Termal tolerans, organizmaların hayatta kalmasının ve fonksiyonunun anahtarıdır 1,2. Gezegen antropojenik karbon emisyonları nedeniyle ısınmaya devam ettikçe, termal sınırların belirlenmesine ve uygulanmasına giderek daha fazla dikkat edilmektedir3. Mortalite, gelişme başarısızlığı ve hareketlilik kaybı gibi çeşitli sonlanım noktaları, hem üst hem de alt termal sınırları belirlemek için kullanılmıştır4. Bu termal sınırlar genellikle bir organizmanın termal nişi için bir vekil olarak kabul edilir. Bu bilgi, küresel ısınmaya karşı daha savunmasız olan türleri tanımlamanın yanı sıra gelecekteki tür dağılımını ve ortaya çıkan tür etkileşimlerini tahmin etmek için kullanılır 3,5,6,7. Bununla birlikte, özellikle küçük planktonik organizmalar için termal sınırların belirlenmesi zor olabilir.
Planktonik organizmalar için, özellikle deniz omurgasızlarının larva aşamaları için, termal sınır kronik maruz kalma yoluyla belirlenebilir. Kronik maruziyet, larvaların günler ila haftalar boyunca çeşitli sıcaklıklarda yetiştirilmesi ve larva hayatta kalma ve / veya gelişim hızının 8,9,10 azaldığı sıcaklığın belirlenmesiyle elde edilir. Bununla birlikte, bu yaklaşım oldukça zaman alıcıdır ve larva yetiştiriciliğinde büyük inkübatörler ve deneyim gerektirir (deniz omurgasız larvalarının kültürlenmesine iyi bir giriş için referans11'e bakınız).
Alternatif olarak, termal strese akut maruz kalma, termal sınırları belirlemek için kullanılabilir. Genellikle, bu belirleme yaklaşımı, larvalı küçük şişelerin sıcaklık kontrollü kuru banyolarayerleştirilmesini içerir 12,13,14, PCR termal döngüleyiciler15,16'daki termal gradyan fonksiyonlarından yararlanmayı veya cam şişeler / mikrosantrifüj tüplerini, şişelerin sıkıca oturduğu deliklere sahip büyük alüminyum blokların uçlarına uygulanan ısıtma ve soğutma ile üretilen bir termal gradyan boyunca koymayı içerir 17, 18,19. Tipik kuru banyolar tek bir sıcaklık üretir; Bu nedenle, bir dizi sıcaklıktaki performansı değerlendirmek için birden fazla ünite aynı anda çalıştırılmalıdır. Termal döngüleyiciler bir gradyan üretir, ancak yalnızca küçük bir numune hacmini (120 μL) barındırır ve dikkatli manipülasyonlar gerektirir. Termal döngüleyicilere benzer şekilde, büyük alüminyum bloklar doğrusal ve kararlı sıcaklık gradyanları oluşturur. Her iki yaklaşım da, nüfusun% 50'si için ölümcül sıcaklığı hesaplamak için lojistik veya probit regresyonu ile birleştirilebilir (LT50)12,20,21. Bununla birlikte, kullanılan alüminyum bloklar ~ 100 cm uzunluğundaydı; Bu boyut, büyük bir laboratuvar alanı ve delikleri delmek için özel bilgisayarlı sayısal kontrollü freze makinelerine erişim gerektirir. Hedef sıcaklığı korumak için iki araştırma sınıfı su banyosu kullanmanın yanı sıra, kurulumu monte etmenin finansal maliyeti yüksektir.
Bu nedenle, bu çalışma, ticari olarak temin edilebilen parçalarla kararlı, doğrusal bir sıcaklık gradyanı oluşturmak için alternatif bir araç geliştirmeyi amaçlamaktadır. Böyle bir ürün küçük bir ayak izine sahip olmalı ve planktonik organizmalar için akut termal strese maruz kalma deneyleri için kolayca kullanılabilmelidir. Bu protokol, hedef organizmalar olarak <1 mm büyüklüğünde zooplankton ile geliştirilmiştir ve bu nedenle 1.5 veya 2 mL'lik bir mikrosantrifüj tüpünün kullanımı için optimize edilmiştir. Daha büyük çalışma organizmaları, kullanılan 1,5 mL mikrosantrifüj tüplerinden daha büyük kaplara ve alüminyum bloklardaki büyütülmüş deliklere ihtiyaç duyacaktır.
Deney aparatını daha erişilebilir hale getirmenin yanı sıra, bu çalışma veri işleme boru hattını basitleştirmeyi amaçlamaktadır. Ticari istatistik yazılımı, lojistik veya probit regresyonunu kullanarak LT50'yi hesaplamak için rutinler sağlarken, lisanslama maliyeti önemsiz değildir. Bu nedenle, açık kaynaklı istatistik programı R22'ye dayanan kullanımı kolay bir komut dosyası, veri analizini daha erişilebilir hale getirecektir.
Bu protokol, kompakt bir ısı bloğunun ticari olarak temin edilebilen parçalarla nasıl üretilebileceğini ve üst termal sınırlarını belirlemek için zooplanktonları (kum doları Dendraster excentricus'un larvaları) akut ısı stresine maruz bırakmak için nasıl uygulanabileceğini göstermektedir.