Kritik adımlar
Üç adımı optimize etmek, bu protokolün başarısını önemli ölçüde artıracaktır. İlk olarak, adım 1.5'te, kapak kapağına uygulanan yapışkan yapıştırıcı ile korunmalıdır. Çok fazla yapışkan yapıştırıcı eklenirse, pupalar kalın bir katılaşmış yapışkan yapıştırıcı tabakasına gömülebilir, bu da diseksiyonu imkansız hale getirir ve notumun kendisini kaplarsa, yapışkan yapıştırıcı numuneden gelen ışığı engeller. İkincisi, 2.3-2.6 adımları sırasında, yanal dokunun mümkün olduğunca çoğunu hariç tutarak, notumun yalnızca üst kubbesini çıkardığınızdan emin olun. Dahil edilirse, yanal doku montaj sırasında sıkıştırılır ve notumun ortasının içe doğru bükülmesine neden olur ve genellikle yüksek sayısal açıklık hedeflerinin çalışma mesafesinin dışına yerleştirilir. Üçüncüsü, temizleme adımı 2.9 sırasında, tek katmanlı epitele zarar vermemek için çok dikkatli olunmalıdır. Dokuda büyük kısımlar eksikse veya sinyal tespit edilemezse, bu adımın suçlanması muhtemeldir.
Sorun giderme
Sorun 1: Montajın ardından, pupa diseksiyon sırasında çift taraflı banttan uzaklaşır. Bu, özellikle yeni başlayanlar için yaygın bir sorundur. En iyi çözüm, pupa kasasının dışının tamamen kuru / yiyecek artıklarından arındırılmış olmasını sağlamaktır. Yiyecekleri bir çift künt forseps ile çıkarmak ve kasanın 10-15 dakika boyunca hava ile kurumasına izin vermek, banda yapışmaya yardımcı olacaktır. Alternatif olarak, diseksiyon sırasında pupaları banda karşı tutmak için baskın olmayan eli ve bir çift künt forseps kullanın. Sorun devam ederse, kasanın arka ucunun tabanına küçük, 5-10 μL damla oje uygulamak ve sertleşmesine izin vermek, genellikle en düzensiz pupalar için bile yeterli yapışma sağlar.
Sorun 2: Notum adım 2.3 sırasında çöküyor veya bütünlük içindeki ilk ihlal düzgün değil. Bütünlüğün ihlali zorsa, immobilizasyon adımlarından çok fazla yapışkan yapıştırıcı olabilir. Disseke edilmiş pupaların daha az yapışkan yapıştırıcıya yerleştirilmesi bu sorunu iyileştirecektir. Ayrıca, mikrodiseksiyon makaslarının keskin olduğundan emin olun. Künt makaslar bütünlüğü kesemez ve içe doğru çökmesine neden olma eğilimindedir. Hemolenf pupadan döküldükten sonra, kesme bıçaklarından birinin notumun deforme olmasına neden olmadan pupaya girebildiğinden emin olun. Notum çökerse ve bıçak pupaya girmezse, bir bıçak pupaya girene kadar kesmeye devam edin.
Sorun 3: Adım 2.4 sırasında makas bütünlüğü yakalar veya sürükler. Makas bütünlüğü yakalamaya veya sürüklemeye başlarsa, genellikle pupaların karşı tarafına geçmeye ve bütünlüğü 'gevşetmeye' devam etmeye yardımcı olur. Daha fazla künt mikrodiseksiyon makasları, bütünlük boyunca temiz kesimler elde etmeyi zorlaştıracaktır ve keskinleştirilmiş makas kullanılmalıdır.
Sorun 4: Boyama sırasında numune yanlışlıkla aspire edilir (adım 3.1-3.6). Disseke edilmiş notu görmek zordur çünkü şeffaftır. Kontrast sağlamak için kapak kapağının altına koyu mavi veya siyah bir tabaka yerleştirmek yararlı olabilir (eski bir pipet ucu tutucu rafı iyi çalışır.) Ek olarak, tüm çözelti değişiklikleri bir diseksiyon mikroskobu altında gerçekleştirilebilir.
Sorun 5: Hiçbir sinyal algılanmadı/yamalı sinyal algılandı. Lekeye özgü sorunları dışladıktan sonra, sinyal algılanmazsa veya yamalıysa, adım 2.9 (temizleme) muhtemelen suçludur. Eksik veya yamalı bir sinyal, temizlik sırasında epitel dokusunun hasar görmesinden ve çıkarılmasından kaynaklanabilir. Tersine, zayıf bir sinyal, çıkarılmazlarsa kas bantlarından / yağ vücut hücrelerinden tıkanmadan kaynaklanabilir, çünkü lekelerin ve antikorların çevreleyen dokuya göre notuma difüzyonunu sınırlayabilirler. Doku hasar görürse, temizlik sırasında daha nazik olmak en iyi çözümdür. Bunun yerine, leke görünür ancak yamalıysa, kas ve yağ gövdesinin mümkün olduğunca çoğunu çıkarmak için temizleme adımına ayrılan canlılığın / zamanın arttırılması önerilir. Ayrıca, leke süresini artırmak, bu sorunun daha iyi temizlik ile çözülmesine yardımcı olabilir.
Sayı 6: Notum dokusu görüntüleme sırasında çarpık/buruşuk bir görünüme sahiptir. Dokunun bükülmesi ve buruşması iki kaynaktan gelir. İlk olarak, montaj sırasında notumun sıkıştırılması, bükülmesine ve bükülmesine neden olur. En iyi çözüm, yanal dokuların mümkün olduğunca çoğunu çıkarmaktır, böylece kubbe mümkün olduğunca kısadır ve kapak kaydırma ara parçaları arasına sığabilir. İkincisi, eğer notum diseksiyon sırasında bükülürse, bu büküm montaj sırasında düzleşmez, bu nedenle diseksiyon sırasında notumun bükülmemesine dikkat edilmelidir. Notumun yanlışlıkla bükülmesi, bütünlüğü pupaların geri kalanından uzaklaştırırken en yaygın olanıdır. Diseksiyon makaslarını, pupa olarak örnek düzlemde tutmak yerine, pupaya göre bir açıyla yapmak caziptir. Bununla birlikte, açılı makas, kesildiğinde bütünlüğün düz kalmak yerine yukarı doğru bükülmesine neden olur.
Mevcut yöntemler, sınırlamalar ve gelecekteki uygulamalar
Wang ve ark.20, pupa epitelinin izolasyonu için karşılaştırılabilir bir diseksiyon protokolü bildirmiştir. Bu teknik, pupa'nın kasasında kalmasını ve bir neşterle hızla ikiye bölünmesini gerektirir. Bu protokol daha önce canlı olarak görüntülenen örneklerle uyumlu değildir, çünkü canlı görüntüleme pupa vakasının büyük bir bölümünün çıkarılmasını gerektirir. Pupa sertlikten yoksun olduğundan, vakanın dışındaki pupa biseksiyonu dokuyu karıştırdı ve bu protokolün oluşturulmasına ilham verdi. Burada detaylandırılan teknik, notumun izolasyonuna ve sabitlenmesine izin verir ve kriyoseksiyon, in situ hibridizasyon veya elektron mikroskobu gibi çok çeşitli diğer yöntemler için ilk adım olarak kullanılabilir.
Bu tekniğin bazı sınırlamaları vardır. İlk olarak, notumun diseksiyonu, sabitlenmesi ve boyanması, notumdaki canlı görüntüleme floresan etiketli proteinlerden daha fazla zaman alıcıdır, bu da pupa vakasını çıkarmak için sadece basit bir diseksiyon gerektirir 9,23. İkincisi, diğer Drosophila dokularının diseksiyonlarına kıyasla, bu diseksiyon ince, kırılgan doku ve hidrofobik kütikül nedeniyle daha zordur. Drosophila epitelindeki proteinleri basitçe görselleştirmek için, sabit embriyolarda, larva kanat disklerinde veya yumurtalıklarda immünohistokimya daha kolaydır. Bununla birlikte, bu teknik, canlı görüntülemenin gücünün sabitleme ve boyama ile eşleştirilmesini sağlar ve bir kez ustalaştığında onu güçlü bir araç haline getirir.
Diseksiyon/fiksasyon tekniğinin canlı görüntülemeye göre bazı avantajları vardır. Bazal (iç) yapılar bazal görünümle daha iyi çözülebilir (Şekil 5L,J). En önemlisi, canlı görüntüleme, genetik olarak sağlanması gereken floroforlarla sınırlıdır ve genellikle uzun genetik geçiş şemaları gerektirir. Buna karşılık, mevcut protokol lekelerin, immünohistokimyanın ve diseksiyon ve fiksasyon gerektiren diğer tekniklerin uygulanmasına izin vermektedir. Bu, dokuda incelenen sinyallerin sayısını önemli ölçüde artırırken, deneysel sonuçlara ulaşma süresini potansiyel olarak azaltır.