RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
tr_TR
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Yu-Fen Chang1, Wan-Chi Su1, Chih-Chuan Su1, Min-Wen Chung1, Jin Chang2, You-Yi Li3, Yi-Ju Kao3, Wen-Pin Chen3, Matthew J. Daniels4,5,6
1LumiSTAR Biotechnology, Inc., 2NEXEL Co., Ltd., 3Institute of Pharmacology, College of Medicine,National Taiwan University, 4Manchester Heart Centre, Manchester Royal Infirmary,Manchester University NHS Foundation Trust, 5Division of Cardiovascular Sciences, Manchester Academic Health Sciences Centre,University of Manchester, 6Division of Cell Matrix Biology and Regenerative Medicine,University of Manchester
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Mevcut protokol, yüksek verimli ilaç taraması ve toksisite testi için iPSC kaynaklı kardiyomiyositlerde (iPSC-CM'ler) tetiklenen hücresel aktivitenin tüm optik kontrolünü ve gözlemini açıklamaktadır. Zaman ve uzaydaki fenotipik kalıpların multi-parametrik nicelleştirilmesi gösterilmiştir. İlaçların saatler boyunca uzun vadeli etkileri veya günler boyunca sıralı ölçümler gösterilmiştir.
Uyarılabilir hücrelerin sağlık ve hastalıkta nasıl çalıştığını ve bu davranışın küçük moleküller veya genetik manipülasyon tarafından nasıl değiştirilebileceğini anlamak önemlidir. Birden fazla emisyon penceresine sahip genetik olarak kodlanmış kalsiyum göstergeleri (GECI'ler) birleştirilebilir (örneğin, farklı hücre altı olayların eşzamanlı gözlemlenmesi için) veya uyarılabilir hücrelerdeki diğer ışığa bağımlı aktüatörlerle genişletilmiş uygulamalarda kullanılabilir (örneğin, genetik olarak kodlanmış optogenetik kontrolün spektral olarak uyumlu kalsiyum göstergeleriyle birleştirilmesi). Bu tür yaklaşımlar primer veya kök hücre kaynaklı nöronlarda, kardiyomiyositlerde ve pankreas beta hücrelerinde kullanılmıştır. Bununla birlikte, cihazların, analiz yazılımının, gösterge performansının ve gen dağıtım verimliliğinin sınırlamaları nedeniyle bu tür yaklaşımların verimini veya gözlem süresini artırmak zor olmuştur. Burada, yüksek performanslı yeşil GECI, mNeonGreen-GECO (mNG-GECO) ve kırmızıya kaymış GECI, K-GECO, Yüksek İçerikli Görüntüleme Sistemi kullanılarak hücresel aktivitenin tamamen optik kontrolünü ve görselleştirmesini sağlamak için optogenetik kontrol ile birleştirilmiştir. Sağlıklı ve hasta kaynaklı iPSC-CM'ler ile kardiyotoksisite testi ve fenotipik ilaç taramasını gösteren uygulamalar gösterilmiştir. Ek olarak, spektral ve kalsiyum afinite göstergesi varyantlarının (NIR-GECO, LAR-GECO ve mtGCEPIA veya Orai1-G-GECO) kombinasyonlarını kullanan multi-parametrik değerlendirmeler de iPSC-CM modelinde farklı hücresel bölmelerle sınırlıdır.
İnsan kaynaklı indüklenmiş pluripotent kök hücreler (iPSC) türevi modeller, hayvan çalışmaları için belirlenen 3Rs hedeflerine (Değiştirme, Azaltma ve İyileştirme) umut verici bir çözüm olarak kabul edilir 1,2. iPSC türevi kardiyomiyositler, insan biyolojisinin temel yönlerini özetledikleri için hastalık modellemesi ve ilaç keşfi için kullanılmıştır3. Kalsiyum görüntüleme, tipik olarak kimyasal boyalarla, ilaç tedavisinden önce ve sonra hücresel aktiviteyi gözlemlemek için kullanılmıştır 4,5. Bununla birlikte, kimyasal boya bazlı kalsiyum algılayıcı problar Na, K-ATPaz'ı doğrudan inhibe eder ve hücresel fonksiyonu bozar6. Bu nedenle, aynı hücrelerin saatler veya günler boyunca izlenmesi, kimyasal boyalar kullanıldığında sorunlu olmuştur. Burada, genetik olarak kodlanmış bir dizi kalsiyum göstergesi (GECI) 7,8,9,10, uzun süreler boyunca gerçek zamanlı çoklu organel ölçümleri sunan bir kardiyak toksisite test platformu oluşturmak için geniş bir uyarma / emisyon ve kalsiyum afinite spektrumunda kullanılmaktadır 11.
iPSC-CM modelindeki yüksek verimli kalsiyum bazlı tarama konseptini, kırmızıya kaymış bir kalsiyum göstergesinin birlikte ekspresyonu ile optik kontrol ve kalsiyum görüntüleme için genetik olarak kodlanmış araçlar kullanarak daha önce gösterilen akademik bağlamın ötesinde daha da geliştirmek için, R-GECO veya K-GECO, optogenetik bir araç olan ChR212,13, kullanıma hazır viral kitler üretilmiştir. Görüntülemeyi oto-mikroakışkan bir sistemle donatılmış yüksek içerikli bir cihaza dönüştürerek, bileşik ilavesinin tek kanallı pipetlenmesi, canlı hücre görüntülemenin üzerine katmanlanır. Son olarak, deneysel yolun her iki önemli yönü, görüntü işleme ve analiz de geliştirildi ve otomatikleştirildi.
Sol ventrikül non-kompaksiyonlu kardiyomiyopati (LVNC) hastası iPSC kaynaklı kardiyomiyositler (iPSC-CM) Ulusal Tayvan Üniversitesi Hastanesi tarafından sağlandı. iPSC'ye yeniden programlamak için hasta örneklerinin toplanması ve araştırma amaçlı bakım protokolleri14 , WMA Helsinki Deklarasyonu'nu (insan denekleri içeren tıbbi araştırmalar için etik ilkeler) takip etti ve Kurumsal İnceleme Kurulu: NTUH'deki Araştırma Etik Komitesi Ofisi (#201612099RINC) tarafından onaylandı. Diğer iPSC-CM'ler ticari satıcılardan temin edildi. iPSC türevlerinin kullanımı kurumumuzda belirli izinler gerektirmez.
1. iPSC türevi kardiyomiyositlerin hazırlanması
2. Genetik olarak kodlanmış kalsiyum göstergelerinin ekspresyonu
3. Fluo-4 kullanarak boya bazlı kalsiyum görüntüleme
4. Toksisite testi ve fenotipik tarama için görüntü toplama ve fonksiyonel testler
5. Küçük molekül hazırlama
6. Görüntüleme işleme ve analizi
İlaç tedavileri olsun veya olmasın, iPSC kaynaklı kardiyomiyositler (iPSC-CM'ler) tarafından eksprese edilen mNG-GECO10'daki spontan kalsiyum salınımının gözlemlenmesi Şekil 1 ve Animasyonlu Video 1'de gösterilmiştir. mNG-GECO kullanılarak elde edilen kinetik izler, küçük moleküler iyon kanalı inhibitörleri verapamil, dofetilit ve E4031'in kalsiyum geçicilerini beklendiği gibi etkilediğini göstermektedir (Şekil 1B). Şekil 1C'de gösterilen tipik kalsiyum geçicisi, Peak sinyali (Genlik), Kalsiyum geçici süresi% 50 (CTD50), Kalsiyum geçici süresi% 90 (CTD90), yükselme süresi ve bozunma süresi elde etmek için Kalsiyum pik analiz yazılımı ile analiz edilebilir. L-tipi bir kalsiyum blokeri17 olan Verapamil, hücrelerdeki kalsiyum akışını beklendiği gibi tamamen inhibe eder (Şekil 1B). Dofetilide ve E4031, deneysel sınıf III antiaritmik ilaçlar olarak listelenen hERG kanal inhibitörleri 18,19,20'dir. Bozunma süresi, araç grubuyla karşılaştırıldığında hem Dofetilide (p < 0.05) hem de E4031 tedavisi (p < 0.001) ile uzar. CTD50 (p < 0.01) ve CTD90'ın (p < 0.001) E4031 tedavisi ile uzaması, sadece araçla karşılaştırıldığında gözlenmiştir (Tablo 1), bu sonuçlar, Q-dalgasının başlangıcı ile T dalgasının sonu arasındaki uzun bir süre boyunca yüzey elektrokardiyogramından belirlenen klinik olarak ilgili bir repolarizasyon ölçümü olan QT aralığı üzerinde bildirilen etkilerle tutarlıdır. önceki çalışmalarda 12,21.
Spontan dövülen hücrelerde CTD değerlendirmesinin zorluğu, CTD'ye dayatılan değişkenlik atış hızıdır. Bu, iPSC-CM modeli için özel bir sorundur; burada 96 kuyu plakasının her bir kuyusu, tüm hücreler aynı ana şişeden gelse bile kendi vuruş hızına sahip olabilir. Optik veya elektriksel hız ile bir vuruş hızı empoze etmek mümkündür. E4031'in doz-yanıtını standartlaştırılmış tempolu koşullar altında değerlendirmek için, iPSC-CM'leri ifade eden ChR2 ve K-GECO7, 1 Hz 470 nm ışık darbesi kullanılarak optik olarak kontrol edildi ve kırmızı K-GECO sinyali kullanılarak gözlemlendi (Şekil 2A ve Ek Şekil 1). Kalsiyum geçicilerinin pik genliğinde ilerleyici azalmalar (p < 0.01) ve çürüme süresinde artış (p < 0.05) artan E4031 konsantrasyonları ile ortaya çıkar (Şekil 2B1). E4031'in doza bağımlı etkisi, pik genlikteki azalmalar için en belirgin olanıydı (Şekil 2B1, B2).
Dakikalar süren kısa süreli çalışmalar tipik olarak kardiyotoksisite değerlendirmeleri için kullanılsa da, kronik toksisite değerlendirmeleri için hastanın haftalar, aylar veya yıllar boyunca ilaçlara maruz kalmasına paralel olarak kör bir nokta vardır. Klinik uygulama ile ilgili tedavi sürelerini yansıtan aralıklar boyunca hastalık veya toksisite etkilerini incelemek avantajlı olacaktır. Sol ventrikül sıkıştırmasız (LVNC) olan bir hastadan iPSC türevi kardiyomiyositleri incelemek için tamamen optik kontrol ve algılama sistemimizi kullandık. iPSC-CM'ler, farklılaşma Günü 25. Günden sonra bir K-GECO viral kiti (adım 2.2-2.6) ile dönüştürüldü. K-GECO sinyali daha sonra her 1-2 haftada bir, ek ilaç tedavileri olsun veya olmasın, aynı kuyucuklarda izlendi. Hem spontan kalsiyum aktivitesi (Şekil 3A,3B) hem de optik pacing altındaki kalsiyum dinamiği (Şekil 3C,D, adım 4.11) yüksek içerikli Görüntüleme Sistemi (adım 4.1-4.12) kullanılarak elde edilmiş ve kalsiyum tepe analiz yazılımı (adım 6) ile işlenmiştir. Şekil 3A, C'de gösterildiği gibi, berrak kalsiyum geçicileri, viral transdüksiyondan bir ay sonra, optik pacing için kullanılan ek ışıkla veya ışık olmadan görünür kalır. Bu çalışma, LVNC iPSC-CM modelinde atım hızını arttıran, kasılma aralığını düzenleyen ve geçici kalsiyum genliğini artıran bir ilacı tanımlamıştır (Şekil 3A, B). Bu verilerden yapılacak iki önemli gözlem vardır. İlk olarak, terapötik perspektiften bakıldığında, ilaç etkisi Gün 63 ve Gün 70 zaman noktalarında dayanıklı görünmektedir. İkincisi ve genel olarak kısa pencereler (<1 dakika) sırasında daha önceki zaman noktalarında (tipik olarak <50 gün) bileşik etkileri tahlil eden bir alanla ilgilidir; Bileşiğin hastalık fenotipi modifiye edici etkileri ancak 60. günden sonra belirgindir, bu da standart tarama protokollerinde yavaş etki mekanizmalarına sahip ilaçların indirgenmesinin kolay olabileceğini düşündürmektedir.
Vuruş frekansının değişkenliği ve ardından kalsiyum geçici süresi üzerindeki etkisi, herhangi bir zaman noktasında sadece iyiden iyiye bir problem değildir. Aynı zamanda iPSC-CM kültürde muhafaza edildikçe de değişir, bu da zamanla bir kuyu içinde değişir (Şekil 3B). Sıralı deneylerde tutarlılık sağlamak için, ilaç tedavisi ile veya ilaç tedavisi olmadan 1 Hz optik pacing uygulanabilir (Şekil 3C, D). Burada, Gün 63 sonuçları, kalsiyum geçicisinde önemli ölçüde daha yüksek genlik, daha kısa CTD90 ve daha kısa bozunma süresi ile cesaret verici eğilimler göstermesine rağmen; 70 günlük zaman dilimine göre - ve nadir hastalıklar için ilaç tarama sürecinde kronik değerlendirmelere duyulan ihtiyacın göstergesi - depolarizasyonlardan (EAD) sonra erken tespit edilir. Hastalık fenotiplemesine veya küçük molekül değerlendirmesine bir pacing protokolü eklemenin değeri, Şekil 3B, D'de beat hızı, kalsiyum geçici genliği, CTD90 ve bozunma süresi için sunulan sonuçların karşılaştırılmasıyla nitel olarak değerlendirilebilir.
Bir GECI'nin, kalsiyum geçicisini görselleştirmek için kimyasal boyaya kıyasla, metodolojiye dayalı bir avantajı, probu bir hücre içindeki belirli bir bölmeyle sınırlama yeteneğidir. Bu, tek hücrelerde birden fazla renk ve / veya afinite varyantını çoğaltarak daha da genişletilebilir. Bu nedenle, sırasıyla endoplazmik retikulum / sarkoplazmik retikulum (ER / SR), mitokondri (veya CRAC kanalı) ve sitozolde ortaya çıkan gerçek zamanlı kalsiyum aktivitesi ölçümü için hücre modellerinde ER-LAR-GECO9, mtGCEPIA 22,23 (veya Oria1-G-GECO) ve NIR-GECO2 8,24 dahil olmak üzere çeşitli GECI'ler geliştirilmiştir. Farklı hücre içi kalsiyum depoları arasındaki etkileşimi incelemek için iPSC-CM modelinde (Şekil 4A, C) birleştirilebilirler. Örneğin, SR kalsiyum deposunu boşaltmak için 10 mM kafein tedavisi kullanılabilir. Burada ER-LAR-GECO sinyalinin azalması (SR'den kalsiyum kaybının göstergesi), beklendiği gibi NIR-GECO sinyalinin (sitozolik kalsiyum konsantrasyonundaki artışın göstergesi) düşüşüne paraleldir. Diğer hücre içi bölmelerin bu dalgalanmalardan nasıl etkilendiği iyi çalışılmamıştır. Yine de, yeşil bir mitokondriyal hedefli mtGCEPIA3'ün dahil edilmesi, bu koşullarda mitokondride kalsiyum alımının meydana geldiğini göstermektedir (Şekil 4A, B).
Benzer şekilde, farklı kalsiyum akımları arasındaki etkileşimin görselleştirilmesi, kalsiyum salınımıyla aktive edilen kanal (CRAC) Ca 2+ akımını ortaya çıkarmak için bir prob olan Orai1-G-GECO25'in dahil edilmesiyle görülebilir (Şekil 4C, D). iPSC-CM modelinde bu sinyal spontan sitozolik kalsiyum geçici ile artar (Şekil 4D1,D2). Buna uygun olarak, kafein ile tedavi hem sitosolde hem de Orai1 kanalından büyük bir kalsiyum geçici uyarır.
Kardiyomiyosit modellerinde kalsiyum geçici görüntülemenin çoğunun kalsiyum boyaları kullanılarak belirlendiği kabul edilmektedir26. Genetik olarak kodlanmış bir kalsiyum göstergesi, farklı kalsiyum görüntüleme yaklaşımlarının yan yana karşılaştırılmasını sağlamak için iPSC türevi kardiyomiyosit modelindeki kimyasal bir boya ile karşılaştırıldı. iPSC-CM'leri eksprese eden K-GECO, Fluo-4 yüklü hücrelerle birlikte görüntülendi. Kardiyomiyositleri eksprese eden K-GECO zaman içinde tutarlı dayak davranışı göstermiştir (Şekil 5A,C). Bununla birlikte, Fluo-4 yüklemesi bu modelde hem vuruş frekansını hem de CTD'yi etkilemiştir (Şekil 5B, C), Fluo-4'ün kendisinin bu tür deneylerin sonuçlarını etkileyebileceğini düşündürmektedir. Bu, özellikle görüntüleme probuna uzun süre maruz kaldıktan sonra geçerli olacaktır; bu, kuyu başına bir dakikalık bekleme süresiyle iyi görüntüleme gerçekleşirse, çok duvarlı görüntüleme formatında ortaya çıkabilir.

Şekil 1: iPSC türevi kardiyomiyositlere uygulanan küçük moleküllü iyon kanalı inhibitörleri. (A-B) IPSC-CM'nin mNG-GECO'yu eksprese eden hızlandırılmış görüntüleri 25 Hz. Ölçek çubuğu = 50 μm. (B) Bileşik ilavesinden sonra temsili Ca2+ salınımları. mNG-GECO eksprese eden hücrelerden elde edilen floresan sinyalleri, F0'ın bazal yoğunluk ve F'nin her zaman noktasında tespit edilen yoğunluk olarak tanımlandığı bir floresan oranı F / F0 olarak sunulur. (C
LumiSTAR, K-GECO, NIR-GECO ve LAR-GECO kullanımının patent koruması için başvuruda bulunmuştur.
Mevcut protokol, yüksek verimli ilaç taraması ve toksisite testi için iPSC kaynaklı kardiyomiyositlerde (iPSC-CM'ler) tetiklenen hücresel aktivitenin tüm optik kontrolünü ve gözlemini açıklamaktadır. Zaman ve uzaydaki fenotipik kalıpların multi-parametrik nicelleştirilmesi gösterilmiştir. İlaçların saatler boyunca uzun vadeli etkileri veya günler boyunca sıralı ölçümler gösterilmiştir.
Tokyo Üniversitesi'nden Prof. Robert Campbell'a materyali ve değerli tartışmayı paylaştığı için teşekkür ederiz; Teknik destek için Moleküler Cihaz'da Dr. Chia-Lin Ho.
| 96 oyuklu plaka | Perkin Elmer | 6055302 | |
| otomatik mikroakışkan sistem | Moleküler Cihaz | Bir cihaz, otomatik olarak bileşik eklemek için kullanılabilen tek kanallı bir pipetleyiciye sahiptir | |
| Kafein | Sigma-Aldrich | C0750 | |
| Cardiosight-S l iPSC türevi kardiyomiyositler | NEXEL | C-002 | |
| Dimetil sülfoksit | Kırlangıç Sigma | 1096780100 | |
| Dofetilide | Sigma-Aldrich | PZ0016 | |
| E4031 | Tocris | 1808 | |
| ER-LAR-GECO viral kiti | LumiSTAR | AA001a | Adeno-viral vektör Fibronektin Sigma-Aldrich F1141|
| Fluo-4 | Invitrogen | F14201 | Kimyasal kalsiyum içine paketlenmiş kırmızıya kaymış GECI hassas boya |
| Jelatin | Sigma-Aldrich | G1890 | |
| ImageXpress Micro Konfokal Yüksek İçerikli Görüntüleme Sistemi | Moleküler Cihaz | ||
| iPSC-CMs Bakım Ortamı | NEXEL | CMS-002 | iPSC-CMs Orta (Cardiosight-S orta) + Cardiosight-S Takviyesi |
| iPSC-CMs Orta (Cardiosight-S orta) | NEXEL | CMS-002 | |
| K-GECO viral kit | LumiSTAR | AA005a | Adeno-viral vektör içine paketlenmiş kırmızıya kaymış GECI |
| LumiCAL yazılımı | LumiSTAR | LUCS01a | Kardiyomiyositlerde kalsiyum zirvesinin analizi için yazılım |
| mNG-GECO viral kiti | LumiSTAR | AL008a | Lenti-viral vektör |
| mt-GCEPIA3 viral kitine | paketlenmiş daha parlak yeşil GECILumiSTAR | AL011a | MITOKONDRI üzerinde GETING lenti-viral vektör |
| NIR-GECO viral kiti | LumiSTAR | AV004a | Viral vektör |
| Orai1-GGECO viral kiti | LumiSTAR | AL010a | lenti-viral vektör Tyrode tuzları içine paketlenmiş Orai1 üzerinde GECI targgeting |
| Sigma-Aldrich | T2145 | ||
| Verapamil hidroklorür | Sigma-Aldrich | V4629 | |
| Y-27632 dihidroklorür | Tocris | 1254 |