Burada açıklanan yöntemler, operasyonel olarak deniz lipitleri olarak tanımlanan maddelerle ilgilidir. Bu tanım, polar olmayan organik çözücülerde sıvı-sıvı ekstraksiyonuna uygun olmalarına dayanır ve su matrislerindeki diğer maddelerden ayrılmaları için uygun bir yöntem sağlar. Hidrofobik doğaları, deniz suyundan veya biyolojik örneklerden izole edilmelerini, zenginleşmelerini ve tuz ve proteinlerin uzaklaştırılmasını kolaylaştırır.
Lipit içeriğinin ve deniz organizmalarındaki bileşiminin ölçülmesi, on yıllardır gıda ağı ekolojisi, su ürünleri beslenmesi ve gıda biliminde büyük ilgi çekmektedir. Lipitler, canlı organizmalarda evrensel bileşenlerdir, hücre zarlarında temel moleküller olarak hareket eder, biyoyararlanımlı enerjinin ana kaynakları olarak, ısı yalıtımı ve yüzdürme sağlar ve sinyal molekülleri olarak hizmet eder. Diğer alanlarda lipit belirleme prosedürleri iyi tanımlanmış olsa da, deniz örnekleriyle kullanımları genellikle alan koşullarına ve örnek tip1'euyum sağlamak için değişiklik gerektirir.
Deniz suyu numuneleri için, ilk adım genellikle normalde filtrasyon yoluyla operasyonel olarak tanımlanmış 'çözünmüş' ve 'partikül' fraksiyonlara ayrılmayı gerektirir (Protokol adım 1). Partikül fraksiyonu filtre tarafından tutulan şeydir ve gözeneklerin boyutu kesme2'yitanımlamada önemlidir. Genellikle partikül madde örneklemesi yaparken, lipit konsantrasyonlarını toplam kütle konsantrasyonlarıyla ilişkilendirmek isteriz, bu durumda bu amaç için ayrı, daha küçük, örnek (örneğin, 10 mL) alınmalıdır (Protokol adım 1, not). Doğru bir kütle tayini elde etmek için filtrasyonun sonuna amonyum format (35 g/L) eklemek önemlidir.
Daha büyük numuneden elde edilen deniz suyu filtratı, numune tipine bağlı olarak 250 mL ile 1 L arasında olmalıdır ve ayrık bir hunide sıvı-sıvı ekstraksiyona tabi tutulur (Protokol adım 2). Lipitlerin hidrofobik doğası, kloroform gibi kutupsal olmayan bir çözücüde ekstraksiyon ile diğer bileşiklerden ayrılabilecekleri anlamına gelir. Suda çözünür bileşenler sulu tabakada kalırken lipitlerin organik tabakaya bölündüğü iki katmanlı bir sistem oluşturulur.
Bir filtre üzerindeki partikül numuneler veya biyolojik numuneler, kloroform içeren değiştirilmiş bir Folch ve ark. ekstraksiyonu3ile çıkarılır (Protokol adım 3). Yine, lipitlerin organik faza bölündüğü, suda çözünür moleküllerin sulu fazda kaldığı ve proteinlerin çöktüğü organik/sulu bir sistem oluşturulur. Aslında, katılar için, çoğu laboratuvar kloroform ve metanol içeren Folch ve ark. ekstraksiyon3 prosedürünün bazı varyasyonlarını kullanır. Filtreler için ilk adım 2 mL kloroform ve 1 mL metanol homojenize etmektir.
Ekstraksiyon sırasında, ester bağı hidrolizini veya karbon-karbon çift bağ oksidasyonunu azaltmak için numuneleri ve çözücüleri buz üzerinde tutarak lipitleri kimyasal veya enzimatik modifikasyondan korumaya özen edilmelidir. Dokular ve hücre lipitleri doğal antioksidanlar ve bölümlere ayırma ile oldukça iyi korunur4; bununla birlikte, örneklerin homojenizasyonunu takiben, hücre içeriği, lipitleri kimyasal veya enzimatik olarak değişime daha fazla atılır. Çoğu sterol gibi bazı lipitler çok kararlıdır, çoklu doymamış yağ asitleri içerenler gibi diğerleri ise kimyasal oksidasyona daha duyarlıdır. Konjuge çift bağlı steroller gibi diğerleri, ışık5ile katalİze edilen oksidasyona eğilimlidir. Ekstraksiyonlardan sonra, lipitler kimyasal oksidasyona karşı çok daha hassastır ve numuneler azot gibi inert bir gaz altında saklanmalıdır. Özleri konsantre etmek için yumuşak bir azot akışı da kullanılır.
Konsantrasyondan sonra, lipitler normalde karbonhidrat ve proteinlerin kJ / g'sinden daha fazla, yüksek konsantrasyonda enerji sağlayan deniz ekosistemlerinin önemli bir bileşeni oldukları için toplu olarak ölçülür. Her zaman bireysel bileşenler olarak ölçülecektir: lipitlerin kapsamlı analizi genellikle kimyasal doğalarına göre daha basit kategorilere ayrılmayı içerir. Bu nedenle, tam bir analiz toplam lipitlerin, lipit sınıflarının ve bireysel bileşiklerin ölçülmesini içerir.
Total lipit, kromatografi ile ayrılmış bireysel ölçülen lipit sınıflarının toplamı alınarak belirlenebilir6. Bir deniz lipit özü biyojenik ve antropojenik kaynaklardan bir düzineden fazla sınıf içerebilir. Lipid yapılarının çok çeşitliliği, yapıların bireysel gruplandırmalarının belirlenmesiyle çok fazla bilgi kazanılması anlamına gelir. Lipid sınıfları bireysel olarak veya belirli gruplarda, belirli organizma türlerinin varlığının yanı sıra fizyolojik durumlarını ve aktivitelerini belirtmek için kullanılmıştır2. Ayrıca, çözünmüş organik madde (DOM) ve hidrofobik kirleticiler de dahil olmak üzere organik malzemenin kökenlerinin bir göstergesi olarak kullanılmıştır.
Triyasikalseroller, fosfolipidler ve steroller daha önemli biyojenik lipit sınıfları arasındadır. İlk ikisi biyokimyasal olarak ilişkilidir, çünkü iki veya üç yağ asidinin estere olduğu gliserol omurgasına sahiptirler (Şekil 1). Triacylglycerols, balmumu esterleri ile birlikte çok önemli depolama maddeleridir, diyalsikalseroller, serbest yağ asitleri ve monoacylglycerols gibi diğer yağ asidi içeren lipit sınıfları genellikle küçük bileşenlerdir. Doymamış olanlar toksik olabileceği için, canlı organizmalarda daha düşük konsantrasyonlarda serbest yağ asitleri bulunur7. Steroller (hem özgür hem de esterleşmiş formlarında) ve yağlı alkoller de daha az polar lipitler arasında yer alırken, glikolipidler ve fosfolipidler polar lipitlerdir. Polar lipitler, hücre zarlarında bulunan lipid bilayerlerinin oluşumunu sağlayan hidrofilik bir gruba sahiptir. Serbest steroller aynı zamanda membran yapısal bileşenleridir ve triyasiller oranında alındığında, yaygın olarak kullanılan bir durum veya beslenme indeksi (TAG : ST) sağlarlar8. Fosfolipidlere (ST : PL) oranla alındığında, tuza karşı bitki hassasiyetini belirtmek için kullanılabilirler: daha yüksek değerler yapısal bütünlüğü korur ve membran geçirgenliğini azaltır9. Bu oranın tersi (PL : ST) sıcaklık adaptasyonu sırasında bivalve dokularda çalışılmıştır10.
Deniz lipid sınıfları silika jel kaplı çubuklar üzerinde ince katmanlı kromatografi (TLC) ile ayrılabilir (Protokol adım 4) ve daha sonra otomatik bir FID tarayıcıda alev iyonizasyon tespiti (FID) ile tespit edilebilir ve ölçülebilir. TLC/FID, küçük örneklerden sinoptik lipit sınıfı verilerini hızla sağladığı için ve tüm sınıfların toplamını alarak, toplam lipitler için bir değer olan deniz numuneleri için rutin olarak kullanılır hale gelmiştir. TLC/FID kalite güvence (QA) değerlendirmesine tabi tutulmuştur ve tutarlı harici kalibrasyon, düşük boşluklar ve hassas çoğaltma analizi11için gerekli standartları karşılar. Değişim katsayıları (CV) veya göreli standart sapmalar% 10 civarındadır ve FID tarayıcı toplam lipid verileri normalde gravimetrik ve diğer yöntemlerle elde edilenlerin yaklaşık%90'ıdır 2. Gravimetri, FID tarayıcısının yalnızca uçucu olmayan bileşikleri ölçmesi ve ayrıca lipid olmayan malzemenin gravimetrik ölçümlere dahil edilmesinin olası bir sonucu olarak daha yüksek toplam lipitler verir.
Lipid sınıf analizi tarafından sağlanan bilgiler, özellikle yağ asitlerinin birey veya sterol veya ikisi olarak belirlenmesiyle birleştirildiğinde yararlıdır. Bu analizlere yönelik ilk adım, lipit özlerindeki sterollerle birlikte tüm bileşen yağ asitlerinin salınır (Protokol adım 5). Çok çeşitli lipit yapıları ve işlevleri, ekosistem sağlığını ve antropojenik ve karasal girdilerden ne ölçüde etkilendiklerini değerlendiren ekolojik ve biyojeokimyasal çalışmalarda geniş kullanım gördükleri anlamına gelir. Diyet değeri olan maddelerin deniz faunasına biyosentezini ölçmek ve su örneklerinin kalitesini belirtmek için kullanılmıştır. Tortu çekirdek örneklerinde lipitlerin ölçülmesi, tortuların kara-deniz marjına yakın insan arazisi kullanımındaki değişikliklere duyarlılığını göstermeye yardımcı olur.
Bireysel lipit bileşiklerini tanımlamak ve ölçmek için birincil araç geleneksel olarak FID ile gaz kromatografisi (GC) olmuştur. Ancak analizden önce, bu bileşikler türetme ile daha uçucu hale getirilir. Yağ asitleri, akil lipit sınıflarından asidik bir katalizör (H2SO4)varlığında salınır (Şekil 1). Organik kimyada, akil grubu (R-C=O) genellikle karboksilik asitten (R-COOH) türetilir. Daha sonra GC sütunlarında daha iyi ayrımlar sağlayan yağ asidi metil esterlerine (FAME) yeniden esterlenirler (Protokol adım 5).