Nörobilim topluluğu arasında yaygın olarak kullanılmasına rağmen, beyin dilimi preparatları da çeşitli dezavantajlarla karşı karşıyadır. Örneğin, ilgi çekici beyin alanlarına giriş ve çıkış bağlantıları artık bir beyin diliminde bağlı değildir. Ayrıca, izole edildikten sonra, doku zamanla yavaşça bozulmaya başlar ve bu işlem beyin diliminin fizyolojik koşullarını değiştirebilir. Özellikle bu konu çok endişe vericidir, çünkü çoğu beyin dilimi kaydı birkaç dakika ila saatler sürer, bu da deney başlamadan önce 6-8 saate kadar izole edilen doku üzerinde gerçekleştirilen kayıtlarla uzun deneysel günlerle sonuçlanır. Ayrıca, beyin omurilik sıvısı ve kan dolaşımı dilim preparatları sırasında kesilir ve bu da bir beyin dilimi içinde önemli endojen bileşiklerin olmamasına neden olabilir. Ve en açık şekilde, dilimleme prosedürünün kendisi elde edilen sonuçları tehlikeye atabilecek mekanik doku hasarına neden olabilir. Bununla birlikte, beyin dilimi preparatlarının gerçek yararları hala dezavantajlarından daha ağır basmaktadır, bu yüzden nörobilim araştırmalarında çok değerli ve kullanılan bir teknik sunarlar.
Akut hipokampal beyin dilimleri, nöronal süreçleri moleküler düzeyden karmaşık beyin devresi çalışmalarına kadar araştırmak için güçlü ve bu nedenle yaygın olarak kullanılan bir teknik sunar. Bu, bir dilim hazırlamada kolayca korunabilen hipokampüsün ideal nöroanatomisini temel18. Sonuç olarak, hipokampal beyin dilimleri, ilaç taramaları17, bilişsel işlevlerde yer alan nöronal ve sinaptik özelliklerin çalışmaları40 , 41ve patolojik beyin durumlarının araştırılması14,42,43dahil olmak üzere çok çeşitli bilimsel araştırma projelerinde kullanılmaktadır. Bununla birlikte, geniş bir farklı uygulama yelpazesi, diğerlerinin yanı sıra diseksiyon koşulları ve kesme düzlemi yönlendirmesi gibi çeşitli parametrelerde farklılık gösterebilen çok çeşitli kullanılabilir dilim hazırlama protokollerine de neden olur. Bu nedenle, uygun bir dilim hazırlama protokolünün seçilebilmesi için bilimsel bir projenin tam araştırma sorusunun belirlenmesi gerekir.
Doku helikopteri hipokampal beyin dilimlerini hazırlamak için kullanılan en eski tekniklerden birini sunar44,45. Bu hazırlık yönteminin en büyük avantajları arasında helikopterin düşük maliyeti ve hızlı ve kolay kullanımı46. Bununla birlikte, doku helikopterleri morfolojik değişikliklere ve hücre ölümüne neden olan mekanik strese neden olur47. Buna karşılık, vibratom oldukça pahalı bir makinedir ve dilim hazırlama süresi önemli ölçüde artar ve bu da dilimin kalitesi üzerinde bir etkiye sahip olabilir. Bununla birlikte, vibratom genellikle dilimleri dokudan ayırmak için daha yumuşak bir şekilde sunar ve beynin tüm izolasyon prosedürü boyunca güzelce soğutulmasını ve oksijenlenmesini sağlar, böylece dilim özelliklerini geliştirir46. Bu nedenle, birkaç grup bu tekniği standart olarak kullanmaktadır ve vibratom16,30,48 kullanılarak akut hipokampal beyin dilimlerinin hazırlanması için protokollergetirmiştir. Bazı protokoller dilimlemenin kendisi için sadece birkaç ayrıntı sağlarken, bunun yerine bu tür dilim hazırlığının belirli bir uygulamasına odaklanır48, diğerleri bu maddede verilen kesme düzlemi veya diğer protokol ayrıntılarında (örneğin, agarose gömme veya dilimleme / kurtarma çözümleri) farklılık gösteren ayrıntılı dilim protokolleri sağlar27,30.
Burada açıklanan protokol, genç hayvanlardan yüksek kaliteli akut yatay hipokampal fare beyin dilimleri hazırlamak için basit bir yöntem sunar. Protokol, entorhinal korteksten hipokampus8,49,50'ye kadar projelenen hipokampal giriş yolunu sunan perforant yolu (medial ve lateral) korumak için özellikle yararlıdır. Sagittal, koronal ve izole hipokampus enine dilim preparatları, çoğunlukla entorhinal korteksin Katman II ve V'sinden kaynaklanan ve hipokampus18içindeki çeşitli alanlara projelenen perforant yolu düzgün bir şekilde korumaz. Entorhinal korteksin hipokampusa göre anatomik olarak konumlandırılması nedeniyle, yatay beyin dilimleri, dilim hazırlığı içinde tamamen bozulmamış perforant yol liflerini korumak için bir gerekliliktir31. Ek olarak, yatay dilimleme ideal olarak dentat girusundan hipokampus 9,30,50içindekiCA3nöronlarına kadar projelendirici yosunlu lifleri korur. Bu nedenle, bu hazırlık yöntemi hipokampal giriş yollarını ve DG ile ilgili süreçleri araştıran çalışmalar için yüksek değerlidir. Ek olarak, bu protokol Schaffer teminat yolunun araştırılmasına izin verir50. Bununla birlikte, sagittal ve koronal beyin dilimi preparatları, CA3 ila CA1 lif projeksiyonları araştırılırken, muhtemelen yüksek kaliteli dilimler elde etme şansını artırabilecek biraz daha hızlı hazırlık süreleri nedeniyle daha yaygın olarak kullanılmaktadır. Bununla birlikte, yatay hipokampal dilim preparatları, tek dilim yarımküre içindeki tüm hipokampal lif yollarının korunmasına ve araştırılmasına izin verdiğinden güçlü bir araştırma aracı sunar. Bu, özellikle devre yanıtları incelendiğinde, örneğin çoklu elektrot tahlil kayıtlarında yararlı olabilir.
Beyin dilimleri hazırlanırken önemli bir endişe, beyin dokusunun uygun şekilde korunmasıdır. Bu, hızlı bir diseksiyon, dokunun sürekli ve yeterli oksijenlenmesi ve soğutulması ve düşük sodyumlu, yüksek sakkaroz dilimleme çözeltisi39,51ile koruyucu kesme yöntemi kullanılarak beyin dokusunun korunması dahil olmak üzere protokolümüzdeki birkaç kritik adımla gerçekleştirilir. Burada açıklanan protokolün % 90 civarında bir başarı oranı vermesine rağmen, yaşlı veya genetik olarak çeşitli hayvanlardan elde edilen dokularla çalışırken veya belirli bir hücre popülasyonu korunmaya çalışırken potansiyel olarak ek koruyucu adımlar gerekebilir. Hassas beyin dokusu preparatlarını korumak için çeşitli yöntemler zaten bildirilmiştir. Bu yöntemler arasında sodyum geçirgenliğini azaltmak için NMDG bazlı dilimleme çözeltilerinin kullanılması52, NMDA reseptör aktivitesini engellemek için dilimleme çözeltisinde yüksek magnezyum seviyelerinin kullanılması53ve kurtarma süresi boyunca koruyucu çözeltilerin uzun süreli kullanımı23. Tüm bu önlemler eksotoksisitenin azalmasına neden olacaktır. Ek olarak, buz gibi koruyucu ACSF çözeltileri ile trans-kardiyak perfüzyon genellikle yaşlı hayvanlarla çalışırken kullanılır ve gereklidir27.
Akut hipokampal beyin dilimleri, nispeten kalın (300-500 μm) akut beyin diliminden elde edilebilen ve yüksek sinyalden gürültü oranı11'igaranti eden yüksek genlik sinyalleri gibi nedenlerle elektrofizyolojik çalışmalar için idealdir ve yaygın olarak kullanılır. Standart olarak kullanılan elektrofizyolojik uygulamalar arasında hücre dışı alan kayıtları ve gerilim veya akım kelepçe modunda hücre içi tam hücre kayıtları bulunur. Yüksek kaliteli elektrofizyolojik veriler elde etmek için, dilim sağlığı birincil endişe kaynağıdır ve sunulan protokole kesinlikle uyularak garanti edilebilir. Bununla birlikte, dilim preparatları son derece hassas bir teknik sunduğundan, her deney başlamadan önce rutin olarak bir kalite kontrolü eklenmelidir. Çeşitli parametreler dilimin kalite kontrolü olarak kullanılabilir ve standart olarak Giriş-Çıkış eğrileri ve temel fEPSP veya EPSC kayıtları19ile değerlendirilir. Bununla birlikte, yetersiz elektrofizyolojik özelliklerin elektrot konumlandırma, oryantasyon ve hatta hasar gibi deneysel hatalardan kaynaklanabileceği ve sadece hazırlanan dilimin sağlığını temsil etmediğini belirtilmelidir. Bu nedenle, basit görselleştirme ve hücrelerin 40x amaç veya DAPI çekirdeği boyama altında değerlendirilmesi gibi ek kalite kontrollerinin yapılması önerilir. Bu tür kalite kontrolleri, birkaç dilim hazırlama oturumu boyunca sabit dilim sağlığını onaylamak için kullanılabilir.
Kalsiyum mikroflüorimetrisi hipokampal beyin dilimlerini incelemek için daha az kullanılan bir teknik sunar. Bununla birlikte, bu teknik, nöronal ve sinaptik sinyalizasyonda yüksek öneme sahip hücre içi kalsiyum akılarını görselleştirmeye ve ölçmeye izin verdiği için standart hücre dışı ve hücre içi elektrot kayıtlarına ek değerdedir. Hücre içi kalsiyum konsantrasyonlarındaki değişiklikler nörotransmitter vezikül salınımı, postsinaptik potansiyel nesil, sinaptik plastisitenin düzenlenmesi ve aksonal sinir iletiminde rol oynar54,55,56. Bu tekniğin bir örneği olarak (Şekil 4), piyasada bulunan bir kalsiyum boyası kullandık. Tartışmasız, doku dilimlerinin kalsiyum boyalarla tedavisi, daha yüksek deneysel zaman diliminin yanı sıra alt konumdaki nöronal hücrelerin verimsiz yüklenmesi gibi zorluklar doğurabilir. Bununla birlikte, bu teknik teknik üzerindeki varyasyonlar bu teknik zorlukları atlatmak için kullanılabilir. Örneğin, kalsiyum ölçümlerini ve yama kelepçe kayıtlarını hipokampal dilimlerde birleştirmek mümkündür. Bu şekilde, bir kalsiyum floresan boyası yama pipet aracılığıyla belirli bir hücreye yüklenebilir ve belirli bir ilgi hücresindeki kalsiyum dinamiklerinin ölçülebilmesini sağlar57. Alternatif olarak, kalsiyum göstergesini ifade eden genetik olarak tasarlanmış hayvanlar, GCaMP58, tüm beyinde veya hücreye özgü bir promotör tarafından yönlendirilebilir. İlginçtir ki, GCaMP hayvanlarından gelen ve ilgi çekici bir proteine doğrudan bağlantı sağlayan beyin dokusu, nöronal ekspresyon modelini belirlemek veya kalsiyum kıvılcımlarına ve dalgalarına katılımı araştırmak için fırsatlar sağlayabilir.
Tamamen, elektrofizyolojik ve görüntüleme kayıtları için farelerden sağlıklı ve uygulanabilir yatay hipokampal beyin dilimlerinin başarılı bir şekilde hazırlanması için kılavuzlar sunuyoruz. Bu metodoloji, dentat girusunda tanımlanan beyin patolojilerinde meydana gelen nörolojik değişikliklere erişmek için çok yararlıdır.