RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
tr_TR
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Burada, CRISPR / Cas9 tabanlı genom düzenlemesi yoluyla genomlarını değiştirmek veya germline dönüşümü yoluyla işaretli transpoze edilebilir elementlerin eklenmesi amacıyla hücre öncesi mısır planthopper embriyolarının toplanması ve mikroenjekte edilmesi için protokoller bulunmaktadır.
Mısır planthopper, Peregrinus maidis, bir mısır zararlısı ve birkaç mısır virüsünün bir vektörüdür. Daha önce yayınlanmış yöntemler, P. maidis'te RNA girişiminin (RNAi) çift sarmallı RNA'ların (dsRNA'lar) nimflere ve yetişkinlere mikroenjeksiyonu yoluyla tetiklenmesini tanımlamaktadır. RNAi'nin gücüne rağmen, bu teknikle üretilen fenotipler geçicidir ve uzun süreli Mendel kalıtımından yoksundur. Bu nedenle, P. maidis alet kutusunun, kararlı mutant suşların üretimini sağlayacak fonksiyonel genomik araçları içerecek şekilde genişletilmesi ve araştırmacıların bu ekonomik açıdan önemli haşere üzerinde yeni kontrol yöntemleri getirmeleri için kapıyı açması gerekmektedir. Bununla birlikte, RNAi için kullanılan dsRNA'ların aksine, CRISPR / Cas9 tabanlı genom düzenleme ve germline transformasyonunda kullanılan bileşenler hücre zarlarını kolayca geçmez. Sonuç olarak, plazmid DNA'ları, RNA'lar ve / veya proteinler, embriyo hücreselleşmeden önce embriyolara mikroenjekte edilmelidir, bu da enjeksiyonun zamanlamasını başarı için kritik bir faktör haline getirir. Bu amaçla, embriyoların P. maidis dişilerinden nispeten kısa aralıklarla toplanmasını sağlamak için agaroz bazlı bir yumurta bırakma yöntemi geliştirilmiştir. Burada, CRISPR bileşenlerine sahip hücre öncesi P. maidis embriyolarının (kılavuz RNA'larla kompleksleştirilmiş Cas9 nükleazı) toplanması ve mikroenjekte edilmesi için ayrıntılı protokoller sağlanmıştır ve beyaz bir P. maidis göz rengi geninin Cas9 bazlı gen nakavtının sonuçları sunulmaktadır. Her ne kadar bu protokoller P. maidis'te CRISPR / Cas9-genom düzenlemesini tanımlasa da, enjeksiyon çözeltisinin bileşimini değiştirerek germline dönüşümü yoluyla transgenik P. maidis üretmek için de kullanılabilirler.
Mısır planthopper, Peregrinus maidis, mısırın ekonomik açıdan önemli bir zararlısıdır 1,2,3. Hem delici emici ağız kısımlarıyla beslenirken hem de üreme sırasında embriyolarını doğrudan bitki dokusuna bıraktıklarında bitkiye doğrudan fiziksel zarar verirler 2,4. Mahsullere doğrudan zarar veren çoklu yollara rağmen, bu böceklerin mahsul sağlığı üzerindeki en büyük etkisi, mısır mozaik virüsü (MMV) ve mısır şerit virüsü 5,6'nın vektörü olarak hareket ederek dolaylıdır. MMV, P. maidis vektörünün gövdesinde çoğalma yeteneğine sahiptir ve virüsün yaşamlarının tamamı boyunca bireysel böceklerde kalmasına izin verir, böylece virüsü yeni konakçı bitkilere yaymaya devam edebilirler 7,8. P. maidis'i ve dolayısıyla vektörleştirdiği virüsleri kontrol etmek için en yaygın yöntemler insektisitlerdir.
Ne yazık ki, bu ürünlerin yanlış yönetilmesi, hedef haşere içinde direnç gelişmesine ve çevrenin kirlenmesine neden olmuştur9. Bu nedenle, bu böcek/virüs-haşere kombinasyonundan kaynaklanan ürün kayıplarını azaltmak için yeni stratejilere ihtiyaç vardır. Önceki çalışmalar, RNA girişiminin (RNAi) P. maidis için etkili bir kontrol yöntemi olabileceğini, çünkü çift sarmallı RNA'yı (dsRNA) yutarken bile gen ekspresyonunda aşağı regülasyona duyarlı olduklarını göstermiştir10. Bununla birlikte, dsRNA'yı sahada yönetmenin en etkili yolu, böceklerin beslendiği bitkiler aracılığıyla olacaktır; Bu nedenle, mahsuller böceklerin zaten taşıdığı herhangi bir virüse karşı hala duyarlı olabilir. CRISPR / Cas9 genom düzenlemesinin ortaya çıkmasıyla, bir haşere popülasyonunun boyutunu azaltmak veya söz konusu popülasyonu vektörleştirdikleri virüslere dirençli bireylerle değiştirmek için kullanılabilecek Cas9 tabanlı gen sürücüsü11,12 de dahil olmak üzere yeni haşere kontrol stratejileri mümkündür.
Bununla birlikte, her türlü gen tahrik sisteminin geliştirilmesi ve konuşlandırılması, transgenik tekniklerin geliştirilmesini gerektirecektir. Bu tür yöntemler P. maidis'te RNAi deneylerini gerçekleştirmek için gerekli değildi, çünkü dsRNA'ların ve / veya siRNA'ların, RNAi'nin P. maidis10,13'teki etkinliği nedeniyle hücre zarlarını geçebildiği varsayılmaktadır. Bu, geleneksel transgenezde veya Cas9 tabanlı gen düzenlemede kullanılan DNA'lar ve / veya proteinler için geçerli değildir; bunlardan herhangi biri, bir gen sürücüsü taşıyan böceklerin yaratılmasının öncüsü olacaktır. Gen düzenlemeyi veya diğer germline transformasyon formlarını gerçekleştirmek için, bu DNA'lar ve proteinler, sinsityal blastoderm aşamasında, böcek embriyosunun hücreselleşmesinden önce ideal olarak embriyolara mikroenjekte edilir. Zamanlama kritiktir, çünkü sinsityal aşama gelişimin en erken kısmıdır14,15. P. maidis dişileri tercihen yumurtalarını bitki dokusuna bıraktıklarından, mikroenjeksiyonlar için yeterli miktarda hücre öncesi embriyonun çıkarılması emek yoğun ve zaman alıcı olabilir. Bu nedenle, hücreselleşmeden önce P. maidis embriyolarını hızlı bir şekilde toplamak ve mikroenjekte etmek için yeni teknikler geliştirilmiştir.
1. P. maidis yetişkinlerinin koloni düzeyinde yetiştirilmesi
2. Agaroz bazlı yumurtlama odası
3. Yüksek nemli bir ortamda embriyo toplanması ve hizalanması
4. CRISPR reaktiflerinin ve enjeksiyon iğnelerinin hazırlanması
5. Mikroenjeksiyon ve enjeksiyon sonrası bakım
6. Embriyoların kuluçkalanması ve kuluçkalanması
Yumurtlama odası, P. maidis dişilerinin, yumurtalarının kolayca geri kazanılabileceği koruyucu bir ortamda yumurtlarken beslenmelerini sağlamak için özel olarak tasarlanmıştır. Bu yöntem kullanılarak, DNA, RNA ve / veya proteinlerle mikroenjeksiyon için yeterli miktarda hücre öncesi embriyo geri kazanıldı. Yetişkin P. maidis dişileri genellikle mısır bitkilerinin yaprak dokusunun içine yumurta bırakır, bu da kısa sürede yeterli miktarda yumurta almayı zorlaştırır, çünkü çok fazla yaprak diseksiyonu gerektirir. Yapay yumurtlama ortamı bu sorunların üstesinden gelmek için bir çözüm sunar. Tablo 1'de gösterildiği gibi, 4 haftada toplam 645 dişiden 6.483 yumurta toplanmıştır. Dişiler genellikle 2. günden sonra yumurta bırakmaya başlar ve 4. günden 6. güne kadar çoğu yumurta sağlar. Yumurtlama aktivitesi 9. günde yavaşladı. Her yumurtlama odası Cuma günü kuruldu ve Pazar gününden bir sonraki Pazar gününe kadar yumurta olup olmadığı kontrol edildi. Bu programı takiben, çoğu yumurtanın çalışma haftası boyunca mikroenjeksiyonlar için toplanmasına izin verildi.
Bu yumurtlama sisteminin ilk pratik uygulaması, Cas9 aracılı gen nakavtının etkinliğini, göz rengi geninin P. maidis ortoloğunu, beyaz (Pmw) bir hedef olarak kullanarak test etmekti. Beyazdaki mutasyonların diğer böcek türlerinde önemli ölçüde göz pigmentasyonu kaybına neden olduğu bilinmektedir ve Beyaz hücre özerktir ve enjekte edilen bireylerde mutasyonların tespit edilmesine izin verir16,17. Küçük bir mutasyonun bile fonksiyon kaybına neden olma olasılığını artırmak için, kılavuz RNA'lar, Beyaz fonksiyon16 için gerekli olan ATP bağlama kaseti bölgesinde kesmek üzere tasarlanmıştır. P. maidis embriyolarına ya fenol kırmızısı (enjeksiyon tamponu), 800 ng/μL (Cas9 kontrolü) nihai konsantrasyonda Cas9 enjeksiyon tamponu veya enjeksiyon tamponuna Cas9 enjekte edildi ve her biri 400 ng/μL konsantrasyonda eklenen üç kılavuz RNA ile birlikte enjekte edildi. Bir enjeksiyon karışımı içindeki üç kılavuzun kombinasyonu, hem büyük bir silme oluşturarak hem de herhangi bir kılavuzun kesim için etkisiz olabileceği olasılığını telafi ederek mutant üretme şansını en üst düzeye çıkarmayı amaçlıyordu. Her tedavi için gelişim oranları karşılaştırılabilir düzeydeydi (Tablo 2), enjekte edilen bireylerin% 50-60'ı gelişim belirtileri gösteriyordu. Tampon ve Cas9 kontrolleri için tarama hızları da karşılaştırılabilirdi; Bununla birlikte, üç kılavuzlu karışımı alan bireylerin tarama oranları nispeten daha düşüktü. Şu anda, azalan sağkalımın beyaz fonksiyon kaybının sonucu mu yoksa hedef dışı etkiler gibi üç kılavuzlu karışımın istenmeyen sonuçlarının sonucu mu olduğu belirsizdir (tartışma bölümüne bakınız). Bununla birlikte, göz pigmentasyonunun tamamen kaybı olan bireylerin hiçbiri (yani tam nakavt) yumurtadan çıkmadı ve enjekte edilen bireylerin soylarının hiçbirinin beyaz gözleri yoktu. Cas9 bazlı mutajenezin hedefteki etkinliği iki şekilde doğrulandı. İlk olarak, enjekte edilenler göz pigmentasyonu kaybı açısından tarandı.
Gelişen 71 kılavuz enjeksiyonlu bireyden 23'ü bir dereceye kadar pigment kaybı gösterdi (Şekil 10) ve bu bireylerin 9'u yumurtadan çıktı ve% ≥32'lik bir nakavt oranıyla sonuçlandı. Her iki kontrol tedavisinde de göz pigmenti kaybı gözlenmedi. İkincisi, kromozomal mutasyonlar polimeraz zincir reaksiyonu (PCR)18 ve dizileme19 ile doğrulandı. Mutant bir çizgi geri kazanılamadığından, genomik DNA, üç kılavuzlu karışım veya tampon ile enjekte edilen embriyo havuzlarından analiz edildi. Üç kılavuzlu karışımın beyaz lokustan ~ 180 baz çiftini çıkarması bekleniyor. Bu, enjekte edilen bireylerden izole edilen genomik DNA'dan çoğaltılan PCR ürünlerinde ve bu ürünlerden üretilen ilişkili sekans verilerinde görülebilir (Şekil 11). Bu kombine kanıt, embriyoların hücreselleşme gerçekleşmeden önce enjekte edildiğini göstermektedir.

Resim 1: Aspiratör. Etkili bir aspiratör, girişte bir vakum pompasının, plastik boru aracılığıyla, 15 mL'lik plastik bir konik tüpe bağlanmasından monte edilebilir. Konik tüpün dibinden yaklaşık 0,5 cm dikkatlice çıkarılmalıdır. P. maidis yetişkinlerini toplanırken yakalamak ve vakum pompasından uzak tutmak için konik tüpe plastik borunun açıklığı üzerine bir pamuk topu yerleştirilmelidir. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 2: Yetişkin kapların yapımı. (A) Gerekli malzemeler (sol üstten saat yönünde): ekran, sıcak tutkal tabancası, tıraş bıçağı, 1 oz kap. (B) 1 oz kabın dibinde büyük bir delik açılmalı ve bu deliği kapatacak kadar büyük bir ekran karesi kesilmelidir. (C) Ekran daha sonra sıcak tutkal kullanılarak deliğin üzerine yapıştırılır. (D) Tutkal ayarlandıktan sonra, fazla ağ çıkarılmalıdır. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 3: P. maidis yetişkinlerinin cinsiyeti. Erkek (solda) ve dişi (sağda) P. maidis yetişkinlerinin ventral tarafları gösterilmiştir. Kadın karnının üzerinde görülebilen ovipozitör, bir bireyin cinsiyetinin en açık göstergesidir. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 4: Yetişkinlerin kaplara kapatılması . (A) 5 cm x 5 cm kare plastik parafin balmumu filmi. (B) Film, orijinal boyutunun 3-4 katına kadar eşit şekilde gerilmelidir. (C) Yetişkinler yetişkin kabına konduktan sonra, gerilmiş film yetişkinleri sabitlemek için açıklığın üzerine yerleştirilmelidir. Daha sonra filmin üzerine 'luk 'luk bir 400 μL'lik bir damla yerleştirilmelidir. (D) Yetişkinler için yeterli beslenme basıncını sağlamak için, ikinci bir 5 cm x 5 cm kare plastik parafin film benzer şekilde gerilmeli ve sakkaroz damlasının üzerine yerleştirilmelidir. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 5: Bir yumurtlama odası kurmak. (A) İhtiyaç duyulan malzemeler (sol üstten saat yönünde): plastik ambalaj, tamamlanmış bir yetişkin kabı (yetişkinlerle birlikte) ve% 1 agarozlu bir Petri kabı (yumurtlama ortamı). (B) Yetişkin kap, doğrudan yumurtlama ortamına yerleştirilen plastik parafin film/ sakkaroz 'sandviç' ile agarozun üzerine yerleştirilmelidir. (C) Yetişkin kabı yumurtlama ortamına sabitlemek için plastik ambalaj kullanılır. Bu, ortamın çok çabuk kurumasını önler. (D) Hava değişiminin devam edebilmesi için yetişkin kabın ekranının örtülmemesine özen gösterilmelidir. (E) Yumurtlama odasının diyagramı. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Resim 6: Nemlendirilmiş başlık. Hava akımlarını en aza indirmek ve embriyolar işlenirken nemi korumak için enjeksiyon kapsamının etrafına nemlendirici ile donatılmış bir başlık yerleştirilmiştir. Kanatlar, uygun nem seviyelerinin korunmasına yardımcı olmak için işçi yerleştirildikten sonra girişin üzerine katlanabilir. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 7: Enjeksiyonlara hazırlık aşamasında embriyoların toplanması . (A) Yumurtlama ortamında biriktirilen embriyolar. Embriyoları ortamdan çıkarmak ve yüzeyine yerleştirmek için bir çift ince forseps kullanılır. (B) 22 mm x 30 mm'lik bir kapak kayması üzerinde 1 mm x 15 mm çift taraflı banttan oluşan dar bir şerit. (C) Embriyoların ortamın yüzeyinden kapak kayması üzerindeki banda aktarılmasını kolaylaştırmak için örtü kayması, yumurtlama ortamına yerleştirilebilir. (D) P. maidis embriyoları muz şeklindedir, bir ucu diğerinden daha dardır (dar uç kırmızı ok başı ile gösterilir; daha geniş uç örnek embriyoda sarı ok başı ile gösterilir). Embriyonun geniş ucu bant üzerine yerleştirilmelidir. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 8: Enjeksiyon . (A) Enjeksiyon platformu, ağzına kadar %1 agar ile doldurulmuş bir Petri kabıdır. Embriyoları tutan bir bant şeridi ile kapak kayması, doğrudan enjeksiyon platformunun yüzeyine yerleştirilmelidir. (B) Enjeksiyon basıncı, embriyolara bir damla suya az miktarda enjeksiyon çözeltisi 'enjekte edilerek' enjekte edilmeden önce test edilmelidir. Bu yöntem, iğneyi tıkanıklıklara karşı kontrol etmek için enjeksiyon işlemi sırasında herhangi bir zamanda da kullanılabilir. (C) İğne embriyonun daha büyük ucuna sokularak embriyolara enjekte edilmelidir. Enjeksiyon başarılı olduysa enjeksiyon çözeltisi görünür olmalıdır. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 9: Enjeksiyon sonrası bakım . (A) Bir kapak kapağındaki tüm embriyolar enjekte edildikten sonra, kapak kayması% 1 agaroz içeren taze bir Petri kabına yerleştirilmelidir. (B) Kapak kaymalı Petri kabı daha sonra embriyolar yumurtadan çıkana kadar bir nem odasında (gösterildiği gibi) tutulabilir. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 10: Pmw nakavt fenotipi. (A) Yaşa uygun kontrol ve (B) Pmw nakavt embriyoları, gelişmekte olan gözler siyah ok uçlarıyla gösterilir. B'deki embriyo mozaiktir, çünkü küçük bir pigmentasyon şeridi görülebilir. (C) Yaşa uygun kontrol ve (D) Pmw nakavt yavruları, gözlerde farklı bir açı gösteren iç kısımlar. D'deki yavru da mozaiktir. Beyaz bir ok, ana resimde pigmentasyon kaybını gösteren bir alana işaret eder. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 11: Pmw nakavt sırası. (A) Pmw mRNA'nın 500-bp'lik artışlarla işaretlenmiş, gRNA bağlanma bölgelerinin yerleri belirtilmiş olarak ölçeklendirilecek modeli: G1, mavi; G2, sarı; G3, pembe. Bu noktada üretilen herhangi bir çerçeve kaydırma mutasyonu, çeviri ürününün çoğunu bozacaktır. (B) gRNA bölgelerinin genomik bağlamı, hepsi tek bir ekzonda (kalın büyük harfle yazılmış metin). Kılavuz bağlama siteleri A ile aynı renklerde vurgulanır ve PAM'lerin altı çizilir. Açıklık ~ 300 bp'dir. Ekzonun çerçeve içi çevirisi yukarıda büyük metinde tek harfli kısaltmalar olarak gösterilmiştir. Göz pigment taşıyıcılarına özgü iki motif işaretlenmiştir. Walker B fonksiyonel alanının CDEPT motifi mor renktedir ve H-loop alanının IHQP motifi yeşil renkte kutulanmıştır. Her iki etki alanı da ATP-taşıyıcı işlevi için kritik öneme sahiptir. (C) Pmw hedef bölgesi iki tur PCR kullanılarak güçlendirildi. İkinci yuvarlak ürün, kılavuzlar arasındaki bölgenin başarılı bir şekilde çıkarılması nedeniyle boyut kayması kanıtı için bir jel üzerinde incelendi. Şeritler: L = 100 bp merdiven; 1 = PCR su kontrolü; 2 = Tampon enjekte edilen yumurtalar; 3-4 = üç kılavuzlu karışımla enjekte edilen iki ayrı yumurta seti. Sadece üç kılavuzlu karışımı alan embriyolar hem WT bandını (kırmızı ok) hem de tam eksizyondan (beyaz ok) kaynaklanan bandı üretti. (D) Alt (beyaz ok) bandın kimliğini doğrulamak için, bu DNA saflaştırıldı, klonlandı ve sıralandı. En üst satır, vahşi tip dizidir. Diğer iki çizgi iki klondan gelen dizilerdir. Üç ek klon alt diziyle eşleşti. Mavi vurgu Kılavuz 1'in bağlama yerini, pembe vurgu ise Kılavuz 3'ün bağlama yerini gösterir. Her iki alelde de, bu iki kılavuz bölge arasındaki tüm bölge silinmiştir. Kısaltmalar: Pmw = Peregrinus maidis beyaz gen; gRNA = kılavuz RNA; PAM = protospacer bitişik motif; ATP = adenozin trifosfat; PCR = polimeraz zincir reaksiyonu; WT = vahşi tip; KO = nakavt. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.
| Ayarlamak | # bardak sayısı | Her fincandaki kadın sayısı # | # yumurta | Toplam # yumurta | |||||||
| 2. Gün | 3. Gün | 4. Gün | 5. Gün | 6. Gün | 7. Gün | 8. Gün | 9. Gün | ||||
| 1 | 10 | 15 | 0 | 26 | 166 | 355 | 530 | 193 | 91 | 37 | 1398 |
| 2 | 15 | 15 | 22 | 238 | 489 | 699 | 520 | 379 | 203 | 58 | 2608 |
| 3 | 8 | 15 | 0 | 57 | 230 | 190 | 116 | 80 | 34 | 1 | 708 |
| 4 | 10 | 15 | 0 | 226 | 446 | 519 | 301 | 179 | 24 | 15 | 1710 |
| Toplam | 43 | 15 | 23 | 547 | 1331 | 1763 | 1467 | 831 | 352 | 111 | 6483 |
Tablo 1: Yapay yumurtlama ortamından temsili yumurta koleksiyonları. Dört set yumurta toplama kabından elde edilen veriler, kurulumdan sonraki ikinci günde başlayan ve dokuzuncu güne kadar devam eden yumurta boyları ile gösterilmiştir.
| Enjeksiyon Tedavisi | Toplam Enjekte Edilen | Toplam Geliştirilmiş | Toplam Yumurtadan Çıkmış | Gelişme Hızı (%) | Tarama Hızı (%) |
| Arabellek | 39 | 20 | 12 | 51 | 31 |
| Cas9 | 39 | 24 | 14 | 61 | 36 |
| Cas9 +Pmw gRNA'lar | 121 | 71 | 28 | 59 | 28 |
Tablo 2: 3 farklı enjeksiyon karışımının enjeksiyonlarından hayatta kalma ve nakavt oranları.
Yazarların açıklayacak hiçbir şeyi yok.
Burada, CRISPR / Cas9 tabanlı genom düzenlemesi yoluyla genomlarını değiştirmek veya germline dönüşümü yoluyla işaretli transpoze edilebilir elementlerin eklenmesi amacıyla hücre öncesi mısır planthopper embriyolarının toplanması ve mikroenjekte edilmesi için protokoller bulunmaktadır.
Kuzey Carolina Eyalet Üniversitesi, Entomoloji ve Bitki Patolojisi Bölümü, DARPA'nın Böcek Müttefikleri Programını destekleyen bir ekibin parçasıdır. İfade edilen görüşler, görüşler ve/veya bulgular yazarlara aittir ve Savunma Bakanlığı veya ABD Hükümeti'nin resmi görüşlerini veya politikalarını temsil ettiği şeklinde yorumlanmamalıdır. Yazarlar birbiriyle çelişen çıkarlar olmadığını beyan ederler. MDL, DR ve AEW projeyi tasarladı ve finansman edinimi, proje yönetimi ve kaynakları sağladı. FC, WK, NG ve MDL, mikroenjeksiyon deneylerini tasarladı ve tasarladı; OH, yumurtlama yöntemini tasarladı ve tasarladı. FC ve WK deneyleri gerçekleştirdi; FC ve WK sonuçları analiz etti; ve FC, WK, NG ve MDL makaleyi yazdı. Yazarlar, Kyle Sozanski ve Victoria Barnett'e P. maidis kolonilerinin korunmasındaki yardımları için özel teşekkürlerini sunmak isterler.
| 1 oz Kaplar | Dart | P100N | Yumurtlama kurulumu için yetişkin kabı |
| 15 mL Konik Tüpler | Olympus | Genesee 28-103 | Vakum aspiratörü kurulumunda toplama tüpü görevi görür |
| 15 mL Konik Tüpler | Olympus | Genesee 28-106 | % 10 sukoroz çözeltisi yapmak ve taramadan önce soğuturken yetişkinleri tutmak için |
| Aspiratör | Bioquip | 1135A | Bitki zararlılarının taşınması için |
| Vakum Aspiratörü | Fischer Teknik | LAV-3 | Daha fazla sayıda böceği aspire etmek için |
| vakum Mavi Spektrum LED Işıklar | Ev Deposu | GLP24FS/19W/LED | Saksı mısır bitkileri için yetiştirme lambaları hazneler |
| Cas9 | TrueCut ile besleniyor Cas9 Protein v2 | A36498 | Bitki zararlısı genlerini kesmek için endonükleaz |
| Şeffaf Vinil Boru | Ev Deposu | 3/8 inç İç Çap x 1/2 inç Dış Çap x 10 ft | Vakum aspiratörü kurulumunda toplama tüpünü pompaya bağlar |
| Mısır bitki zararlıları | Kuzey Carolina Eyalet Üniversitesi | N/A | Dr. Anna Whitfield'ın laboratuvarından talep |
| Pamuk | topları Genessee | 51-101 | Vakum aspiratörü kurulumunda toplama tüpünde filtre/böcek yakalayıcı görevi görür |
| Çift taraflı bant | Scotch Çift Taraflı Bant | NA | Mikroenjeksiyon için yumurta tutma |
| Early Sunglow mısır | Parkı Tohum Şirketi | 05093-PK-N | Bitki zararlıları yetiştirmek için mısır |
| epTIPS Mikro Yükleyici Uçları | Eppendorf | C2554691 | Dolgu iğnesi yükleme uçları |
| Femtojet Mikroenjeksiyon Sistemi | Eppendorf | 5247 | Enjeksiyon basıncını kontrol eder (iğne deliği boyutuna bağlı olarak 12-20 psi) |
| Nutri-Fly Drosophila Agar | Genessee | 66-103 | Yumurtlama tabağı hariç her şey için alt tabaka |
| İnce forseps | Bioquip | 4731 | Yumurta işleme |
| Genel Amaçlı LE Agarose | Apex | 20-102 | Substrat han yumurtlama kabı (yumurtlama ortamı) |
| Kılavuz RNA 1 - GGUUCAUCGCAAAAUAGCAG | Synthego | CRISPRevolution sgRNA EZ Kiti (1,5 nmol) | Bitki zararlısı white gen |
| Kılavuzu, RNA 2 - UCUGAAAUCACUGGCCAAUA | Synthego | CRISPRevolution sgRNA EZ Kiti (1,5 nmol) | Bitki zararlısı beyaz gen Kılavuzunu hedeflemek için RNA |
| kılavuzları RNA 3 - GAGGGCAGAGUCGCUUUCUU | Synthego | CRISPRevolution sgRNA EZ Kiti (1.5 nmol) | Bitki zararlısı beyaz genini hedeflemek için RNA kılavuzları |
| Nemlendirici | Homedics | UHE-CM45 | Nemlendirilmiş davlumbazda nem sağlamak için |
| Nem odası | Billups-Rothenberg | MIC-101 | Enjekte edilen embriyoları yumurtadan çıkana kadar tutmak için |
| Böcek yetiştirme kafesleri | Bioquip (özel sipariş) | 1450 L'ye yakın (plastik ön ve file kumaş yanları vardır) | Mısır üzerinde bitki zararlıları için kafes |
| Lazer Tabanlı Mikropipiette Çektirme | Sutter Aletleri | P-2000/G | Enjeksiyon iğneleri yapmak için / Isı = 700, FIL = 4, VEL = 40, DEL = 170, PUL = 160 |
| Leica M165 FC Floresan Stereomikroskop | Leica | M165 FC | Bitki zararlısı tarama |
| Mikroenjeksiyon Kapsamı | Leica | MZ12-5 | XY aşaması Mikromanipülatör ile donatılmış mikroenjeksiyon kapsamı |
| Narishige | MN-151 | Mikroenjeksiyon iğnesini konumlandırmak için | |
| Mikropipet beveler | Sutter Instruments | FG-BV10-D | Eğim verme enjeksiyon iğneleri için / 20 derecelik açıda kullanılan 'ince' dereceli plaka |
| Mikroskop Aşaması | AmScope | GT100 XY Kayar Tabla | Embriyoları mikroskop altında konumlandırmak ve hareket ettirmek için |
| Minyatür Boya Fırçası | Testor #2 8733 | 3'lü paket halinde satılır 281206 | Embriyo işleme için ince boya fırçaları |
| İğne Tutucu | Narishige | HI-7 | Mikroenjeksiyon iğnesini tutmak için |
| Percival İnkübatör Percival | I41VLH3C8 | Yumurtadan çıkana kadar enjekte edilenlerin yetiştirilmesi | |
| Petri Kapları (100 x 15 mm) | VWR | 89038-968 | Yumurtlama için agar kabı yapımı |
| pGEM-T Kolay Vektör Sistemi I klonlama kiti | Promega | A1360 | Klonlama Pm white hedef bölge |
| Fenol Kırmızı | Sigma | 143-78-8 | Mikroenjeksiyon tamponu |
| Düz Mikroskop Slaytlar veya lamel | Fisher Scientific | 12-549-3 | Mikroenjeksiyon için yumurtaları tutun |
| Plazmid DNA Midi | Kiti Zymo | D4200 | Enjeksiyona hazır plazmit DNA'larının saflaştırılması |
| Plastik parafin filmi | Pechiney Plastik Ambalaj | PM-996 | Rulo boyutu 4 inç x 125 ft |
| Streç film | Glad ClingWrap Plastik Sargı | NA | Tüm yumurtlama haznesini sarın |
| Astar - PmW CRISPR kontrolü F1 - AAGGAATTTCTGGAGGTGAAA | IDT | 25 nmol DNA Oligo | Pm beyaz geni içinde hedef bölge boyunca amplasyon için ilk tur Astar |
| - PmW CRISPR kontrolü R1 - GATTCCTCGCTGTTGGGT | IDT | 25 nmol DNA Oligo | Pm beyaz geni içinde hedef bölge boyunca amplasyon için ilk tur Primer |
| - PmW CRISPR kontrolü F3 - TCACAGACCCTGGTGCTAATC | IDT | 25 nmol DNA Oligo | Pm beyaz geni içinde hedef bölge boyunca amplasyon için İkinci |
| - PmW CRISPR kontrolü R3 - GTCCACAATCCACACTTCTGA | IDT | 25 nmol DNA Oligo | Pm beyaz geni içinde hedef bölge boyunca amplasyon için İkinci Tur Astar |
| Kuvars kılcal damarlar | Sutter Instruments | QF100-50-10 | Mikroenjeksiyon iğneleri yapmak için / OD 1 mm, İç çap 0,7 mm, 10 cm uzunluk |
| Ekran (Beyaz Organze Kumaş) | Joann Kumaşlar | 16023889 | Yetişkin kabını kaplamak için |
| Sparkleen | Fisher Scientific | 04-320-4 | Bulaşıkları yıkayın |
| Sucrose | Fisher Scientific | BP220-1 | % 10 sukoroz çözeltisi yapmak için |