$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Gastrointestinal (GI) sistem, birden fazla işlevi, konak hücre tipleri (örneğin epitel, bağışıklık, stromal vb.) ve trilyonlarca mikrop göz önüne alındığında karmaşık bir organ sistemidir. Bu karmaşıklığın ışığında, GI kanalı hastalıkları genellikle tüm bu faktörlerin etkileşimini içerir. Örneğin, enflamatuar bağırsak hastalıkları (IBD), enflamatuar hücrelerin aktivasyonunu, disbiyozu ve epitel onarımı 1, 2 ,3,4,5,6,7'yi içeren GI kanalında iltihaplanma ve remisyon döngüleri ile ilişkilidir. GI sisteminin IBD ve diğer enflamatuar durumlarını incelemek için uygun model sistemlerine sahip olmak, hastalığın patogenezini emmek için kritik öneme sahiptir. Genetik olarak tasarlanmış fareler ve kemirgenlerde dektran sodyum sülfat (DSS) gibi kimyasalların kullanımı da dahil olmak üzere IBD patogenezini incelemek için çeşitli modellervardır 8,9,10. Bu modellerin sınırlamaları, iltihabın indüksiyonunu hassas bir şekilde kontrol edememenin yanı sıra yara iyileşmesini değerlendirmede zorluklar içerir. IBD patogenezinin yönlerini taklit etmek için alternatif yöntemler tedaviler geliştirmek için yararlı olabilir.
Farelerde kolonoskopik güdümlü çimdik biyopsileri, enflamatuar yanıtın patogenezini, yara iyileşmesini ve kolondaki konak mikrop etkileşimlerini incelemek için yararlı bir model sistemi sunar. Bu yaklaşım ilk olarak 2009 yılında akut inflamatuar yanıtı ve bağırsaktaki yara iyileşmesini incelemek için yardımcılığını gösteren deneysel bir araç olarak kullanılmıştır11. Daha sonrakiçalışmalar, kolon yaraiyileşmesinde 11 , 12 , 13 , 14 , 15,16,17,18'de bağırsak mikrobiyotasının yanı sıra farklı sinyal yollarının rollerini değerlendirmek için bu tekniği kullandı. Daha yakın zamanda, grubumuz kolon hasarına akut yanıtta sphingosine-1-fosfat sinyalinin ve bakterilerin önemini araştırmak için bu modeli kullandı19. Yararlı olmasına rağmen, farelerde kolonoskopik güdümlü çimdik biyopsileri yapmak ve sonraki doku değişikliklerini değerlendirmek teknik olarak zor olabilir. Örneğin, yaralanmanın indüksiyonu üzerine bağırsağın delinmesinin gerçekleşmesi ve seri kolonoskopiler yoluyla yara yatağının tutarlı ölçümlerinin sağlanması zor olabilir. Ek olarak, histolojik veya immünohistokimyasal analizler için yara yatağını görselleştirmek için kolonik dokuyu düzgün bir şekilde yönlendirmek zor olabilir. Her ne kadar bu yöntemlerle ilgili bazı bilgiler mevcut olsa da18,20Bu tekniklerin kesin bir adım açısından açıklaması, bu modelin güvenilirliğini ve daha geniş yararını geliştirmeyi vaat eden görsel yardımlar sağlayacaktır. Burada, farelerde kolonoskopik güdümlü çimdik biyopsileri yapmak, zamanla yara kapatmayı izlemek ve yara yatağının histolojik ve moleküler analizlerini sağlamak için dokuyu hazırlamak için ayrıntılı bir yöntem sunuyoruz. Bu teknikleri gerçekleştirmek için standart bir yöntem oluşturmak, GI iltihabı ve yara onarımı için potansiyel olarak önemli olan daha önce araştırılmamış arabulucuları incelemek için bu modelin kullanımını genişletebilir.