduğunda, tabak ya da kapalı, tencere böylece solan ve kontaminasyonu önlemek için havaya bitki maruz minimize korumak. Aksi belirtilmedikçe, tüm bitki incubations dolapları 24 ° C ışık/12 h 20 ° C karanlık ve 67 µmol m-1 s-112 h koşullar altında yapılmıştır. Aksi belirtilmedikçe, tüm bakteri manipülasyon ve vitro bitki transferler laminar akış kukuIeta aseptik şartlarda gerçekleştirin. Agrobacterium ve vitro bitki kültürler için tüm medya tarifleri Tablo S1içinde sağlanır.
Uyarı: Genetiği değiştirilmiş bakteri ve yürüttüğü atık konteyner bitkiler Kasası.
1. Agrobacterium kültürler dönüşümü için kullanılan
Not: (Lütfen Dr. Inge Broer tarafından sağlanan) C58C1:Pri15837 A. rhizogenes dönüştürme için kullanılan zorlanma ve bunun için A. tumefaciens (lütfen Dr Salomé Prat tarafından sağlanan) GV2260 oldu. A. rhizogenes ile ikili vektör PK7GWIWG2_II-T-bir dönüşüm işareti taşıyan kıllı kök izlemek için DNA içeren RedRoot (VIB-bölümü bitki sistemleri Biyoloji Universiteit Gent; http://gateway.psb.ugent.be) dönüştü oluşumu. A. rhizogenes ve A. tumefacienstarafından oluşturulan dönüştürülmüş kökleri karşılaştırmak için her ikisi de β-glucoronidase (GUS) muhabir gen sürüş FHT organizatörü taşıyan bir T-DNA içeren ikili vektör pKGWFS7 ile dönüştürülmüş ve sefaloridin direnç gen olarak seçilebilir işaret15.
- Agrobacterium kolonisi almak ve bu gecede (O/N) antibiyotik (Tablo S1) ile desteklenmiş YEB orta 5 ml 200 devir / dakikada sallayarak ile 50 mL santrifüj tüpü 28 ° C'de büyümek.
- A. tumefaciens dönüştürme için OD600 olmalıdır optik yoğunluk ölçmek = 0,6-1.0.
- Optik yoğunluk daha yüksek ise, OD600 düşürücü bir alt kültür olun kültür OD600 ulaşıncaya kadar taze medya ve bekleme ile 0,3 = = 0,6-1.
- Agrobacterium kültür 3000 x g bir tezgah üstü santrifüj oda sıcaklığında 10 dakika içinde de 1 mL santrifüj kapasitesi.
- Pipetting tarafından süpernatant kaldırın ve 1 mL taze YEB orta Antibiyotikler olmadan hücrelerde resuspend. Antibiyotik tümüyle kaldırılmasını sağlamak için bu adımı yineleyin.
- A. tumefaciens dönüşüm için son resuspension OD600 son optik yoğunluğu elde etmek için uygun YEB birim ekleme 0.8 =.
- Hücreler buz bulaşması için bitkiler hazırlanırken tutmak.
2. bitki materyali için dönüştürme
- Bir ya da iki düğüm kök kesimler de apikal veya steril vitro patates bitkilerden (donör bitkiler); yardımcı tomurcukları içeren yapmak Onları 3-4 hafta boyunca (şekil 1A ve şekil 2A) katı 2MS orta tencere içinde büyümek.
3. bitki A. rhizogenes (şekil 1) kullanarak dönüştürme
Not: Bu prosedür dönüştürülmüş kıllı kökleri almak sağlanır. Transgene ifade değerlendirmek için bir negatif kontrol gereklidir. Negatif kontrol hazırlamak için dönüştürülmemiş ya da dönüştürme marker gen içerir boş vektör ile dönüştürülmüş bir A. rhizogenes zorlanma kullanarak yordamı izleyin.
- Taze medya tabak kullanın; Alternatif olarak, tabakları, kapak tarafı ile 4 ° C'de medya kurutma önlemek için şeffaf filmle sıkıca kapalı tutulabilir. Kare medya tabak hazırlamak için onları ~ 15 °, MS, 40 mL ile doldurun eğim ve kuvvetlendirmek bildirin. Bu bitki ile orta hava parçası temasını en aza indirmek olacaktır.
- Çok dikkatli bir şekilde bir donör bitki bir 120 x 120 mm kare tabak 2 MS ortamından aktarmak.
- Cerrahi bir iğne A. rhizogenes kültürünün bir kök düğümler arası 3 μL için enjekte ve farklı internodes mümkün olduğunda bitki başına iki kez tekrarlayın.
Not: her enjeksiyon bir bağımsız dönüşüm olayı (şekil 1B) olarak düşünün.
- Hemen tüm bitki katı MS Orta 0,1 mM acetosyringone ile takviye ile kare bir tabağa aktarın. Plaka başına 2 bitkiler karşılamak.
Not: 1 M acetosyringone hisse senedi çözüm DMSO içinde hazırlanan ve -20 ° C'de depolanan
- Cerrahi bant kullanarak plaka mühür ve dikey 4 gündür bir büyüme kabine içinde düzenleyin.
- Bitki için yeni bir kare plaka A. rhizogenesöldürmeye sefotaksim sodyum ile [500 µg/mL] desteklenen MS orta aktarabilirsiniz.
- 10-12 gün sonra kıllı kökleri (şekil 1 c,1 D) görünmesini başlayacak. Daha sonra yerli bitki köklerinin tüketim ve bitki için yeni bir kare tabak sefotaksim sodyum [500 µg/mL] ile desteklenen MS orta aktarabilirsiniz.
Not: Dönüştürülmüş kıllı kökleri tarafından kırmızı Floresans ne zaman bir DsRed dönüşümün işaretçisi (şekil 3D) kullanarak kontrol edilebilir.
- Kompozit tesisi (şekil 1E) elde etmek için 3-4 hafta sefotaksim sodyum [500 μg/mL] ile desteklenen MS ortamda büyümeye transgenik kıllı kökleri izin (orta her hafta değiştirin).
- Amacına bağlı olarak takip transgenik kıllı kökleri ve negatif kontrolleri yaymak.
- Bir hydroponic (Tablo S2) veya toprak orta büyük gelişme için izin vermek için tüm bileşik bitki aktarın.
- Kırmızı floresan dönüştürme işaretleyici (DsRed protein) ifade kökleri kesilmiş bir neşter kullanarak tek tek dönüştürülmüş kıllı kökleri yaymak için ne zaman onlar 4-8 cm uzunluğunda (şekil 1E) ve onları bir petri Gamborg B5 katı orta ile içine transfer % 2 sukroz ve sefotaksim sodyum ile [500 μg/mL] desteklenmiştir. Plastik laboratuar film ile plakalarının ve onları 20 ° C'de karanlıkta büyümek
Not: Kökleri steril koşullarda ( Tablo malzemelerigörmek) floresan algılamak için donatılmış bir stereomicroscope altında manipüle edilebilir.
- Biyokütle üretimi (yani, gen ifade analizi) için 5 cm uzun kıllı kök kesmek ve ile Gamborg B5 sıvı orta % 2 sukroz ve sefotaksim sodyum ile [500 µg/mL] takıma 20 mL 150 ml Erlenmeyer şişeye aktarabilirsiniz. Bu karanlıkta 20 ° C ile 60 d/d, 6 hafta boyunca büyümeye.

Resim 1: patates transgenik kıllı kökleri A. rhizogeneskullanarak elde etmek için zaman çizelgesi '. Dönüşüm süreci ve kıllı kökleri büyümek için sonraki adımları her aşamada ulaşmak için toplu hafta gösterilir. Farklı aşamalarında temsil edici görüntüleri tasvir: 3-hafta-yaşlı vitro kullanarak işlemi başlatma tertibatları (A), o zaman enfeksiyon bitkilerin A. rhizogenes (B), proliferatif oluşumu enjekte edilerek doku (C, ok) gelişmekte olan kıllı kökleri (D) ile ve kırmızı floresan dönüşümün işaretçisi DsRed (E) ifade gelişmiş kıllı kökleri. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
4. bitki A. tumefaciens (Şekil 2) kullanarak dönüştürme
Not: Bu prosedür dönüştürülmüş bitkilerin almak sağlanır. Transgene'nın etkisini değerlendirmek için bir negatif kontrol gereklidir. Bir seçenek ile boş vektör dönüştürülmüş bir A. tumefaciens kullanarak yordamı takip etmektir. Alternatif olarak, vahşi türü bitkiler kullanılabilir.
- Keser ve bir yaprak (şekil 2A) 3-4-hafta-yaşlı bitkilerden bir kabında yerleştirir. Bir neşter kullanarak petiole dışlamak ve enine keser (yaprak boyutuna bağlı olarak 1-3) (şekil 2B) kesme kaçınarak kenarları yaprak Merkezi'nden yapmak.
- Hemen taze 2MS üzerinde 10 mL sıvı bir petri abaxial tarafı ile medyada yukarı yüzen yaprak yerleştirmek ve plaka kapatın. İlâ 15 accomodating adım cv. özellikle yaprakları yineleyin ve 25 (yaprak boyutu) bağlı olarakndigena ssp. için bırakır.
- Hemen A. tumefaciens kültürünün 80 µL OD600 eklemek sıvı ortamda 0.8 = ve bakteriyel çözüm dağıtmak 1 dk için el ile plaka lunaparkçı.
- Dikkatle film mühürleme ile mühür, alüminyum folyo ile kapatın ve 24 ° C'de ortaya dönüştürme izin için bir odasında 2 gün kuluçkaya.
- CIM orta (şekil 2B) kadar abaxial yan tutmak yapraklarını aktarın ve onları bir hafta içinde bir büyüme kabine için kuluçkaya.
- Böylece yapraklar daha iyi medyada kalabileceği CIM orta cımbız ile kazı.
- SIM orta (şekil 2C) kadar abaxial yan tutmak yapraklarını aktarın ve onları bir büyüme orta her 7-10 günde, sürgünler 2 cm boyunda olana yenileniyor kabine kuluçkaya.
- Böylece yapraklar tamamen medya tarafından çevrili olmak SIM orta cımbız ile kazı. Ortaya sürgünler kapağı ulaştığınızda, uzun boylu Petri yemekler ile çalışmak (100 x 20 mm, yükseklik x çapı).
Not: 6-7 hafta (şekil 2E) sonra SIM orta (şekil 2B) ve sürgünler 2-3 hafta sonra Kallus oluşturacak. Çekimleri ne zaman onlar bağımsız yarasından oluşmuş Kallus ortaya bağımsız dönüşüm olayları olarak kabul edilecektir.
- Kesme üç vuruyor ortaya çıktı (aynı dönüşüm olayı olarak kabul edilir) her Kallus (şekil 2E), onlara kültür şişeler MG orta ile sefotaksim sodyum [250 mg/L] ile izin vermek için takıma transfer destekliyorum, etiket alt bir sayı ile ve bir büyüme kabin 3-4 hafta için ya da sürgün dinç (şekil 2F) kadar kuluçkaya.
Not: sürgün, kesme kaldırdığınızda de Kallus aksi takdirde kök oluşturacak değil.
- Olarak bağımsız satırları gerektiği kadar yineleyin. En fazla 5 farklı dönüştürme olayları farklı etkinlikler bitkilerden değil karışık tam güven içinde çalışmak için 8 cm çapında bir kültür şişesi yerleştirilebilir.
- Her olay en güçlü bitki seçin, 3-4 internodes ile çekim apikal segment keser ve yeni bir kültür şişeye sefotaksim sodyum [250 mg/L] ile desteklenmiş 2MS orta ile yerleştirir.
Not: 3-6 hafta içinde bitki verimli bir şekilde büyüyecek, güçlü bir çekim ve kökleri gelişmekte.
- Seçilen bitki tam olarak geliştirmiştir kadar seçili olmayan sürgünler odasına getir.
- En az bir düğümler arası veya apikal bud ile bitki kök kesimleri kesme ve sefotaksim [250 mg/L] ile desteklenen yeni 2MS orta aktarabilirsiniz. Onları kabine büyüme kuluçkaya.
- Her 3-4 hafta dönüştürülmüş vitro hatları kurmak için çoğaltma.
Not: Sefotaksim sodyum 2MS orta için en az üç sonraki transferler emin olmak için A. tumefaciensöldürmek için gereklidir; A. tumefaciens büyüme gözlem yapılırsa, daha sonra bitkiler tekrar sefotaksim sodyum ile desteklenmiş 2MS medyaya aktarmak.
- Bitki fenotip karakterize etmek için bitkiler toprak tam onların karakterizasyonu için ya da suda kültür kök muayene için aktarmak.
- Toprakta yaymak ve kurulan satırları korumak için üretilen yumrular tutun.

Resim 2: patates elde etmek için zaman çizelgesi dönüştürülmüş A. tumefacienskullanarak bitkiler. Dönüşüm süreci ve bitkiler büyümek için sonraki adımları her aşamada ulaşmak için toplu hafta gösterilir. Farklı aşamalarında temsil edici görüntüleri tasvir: işlemi kullanarak başlatma (A) 3 - hafta eski vitro bitkilerin yaprakları, yaralı ve virüslü transferini CIM medya (B), ne zaman transfer yaprakları yaprakları SIM medya (C), yaralı alanların etrafında Kallus görselleştirme SIM medya (D), SIM medya (E) 9-11 hafta sonra ateş oluşumu ve (F) MG medyaya transfer ediliyor sonra sürgünler 2-3 hafta sonra. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
5. hydroponic kültür
- Hoagland'ın çözüm yarım strength için hazırlamak (0.5 x) (Tablo S2) 10 L kova.
- Homojenliği ve uygun oksijen koşulları korumak için bir akvaryum pompası sokmak.
- Karanlık koşullarda kökleri büyümeye alüminyum folyo ile kova duvarlarını kapsayacak.
- Kök zarar kaçınarak, vitro bitkiler için hydroponic kültür aktarın.
Not: kökleri mikroorganizma yayılması kuluçka sırasında dikkatli bir şekilde suya batırılır kökleri sallayarak önlemek için kalan herhangi bir vitro ortamda kaldırın.
- Şeffaf film yeterli iklimlendirme ve büyüyen odasında kuluçkaya sağlamak bir sera gibi bitkilerle kapsar.
- 3 gün sonra filmde delikler yapmak ve tamamen bir hafta sonra çıkarın.
- Taze medya ile 10 günde değiştirin.
6. GUS histochemical muhabir gen tahlil
Not: bizim durumumuzda GUS analiz 2-3 hafta suda veya içinde vitrokökleri ile gerçekleştirildi.
- Kökleri % 90'ı soğuk aseton (v/v) ile düzeltmek ve 20 dakika boyunca buz üzerinde kuluçkaya.
- Distile su ile iki yıkama gerçekleştirin.
- Taze GUS çözüm (Tablo 1) Boyama ekleyin ve vakum uygulayın (-70 Pa) 20 dk için.
- İçinde karanlık bir mavi renk görünene kadar veya 4 h için ışığa duyarlı GUS korumak için 37 ° C'de kuluçkaya.
Not: Ferri ve ferrocyanide GUS çözümde varlığı reaksiyon ürünleri Difüzyon en aza indirmek ve daha kesin yerelleştirme sağlar.
Dikkat: bir duman başlığı kullan ve toksik siyanür türevleri GUS çözüm (potasyum ferricyanide ve potasyum ferrocyanide) ele alırken koruyucu giysi giyin. GUS substrat ve elden çıkarma malzeme güvenli bir şekilde atılmalıdır.
- Çözüm boyama GUS kaldırmak ve uygun kaplarda atın.
- Etanol % 70 (v/v) ile iki yıkama gerçekleştirin.
- Parlak alan mikroskop altında gözlemlemek.
Not: boyama GUS için birkaç hafta stabil; Ancak, ilk haftasında GUS sinyal açıktır ve komşu hücrelerin içine daha az dağılır. Daha uzun depolama, tüp mühür ve 4 ° C'de depolayın

Tablo 1: GUS boyama çözüm tarifi.