RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
tr_TR
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Pavan S. Krishnan1,2, Fernando T. Zamuner1,3, Carolyn M. Jenks1, Johnny Y. Xie4, Lisa Zhang5, Mohammed Lehar1, Neal S. Fedarko6, Mariana Brait1,3, John P. Carey1
1Department of Otolaryngology-Head & Neck Surgery,Johns Hopkins University School of Medicine, 2Virginia Commonwealth University School of Medicine, 3Department of Oncology, The Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center,Johns Hopkins University School of Medicine, 4Department of Otolaryngology-Head and Neck Surgery,University of Michigan Medical School, 5Department of Otolaryngology-Head and Neck Surgery,The Ohio State University College of Medicine, 6ICTR Clinical Research Core Laboratory,Johns Hopkins University School of Medicine
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
İnsan plazmasındaki kalsitonin gen ilişkili peptid (CGRP) konsantrasyonları ile ilgili yayınlanmış veriler tutarsızdır. Bu tutarsızlıklar, bu nöropeptidi ölçmek için standartlaştırılmış, doğrulanmış bir metodolojinin eksikliğinden kaynaklanıyor olabilir. Burada, insan plazmasındaki CGRP'yi saflaştırmak ve ölçmek için doğrulanmış bir enzime bağlı immünosorbent testi (ELISA) protokolünü açıklıyoruz.
Kalsitonin geni ile ilişkili peptid (CGRP), migren baş ağrılarının patofizyolojisinde varsayılan bir rol oynayan ve biyobelirteç statüsü için aday olabilen vazoaktif bir nöropeptittir. CGRP, aktivasyon üzerine nöronal liflerden salınır ve trigeminal efferent innervasyon alan vaskülatürde steril nörojenik inflamasyon ve arteriyel vazodilatasyonu indükler. Periferik vaskülatüründe CGRP'nin varlığı, enzime bağlı immünosorbent testi (ELISA) gibi proteomik tahliller kullanarak insan plazmasında bu nöropeptidi tespit etmek ve ölçmek için araştırmaları teşvik etmiştir. Bununla birlikte, 6.9 dakikalık yarılanma ömrü ve genellikle tam olarak tanımlanamayan tahlil protokollerinin teknik detaylarındaki değişkenlik, literatürde tutarsız CGRP ELISA verileri vermiştir. Burada, insan plazmasında CGRP'nin saflaştırılması ve nicelleştirilmesi için modifiye edilmiş bir ELISA protokolü sunulmaktadır. Prosedürel adımlar, numune toplama ve hazırlama, saflaştırma aracı olarak polar sorbent kullanarak ekstraksiyon, spesifik olmayan bağlanmayı engellemek için ek adımlar ve ELISA yoluyla nicelleştirmeyi içerir. Ayrıca, protokol spike ve geri kazanım ve seyreltme deneylerinin doğrusallığı ile doğrulanmıştır. Bu doğrulanmış protokol teorik olarak sadece migren ile değil, aynı zamanda CGRP'nin rol oynayabileceği diğer hastalıklarla da bireylerin plazmasındaki CGRP konsantrasyonlarını ölçmek için kullanılabilir.
Kalsitonin geni ile ilişkili peptid (CGRP), perivasküler lokalizasyonu olan nöronal liflerde ve nöronal olmayan dokularda bulunan 37 amino asitlik bir nöropeptittir. CGRP'nin iki formu, α- ve β-CGRP,% 90'dan fazla homolojiyi paylaşır ve fizyolojik fonksiyonları paylaşır; Bununla birlikte, αCGRP merkezi ve periferik sinir sisteminde, βCGRP ise enterik sinir sisteminde bulunur 1,2. Nosiseptör aktivasyonu ve kalsiyuma bağımlı ekzositoz üzerine, CGRP nöronlardan salınır ve arteriyel vazodilatasyon ve plazma protein ekstravazasyonunu içeren steril nörojenik inflamasyonu indükler 3,4,5,6,7. Buradan, CGRP postkapiller damarlarda görülür ve migren 8,9,10,11 gibi afferent nosiseptif aktivasyona neden olan hastalıklar için bir biyobelirteç olabilir. CGRP, anjiyogenez ve immün modülasyondaki rolü nedeniyle COVID-19'a da dahil edilmiştir ve olumsuz hastalık evrimini öngörebilir12,13. Bu nedenle, insan plazmasında CGRP'nin doğru bir şekilde ölçülmesi için bir protokol geniş bir değere sahip olabilir.
Belki de en çok dikkat CGRP'nin migrendeki rolüne verilmiştir. Preklinik ve klinik çalışmalara dayanarak, CGRP migren için olası bir biyobelirteç ve tedavi için bir hedef olarak ortaya konmuştur 3,4,5,6,7,8,9,10. Bazı çalışmalar, kontrol katılımcılarına göre epizodik migreni olan kohortlarda CGRP yüksekliği bulmuştur10,14,15. CGRP inhibitörlerinin migren baş ağrısı tedavisi için klinik çalışmalardaki başarısı, migren baş ağrıları için nedensel bir faktör olarak yüksek CGRP'yi ima ediyor gibi görünmektedir. Bununla birlikte, tüm araştırmacılar bu sonuçları doğrulamamıştır16,17,18,19. Ayrıca, CGRP'nin migrenin baş ağrısı olmayan semptomlarındaki rolü henüz aydınlatılmamıştır; Mevcut çalışma, migrenin vestibüler semptomlarında CGRP'nin rolünü anlama arzusuyla motive edildi.
Literatürdeki tutarsız CGRP immünoassay verileri çeşitli nedenlere bağlı olabilir. İlk olarak, CGRP'nin periferik vaskülatürdeki yarı ömrü, serin proteazlar 21, insülin parçalayıcı enzimler ve diğer metaloproteazlar 22, nötral endopeptidazlar23 ve endotelin dönüştürücü enzim-124'ün aktivitesi nedeniyle 6.9 dakika 20'dir. İkincisi, CGRP'yi ölçmek için kullanılan immünoassayların değişken teknik detayları bu tür çalışmalarda tam olarak tanımlanmamıştır. Son olarak, immünoassay metodolojisinin standardizasyon eksikliği resmi daha da karmaşıklaştırmaktadır.
Bu makalede, insan plazmasında α- ve βCGRP'nin saflaştırılmasına ve doğru bir şekilde nicelleştirilmesine izin veren modifiye enzime bağlı immünosorbent testi (ELISA) protokolü açıklanmaktadır. Kitin antikorları amilin, kalsitonin veya P maddesi ile çapraz reaktif değildir. Bu protokol, verileri burada sunulan ani artış ve geri kazanım ve seyreltmenin doğrusallığı gibi gerekli doğrulama deneylerinden geçmiştir. Validasyondan geçen böyle bir CGRP ELISA protokolü daha önce literatürde tam olarak tanımlanmamıştır. Bu protokol, migrenin yanı sıra kardiyolojik 2,25, dermatolojik26, obstetrik 27, romatolojik28,29, kas-iskelet sistemi30,31, endokrin 32,33 ve CGRP'nin ilişkili olduğu viral hastalıklar12,13 bağlamında insan plazmasındaki CGRP'yi ölçmek için kullanılabilir.
Bu protokol, Johns Hopkins Kurumsal İnceleme Kurulu'nun (NA_00092491) onayı ile rıza gösteren bireylerden alınan insan plazma örnekleri kullanılarak geliştirilmiştir.
1. Numune toplama ve hazırlama
2. Plazma örneklerinin ekstraksiyonu
3. ELISA plakasının hazırlanması - spesifik olmayan bağlamayı sınırlamak için bloke etme
4. Tahlil prosedüründen önce
5. Tahlil prosedürü
6. Veri analizi
Protokolde vurgulanması gereken birkaç önemli adım vardır. İlk olarak, bir serin proteaz inhibitörü olan aprotinin, CGRP'nin daha fazla enzimatik bozulmasını önlemek için toplandıktan hemen sonra tam kan örneklerine eklenmelidir. Serin proteazların CGRP metabolizmasında rol oynadığı gösterilmiştir ve önceki bir çalışmada da insanlarda CGRP'nin ölçülmesinde aprotinin kullanılmıştır21,35. Proteaz inhibitörleri kullanılmazsa ve numune hazırlama 60 dakikadan uzun sürerse, ELISA uygulandığında CGRP seviyelerinin düşmesi beklenebilir. İkincisi, ELISA'dan önce katı faz ekstraksiyonu, CGRP'yi elüentte yoğunlaştırır ve plazma matrisinden potansiyel olarak müdahale eden molekülleri ortadan kaldırır. Bu ekstraksiyon adımı, spike ve geri kazanım deneylerinde CGRP verimini arttırır (bir sonraki bölümde daha ayrıntılı olarak tartışılmıştır). Ekstraksiyondan sonra soğuk bir odada vakumlu santrifüjleme, CGRP kaybını daha da sınırlar. Üçüncü olarak, ELISA'dan önce, mikrotitre plakaları bir bloke tampon kullanılarak bloke edilmelidir. Bu, tampondaki spesifik olmayan proteinlerin plakalardaki kalan bağlanma bölgelerine pasif adsorpsiyonuna izin verir, böylece arka plan sinyalini azaltır. Engelleme, gerçekçi olmayan yüksek CGRP verimini azaltmaya yardımcı olur.
Ani artış ve geri kazanım deneyleri, CGRP tespitinin standart eğri seyreltici (burada, ÇED tamponu) ile deneysel numune matrisi (burada, plazma) arasındaki farklardan etkilenip etkilenmediğini belirler. Plazma ve / veya serum, CGRP'ye antikor bağlanmasını bloke eden veya peptidi parçalayan moleküller içerebilir, böylece tahlilin CGRP'nin başlangıç konsantrasyonunu doğru bir şekilde tespit etme ve ölçme kabiliyetine müdahale eder. Bu amaçla, plazma örneklerine bilinen miktarlarda CGRP ekledik - "spiking" adımı - ve ekstraksiyon ve ELISA'dan sonra ne kadar CGRP'nin "geri kazanıldığını" hesapladık. CGRP stoğu üreticiden alınmış ve kullanıma kadar -20 °C dondurucuda saklanmıştır.
Seyreltme testinin doğrusallığında, bir numune seri olarak seyreltilir ve her seyreltme için CGRP konsantrasyonları hesaplanır. Seyreltilmiş numuneler CGRP konsantrasyonunda uygun doğrusal düşüşler göstermiyorsa, bu, ÇED tamponunun veya plazmasının bazı konsantrasyonlarda CGRP'nin tespitine müdahale ettiğini veya standart eğrinin etkilenen aralıkta doğru olmadığını gösterir. Yukarıda açıklanan başak ve geri kazanım deneyini gerçekleştirirken, "çivili" örnekleri seri olarak seyrelttik; 200 pg / mL'lik bir CGRP konsantrasyonu vermek için bir plazma numunesini çiviledik ve daha sonra numuneyi 100 pg / mL'ye ve daha sonra 50 pg / mL'ye seyrelttik.
Kardiyovasküler, solunum veya yakın zamanda baş ağrısı veya nörolojik semptomlar öyküsü olmayan üç katılımcıdan alınan plazma örnekleri, farklı CGRP konsantrasyonları ile çivilendi. Protokol, çivili olmayan kontrol örneklerine ek olarak bu örnekler için de çalıştırılmıştır. Şekil 1 , seyreltme deneylerinin başak ve geri kazanımı ve doğrusallığı için bir plaka haritası örneği göstermektedir. Doğrusal aralığın ötesine geçmeye izin veren standart bir eğri oluşturmak için dört parametreli bir lojistik uyum gerçekleştirildi (Tablo 1 ve Şekil 2). İyileşme oranları her bir çivili örneklem için hesaplandı ve kabul edilebilir aralıkta idi (Tablo 2). Seyreltmenin doğrusallığı çivili örneklerde gösterilmiştir (Şekil 3). Tablo 3 , üreticinin talimatlarını izleyerek ve spesifik olmayan bağlamayı engellemek için eklenen adımların dahil edilmesinden önce gerçekleştirilen başarısız bir ani artış ve kurtarma deneyinden elde edilen sonuçları göstermektedir. Bu veriler, spesifik olmayan bağlamanın varlığını gösteren 5'lik üst sınırı aşan kurtarma oranlarını göstermektedir. Bir blokaj tamponu kullanarak plakayı bloke etmek için protokoldeki adımları ekledikten sonra (adım 3.1-3.5), bu etkiyi azaltabildik ve kabul edilebilir geri kazanım değerlerine ulaşabildik (Tablo 2). Migren veya vestibüler semptomları olmayan üç hastada, plazmadaki ortalama CGRP konsantrasyonunun 1.68 ± 0.13 pg / mL olduğunu bulduk. Gelecekteki deneyler, mevcut metodolojiyi daha geniş bir kontrol hastası ölçeğinde kullanmayı amaçlamalıdır.

Şekil 1: Örnek plaka haritası. Her plaka, hepsi çift veya üçlü olarak standartlar, numuneler, boşluklar ve NSB kuyuları içermelidir. Boş kuyucuklar sıvı içermemelidir ve NSB kuyuları tescilli enzim immünoassay tamponu, enzime bağlı ikincil antikor ve Ellman reaktifi içermelidir. NSB kuyucukları için ortalama absorbans değerleri, standart eğri oluşturulmadan önce standardın absorbans değerlerinden çıkarılmalıdır. NSB kuyuları için ortalama absorbans değerleri, geri kazanım yüzdesi hesaplanmadan önce numunelerin absorbans değerlerinden de çıkarılmalıdır. Plaka pozisyonunun bir etkisi yoktur. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 2: Dört parametreli lojistik (4PL) regresyon standart eğrisi örneği. Bu standart eğri, Tablo 1'de görülene benzer bir biçimde bir denklemle matematiksel olarak tanımlanmıştır. 4PL regresyon eğrisi, doğrusal eğrilere kıyasla biyolojik sistemlere daha uygundur. Bu eğri ve denklem, kalite kontrollerini ve numuneleri standardın oluşturulduğu aynı plaka üzerinde interpolasyon yapmak için kullanılır. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 3: 200 pg/mL'de çivilenmiş, daha sonra seri olarak 1:2 ve 1:4 oranında seyreltilmiş örnekleri gösteren seyreltme çizgisi grafiğinin doğrusallığı. Bu veriler, çok çeşitli seyreltmeler üzerinde doğrusallığı gösterir ve bu da tahlil yönteminin çok çeşitli CGRP konsantrasyonlarında doğru olduğunu gösterir. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.
| Parametre | Değer |
| X50 | 294.75 |
| Denklem | ![]() |
| Denklem formu | ![]() |
Tablo 1: X50 titreli afour-parametreli lojistik (4PL) regresyon standart eğri denklemi örneği. Bir 4PL regresyon eğrisi, biyolojik sistemlerde görülen karmaşıklığı barındırır. Bu eğri, doğrusal regresyondan daha uygun olduğu için ELISA'nın sonuçlarını analiz etmek için kullanılmıştır.
| Absorbans (OD) | İnterpolasyonlu konsantrasyon (pg/mL) | Yüzde verim | |
| Çivisiz kontrol | -0.0434 | Eğriye düşmez (yani, ~ 0) | |
| 200 pg/mL'de çivili | 0.2712 | 214.7 ± 23.4 | 107.40% |
| 100 pg/mL'de çivili | 0.0966 | 102,7 ± 2,35 | 102.70% |
| 50 pg/mL'de çivili | 0.0205 | 55,1 ± 12,65 | 110.20% |
Tablo 2: Katı faz ekstraksiyonu ve plaka blokajı eksikliği nedeniyle üç kontrol katılımcısının başarılı bir başak ve iyileşme deneyinin sonuçları. Çivili numuneler için verim yüzdesi, ideal 0 verimin% 20'sine düştü, bu da CGRP tespitinin plazmanın deneysel numune matrisinden etkilenmediğini gösteriyor.
| Absorbans (OD) | İnterpolasyonlu konsantrasyon (pg/mL) | Yüzde verim | |
| Çivisiz kontrol | -0.2087 | Eğriye düşmez (yani, ~ 0) | |
| 200 pg/mL'de çivili | 2.371 | 264.2 ± 104 | 132.10% |
| 100 pg/mL'de çivili | 1.134 | 167,5 ± 31,2 | 167.50% |
| 50 pg/mL'de çivili | 0.3218 | 80,55 ± 4,54 | 161.10% |
Tablo 3: Plaka blokajı eksikliği nedeniyle üç kontrol katılımcısının başarısız bir başak ve iyileşme deneyinin sonuçları. Çivili numuneler için verim yüzdesi,% 120 verimin üst sınırının çok üzerine düştü ve bu da tahlilin NSB tarafından bozulabileceğini gösteriyor. Bu sonuçları elde ettikten sonra, testten önce plakadaki NSB'yi bloke etmek için protokole 3.1-3.5 adımlarını ekledik.
| Absorbans (OD) | İnterpolasyonlu konsantrasyon (pg/mL) | Yüzde verim | |
| Çivisiz kontrol | 0.0401 | 12.93 | |
| 100 pg/mL'de çivili | 0.0315 | 10.17±2.31 | 10.17% |
| 50 pg/mL'de çivili | 0.0152 | 4.895±15,4 | 9.79% |
| 25 pg/mL'de çivili | 0.0007 | 0,2177±6,43 | 0.87% |
Tablo 4: Üç kontrol katılımcısının başarısız bir başak ve iyileşme deneyinin sonuçları.
Yazarların ekleyeceği başka bir açıklama yoktur.
İnsan plazmasındaki kalsitonin gen ilişkili peptid (CGRP) konsantrasyonları ile ilgili yayınlanmış veriler tutarsızdır. Bu tutarsızlıklar, bu nöropeptidi ölçmek için standartlaştırılmış, doğrulanmış bir metodolojinin eksikliğinden kaynaklanıyor olabilir. Burada, insan plazmasındaki CGRP'yi saflaştırmak ve ölçmek için doğrulanmış bir enzime bağlı immünosorbent testi (ELISA) protokolünü açıklıyoruz.
Robert N. Cole, Lauren R. DeVine ve Marcos Iglesias'a bu protokolle ilgili yararlı tartışmaları için teşekkür ederiz. Bu kısmen Amerikan Otoloji Derneği (Fellowship Grant, PSK), Amerikan İşitme Araştırma Vakfı (90066548/90072266, JPC) ve Ulusal Sağlık Enstitüleri'nin (NIH) bir bileşeni olan Ulusal Translasyonel Bilimleri Geliştirme Merkezi (NCATS) ve NIH Tıbbi Araştırma Yol Haritası (UL1 TR003098, NSF) tarafından finanse edilerek desteklenmiştir. Yayının içeriği yalnızca yazarların sorumluluğundadır ve Johns Hopkins ICTR, NCATS veya NIH'nin resmi görüşünü temsil etmek zorunda değildir.
| 1.7 mL Safeseal mikrosantrifüj tüpü | Sorenson Bioscience, Inc. | 11510 | |
| %99 metanol | ThermoFisher Scientific | L13255.0F | |
| 15 mL konik santrifüj tüpü | Falcon | 14-959-49B | |
| 2 mL yuvarlak tabanlı steril kriyoviyaller | CRYO. S | 122263 | |
| %4 asetik asit | ThermoFisher Scientific | 035572.K2 | |
| 6.0 mL Vacutainer EDTA toplama tüpü | BD | 367863 | |
| Allegra 64R tezgah üstü santrifüj | Beckman Coulter, Inc. | 367586 | |
| Aprotinin | VWR | 76344-814 | |
| CGRP (insan) ELISA kiti | Bertin Bioreagent | A05481 | |
| CGRP stoğu | Bertin Bioreagent | ||
| EIA Tamponu | Bertin Bioreagent | A07000 | |
| Ellman Reaktifi | Bertin Bioreagent | A09000_49+1 | |
| Çok kanallı pipetler | ThermoFisher Scientific | 4661180N | |
| Oasis HLB 3 cc Vac Kartuşları | Sular | WAT094226 | |
| Orbital Çalkalayıcı | Bellco | 7744-01010 | |
| Hassas mikropipetler | ThermoFisher Scientific | F144055MG | |
| SpectraMax M Serisi Çok Modlu Mikroplaka okuyucu | Moleküler Cihazlar Parça | Numarası M2 | |
| TBS/ Fischer Scientific'ten Balık Jelatin | Bioworld | 50-199-167 | |
| Ultra saf su ELISA Sınıfı | Bertin Bioreagent | A07001 | |
| Vacufuge plus - Santrifüj Konsantratörü | Eppendorf | 22820109 | |
| Yıkama Tamponu | Bertin Bioreagent | A17000 |