Ağ Farmakolojisi Akciğer Adenokarsinomuna Karşı Trikosantiz-Fritillaria Thunbergii Etki Mekanizmasının Tahmini ve Deneysel Validasyonu

Özet

Bu çalışma, ağ farmakolojisi ve deneysel doğrulamaya dayanarak akciğer adenokarsinomunun tedavisinde Trichosanthes-Fritillaria thunbergii'nin mekanizmasını ortaya koymaktadır. Çalışma ayrıca, PI3K / AKT sinyal yolunun Trichosanthes-Fritillaria thunbergii'nin akciğer adenokarsinomunun tedavisinde etkisinde hayati bir rol oynadığını göstermektedir.

Özet

Akciğer adenokarsinomunun (LUAD) tedavisinde Trichosanthes-Fritillaria thunbergii'nin mekanizmasını ağ farmakolojisi ve deneysel doğrulamaya dayalı olarak incelemeyi amaçladık. Trichosanthis ve Fritillaria thunbergii'nin etkili bileşenleri ve potansiyel hedefleri, geleneksel Çin tıbbının yüksek verimli deney ve referans rehberliğinde (HERB) veritabanı ve benzerlik topluluğu yaklaşımı (SEA) veritabanı ile toplandı ve LUAD ile ilgili hedefler GeneCards ve İnsanda Çevrimiçi Mendel Kalıtım (OMIM) veritabanları tarafından sorgulandı. Cytoscape yazılımı tarafından bir ilaç-bileşen-hastalık-hedef ağı oluşturulmuştur. Protein-protein etkileşimi (PPI) ağı, gen ontolojisi (GO) fonksiyonu ve Kyoto Genler ve Genomlar Ansiklopedisi (KEGG) yol zenginleştirme analizleri, çekirdek hedefleri ve anahtar yolları elde etmek için yapılmıştır. Sonraki deneysel doğrulama için Trichosanthes-Fritillaria thunbergii ve A549 hücrelerinin sulu bir ekstraktı kullanıldı. HERB veri tabanı ve literatür taraması yoluyla, 31 etkili bileşik ve Trichosanthes-Fritillaria thunbergii'nin 157 potansiyel hedef geni tarandı, bunlardan 144'ü akciğer adenokarsinomunun tedavisinde Trichosanthes-Fritillaria thunbergii'nin düzenleyici hedefleriydi. GO fonksiyonel zenginleştirme analizi, Trichosanthes-Fritillaria thunbergii'nin akciğer adenokarsinomuna karşı etki mekanizmasının esas olarak protein fosforilasyonu olduğunu göstermiştir. KEGG yol zenginleştirme analizi, akciğer adenokarsinomunun Trichosanthes-Fritillaria thunbergii ile tedavisinin esas olarak PI3K / AKT sinyal yolunu içerdiğini göstermiştir. Deneysel doğrulama, Trichosanthes-Fritillaria thunbergii'nin sulu bir ekstraktının A549 hücrelerinin çoğalmasını ve AKT'nin fosforilasyonunu inhibe edebileceğini göstermiştir. Ağ farmakolojisi ve deneysel doğrulama yoluyla, PI3K / AKT sinyal yolunun akciğer adenokarsinomunun tedavisinde Trichosanthes-Fritillaria thunbergii'nin etkisinde hayati bir rol oynadığı doğrulanmıştır.

Giriş

Akciğer kanseri, skuamöz hücreli karsinom, adenokarsinom, büyük hücreli karsinom ve küçük hücreli karsinom¹ dahil olmak üzere akciğer bronşiyal mukozasından köken alan malign tümörleri ifade eder. Akciğer adenokarsinomu (LUAD) en sık görülen akciğer kanseri türüdür ve toplam akciğer kanseri vakalarının yaklaşık% 40'ını oluşturur². Çoğu hastaya ileri evrede tanı konulur veya uzak metastazı vardır ve bu nedenle ameliyat fırsatını kaybeder³. Mevcut klinik tedavide, eşzamanlı kemoradyoterapi LUAD tedavisinde en yaygın stratejidir, ancak ciddi advers reaksiyonlar nedeniyle uygulaması sınırlıdır

Protokol

Tüm ağ farmakolojisi prosedürleri, Ağ Farmakolojisi Değerlendirme Yöntemleri Kılavuzu^18'e uygun olarak gerçekleştirilmiştir. Tüm deneysel prosedürler Pekin Çin Tıbbı Üniversitesi'nin laboratuvar yönetimi yönetmeliklerine uygun olarak gerçekleştirilmiştir.

1. Ağ farmakolojik tahmini

1. Aktif bileşenlerin seçimi
   1. HERB veritabanını (http://herb.ac.cn)¹⁹ açın ve iki ilacın bileşenlerini elde etmek için anahtar kelimeler olarak "Gualou" ( Trichosanthes kirilowii Maxim'in Çince adı) ve "Zhebeimu" (Bulbus Fritillariae thunbergii'nin Çince adı) kullanın.....

Sonuçlar

21 Trichosanthes-Fritillaria thunbergia bileşeni ve 144 karşılık gelen hedef dahil olmak üzere toplam 31 Trichosanthes-Fritillaria thunbergia ile ilişkili aktif bileşen tanımlanmıştır. Genel olarak, sırasıyla GeneCards veritabanından ve OMIM veritabanından 9.049 ve 67 LUAD ile ilişkili gen çıkarıldı. Kopyalanan genleri sildikten sonra, LUAD ile ilgili 9.057 gen tanımlandı. LUAD ile ilişkili genlerin ve Trichosanthes-Fritillaria thunbergii aktif bileşen ile ilişkili hedeflerin kesişimi,.......

Tartışma

Genel olarak, tam bir ağ farmakolojisi çalışması, veritabanlarından aktif bileşenlerin tanımlanmasını, aktif bileşenlere ve hastalıklara karşılık gelen hedeflerin elde edilmesini, bir ilaç-bileşen-hastalık-hedef ağının oluşturulmasını ve çekirdek hedeflerin ve yolların tahmin edilmesini içerir. Aktif bileşenler ve çekirdek proteinler arasındaki ilişki (moleküler kenetlenme) bilgisayar teknolojisi tarafından önceden tahmin edilir ve son doğrulama bir deney kullanılarak gerçekleştirilir.

İlgili .......

Malzemeler

Bu makalede kullanılan malzemelerin listesi

Ad	Şirket	Katalog numarası	Yorumlar
% 0.25 tripsin-EDTA	Gibco	R001100
A549  hücre hattı	Procell	CL-0016
AKT antikoru	CST	4691S
BCA Protein Test Kiti	Solarbio	PC0020
Kemilüminesans tespit sistemi	Şangay Qinxiang Bilimsel Enstrüman Fabrikası	ChemiScope 6100
Dulbecco'nun modifiye kartal ortamı (DMEM)	Solarbio	11995
Geliştirilmiş kemilüminesans (ECL) kiti	ABklonal	RM00021
Fetal sığır serumu	ScienCell	0025
HRP Keçi Anti-Tavşan IgG (H + L)	ABklonal	AS014
MTS test kiti	Promega	G3580
p-AKT antikoru	CST	6040S
Penisilin streptomisin	Gibco	C14-15070-063
Fenilmetansülfonil florür (PMSF)	Solarbio	P0100
Fosfataz inhibitörü	Beyotime	P1081
Fosfat tamponlu salin (PBS)	Solarbio	P1020
Poliviniliden diflorür (PVDF) membranlar	Kırlangıç	ISEQ00010
RIPA lizis çözeltisi	Solarbio	R0010
Döner evaporatör	Şangay Yarong Biyokimyasal Alet Fabrikası	RE52CS-1
Vakumlu dondurarak kurutma mekanizması	Ningbo Scientz Biyoteknoloji	SCIENTZ-10
ve beta; -Aktin antikoru	ABklonal	AC026