Tüm prosedürler Kore İleri Bilim ve Teknoloji Enstitüsü Hayvan Etik Kurulu tarafından onaylandı. Tüm deneyler Kurumsal Hayvan Bakım ve Kullanım Komitesi'nin kılavuzuna uygun olarak gerçekleştirildi.
NOT: Bu protokol altı ana adımdan oluşur: virüs enjeksiyon cerrahisi, GRIN lens implant cerrahisi, GRIN lens implantasyonunun doğrulanması, taban plakası eki, davranış testi sırasında GCaMP sinyalinin optik kaydı ve veri işleme (Şekil 1A). Ameliyat dışında ticari yazılım paketi (Inscopix) kullanılmaktadır.
1. Stereotaksik cerrahi - AAV Virüs enjeksiyonu
NOT: Bu cerrahi işlemde kullanılan fare zorlanması C57BL6/J'dir. Hayvanın vücudu ameliyat sırasında steril bir örtü ile kaplanır ve protokoldeki tüm adımlar steril eldiven giyerek gerçekleştirilir. Birden fazla ameliyat genellikle aynı gün içinde yapılmaz. Bununla birlikte, aynı gün içinde birden fazla farenin aynı ameliyatı olması gerekiyorsa, fareler arasındaki cerrahi aletleri dezenfekte etmek için her fare için ayrı bir otomatik kapatılmış cerrahi araç seti ve% 70 etanol kullanın. Cerrahi işlem sırasında fareyi sıcak tutmak için, fare stereotaksik çerçeveye sabitlendikten sonra özel yapım bir cerrahi battaniye ile kaplanır.
- Gerekli tüm cerrahi aletleri% 70 etanol ile dezenfekte edin ve bir Hamilton şırıncığı ve bir cam pipet hazırlayın. Cam pipetleri damıtılmış su ile doldurun.
NOT: Protokolde kullanılan tüm cerrahi aletler otoklavlanmıştır. GRIN lens ve kafatası vidaları sterilizasyon için otoklavlanamadığı için iltihabı önlemek için dezenfektan olarak p etanol kullanılır. Denenmemekle birlikte, gaz veya kimyasal sterilizasyon gibi başka sterilizasyon biçimleri de kullanılabilir.
- Fareyi pentobarbital (vücut ağırlığının 83 mg⭐kg-1'i) ile intraperitoneal enjeksiyonla uyuşturun. Fare bilinçsiz hale geldikten sonra, kafatasındaki kürkü tıraş edin.
- Kafatasının üzerindeki cildi% 70 etanol ile temizleyin ve fareyi stereotaksik çerçeveye sabitin. Cildi dikkatlice çıkarın ve kafatası yüzeyini pamuk ucu aplikatörü kullanarak% 35 hidrojen peroksit çözeltisi ile silin. Ameliyat sırasında kornea kurumasını önlemek için yağlayıcı göz merhemi uygulayın.
NOT: Genellikle sadece aseptik cilt hazırlığı için% 70 etanol kullanmada bir sorun olmamasına rağmen, iodoforlar veya klorheksidin çözeltisi ve% 70 etanol gibi 3 alternatif dezenfektan turu kullanılması önerilir. Bu protokolde, fare kafatasındaki bağ dokusunun mümkün olduğunca tamamen çıkarıldığından emin olmak için daha yüksek hidrojen peroksit konsantrasyonu kullanılır, bu da daha sonraki görüntüleme sırasında hareket yapıtını azaltmak için kritik öneme sahiptir, çünkü kafatasındaki bağ dokusu, taban plakasının kafatasına sıkı bir şekilde bağlanmasına müdahale eder. % 35 hidrojen peroksitin normalde kullanılandan çok daha yüksek olduğu belirtilmelidir (% 3).
- Pimini stereotaksik prob tutucu ile sabitle. Bregma ve lambda'nın yüksekliğini pim ile hizalayın.
- Kraniyotomi için fare kafatasında belirli bir konum bulun.
NOT: Virüs enjeksiyonu için lateral amigdalanın (LA) koordinatları (AP, ML, DV) = (-1,6 mm, -3,5 mm, -4,3 mm) bu protokoldeki (AP; Ön-Posterior, ML; Medial-Yanal, DV; Dorsal-Ventral, her kısaltma bregma'dan göreceli eksenel mesafeyi gösterir)26. Koordinatlar her deneysel durum için optimize edilmelidir.
- Kafatası yüzeyini delin (Şekil 1B). Kafatası fraksiyonlarını fosfat tamponlu salin (PBS) ile yıkayın. Geri kalan tabakayı kümesleri veya 27 G iğne kullanarak çıkarın.
- Kafatasını delerken, beyin dokusu yüzeyinin zarar görmesini önlemek için son dura tabakasına dokunmamaya çalışın. Hasarlı bir beyin yüzeyi lens çevresinde iltihaplanmaya neden olur, bu da kayıt sırasında şiddetli hareket yapıtlarına ve yüksek otofluoresansa neden olur. Kraniyotomi büyüklüğü 1,6 mm'dir. Matkap hızı 18.000 rpm ve uç boyutu 0,6 mm'dir.
- GRIN lensi delinmiş alanın beyin dokusu yüzeyinden hedef amigdala bölgesine indirmek için, bregma ve maruz kalan beyin yüzeyi arasındaki DV farkını bregmaya dayalı olarak ayarlanan lens implantasyonunun DV koordinatından çıkararak "A Değeri" olarak adlandırılan mesafeyi hesaplayın (bu durumda 4,2 mm, Şekil 1C).
- Cam pipete 3 μL mineral yağ ve 0,7 μL AAV virüs çözeltisi yükleyin.
NOT: Mineral yağ, virüs çözeltisini ve suyu ayırmaya yardımcı olur. 0.7 μL, LA virüs enjeksiyonu için LA'yi tamamen kapsayabilen optimize edilmiş bir hacimdir.
- Pimini stereotaksik prob tutucusundan çıkarın ve cam pipetleri sabitleyin.
- Adım 1.5'te belirtilen enjeksiyon yerinde cam pipet bulun. Kanama tamamen durduktan sonra cam pipetleri beyin dokusuna yerleştirin.
- Enjeksiyon pompası kullanarak virüsü cam pipetle teslim edin.
NOT: Yeterli sayıda GCaMP ifade hücresi elde etmek için virüsün titresi 1 x10 13 vg/mL'den yüksek olmalıdır. Enjeksiyon hızı 0.1 μL / dk'dır ve 10 dakika boyunca yayılır. Kanama varsa, beyin yüzeyini PBS ile yıkayın. Bu adımda beyin yüzeyini ıslak tutun.
- Enjeksiyonu bitirdikten sonra, cam pipet yavaşça çıkarın.
2. Stereotaksik cerrahi – GRIN lens implantasyonu
NOT: GRIN lens implant cerrahisi bu protokolün en kritik adımıdır. GRIN lens hareketinin tutarlı bir yavaş hızı başarılı GRIN lens implantasyonu için kritik olduğundan, motorlu bir ameliyat kolu yararlı olabilir. Motorlu cerrahi kol, bilgisayar yazılımı tarafından kontrol edilen stereotaksik bir manipülatördür. Bu protokolde motorlu kol kullanılsa da implantasyon sırasında lens sürekli ve yavaş hareket ettiği sürece başka yollar da kullanılabilir. Cihaz hakkında ayrıntılı bilgi Malzeme Tablosundadır.
- İki kafatası vidası yerleştirmek için kafatasını delin. Tüm kafatası fraksiyonlarını PBS ile yıkayın.
NOT: Daha sonraki optik görüntülemedeki hareket yapıtlarını azaltmak için en az iki vida gereklidir. İki kafatası vidası ve GRIN lens implant pozisyonu bir eşkenal üçgen oluşturur (Şekil 1B). Kraniyotomi boyutu vidanın çapına sıkıca uymalıdır. Kanama varsa, kanayan yüzeyi PBS ile yıkayın. Matkap hızı 18.000 rpm ve uç boyutu 0,6 mm'dir.
- İltihabı önlemek için vidaları% 70 etanol ile dezenfekte edin. Vidaları mümkün olduğunca derine yerleştirin.
NOT: Vidalar çimento gibi ek yapıştırma olmadan sıkıca sabitlenmelidir.
- Stereotaksik çerçeveye motorlu bir ameliyat kolu takın. Gerekli donanımı, kontrol yazılımının yüklü olduğu dizüstü bilgisayara bağlayın (Malzeme Tablosu).
- GRIN lensi indirmeden önce, 26 G iğne ile bir iğne izi yapmaya hazırlanın.
NOT: İğne izi, enjeksiyon yolu boyunca beyin yapısının ciddi bir bozulmasına neden olmadan nispeten kalın GRIN lensin amigdala gibi derin beyin bölgelerine yerleştirilmesine yardımcı olan bir tür kılavuz parçadır. Bu kılavuz parçaya iğne izi denir, çünkü nispeten ince 26 G iğnenin alçaltma ve yükseltme prosedürü ile yapılır.
- İğneyi stereotaksik çerçevede tutmak için kanül tutucuyu takın.
- 26 G iğneyi kanül tutucu ile kavrayın ve iğne yerleştirme bölgesinin koordinatlarını hesaplayın.
NOT: Bu protokolde, iğne ekleme bölgesinin koordinatları virüs enjeksiyon bölgesinden (AP, ML, DV) = (-1,6 mm, -3,55 mm, -3,7 mm) 50 μm yanaldır.
- Kontrol yazılımına erişin ve iğne pozisyonunu manipüle etmek için tam hazırlık yapın.
- Denetim yazılımını çalıştırın ve oturumu denetlemeye başlamak için Yeni proje başlat düğmesini seçin.
NOT: Kontrol oturumunda, birkaç boş kutu ve menü düğmesi vardır. Boş kutular koordinatlar için giriş alanıdır. Boş kutulara koordinatları girdikten sonra motorlu stereotaksik kol Git butonuna tıklayarak hareket eder. Stereotaksik kol hareket ederken Git düğmesi DUR düğmesine dönüşür. Birkaç menü düğmesi arasında, bu protokolde yalnızca Araç düğmesi gereklidir.
- Araç düğmesini tıklatın. Çerçeveyi kalibre etme menü düğmesini tıklatarak kontrol yazılımını kalibre edin. Kalibrasyon, manipülatörün gerçek konumunun Stereodrive yazılımında değer olarak ayarlanması işlemidir.
- Stereotaksik manipülatör kullanarak kafatası yüzeyindeki açıkta kalan beyin yüzeyinde iğnenin ucunu bulun.
NOT: İğnenin hızı, Araç menüsündeki Microdrive hız menüsü kullanılarak ayarlanır. Varsayılan hız 3,0 mm/s'dir. Ancak bu adımda 0,5 mm/s hız önerilir. İğnenin hareketi ok tuşları tarafından kontrol edilir.
- Beyin yüzeyini ıslak tutmak için 2-3 damla PBS ekleyin. Bilgisayar ekranındaki boş kutuyu LA'nin uygun DV koordinatlarıyla doldurun. Beyin yüzeyi kuruysa, iğnenin beyin dokusuna nüfuz etmesine engel olur.
- Git düğmesine tıklayarak 26 G iğneyi 26 G'ye düşür. İğne DV koordinatları tarafından belirlenen hedef bölgeye ulaştığında otomatik olarak durur. İğnenin hızı 100 μm / dk'dır. Kanama varsa DURDUR butonuna tıklayarak iğneyi durdurun ve beyin yüzeyini PBS ile yıkayın. Bu adımda beyin yüzeyini ıslak tutun. Kanama durduktan sonra tekrar alçalmaya başlayın.
- İğne hareket etmeyi tamamen durdurduktan sonra, bilgisayar ekranındaki boş kutuya 45,00 mm girin.
NOT: 45,00 mm, iğnenin başlangıç konumuna dönmesini sağlayan DV koordinatının bir değeridir.
- Git düğmesini tıklatarak iğneyi yükseltin. İğne hareketinin hızı 100-200 μm / dk'dır.
- İğne hareket etmeyi durdurduktan sonra, beyin yüzeyindeki PBS'yi çıkarın. İğne ve kanül tutucuyu stereotaksik çerçeveden kaldırın. Deneyci gerektiğinde DUR düğmesini tıklatarak iğneyi el ile durdurabilir.
- Stereotaksik çubuğu lens tutucu ile donatın. GRIN lensi lens tutucusuna takın.
NOT: Bu protokolde LA'yi hedeflemek için optimize edilmiş GRIN lens (0,6 mm çapında, 7,3 mm uzunluğunda) kullanılır. Lens tutucu hazır değilse, GRIN lensi kavramak için bir bulldog klipsi kullanmanın alternatif bir yoludur.
- Lensi % 70 etanol ile dezenfekte edin ve stereotaksik çubuğu stereotaksik çerçevelere takın.
- GRIN lensin ucunu kafatası yüzeyinde belirlenen yerde bulun (adım 2.8'de açıklanan yöntemle aynı).
NOT: GRIN lensin koordinatı (AP, ML, DV) = (-1,6 mm, -3,55 mm, -4,2 mm)(Şekil 1C). Lens, ucunda hasar görmemesi için kafatasına dokunmamalıdır.
- Adım 2.16'da açıklanan lens implantasyonunun DV koordinatından "A Değeri"nin mutlak değerini çıkararak DV koordinatını hesaplayın.
- Beyin yüzeyine 2-3 damla PBS bırakın. Alçalma için 1000 μm ve bilgisayar ekranındaki boş kutuya lensi yükseltmek için 300 μm girin.
- Hedef bölgeye ulaşana kadar GRIN lensin alçaltılmasını (1000 μm aşağı) ve yükseltilmesini (300 μm yukarı) tekrarlayın. Bu yukarı ve aşağı prosedür, implantasyon yolu boyunca beyin yapılarının bozulmasına neden olabilecek lensin alçaltma prosedürü nedeniyle beyin dokusunun içinde oluşan basıncın serbest bırakılmasına yardımcı olmak için kullanılır.
NOT: GRIN lens hareketinin hızı 100 μm/dk'dır. Kanama olsa bile, GRIN lensi hareket ettirmeyi bırakmayın ve beyin yüzeyini PBS ile yıkayın. Bu adımda beyin yüzeyini ıslak tutun. Beyin yüzeyi kuruysa, beyin dokusu GRIN lens yüzeyine yapışır ve beyin yapısının bozulmasına neden olur.
- GRIN lens hedef bölgeye ulaşırsa, PBS'yi çıkarın ve reçine diş çimentosünü GRIN lensin, vidaların ve yan duvarlarının etrafına dikkatlice uygulayın (Şekil 1D).
NOT: Reçine çimentosunda kafatasının her yerine uygulanması hareket yapıtlarını azaltabilir. Aksine, reçine çimentosu yanlışlıkla kafatasına bağlı kasları kaplarsa, hareket yapıtlarını arttırır.
- Reçine diş çimentosu sertleştikten sonra, GRIN lensi lens tutucudan sökün ve kafatasının her yerine akrilik çimento uygulayın (Şekil 1D).
- Kafa plakasını takmak için lens tutucuyu stereotaksik çubuktan sökün ve kafa plakasını bantlar kullanarak çubuğun ucuna takın. Kafa plakasının yatay olup olmadığını onaylayın.
NOT: Eğik bir kafa plakası eğik bir görünüme neden olur. Fare kafasını mobil ev kafes sistemine (taban plakası ek bölümünde) sabitlemek için bir kafa plakası gereklidir. Deneyci sistemi kullanmazsa, bu adımı (adım 2.22) ve aşağıdaki adım 2.23'ü atlayın.
- Kafa plakası lens manşetinin üst kısmına yer bulana kadar çubuğu yavaşça dirin. Kafa plakasını 1000 μm daha düşür. Yerleştirilen GRIN lensin kafa plakasını hareket ettirerek baş plakasının iç halkasının sağ kenarında bulun.
NOT: Kafa plakası implante edilen GRIN lens yüzeyinden daha düşük konumlandırılmalıdır; aksi takdirde, mikroendoskop akril çimento nedeniyle odak düzlemini ayarlamak için implante grin lense yeterince yaklaşamaz.
- Baş plakasını çimento katmanlarına tutturmak için akrilik çimento uygulayın (Şekil 1D).
- Lens yüzeyini tozdan korumak için yerleştirilen GRIN lens yüzeyine parafin filmi takın. Daha sonra parafin filminin lens yüzeyinde kalmasını sağlamak için parafin filmine çıkarılabilir epoksi bağı uygulayın.
- Farenin periton boşluğuna analjezik (PBS'de 0,5 mg/mL) ve antienflamatuar bir ilaç olan Deksametazon (PBS'de 0,02 mg/mL) çözeltisi olan Carprofen'i enjekte edin.
NOT: İlacın dozu vücut ağırlığına bağlıdır: Carprofen (5 mg⭐kg-1 vücut ağırlığı) ve Deksametazon (0.2 mg⭐kg-1 vücut ağırlığı). Hem Carprofen hem de Deksametazon ameliyattan sonra ve ameliyat sonrası 7 gün boyunca günde bir kez uygulanır.
- İlacı 1 hafta boyunca uygulamak için ev kafesi suyunda bir antibiyotik olan 0.3 mg / mL amoksisilin karıştırın.
- Fareyi ev kafesine geri koyun ve iyileşme ve virüs transdüksiyon için 5-8 hafta izin verin.
NOT: Fare, anesteziden uyanana kadar elektrikli bir battaniye üzerinde önceden ısıtılmış bir kafeste kurtarılır.
3. GRIN lens implantasyonunun doğrulanması
NOT: GRIN lens implantasyonunun doğrulanması, implante edilen GRIN lensin GCaMP ekspresyasyon hücrelerine hedefte olup olmadığı hakkında bilgi sağlar. Bu bilgilere dayanarak, deneyci, hedef dışı GRIN lens implantasyonu olan hayvanları hariç tutarak davranış testi ve veri işleme gibi zaman alıcı süreçlerden zaman kazandırır. Doğrulama yordamı sırasında, GCaMP ifadeli hücreler kayıt görüntüleme alanına odaklanmalıdır. Bu adımda mobil bir ev kafesi kullanılır. Mobil ev kafesi, grin lens implantasyonu ve taban plakası ataşmanının doğrulanması sırasında kafa sabit farelerinin bacaklarını serbestçe hareket ettirmelerini sağlayan özel bir yuvarlak şekilli aparattır. Bu aparatta, kafa sabit farelerinin bacaklarının yer aldığı bir hava kaldırma masası, kafa sabit olmasına rağmen bacakların serbest dolaşımını sağlar. Amigdalanın lateral çekirdeğindeki hücreler genellikle dinlenme veya uyuşturulmuş durumda sessizdir, bu nedenle GCaMP floresan sinyalleri bu koşullarda nadiren tespit edilir, bu da GRIN lens implantasyonu ve taban plakası ekinin doğrulanması sırasında GCaMP'yi ifade eden hücreleri bulmayı çok zor, bazen imkansız hale getirir. Bununla birlikte, bacakların hareketi genellikle amigdala lateral çekirdeği hücrelerinde GCaMP floresan sinyalleri üretir ve böylece mikroskobun bulunmasına yardımcı olabilir. Böylece, mobil ev kafesi bu protokolde kullanılır.
- Stereotaksik manipülatörü mobil ev kafes sistemine monte edin.
- Fareyi% 1.5 izofluran gazı ile uyuşturun. Fare tamamen bilinçsiz olduktan sonra, fareyi mobil ev kafes sisteminin baş çubuğuna yerleştirin.
- Farenin altındaki karbon kafesini bulun. Karbon kafesini kapatın ve kafesin sürtünmeden serbestçe hareket etmesini sağlamak için hava akışını açın. Fare etkinleşene kadar birkaç dakika bekleyin.
NOT: Hava akışının hızı her deneysel durum için optimize edilmelidir (burada, 100 L /dk).
- yerleştirilen GRIN lensin yüzeyindeki parafin filmi ve epoksi bağını çıkarın ve lens kağıdı kullanarak lens yüzeyini % 70 etanol ile silin.
- Veri toplama (DAQ) yazılımını hazırlayın (örneğin, Inscopix). Görüntüleme koşullarını ayarlayın.
NOT: DAQ yazılımı mikroskobu (LED gücü, lens odağıvb.)ve veri depolamayı kontrol etmek için kullanılır.
- DAQ kutusunu açın ve mikroskop takın. Ardından, doğrudan bir kablo kullanarak veya kablosuz internet üzerinden bir dizüstü bilgisayara bağlayın.
NOT: DAQ yazılımı, DAQ kutusu (örneğin, Inscopix) adı verilen ekstra donanıma yüklenir. DAQ kutusunu dizüstü bilgisayara bağlayarak, DAQ yazılımı bir dizüstü bilgisayarda erişilebilir hale gelir.
- DAQ yazılımına bir internet tarayıcısı üzerinden erişin (Firefox önerilir).
- Tanımlı Oturumdagerekli tüm ayrıntıları (Tarih, fare kimliğivb.)ayarlayın. Ardından Kaydet ve Devam 'ıtıklatın. Kaydettikten sonra Çalıştır oturumunaerişin.
- Çalışma Oturumu'nda pozlama süresi, kazanç, elektronik odaklama ve pozlama-LED gücü gibi görüntüleme koşullarını ayarlayın.
NOT: Kazanç ve pozlama-LED gücü laboratuvar koşullarına bağlı olarak değiştirilebilir. Elektrik odağı için önerilen değer 500 ve maruz kalma süresi 50 ms'dir. LED gücünü ve kazancı değiştirmek için herhangi bir kısıtlama yoktur. Bununla birlikte, daha yüksek bir ışık yoğunluğu daha fazla ağartmaya neden olabilir. Kaydın pozlama süresi, video kaydının kare hızını belirler. Daha yüksek kare hızları sinyal yoğunluğunu azaltır. Görüntüleme için kullanılan GECI'ler için kare hızları optimize edilmelidir.
- Mikroskobu stereotaksik bir manipülatör üzerinde tutmak için, stereotaksik çubuğu mikroskop tutuculu stereotaksik manipülatöre takın.
NOT: Tutucu, stereotaksik cihaza, hedef beyin konumuna yerleştirmek için bir mikroskop gövdesi tutmak için takılabilen küçük bir aksesuardır.
- Mikroskobu mikroskop tutucu ile kavrayın. Mikroskopa bağlı LED ışığı açın ve mikroskobu dikey olarak hizalayın. yerleştirilen GRIN lensin yüzeyi ortaya çıkıp gelene kadar görüntüyü gözlemlerken mikroskobu düşürin.
- Yerleştirilen GRIN lensin merkezini görünümün merkeziyle hizalayın.
NOT: GRIN lens implantasyonunun doğrulanması bu adımda yapılabilir (sonuç bölümünde, Şekil 2B, Şekil 2 D, Şekil 2F' de belirtilmiştir).
- Yerleştirilen GRIN lens yüzeyinin görüntüsünü yakalayın (Klavyede Prt Sc düğmesine tıklayın). İmplantlı GRIN lens yüzeyinin görüntüsü, daha sonraki veri işleme sırasında nöronal olmayan bileşenlerin seçimini kaldırmak için gereklidir (adım 6.8).
- Mikroskobun uygun konumunu bulun. GCaMP7b ekspresyonlu hücreleri aramak için görüntüyü gözlemlerken mikroskobun objektif merceğini yavaşça yükseltin.
NOT: Görüntü alımının veya pozlama-LED gücünün kazancını ayarlamak gerekebilir. GRIN lens implantasyonunun doğrulanması bu adımda yapılabilir (sonuç bölümünde belirtilen, Şekil 2A, Şekil 2C, Şekil 2E).
4. Taban plakası eki
NOT: Taban plakası bağlanma adımı, GRIN lens implantasyonunun doğrulanmasını izler. Taban plakası, mikroskobu farelerin kafasına monte etmek için bir platformdur. Önceki bölümde belirtildiği gibi, bu protokolde mobil bir ev kafesi kullanılır.
- GRIN lens implantasyonunu doğruladıktan sonra, mikroskop tutucusundan minyatür bir mikroskobu sökün.
- Mikroskopa taban plakası takın. Taban plakasının mikroskopa sabit bağlanması için altıgen anahtar kullanarak vidayı sıkın.
- Mikroskobu mikroskop tutucu ile kavrayın. Mikroskopa bağlı LED ışığı açın ve mikroskobu dikey olarak hizalayın. yerleştirilen GRIN lensin yüzeyi gözlemlenene kadar mikroskobu dürt. Yerleştirilen GRIN lensin merkezini görünümün merkeziyle hizalayın.
- Mikroskobun uygun konumunu bulun. GCaMP7b ekspresyonlu hücrelerin en iyi görüntülerini veren bir odak düzlemi bulana kadar mikroskobun objektif merceğini yavaşça yükseltin (Şekil 2A).
NOT: Bu adım sırasında görüntü alma veya pozlama-LED gücünün kazancını ayarlamak gerekebilir.
- Taban plakasını kafa plakasına(Şekil 2G)sapta takmak için akrilik çimento uygulayın. Taban plakası ve kafa plakası arasında akrilik çimento ile yan duvarları oluşturun.
NOT: Akrilik çimento sertleştiğinde küçülür. Bu nedenle, çimento tamamen sertleşene kadar mikroskobu çıkarmayın (bu adım en az 30 dakika sürer). Mikroskop ve objektif merceği akrilik çimento ile istenmeyen çimentolaşmayı önlemek için çimentolama çok dikkatli yapılmalıdır.
- Akrilik çimento tamamen sertleştikten sonra vidayı gevşetin ve mikroskop gövdesini yavaşça yükseltin.
- Yan tarafta bir boşluk varsa, implante edilen GRIN lensi tozdan korumak için ek çimentolamayı yeniden yapılandırın.
- Yerleştirilen GRIN lensi tozdan korumak için taban plakasını örtün ve taban plakasının vidasını sıkın.
- Kafa plakasını baş çubuğundan serbest bırakın. Gelecekteki optik görüntülemeye kadar fareyi ev kafesine geri döndürün.
5. Davranış testi sırasında GCaMP sinyalinin optik kaydı
NOT: Davranış sırasında GCaMP sinyal kaydı prosedürü optik görüntüleme, deneysel tasarım ve laboratuvar ortamı için kullanılan sistemlere bağlı olarak çok farklı olabilir. Bu nedenle, bu bölümde basit bir şekilde açıklanmıştır.
- Davranış testinden önce birkaç gün işleme gerçekleştirin.
- Davranış aygıtını (örneğin, korku şartlandırma odası, davranış yazılımı ve Coulbourn Enstrümanı) ve dizüstü bilgisayarı hazırlayın.
- Mikroskobu DAQ kutusuna takın ve DAQ kutusunu açın.
- DAQ kutusunu kablosuz internet bağlantısıyla dizüstü bilgisayara bağlayın.
- Dizüstü bilgisayarda DAQ yazılımını (Firefox tarayıcısı önerilir) başlatın. Dosya yöneticisi düğmesini tıklatın ve kaydedilen verileri kaydetmek için DAQ kutusunun kalan depolama kapasitesini denetleyin.
NOT: Veri boyutu 30 dakikalık kayıt için yaklaşık 80 GB'tır.
- Tanımlı oturuma gerekli bilgileri (Tarih, fare kimliğivb.)girin ve Çalıştır oturumunagirin.
- Fareyi yavaşça tutun ve kafasındaki taban plakası kapağını çıkarın. Mikroskobu taban plakası platformuna yerleştirmek.
- Taban plakası vidasını sıkın ve hayvanı baş montajlı bir mikroendoskopla davranış odasına yerleştirin.
NOT: İşleme yeterli değilse, fare bu adımda kaçmaya çalışır.
- NI kartı, BNC kablosu kullanarak DAQ kutusunun TRIG bağlantı noktasına bağlayın. NI kartı, davranış yazılımından (örneğin FreezeFrame) TTL sinyalleri alır ve GCaMP sinyalinin ve hayvanın davranışının eşzamanlı kayıt prosedürünü koordine eder.
- Odak düzlemini ayarlayın.
NOT: Odak düzlemi, mikroskopun objektif lensi ile beyne yerleştirilen GRIN lens arasındaki mesafeye göre belirlenir. Odak düzlemini ayarlamak için, görüntüleri gözlemlerken objektif lens konumu manipüle edilir. Hücrelerin ve kan damarlarının net morfolojisini gösteren bu iki lens arasındaki mesafe görüntüleme için odak düzlemi olarak ayarlanır. Bu protokolde, DAQ yazılımı ayarlama sırasında objektif lensin hareketini kontrol etmek için kullanılır.
- Çalışma oturumunda optimize edilmiş pozlama süresini, kazancı, LED gücünü ayarlayın.
NOT: Genellikle pozlama süresi için 50 ms kullanılır. Kazanç ve LED gücü görüntü histogramlarına göre ayarlanır. Histogramlar piksellerin floresan yoğunluğunun dağılımını gösterir. Görsel incelemeye dayanarak, histogramın sağ kenarı GCaMP7b durumunda% 40 ila% 60 arasında bir değere sahip olmalıdır. Görüntüleme için kullanılan GECI'lere bağlı olarak değişir.
- Kayıt seçeneğini Tetiklenen kayıtolarak değiştirin. Kaydet'i tıklatın ve davranışı başlatın.
NOT: Tetiklenen kayıt seçeneği, kayıt oturumunun ve davranış oturumunun eşleşen bir zaman çizelgesini sağlar. TTL sinyali alınırsa, TRIG bağlantı noktasının üzerindeki kırmızı ışık yanar.
- Davranış testini bitirdikten sonra mikroskobu ayırın ve taban plakası kapağını takın.
- Fareyi ev kafesine geri götür. Ardından, Dosya yöneticisi'ni seçin ve DAQ kutusundan verileri dışarı aktarın.
- Davranış testinden sonra, ölüm sonrası histolojik doğrulama için fareyi feda edin.
6. Veri işleme
NOT: Veri işleme prosedürü, veri işleme yazılımına ve görüntüleme deneyi için kullanılan GECI'lere bağlı olarak çok farklıdır. Bu nedenle, bu bölümde basit bir şekilde açıklanmıştır. Bu protokol ticari veri işleme yazılımı kullanır (bkz. Malzeme Tablosu). Alternatif olarak, tartışma bölümünde belirtilen diğer açık kaynaklı yazılımlar da sorunsuz bir şekilde kullanılabilir. Bu iletişim kuralında kullanılan değişkenler Tablo 1'de listelenmiştir.
- Kayıt video veri dosyasını (1280 piksel x 800 piksel) DAQ kutusundan veri işleme için masaüstü bilgisayara aktarın. Veri işleme yazılımını başlatın.
NOT: Veri işleme yazılımı önceki adımlarda DAQ yazılımından farklıdır. Veri işleme yazılımında, 6 adım vardır: kaydedilen videodan tek hücreli kalsiyum geçici verilerini çıkarmak için gerekli olan aşağı örnekleme, kırpma, uzamsal filtre, hareket düzeltme, ΔF / F hesaplaması, olay algılama.
- Videoyu altörnekle ve kırpın.
NOT: Veri işleme hızını artırmak için altörnekleme ve kırpma gereklidir. GCaMP sinyalinin gözlendiği ilgi alanı hariç alanı kırpın.
- Uzamsal filtre uygulayın. Uzamsal filtre uyguladıktan sonra ortalama bir yoğunluk projeksiyon görüntüsü oluşturun.
NOT: Uzamsal filtre, kaydedilen video görüntüsündeki her pikseli ayırt eder ve yüksek kontrastlı bir görüntü sağlar. İki tip kesme filtresi vardır, düşük ve yüksek kesme filtresi. Düşük kesme filtrelerinin daha yüksek değeri görüntü kontrastını artırır, ancak aynı genel olarak gri gürültü de artar. Yüksek kesme filtresinin düşük değeri görüntünün bulanıklaşmasını sağlar.
- Hareket düzeltmesi uygulayın. Ortalama yoğunluk projeksiyon görüntüsünü hareket düzeltme için referans görüntü olarak kullanın.
- Referans görüntü olarak ilk karenin görüntüsünü kullanarak hareket düzeltmeyi yeniden uygulayın.
NOT: hareket düzeltmenin iki adımı hareket yapıtını önemli ölçüde azaltır.
- Parlaklıkta değişiklik gösteren pikselleri görselleştirmek için ΔF/F hesaplaması uygulayın.
NOT: Piksellerin parlaklık değişimi GCaMP'nin floresan yoğunluğu değişiminden kaynaklanır ve kalsiyum geçicilerini gösterir.
- Her hücrenin kalsiyum geçici eğrisini görselleştirmek için PCA/ICA algoritmasını uygulayın.
NOT: PCA/ICA, bir veri grubunu tek bileşenli veri kümesine sıralamak için bir algoritmadır. Değişkenler her laboratuvar durumu için optimize edilmelidir. Bu iletişim kuralında, ICA zamansal ağırlığı (bu protokolde 0,4 kullanılır)27dışında tüm değişkenler varsayılandır.
- Aşağıdaki Not'ta açıklanan ölçütlere göre tanımlanan bileşenler arasında nöronal olmayan bileşenlerin seçimini el ile kaldırın.
NOT: Bu amaçla iki ana kriter kullanılmaktadır. İlk olarak, bir nörondan kaynaklanan GCaMP sinyali net bir küresel şekle benziyor. Böylece, sadece net bir küresel şekle sahip sinyal nöron olarak seçilir. İkincisi, amigdala piramidal hücrenin hücre gövdesinin çapının yaklaşık 20 μm28,29,30olduğu bilinmektedir, sadece bu boyutla kabaca eşleşen sinyal bir nöron olarak seçilir. GCaMP sinyalinin boyutunu belirlemek için, tek bir pikselin gerçek boyutu lens yüzeyinin yakalanan görüntüsüne göre hesaplanır (adım 3.9) ve tek küresel şeklin maksimum genişliği hesaplanır. Örneğin, bu protokolde, implante edilen GRIN lensin çapı 600 μm'dir. Bu nedenle, lensin çapı 800 piksel ise, tek pikselin gerçek boyutu 1,5 μm'dir (20 μm yaklaşık 7 pikseldir).
- Kalsiyum geçicisinin (kalsiyum olayı) önemli bir artışını tespit etmek için olay algılama işlevini uygulayın.
NOT: Bu adımda, olay en küçük bozulma süresi (φ) adı verilen değişken gereklidir. Bu protokolde, 1.18s GCaMP7b için optimize edilmiş bir değişken olarak kullanılır. Ortalama yarı çürüme süresi (t1/2=0.82s), hücrelerin spontan aktivitesi sırasında ΔF/F eğrisine göre hesaplanır. GCaMP üstel çürümeyi takip edildiğinden, δ =
.